id	sid	tid	token	lemma	pos
ijassa-310	1	1	188	188	NUM
ijassa-310	1	2	-	-	SYM
ijassa-310	1	3	200	200	NUM
ijassa-310	1	4	advances	advance	NOUN
ijassa-310	1	5	in	in	ADP
ijassa-310	1	6	systems	system	NOUN
ijassa-310	1	7	science	science	NOUN
ijassa-310	1	8	and	and	CCONJ
ijassa-310	1	9	applications	application	NOUN
ijassa-310	1	10	(	(	PUNCT
ijassa-310	1	11	2011	2011	NUM
ijassa-310	1	12	)	)	PUNCT
ijassa-310	1	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	14	vol	vol	NOUN
ijassa-310	1	15	.	.	PROPN
ijassa-310	1	16	11	11	NUM
ijassa-310	1	17	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	18	no	no	INTJ
ijassa-310	1	19	.	.	NOUN
ijassa-310	1	20	1	1	NUM
ijassa-310	1	21	-	-	SYM
ijassa-310	1	22	2	2	NUM
ijassa-310	1	23	issn	issn	PROPN
ijassa-310	1	24	1078	1078	NUM
ijassa-310	1	25	-	-	SYM
ijassa-310	1	26	6236	6236	NUM
ijassa-310	1	27	international	international	PROPN
ijassa-310	1	28	institute	institute	NOUN
ijassa-310	1	29	for	for	ADP
ijassa-310	1	30	general	general	ADJ
ijassa-310	1	31	systems	system	NOUN
ijassa-310	1	32	studies	study	NOUN
ijassa-310	1	33	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	34	inc	inc	PROPN
ijassa-310	1	35	.	.	PROPN
ijassa-310	1	36	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	1	37	for	for	ADP
ijassa-310	1	38	gene	gene	NOUN
ijassa-310	1	39	networks	network	NOUN
ijassa-310	1	40	of	of	ADP
ijassa-310	1	41	colon	colon	NOUN
ijassa-310	1	42	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	1	43	based	base	VERB
ijassa-310	1	44	on	on	ADP
ijassa-310	1	45	logical	logical	ADJ
ijassa-310	1	46	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	1	47	*	*	SYM
ijassa-310	1	48	1	1	NUM
ijassa-310	1	49	college	college	NOUN
ijassa-310	1	50	of	of	ADP
ijassa-310	1	51	information	information	NOUN
ijassa-310	1	52	science	science	NOUN
ijassa-310	1	53	and	and	CCONJ
ijassa-310	1	54	engineering	engineering	NOUN
ijassa-310	1	55	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	56	shandong	shandong	PROPN
ijassa-310	1	57	university	university	PROPN
ijassa-310	1	58	of	of	ADP
ijassa-310	1	59	science	science	NOUN
ijassa-310	1	60	and	and	CCONJ
ijassa-310	1	61	technology	technology	NOUN
ijassa-310	1	62	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	63	qingdao	qingdao	PROPN
ijassa-310	1	64	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	65	shandong	shandong	PROPN
ijassa-310	1	66	266510	266510	NUM
ijassa-310	1	67	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	68	china	china	PROPN
ijassa-310	1	69	2	2	NUM
ijassa-310	1	70	college	college	NOUN
ijassa-310	1	71	of	of	ADP
ijassa-310	1	72	applied	apply	VERB
ijassa-310	1	73	science	science	NOUN
ijassa-310	1	74	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	75	beijing	beijing	PROPN
ijassa-310	1	76	university	university	PROPN
ijassa-310	1	77	of	of	ADP
ijassa-310	1	78	technology	technology	PROPN
ijassa-310	1	79	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	80	beijing	beijing	PROPN
ijassa-310	1	81	100124	100124	NUM
ijassa-310	1	82	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	83	china	china	PROPN
ijassa-310	1	84	３	３	PROPN
ijassa-310	1	85	department	department	PROPN
ijassa-310	1	86	of	of	ADP
ijassa-310	1	87	mathematics	mathematic	NOUN
ijassa-310	1	88	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	89	southern	southern	ADJ
ijassa-310	1	90	illinois	illinois	PROPN
ijassa-310	1	91	university	university	PROPN
ijassa-310	1	92	carbondale	carbondale	PROPN
ijassa-310	1	93	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	94	makanida	makanida	NOUN
ijassa-310	1	95	62958	62958	NUM
ijassa-310	1	96	,	,	PUNCT
ijassa-310	1	97	usa	usa	PROPN
ijassa-310	1	98	email	email	NOUN
ijassa-310	1	99	:	:	PUNCT
ijassa-310	1	100	wangshd2008@yahoo.com.cn	wangshd2008@yahoo.com.cn	NOUN
ijassa-310	1	101	abstract	abstract	ADJ
ijassa-310	1	102	genome	genome	NOUN
ijassa-310	1	103	forms	form	NOUN
ijassa-310	1	104	gene	gene	NOUN
ijassa-310	1	105	networks	network	NOUN
ijassa-310	1	106	in	in	ADP
ijassa-310	1	107	terms	term	NOUN
ijassa-310	1	108	of	of	ADP
ijassa-310	1	109	complicated	complicated	ADJ
ijassa-310	1	110	interaction	interaction	NOUN
ijassa-310	1	111	to	to	PART
ijassa-310	1	112	realize	realize	VERB
ijassa-310	1	113	its	its	PRON
ijassa-310	1	114	functions	function	NOUN
ijassa-310	1	115	.	.	PUNCT
ijassa-310	2	1	the	the	DET
ijassa-310	2	2	fundamental	fundamental	ADJ
ijassa-310	2	3	principle	principle	NOUN
ijassa-310	2	4	that	that	SCONJ
ijassa-310	2	5	“	"	PUNCT
ijassa-310	2	6	the	the	DET
ijassa-310	2	7	structure	structure	NOUN
ijassa-310	2	8	of	of	ADP
ijassa-310	2	9	system	system	NOUN
ijassa-310	2	10	determines	determine	VERB
ijassa-310	2	11	its	its	PRON
ijassa-310	2	12	function	function	NOUN
ijassa-310	2	13	”	"	PUNCT
ijassa-310	2	14	inspires	inspire	VERB
ijassa-310	2	15	researchers	researcher	NOUN
ijassa-310	2	16	to	to	PART
ijassa-310	2	17	contrast	contrast	VERB
ijassa-310	2	18	the	the	DET
ijassa-310	2	19	differences	difference	NOUN
ijassa-310	2	20	between	between	ADP
ijassa-310	2	21	the	the	DET
ijassa-310	2	22	structure	structure	NOUN
ijassa-310	2	23	of	of	ADP
ijassa-310	2	24	gene	gene	NOUN
ijassa-310	2	25	networks	network	NOUN
ijassa-310	2	26	for	for	ADP
ijassa-310	2	27	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	2	28	and	and	CCONJ
ijassa-310	2	29	control	control	NOUN
ijassa-310	2	30	groups	group	NOUN
ijassa-310	2	31	to	to	PART
ijassa-310	2	32	get	get	VERB
ijassa-310	2	33	useful	useful	ADJ
ijassa-310	2	34	information	information	NOUN
ijassa-310	2	35	of	of	ADP
ijassa-310	2	36	molecular	molecular	ADJ
ijassa-310	2	37	mechanism	mechanism	NOUN
ijassa-310	2	38	of	of	ADP
ijassa-310	2	39	the	the	DET
ijassa-310	2	40	formation	formation	NOUN
ijassa-310	2	41	of	of	ADP
ijassa-310	2	42	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	2	43	.	.	PUNCT
ijassa-310	3	1	in	in	ADP
ijassa-310	3	2	this	this	DET
ijassa-310	3	3	research	research	NOUN
ijassa-310	3	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	3	5	the	the	DET
ijassa-310	3	6	higher	high	ADJ
ijassa-310	3	7	-	-	PUNCT
ijassa-310	3	8	order	order	NOUN
ijassa-310	3	9	logical	logical	ADJ
ijassa-310	3	10	networks	network	NOUN
ijassa-310	3	11	are	be	AUX
ijassa-310	3	12	constructed	construct	VERB
ijassa-310	3	13	through	through	ADP
ijassa-310	3	14	reverse	reverse	ADJ
ijassa-310	3	15	network	network	NOUN
ijassa-310	3	16	modeling	modeling	NOUN
ijassa-310	3	17	based	base	VERB
ijassa-310	3	18	on	on	ADP
ijassa-310	3	19	the	the	DET
ijassa-310	3	20	expression	expression	NOUN
ijassa-310	3	21	data	datum	NOUN
ijassa-310	3	22	of	of	ADP
ijassa-310	3	23	phylogenetic	phylogenetic	ADJ
ijassa-310	3	24	profiles	profile	NOUN
ijassa-310	3	25	of	of	ADP
ijassa-310	3	26	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	3	27	-	-	PUNCT
ijassa-310	3	28	related	relate	VERB
ijassa-310	3	29	genes	gene	NOUN
ijassa-310	3	30	in	in	ADP
ijassa-310	3	31	the	the	DET
ijassa-310	3	32	normal	normal	ADJ
ijassa-310	3	33	and	and	CCONJ
ijassa-310	3	34	diseased	diseased	ADJ
ijassa-310	3	35	stages	stage	NOUN
ijassa-310	3	36	.	.	PUNCT
ijassa-310	4	1	through	through	ADP
ijassa-310	4	2	contrasting	contrasting	NOUN
ijassa-310	4	3	of	of	ADP
ijassa-310	4	4	the	the	DET
ijassa-310	4	5	network	network	NOUN
ijassa-310	4	6	structure	structure	NOUN
ijassa-310	4	7	between	between	ADP
ijassa-310	4	8	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	4	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	4	10	control	control	NOUN
ijassa-310	4	11	groups	group	NOUN
ijassa-310	4	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	4	13	such	such	ADJ
ijassa-310	4	14	obvious	obvious	ADJ
ijassa-310	4	15	differences	difference	NOUN
ijassa-310	4	16	in	in	ADP
ijassa-310	4	17	the	the	DET
ijassa-310	4	18	structural	structural	ADJ
ijassa-310	4	19	components	component	NOUN
ijassa-310	4	20	of	of	ADP
ijassa-310	4	21	networks	network	NOUN
ijassa-310	4	22	are	be	AUX
ijassa-310	4	23	found	find	VERB
ijassa-310	4	24	as	as	ADP
ijassa-310	4	25	the	the	DET
ijassa-310	4	26	number	number	NOUN
ijassa-310	4	27	of	of	ADP
ijassa-310	4	28	non	non	ADJ
ijassa-310	4	29	-	-	ADJ
ijassa-310	4	30	isolated	isolated	ADJ
ijassa-310	4	31	nodes	node	NOUN
ijassa-310	4	32	and	and	CCONJ
ijassa-310	4	33	the	the	DET
ijassa-310	4	34	logical	logical	ADJ
ijassa-310	4	35	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	4	36	,	,	PUNCT
ijassa-310	4	37	the	the	DET
ijassa-310	4	38	distribution	distribution	NOUN
ijassa-310	4	39	of	of	ADP
ijassa-310	4	40	logic	logic	ADJ
ijassa-310	4	41	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	4	42	of	of	ADP
ijassa-310	4	43	2	2	NUM
ijassa-310	4	44	-	-	PUNCT
ijassa-310	4	45	order	order	NOUN
ijassa-310	4	46	.	.	PUNCT
ijassa-310	5	1	furthermore	furthermore	ADV
ijassa-310	5	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	5	3	the	the	DET
ijassa-310	5	4	dynamical	dynamical	ADJ
ijassa-310	5	5	behaviors	behavior	NOUN
ijassa-310	5	6	of	of	ADP
ijassa-310	5	7	logical	logical	ADJ
ijassa-310	5	8	networks	network	NOUN
ijassa-310	5	9	of	of	ADP
ijassa-310	5	10	the	the	DET
ijassa-310	5	11	commander	commander	NOUN
ijassa-310	5	12	genes	gene	NOUN
ijassa-310	5	13	of	of	ADP
ijassa-310	5	14	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	5	15	and	and	CCONJ
ijassa-310	5	16	control	control	NOUN
ijassa-310	5	17	groups	group	NOUN
ijassa-310	5	18	are	be	AUX
ijassa-310	5	19	simulated	simulate	VERB
ijassa-310	5	20	and	and	CCONJ
ijassa-310	5	21	analyzed	analyze	VERB
ijassa-310	5	22	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	5	23	and	and	CCONJ
ijassa-310	5	24	significant	significant	ADJ
ijassa-310	5	25	differences	difference	NOUN
ijassa-310	5	26	in	in	ADP
ijassa-310	5	27	dynamical	dynamical	ADJ
ijassa-310	5	28	stability	stability	NOUN
ijassa-310	5	29	are	be	AUX
ijassa-310	5	30	discovered	discover	VERB
ijassa-310	5	31	.	.	PUNCT
ijassa-310	6	1	when	when	SCONJ
ijassa-310	6	2	the	the	DET
ijassa-310	6	3	above	above	ADJ
ijassa-310	6	4	method	method	NOUN
ijassa-310	6	5	is	be	AUX
ijassa-310	6	6	applied	apply	VERB
ijassa-310	6	7	to	to	ADP
ijassa-310	6	8	the	the	DET
ijassa-310	6	9	expression	expression	NOUN
ijassa-310	6	10	data	datum	NOUN
ijassa-310	6	11	of	of	ADP
ijassa-310	6	12	different	different	ADJ
ijassa-310	6	13	stages	stage	NOUN
ijassa-310	6	14	of	of	ADP
ijassa-310	6	15	other	other	ADJ
ijassa-310	6	16	cancers	cancer	NOUN
ijassa-310	6	17	,	,	PUNCT
ijassa-310	6	18	revelatory	revelatory	ADJ
ijassa-310	6	19	differences	difference	NOUN
ijassa-310	6	20	of	of	ADP
ijassa-310	6	21	the	the	DET
ijassa-310	6	22	variation	variation	NOUN
ijassa-310	6	23	of	of	ADP
ijassa-310	6	24	reaction	reaction	NOUN
ijassa-310	6	25	modes	mode	NOUN
ijassa-310	6	26	for	for	ADP
ijassa-310	6	27	the	the	DET
ijassa-310	6	28	formation	formation	NOUN
ijassa-310	6	29	and	and	CCONJ
ijassa-310	6	30	development	development	NOUN
ijassa-310	6	31	of	of	ADP
ijassa-310	6	32	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	6	33	can	can	AUX
ijassa-310	6	34	be	be	AUX
ijassa-310	6	35	given	give	VERB
ijassa-310	6	36	,	,	PUNCT
ijassa-310	6	37	which	which	PRON
ijassa-310	6	38	is	be	AUX
ijassa-310	6	39	useful	useful	ADJ
ijassa-310	6	40	for	for	ADP
ijassa-310	6	41	the	the	DET
ijassa-310	6	42	study	study	NOUN
ijassa-310	6	43	of	of	ADP
ijassa-310	6	44	the	the	DET
ijassa-310	6	45	mechanism	mechanism	NOUN
ijassa-310	6	46	of	of	ADP
ijassa-310	6	47	the	the	DET
ijassa-310	6	48	development	development	NOUN
ijassa-310	6	49	of	of	ADP
ijassa-310	6	50	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	6	51	.	.	PUNCT
ijassa-310	7	1	keywords	keyword	VERB
ijassa-310	7	2	systems	system	NOUN
ijassa-310	7	3	biology	biology	NOUN
ijassa-310	7	4	gene	gene	NOUN
ijassa-310	7	5	network	network	NOUN
ijassa-310	7	6	logical	logical	ADJ
ijassa-310	7	7	network	network	NOUN
ijassa-310	7	8	dynamics	dynamic	NOUN
ijassa-310	7	9	1	1	NUM
ijassa-310	7	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	8	1	introduction	introduction	NOUN
ijassa-310	8	2	the	the	DET
ijassa-310	8	3	invasion	invasion	NOUN
ijassa-310	8	4	and	and	CCONJ
ijassa-310	8	5	metastasis	metastasis	NOUN
ijassa-310	8	6	of	of	ADP
ijassa-310	8	7	colon	colon	NOUN
ijassa-310	8	8	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	8	9	is	be	AUX
ijassa-310	8	10	an	an	DET
ijassa-310	8	11	important	important	ADJ
ijassa-310	8	12	reason	reason	NOUN
ijassa-310	8	13	that	that	PRON
ijassa-310	8	14	would	would	AUX
ijassa-310	8	15	influence	influence	VERB
ijassa-310	8	16	the	the	DET
ijassa-310	8	17	prognosis	prognosis	NOUN
ijassa-310	8	18	of	of	ADP
ijassa-310	8	19	the	the	DET
ijassa-310	8	20	patients	patient	NOUN
ijassa-310	8	21	and	and	CCONJ
ijassa-310	8	22	lead	lead	VERB
ijassa-310	8	23	to	to	ADP
ijassa-310	8	24	death	death	NOUN
ijassa-310	8	25	.	.	PUNCT
ijassa-310	9	1	in	in	ADP
ijassa-310	9	2	recent	recent	ADJ
ijassa-310	9	3	years	year	NOUN
ijassa-310	9	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	9	5	through	through	ADP
ijassa-310	9	6	studying	study	VERB
ijassa-310	9	7	for	for	ADP
ijassa-310	9	8	the	the	DET
ijassa-310	9	9	etiology	etiology	NOUN
ijassa-310	9	10	and	and	CCONJ
ijassa-310	9	11	pathogenesis	pathogenesis	NOUN
ijassa-310	9	12	of	of	ADP
ijassa-310	9	13	colon	colon	NOUN
ijassa-310	9	14	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	9	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	9	16	it	it	PRON
ijassa-310	9	17	is	be	AUX
ijassa-310	9	18	generally	generally	ADV
ijassa-310	9	19	accepted	accept	VERB
ijassa-310	9	20	by	by	ADP
ijassa-310	9	21	the	the	DET
ijassa-310	9	22	biomedical	biomedical	ADJ
ijassa-310	9	23	scientists	scientist	NOUN
ijassa-310	9	24	that	that	SCONJ
ijassa-310	9	25	the	the	DET
ijassa-310	9	26	formation	formation	NOUN
ijassa-310	9	27	and	and	CCONJ
ijassa-310	9	28	development	development	NOUN
ijassa-310	9	29	of	of	ADP
ijassa-310	9	30	human‟s	human‟s	ADP
ijassa-310	9	31	colon	colon	NOUN
ijassa-310	9	32	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	9	33	is	be	AUX
ijassa-310	9	34	a	a	DET
ijassa-310	9	35	complicated	complicated	ADJ
ijassa-310	9	36	process	process	NOUN
ijassa-310	9	37	which	which	PRON
ijassa-310	9	38	involves	involve	VERB
ijassa-310	9	39	the	the	DET
ijassa-310	9	40	alteration	alteration	NOUN
ijassa-310	9	41	of	of	ADP
ijassa-310	9	42	many	many	ADJ
ijassa-310	9	43	genes	gene	NOUN
ijassa-310	9	44	and	and	CCONJ
ijassa-310	9	45	stages	stage	NOUN
ijassa-310	9	46	.	.	PUNCT
ijassa-310	10	1	the	the	DET
ijassa-310	10	2	process	process	NOUN
ijassa-310	10	3	of	of	ADP
ijassa-310	10	4	canceration	canceration	NOUN
ijassa-310	10	5	of	of	ADP
ijassa-310	10	6	the	the	DET
ijassa-310	10	7	cells	cell	NOUN
ijassa-310	10	8	contains	contain	VERB
ijassa-310	10	9	the	the	DET
ijassa-310	10	10	stages	stage	NOUN
ijassa-310	10	11	of	of	ADP
ijassa-310	10	12	initiation	initiation	NOUN
ijassa-310	10	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	10	14	development	development	NOUN
ijassa-310	10	15	and	and	CCONJ
ijassa-310	10	16	diffusion	diffusion	NOUN
ijassa-310	10	17	,	,	PUNCT
ijassa-310	10	18	and	and	CCONJ
ijassa-310	10	19	every	every	DET
ijassa-310	10	20	stage	stage	NOUN
ijassa-310	10	21	involves	involve	VERB
ijassa-310	10	22	the	the	DET
ijassa-310	10	23	activation	activation	NOUN
ijassa-310	10	24	of	of	ADP
ijassa-310	10	25	oncogenes	oncogene	NOUN
ijassa-310	10	26	and	and	CCONJ
ijassa-310	10	27	the	the	DET
ijassa-310	10	28	inactivation	inactivation	NOUN
ijassa-310	10	29	of	of	ADP
ijassa-310	10	30	the	the	DET
ijassa-310	10	31	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	10	32	suppressor	suppressor	NOUN
ijassa-310	10	33	genes	gene	NOUN
ijassa-310	10	34	.	.	PUNCT
ijassa-310	11	1	hence	hence	ADV
ijassa-310	11	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	11	3	finding	find	VERB
ijassa-310	11	4	the	the	DET
ijassa-310	11	5	functional	functional	ADJ
ijassa-310	11	6	genome	genome	NOUN
ijassa-310	11	7	related	relate	VERB
ijassa-310	11	8	with	with	ADP
ijassa-310	11	9	disease	disease	NOUN
ijassa-310	11	10	characteristics	characteristic	NOUN
ijassa-310	11	11	from	from	ADP
ijassa-310	11	12	many	many	ADJ
ijassa-310	11	13	virulence	virulence	NOUN
ijassa-310	11	14	genes	gene	NOUN
ijassa-310	11	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	11	16	the	the	DET
ijassa-310	11	17	reaction	reaction	NOUN
ijassa-310	11	18	modes	mode	VERB
ijassa-310	11	19	among	among	ADP
ijassa-310	11	20	genes	gene	NOUN
ijassa-310	11	21	and	and	CCONJ
ijassa-310	11	22	the	the	DET
ijassa-310	11	23	dynamic	dynamic	NOUN
ijassa-310	11	24	of	of	ADP
ijassa-310	11	25	oncogenes	oncogene	NOUN
ijassa-310	11	26	etc	etc	X
ijassa-310	11	27	.	.	X
ijassa-310	11	28	is	be	AUX
ijassa-310	11	29	of	of	ADP
ijassa-310	11	30	great	great	ADJ
ijassa-310	11	31	significance	significance	NOUN
ijassa-310	11	32	to	to	ADP
ijassa-310	11	33	the	the	DET
ijassa-310	11	34	diagnosis	diagnosis	NOUN
ijassa-310	11	35	and	and	CCONJ
ijassa-310	11	36	cure	cure	NOUN
ijassa-310	11	37	of	of	ADP
ijassa-310	11	38	the	the	DET
ijassa-310	11	39	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	11	40	and	and	CCONJ
ijassa-310	11	41	drug	drug	NOUN
ijassa-310	11	42	design	design	NOUN
ijassa-310	11	43	.	.	PUNCT
ijassa-310	12	1	this	this	PRON
ijassa-310	12	2	is	be	AUX
ijassa-310	12	3	also	also	ADV
ijassa-310	12	4	an	an	DET
ijassa-310	12	5	important	important	ADJ
ijassa-310	12	6	project	project	NOUN
ijassa-310	12	7	in	in	ADP
ijassa-310	12	8	the	the	DET
ijassa-310	12	9	research	research	NOUN
ijassa-310	12	10	of	of	ADP
ijassa-310	12	11	*	*	PUNCT
ijassa-310	12	12	supported	support	VERB
ijassa-310	12	13	by	by	ADP
ijassa-310	12	14	the	the	DET
ijassa-310	12	15	national	national	ADJ
ijassa-310	12	16	natural	natural	PROPN
ijassa-310	12	17	science	science	PROPN
ijassa-310	12	18	foundation	foundation	PROPN
ijassa-310	12	19	of	of	ADP
ijassa-310	12	20	china	china	PROPN
ijassa-310	12	21	(	(	PUNCT
ijassa-310	12	22	grant	grant	PROPN
ijassa-310	12	23	nos	nos	PROPN
ijassa-310	12	24	.	.	PROPN
ijassa-310	12	25	60874036	60874036	NUM
ijassa-310	12	26	,	,	PUNCT
ijassa-310	12	27	60503002	60503002	NUM
ijassa-310	12	28	)	)	PUNCT
ijassa-310	12	29	and	and	CCONJ
ijassa-310	12	30	sdust	sdust	ADJ
ijassa-310	12	31	research	research	NOUN
ijassa-310	12	32	fund	fund	NOUN
ijassa-310	12	33	xiuzhu	xiuzhu	PROPN
ijassa-310	12	34	xu	xu	PROPN
ijassa-310	13	1	1	1	NUM
ijassa-310	13	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	13	3	shudong	shudong	PROPN
ijassa-310	13	4	wang	wang	PROPN
ijassa-310	13	5	1	1	NUM
ijassa-310	13	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	13	7	kaikai	kaikai	PROPN
ijassa-310	13	8	li	li	PROPN
ijassa-310	13	9	1	1	NUM
ijassa-310	13	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	13	11	dashun	dashun	PROPN
ijassa-310	13	12	xu	xu	PROPN
ijassa-310	13	13	3	3	NUM
ijassa-310	13	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	13	15	dazhi	dazhi	ADJ
ijassa-310	13	16	meng1,2	meng1,2	PROPN
ijassa-310	13	17	mailto:wangshd2008@yahoo.com.cn	mailto:wangshd2008@yahoo.com.cn	X
ijassa-310	13	18	app	app	NOUN
ijassa-310	13	19	:	:	PUNCT
ijassa-310	13	20	ds	ds	ADJ
ijassa-310	13	21	:	:	PUNCT
ijassa-310	13	22	fundamental%20principle	fundamental%20principle	NOUN
ijassa-310	13	23	javascript	javascript	NOUN
ijassa-310	13	24	:	:	PUNCT
ijassa-310	13	25	showjdsw('jd_t','j	showjdsw('jd_t','j	NOUN
ijassa-310	13	26	_	_	PUNCT
ijassa-310	13	27	'	'	PUNCT
ijassa-310	13	28	)	)	PUNCT
ijassa-310	14	1	app	app	ADJ
ijassa-310	14	2	:	:	PUNCT
ijassa-310	14	3	ds	ds	ADJ
ijassa-310	14	4	:	:	PUNCT
ijassa-310	14	5	contrast	contrast	VERB
ijassa-310	14	6	http://dict.cnki.net/dict_source.aspx?searchword=profiles	http://dict.cnki.net/dict_source.aspx?searchword=profiles	NUM
ijassa-310	14	7	app	app	ADJ
ijassa-310	14	8	:	:	PUNCT
ijassa-310	14	9	ds	ds	ADJ
ijassa-310	14	10	:	:	PUNCT
ijassa-310	14	11	contrast	contrast	NOUN
ijassa-310	14	12	app	app	ADJ
ijassa-310	14	13	:	:	PUNCT
ijassa-310	14	14	ds	ds	ADJ
ijassa-310	14	15	:	:	PUNCT
ijassa-310	14	16	structural	structural	ADJ
ijassa-310	14	17	javascript	javascript	NOUN
ijassa-310	14	18	:	:	PUNCT
ijassa-310	14	19	void(0	void(0	NOUN
ijassa-310	14	20	)	)	PUNCT
ijassa-310	14	21	javascript	javascript	NOUN
ijassa-310	14	22	:	:	PUNCT
ijassa-310	14	23	void(0	void(0	NOUN
ijassa-310	14	24	)	)	PUNCT
ijassa-310	14	25	javascript	javascript	NOUN
ijassa-310	14	26	:	:	PUNCT
ijassa-310	14	27	showjdsw('jd_t','j	showjdsw('jd_t','j	NOUN
ijassa-310	14	28	_	_	PUNCT
ijassa-310	14	29	'	'	PUNCT
ijassa-310	14	30	)	)	PUNCT
ijassa-310	14	31	javascript	javascript	NOUN
ijassa-310	14	32	:	:	PUNCT
ijassa-310	14	33	showjdsw('jd_t','j	showjdsw('jd_t','j	NOUN
ijassa-310	14	34	_	_	PUNCT
ijassa-310	14	35	'	'	PUNCT
ijassa-310	14	36	)	)	PUNCT
ijassa-310	14	37	javascript	javascript	NOUN
ijassa-310	14	38	:	:	PUNCT
ijassa-310	14	39	showjdsw('jd_t','j	showjdsw('jd_t','j	NOUN
ijassa-310	14	40	_	_	PUNCT
ijassa-310	14	41	'	'	PUNCT
ijassa-310	14	42	)	)	PUNCT
ijassa-310	14	43	javascript	javascript	NOUN
ijassa-310	14	44	:	:	PUNCT
ijassa-310	14	45	showjdsw('jd_t','j	showjdsw('jd_t','j	NOUN
ijassa-310	14	46	_	_	PUNCT
ijassa-310	14	47	'	'	PUNCT
ijassa-310	14	48	)	)	PUNCT
ijassa-310	15	1	app	app	ADJ
ijassa-310	15	2	:	:	PUNCT
ijassa-310	15	3	ds	ds	ADJ
ijassa-310	15	4	:	:	PUNCT
ijassa-310	15	5	process	process	NOUN
ijassa-310	15	6	advances	advance	NOUN
ijassa-310	15	7	in	in	ADP
ijassa-310	15	8	systems	system	NOUN
ijassa-310	15	9	science	science	NOUN
ijassa-310	15	10	and	and	CCONJ
ijassa-310	15	11	applications	application	NOUN
ijassa-310	15	12	(	(	PUNCT
ijassa-310	15	13	2011	2011	NUM
ijassa-310	15	14	)	)	PUNCT
ijassa-310	15	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	15	16	vol	vol	NOUN
ijassa-310	15	17	.	.	PROPN
ijassa-310	15	18	11	11	NUM
ijassa-310	15	19	,	,	PUNCT
ijassa-310	15	20	no	no	INTJ
ijassa-310	15	21	.	.	NOUN
ijassa-310	15	22	1	1	NUM
ijassa-310	15	23	-	-	SYM
ijassa-310	15	24	2	2	NUM
ijassa-310	15	25	189	189	NUM
ijassa-310	15	26	bioinformatics	bioinformatic	NOUN
ijassa-310	15	27	[	[	X
ijassa-310	15	28	1	1	NUM
ijassa-310	15	29	-	-	SYM
ijassa-310	15	30	2	2	NUM
ijassa-310	15	31	]	]	PUNCT
ijassa-310	15	32	.	.	PUNCT
ijassa-310	16	1	in	in	ADP
ijassa-310	16	2	recent	recent	ADJ
ijassa-310	16	3	years	year	NOUN
ijassa-310	16	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	16	5	the	the	DET
ijassa-310	16	6	theoretical	theoretical	ADJ
ijassa-310	16	7	methods	method	NOUN
ijassa-310	16	8	for	for	ADP
ijassa-310	16	9	studying	study	VERB
ijassa-310	16	10	the	the	DET
ijassa-310	16	11	pathogenesis	pathogenesis	NOUN
ijassa-310	16	12	of	of	ADP
ijassa-310	16	13	cancers	cancer	NOUN
ijassa-310	16	14	are	be	AUX
ijassa-310	16	15	mostly	mostly	ADV
ijassa-310	16	16	based	base	VERB
ijassa-310	16	17	on	on	ADP
ijassa-310	16	18	the	the	DET
ijassa-310	16	19	expression	expression	NOUN
ijassa-310	16	20	data	datum	NOUN
ijassa-310	16	21	of	of	ADP
ijassa-310	16	22	phylogenetic	phylogenetic	ADJ
ijassa-310	16	23	profiles	profile	NOUN
ijassa-310	16	24	[	[	X
ijassa-310	16	25	3−11	3−11	NUM
ijassa-310	16	26	]	]	PUNCT
ijassa-310	16	27	,	,	PUNCT
ijassa-310	16	28	and	and	CCONJ
ijassa-310	16	29	the	the	DET
ijassa-310	16	30	computational	computational	ADJ
ijassa-310	16	31	methods	method	NOUN
ijassa-310	16	32	have	have	AUX
ijassa-310	16	33	just	just	ADV
ijassa-310	16	34	been	be	AUX
ijassa-310	16	35	developed	develop	VERB
ijassa-310	16	36	to	to	PART
ijassa-310	16	37	detect	detect	VERB
ijassa-310	16	38	functional	functional	ADJ
ijassa-310	16	39	linkages	linkage	NOUN
ijassa-310	16	40	between	between	ADP
ijassa-310	16	41	proteins	protein	NOUN
ijassa-310	16	42	or	or	CCONJ
ijassa-310	16	43	genes	gene	NOUN
ijassa-310	16	44	,	,	PUNCT
ijassa-310	16	45	such	such	ADJ
ijassa-310	16	46	as	as	ADP
ijassa-310	16	47	pearson	pearson	PROPN
ijassa-310	16	48	correlation	correlation	NOUN
ijassa-310	16	49	coefficient	coefficient	NOUN
ijassa-310	16	50	,	,	PUNCT
ijassa-310	16	51	euclidean	euclidean	ADJ
ijassa-310	16	52	and	and	CCONJ
ijassa-310	16	53	hamming	hamming	ADJ
ijassa-310	16	54	distances	distance	NOUN
ijassa-310	16	55	,	,	PUNCT
ijassa-310	16	56	mutual	mutual	ADJ
ijassa-310	16	57	information	information	NOUN
ijassa-310	16	58	,	,	PUNCT
ijassa-310	16	59	the	the	DET
ijassa-310	16	60	hypergeometric	hypergeometric	ADJ
ijassa-310	16	61	distribution	distribution	NOUN
ijassa-310	16	62	and	and	CCONJ
ijassa-310	16	63	shortest	short	ADJ
ijassa-310	16	64	-	-	PUNCT
ijassa-310	16	65	path	path	NOUN
ijassa-310	16	66	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	17	1	[	[	X
ijassa-310	17	2	12−14	12−14	X
ijassa-310	17	3	]	]	PUNCT
ijassa-310	17	4	.	.	PUNCT
ijassa-310	18	1	however	however	ADV
ijassa-310	18	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	18	3	traditional	traditional	ADJ
ijassa-310	18	4	pairwise	pairwise	NOUN
ijassa-310	18	5	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	18	6	can	can	AUX
ijassa-310	18	7	not	not	PART
ijassa-310	18	8	adequately	adequately	ADV
ijassa-310	18	9	illustrate	illustrate	VERB
ijassa-310	18	10	the	the	DET
ijassa-310	18	11	complexities	complexity	NOUN
ijassa-310	18	12	that	that	PRON
ijassa-310	18	13	arise	arise	VERB
ijassa-310	18	14	in	in	ADP
ijassa-310	18	15	cellular	cellular	ADJ
ijassa-310	18	16	networks	network	NOUN
ijassa-310	18	17	because	because	SCONJ
ijassa-310	18	18	of	of	ADP
ijassa-310	18	19	branching	branch	VERB
ijassa-310	18	20	and	and	CCONJ
ijassa-310	18	21	alternative	alternative	ADJ
ijassa-310	18	22	pathways	pathway	NOUN
ijassa-310	18	23	.	.	PUNCT
ijassa-310	19	1	for	for	ADP
ijassa-310	19	2	instance	instance	NOUN
ijassa-310	19	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	19	4	shikimate	shikimate	VERB
ijassa-310	19	5	5	5	NUM
ijassa-310	19	6	-	-	PUNCT
ijassa-310	19	7	dehydrogenase	dehydrogenase	NOUN
ijassa-310	19	8	(	(	PUNCT
ijassa-310	19	9	cog0169	cog0169	PROPN
ijassa-310	19	10	)	)	PUNCT
ijassa-310	19	11	is	be	AUX
ijassa-310	19	12	present	present	ADJ
ijassa-310	19	13	if	if	SCONJ
ijassa-310	19	14	and	and	CCONJ
ijassa-310	19	15	only	only	ADV
ijassa-310	19	16	if	if	SCONJ
ijassa-310	19	17	3	3	NUM
ijassa-310	19	18	-	-	PUNCT
ijassa-310	19	19	dehydroquinate	dehydroquinate	NOUN
ijassa-310	19	20	dehydratase	dehydratase	NOUN
ijassa-310	19	21	(	(	PUNCT
ijassa-310	19	22	cog0757	cog0757	NOUN
ijassa-310	19	23	)	)	PUNCT
ijassa-310	19	24	or	or	CCONJ
ijassa-310	19	25	3	3	NUM
ijassa-310	19	26	-	-	PUNCT
ijassa-310	19	27	dehydroquinate	dehydroquinate	NOUN
ijassa-310	19	28	dehydratase	dehydratase	NOUN
ijassa-310	19	29	(	(	PUNCT
ijassa-310	19	30	cog0710	cog0710	NOUN
ijassa-310	19	31	)	)	PUNCT
ijassa-310	19	32	is	be	AUX
ijassa-310	19	33	present	present	ADJ
ijassa-310	20	1	[	[	X
ijassa-310	20	2	15	15	NUM
ijassa-310	20	3	]	]	PUNCT
ijassa-310	20	4	.	.	PUNCT
ijassa-310	21	1	in	in	ADP
ijassa-310	21	2	order	order	NOUN
ijassa-310	21	3	to	to	PART
ijassa-310	21	4	further	far	ADV
ijassa-310	21	5	reveal	reveal	VERB
ijassa-310	21	6	the	the	DET
ijassa-310	21	7	ubiquitous	ubiquitous	ADJ
ijassa-310	21	8	logical	logical	ADJ
ijassa-310	21	9	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	21	10	mentioned	mention	VERB
ijassa-310	21	11	above	above	ADV
ijassa-310	21	12	in	in	ADP
ijassa-310	21	13	biology	biology	NOUN
ijassa-310	21	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	21	15	a	a	DET
ijassa-310	21	16	computational	computational	ADJ
ijassa-310	21	17	approach	approach	NOUN
ijassa-310	21	18	-	-	PUNCT
ijassa-310	21	19	logic	logic	NOUN
ijassa-310	21	20	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	21	21	of	of	ADP
ijassa-310	21	22	phylogenetic	phylogenetic	ADJ
ijassa-310	21	23	profiles	profile	NOUN
ijassa-310	21	24	(	(	PUNCT
ijassa-310	21	25	abbreviated	abbreviate	VERB
ijassa-310	21	26	as	as	ADP
ijassa-310	21	27	lapp	lapp	NOUN
ijassa-310	21	28	)	)	PUNCT
ijassa-310	21	29	was	be	AUX
ijassa-310	21	30	proposed	propose	VERB
ijassa-310	21	31	for	for	ADP
ijassa-310	21	32	identifying	identify	VERB
ijassa-310	21	33	detailed	detailed	ADJ
ijassa-310	21	34	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	21	35	among	among	ADP
ijassa-310	21	36	proteins	protein	NOUN
ijassa-310	21	37	on	on	ADP
ijassa-310	21	38	the	the	DET
ijassa-310	21	39	basis	basis	NOUN
ijassa-310	21	40	of	of	ADP
ijassa-310	21	41	genomic	genomic	ADJ
ijassa-310	21	42	data	datum	NOUN
ijassa-310	21	43	,	,	PUNCT
ijassa-310	21	44	which	which	PRON
ijassa-310	21	45	was	be	AUX
ijassa-310	21	46	applied	apply	VERB
ijassa-310	21	47	into	into	ADP
ijassa-310	21	48	4873	4873	NUM
ijassa-310	21	49	distinct	distinct	ADJ
ijassa-310	21	50	orthologous	orthologous	ADJ
ijassa-310	21	51	protein	protein	NOUN
ijassa-310	21	52	families	family	NOUN
ijassa-310	21	53	of	of	ADP
ijassa-310	21	54	67	67	NUM
ijassa-310	21	55	fully	fully	ADV
ijassa-310	21	56	sequenced	sequence	VERB
ijassa-310	21	57	organisms	organism	NOUN
ijassa-310	21	58	,	,	PUNCT
ijassa-310	21	59	and	and	CCONJ
ijassa-310	21	60	identified	identify	VERB
ijassa-310	21	61	750	750	NUM
ijassa-310	21	62	,	,	PUNCT
ijassa-310	21	63	000	000	NUM
ijassa-310	21	64	triplets	triplet	NOUN
ijassa-310	21	65	from	from	ADP
ijassa-310	21	66	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	21	67	of	of	ADP
ijassa-310	21	68	the	the	DET
ijassa-310	21	69	original	original	ADJ
ijassa-310	21	70	,	,	PUNCT
ijassa-310	21	71	unshuffled	unshuffled	ADJ
ijassa-310	21	72	biological	biological	ADJ
ijassa-310	21	73	protein	protein	NOUN
ijassa-310	21	74	profiles	profile	NOUN
ijassa-310	21	75	[	[	X
ijassa-310	21	76	15	15	NUM
ijassa-310	21	77	]	]	PUNCT
ijassa-310	21	78	.	.	PUNCT
ijassa-310	22	1	lapp	lapp	PROPN
ijassa-310	22	2	can	can	AUX
ijassa-310	22	3	reveal	reveal	VERB
ijassa-310	22	4	the	the	DET
ijassa-310	22	5	causal	causal	NOUN
ijassa-310	22	6	or	or	CCONJ
ijassa-310	22	7	restricted	restrict	VERB
ijassa-310	22	8	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	22	9	in	in	ADP
ijassa-310	22	10	complex	complex	ADJ
ijassa-310	22	11	network	network	NOUN
ijassa-310	22	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	22	13	help	help	VERB
ijassa-310	22	14	biologists	biologist	NOUN
ijassa-310	22	15	to	to	PART
ijassa-310	22	16	understand	understand	VERB
ijassa-310	22	17	the	the	DET
ijassa-310	22	18	unknown	unknown	ADJ
ijassa-310	22	19	logical	logical	ADJ
ijassa-310	22	20	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	22	21	among	among	ADP
ijassa-310	22	22	genes	gene	NOUN
ijassa-310	22	23	or	or	CCONJ
ijassa-310	22	24	proteins	protein	NOUN
ijassa-310	22	25	,	,	PUNCT
ijassa-310	22	26	and	and	CCONJ
ijassa-310	22	27	further	far	ADV
ijassa-310	22	28	discover	discover	VERB
ijassa-310	22	29	the	the	DET
ijassa-310	22	30	new	new	ADJ
ijassa-310	22	31	biological	biological	ADJ
ijassa-310	22	32	mechanisms	mechanism	NOUN
ijassa-310	22	33	through	through	ADP
ijassa-310	22	34	experiments	experiment	NOUN
ijassa-310	22	35	.	.	PUNCT
ijassa-310	23	1	as	as	SCONJ
ijassa-310	23	2	an	an	DET
ijassa-310	23	3	application	application	NOUN
ijassa-310	23	4	of	of	ADP
ijassa-310	23	5	triplet	triplet	NOUN
ijassa-310	23	6	logic	logic	NOUN
ijassa-310	23	7	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	23	8	to	to	ADP
ijassa-310	23	9	85	85	NUM
ijassa-310	23	10	diffuse	diffuse	NOUN
ijassa-310	23	11	infiltrating	infiltrating	ADJ
ijassa-310	23	12	gliomas	glioma	NOUN
ijassa-310	23	13	quantified	quantify	VERB
ijassa-310	23	14	using	use	VERB
ijassa-310	23	15	oligonucleotide	oligonucleotide	NOUN
ijassa-310	23	16	arrays	array	VERB
ijassa-310	23	17	,	,	PUNCT
ijassa-310	23	18	the	the	DET
ijassa-310	23	19	meaningful	meaningful	ADJ
ijassa-310	23	20	sets	set	NOUN
ijassa-310	23	21	of	of	ADP
ijassa-310	23	22	genes	gene	NOUN
ijassa-310	23	23	that	that	PRON
ijassa-310	23	24	matched	match	VERB
ijassa-310	23	25	clinical	clinical	ADJ
ijassa-310	23	26	outcomes	outcome	NOUN
ijassa-310	23	27	were	be	AUX
ijassa-310	23	28	explored	explore	VERB
ijassa-310	23	29	[	[	X
ijassa-310	23	30	16	16	NUM
ijassa-310	23	31	]	]	PUNCT
ijassa-310	23	32	.	.	PUNCT
ijassa-310	24	1	a	a	DET
ijassa-310	24	2	bayesian	bayesian	NOUN
ijassa-310	24	3	modeling	model	VERB
ijassa-310	24	4	framework	framework	NOUN
ijassa-310	24	5	for	for	ADP
ijassa-310	24	6	combining	combine	VERB
ijassa-310	24	7	phylogenetic	phylogenetic	ADJ
ijassa-310	24	8	profile	profile	NOUN
ijassa-310	24	9	data	datum	NOUN
ijassa-310	24	10	via	via	ADP
ijassa-310	24	11	a	a	DET
ijassa-310	24	12	likelihood	likelihood	NOUN
ijassa-310	24	13	with	with	ADP
ijassa-310	24	14	rosetta	rosetta	PROPN
ijassa-310	24	15	stone	stone	NOUN
ijassa-310	24	16	data	datum	NOUN
ijassa-310	24	17	via	via	ADP
ijassa-310	24	18	a	a	DET
ijassa-310	24	19	prior	prior	ADJ
ijassa-310	24	20	probability	probability	NOUN
ijassa-310	24	21	was	be	AUX
ijassa-310	24	22	described	describe	VERB
ijassa-310	24	23	[	[	X
ijassa-310	24	24	17	17	NUM
ijassa-310	24	25	]	]	PUNCT
ijassa-310	24	26	.	.	PUNCT
ijassa-310	25	1	a	a	DET
ijassa-310	25	2	three	three	NUM
ijassa-310	25	3	-	-	PUNCT
ijassa-310	25	4	way	way	NOUN
ijassa-310	25	5	gene	gene	NOUN
ijassa-310	25	6	interaction	interaction	NOUN
ijassa-310	25	7	model	model	NOUN
ijassa-310	25	8	was	be	AUX
ijassa-310	25	9	proposed	propose	VERB
ijassa-310	25	10	that	that	SCONJ
ijassa-310	25	11	captured	capture	VERB
ijassa-310	25	12	the	the	DET
ijassa-310	25	13	dynamic	dynamic	NOUN
ijassa-310	25	14	of	of	ADP
ijassa-310	25	15	co	co	ADJ
ijassa-310	25	16	-	-	NOUN
ijassa-310	25	17	expression	expression	ADJ
ijassa-310	25	18	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	25	19	between	between	ADP
ijassa-310	25	20	two	two	NUM
ijassa-310	25	21	genes	gene	NOUN
ijassa-310	25	22	[	[	X
ijassa-310	25	23	18	18	NUM
ijassa-310	25	24	]	]	PUNCT
ijassa-310	25	25	.	.	PUNCT
ijassa-310	26	1	a	a	DET
ijassa-310	26	2	logical	logical	ADJ
ijassa-310	26	3	network	network	NOUN
ijassa-310	26	4	with	with	ADP
ijassa-310	26	5	16	16	NUM
ijassa-310	26	6	active	active	ADJ
ijassa-310	26	7	genes	gene	NOUN
ijassa-310	26	8	of	of	ADP
ijassa-310	26	9	shoot	shoot	NOUN
ijassa-310	26	10	in	in	ADP
ijassa-310	26	11	different	different	ADJ
ijassa-310	26	12	external	external	ADJ
ijassa-310	26	13	stimuli	stimulus	NOUN
ijassa-310	26	14	was	be	AUX
ijassa-310	26	15	constructed	construct	VERB
ijassa-310	26	16	,	,	PUNCT
ijassa-310	26	17	and	and	CCONJ
ijassa-310	26	18	the	the	DET
ijassa-310	26	19	dynamics	dynamic	NOUN
ijassa-310	26	20	of	of	ADP
ijassa-310	26	21	the	the	DET
ijassa-310	26	22	network	network	NOUN
ijassa-310	26	23	was	be	AUX
ijassa-310	26	24	analyzed	analyze	VERB
ijassa-310	26	25	[	[	X
ijassa-310	26	26	19	19	NUM
ijassa-310	26	27	]	]	PUNCT
ijassa-310	26	28	.	.	PUNCT
ijassa-310	27	1	in	in	ADP
ijassa-310	27	2	this	this	DET
ijassa-310	27	3	work	work	NOUN
ijassa-310	27	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	27	5	the	the	DET
ijassa-310	27	6	logical	logical	ADJ
ijassa-310	27	7	networks	network	NOUN
ijassa-310	27	8	of	of	ADP
ijassa-310	27	9	the	the	DET
ijassa-310	27	10	normal	normal	ADJ
ijassa-310	27	11	and	and	CCONJ
ijassa-310	27	12	diseased	diseased	ADJ
ijassa-310	27	13	stages	stage	NOUN
ijassa-310	27	14	are	be	AUX
ijassa-310	27	15	constructed	construct	VERB
ijassa-310	27	16	through	through	ADP
ijassa-310	27	17	lapp	lapp	NOUN
ijassa-310	27	18	method	method	NOUN
ijassa-310	27	19	based	base	VERB
ijassa-310	27	20	on	on	ADP
ijassa-310	27	21	the	the	DET
ijassa-310	27	22	expression	expression	NOUN
ijassa-310	27	23	data	datum	NOUN
ijassa-310	27	24	of	of	ADP
ijassa-310	27	25	phylogenetic	phylogenetic	ADJ
ijassa-310	27	26	profiles	profile	NOUN
ijassa-310	27	27	of	of	ADP
ijassa-310	27	28	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	27	29	-	-	PUNCT
ijassa-310	27	30	related	relate	VERB
ijassa-310	27	31	genes	gene	NOUN
ijassa-310	27	32	.	.	PUNCT
ijassa-310	28	1	through	through	ADP
ijassa-310	28	2	contrasting	contrasting	NOUN
ijassa-310	28	3	of	of	ADP
ijassa-310	28	4	the	the	DET
ijassa-310	28	5	network	network	NOUN
ijassa-310	28	6	structure	structure	NOUN
ijassa-310	28	7	between	between	ADP
ijassa-310	28	8	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	28	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	28	10	control	control	NOUN
ijassa-310	28	11	groups	group	NOUN
ijassa-310	28	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	28	13	such	such	ADJ
ijassa-310	28	14	obvious	obvious	ADJ
ijassa-310	28	15	differences	difference	NOUN
ijassa-310	28	16	in	in	ADP
ijassa-310	28	17	the	the	DET
ijassa-310	28	18	structural	structural	ADJ
ijassa-310	28	19	components	component	NOUN
ijassa-310	28	20	of	of	ADP
ijassa-310	28	21	networks	network	NOUN
ijassa-310	28	22	are	be	AUX
ijassa-310	28	23	found	find	VERB
ijassa-310	28	24	as	as	ADP
ijassa-310	28	25	the	the	DET
ijassa-310	28	26	number	number	NOUN
ijassa-310	28	27	of	of	ADP
ijassa-310	28	28	non	non	ADJ
ijassa-310	28	29	-	-	ADJ
ijassa-310	28	30	isolated	isolated	ADJ
ijassa-310	28	31	nodes	node	NOUN
ijassa-310	28	32	and	and	CCONJ
ijassa-310	28	33	the	the	DET
ijassa-310	28	34	logical	logical	ADJ
ijassa-310	28	35	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	28	36	,	,	PUNCT
ijassa-310	28	37	the	the	DET
ijassa-310	28	38	distribution	distribution	NOUN
ijassa-310	28	39	of	of	ADP
ijassa-310	28	40	logic	logic	ADJ
ijassa-310	28	41	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	28	42	of	of	ADP
ijassa-310	28	43	2	2	NUM
ijassa-310	28	44	-	-	PUNCT
ijassa-310	28	45	order	order	NOUN
ijassa-310	28	46	.	.	PUNCT
ijassa-310	29	1	the	the	DET
ijassa-310	29	2	differences	difference	NOUN
ijassa-310	29	3	inspire	inspire	VERB
ijassa-310	29	4	biomedical	biomedical	ADJ
ijassa-310	29	5	researchers	researcher	NOUN
ijassa-310	29	6	:	:	PUNCT
ijassa-310	29	7	the	the	DET
ijassa-310	29	8	reason	reason	NOUN
ijassa-310	29	9	that	that	SCONJ
ijassa-310	29	10	organism	organism	NOUN
ijassa-310	29	11	is	be	AUX
ijassa-310	29	12	normal	normal	ADJ
ijassa-310	29	13	in	in	ADP
ijassa-310	29	14	the	the	DET
ijassa-310	29	15	normal	normal	ADJ
ijassa-310	29	16	stage	stage	NOUN
ijassa-310	29	17	might	might	AUX
ijassa-310	29	18	be	be	AUX
ijassa-310	29	19	that	that	SCONJ
ijassa-310	29	20	the	the	DET
ijassa-310	29	21	biochemical	biochemical	ADJ
ijassa-310	29	22	reaction	reaction	NOUN
ijassa-310	29	23	mode	mode	NOUN
ijassa-310	29	24	,	,	PUNCT
ijassa-310	29	25	the	the	DET
ijassa-310	29	26	extent	extent	NOUN
ijassa-310	29	27	of	of	ADP
ijassa-310	29	28	gene	gene	NOUN
ijassa-310	29	29	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	29	30	and	and	CCONJ
ijassa-310	29	31	most	most	ADJ
ijassa-310	29	32	of	of	ADP
ijassa-310	29	33	the	the	DET
ijassa-310	29	34	genes	gene	NOUN
ijassa-310	29	35	play	play	VERB
ijassa-310	29	36	normal	normal	ADJ
ijassa-310	29	37	roles	role	NOUN
ijassa-310	29	38	.	.	PUNCT
ijassa-310	30	1	furthermore	furthermore	ADV
ijassa-310	30	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	30	3	the	the	DET
ijassa-310	30	4	dynamical	dynamical	ADJ
ijassa-310	30	5	behaviors	behavior	NOUN
ijassa-310	30	6	of	of	ADP
ijassa-310	30	7	logical	logical	ADJ
ijassa-310	30	8	networks	network	NOUN
ijassa-310	30	9	of	of	ADP
ijassa-310	30	10	the	the	DET
ijassa-310	30	11	commander	commander	NOUN
ijassa-310	30	12	genes	gene	NOUN
ijassa-310	30	13	of	of	ADP
ijassa-310	30	14	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	30	15	and	and	CCONJ
ijassa-310	30	16	control	control	NOUN
ijassa-310	30	17	groups	group	NOUN
ijassa-310	30	18	are	be	AUX
ijassa-310	30	19	simulated	simulate	VERB
ijassa-310	30	20	and	and	CCONJ
ijassa-310	30	21	analyzed	analyze	VERB
ijassa-310	30	22	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	30	23	and	and	CCONJ
ijassa-310	30	24	significant	significant	ADJ
ijassa-310	30	25	differences	difference	NOUN
ijassa-310	30	26	in	in	ADP
ijassa-310	30	27	dynamical	dynamical	ADJ
ijassa-310	30	28	stability	stability	NOUN
ijassa-310	30	29	are	be	AUX
ijassa-310	30	30	discovered	discover	VERB
ijassa-310	30	31	that	that	SCONJ
ijassa-310	30	32	the	the	DET
ijassa-310	30	33	number	number	NOUN
ijassa-310	30	34	of	of	ADP
ijassa-310	30	35	attractors	attractor	NOUN
ijassa-310	30	36	for	for	ADP
ijassa-310	30	37	control	control	NOUN
ijassa-310	30	38	group	group	NOUN
ijassa-310	30	39	is	be	AUX
ijassa-310	30	40	far	far	ADV
ijassa-310	30	41	less	less	ADJ
ijassa-310	30	42	than	than	ADP
ijassa-310	30	43	the	the	DET
ijassa-310	30	44	one	one	NUM
ijassa-310	30	45	of	of	ADP
ijassa-310	30	46	the	the	DET
ijassa-310	30	47	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	30	48	groups	group	NOUN
ijassa-310	30	49	.	.	PUNCT
ijassa-310	31	1	this	this	DET
ijassa-310	31	2	paper	paper	NOUN
ijassa-310	31	3	is	be	AUX
ijassa-310	31	4	organized	organize	VERB
ijassa-310	31	5	as	as	SCONJ
ijassa-310	31	6	follows	follow	VERB
ijassa-310	31	7	:	:	PUNCT
ijassa-310	31	8	in	in	ADP
ijassa-310	31	9	the	the	DET
ijassa-310	31	10	first	first	ADJ
ijassa-310	31	11	part	part	NOUN
ijassa-310	31	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	31	13	the	the	DET
ijassa-310	31	14	background	background	NOUN
ijassa-310	31	15	of	of	ADP
ijassa-310	31	16	our	our	PRON
ijassa-310	31	17	work	work	NOUN
ijassa-310	31	18	and	and	CCONJ
ijassa-310	31	19	the	the	DET
ijassa-310	31	20	present	present	ADJ
ijassa-310	31	21	researching	research	VERB
ijassa-310	31	22	situation	situation	NOUN
ijassa-310	31	23	of	of	ADP
ijassa-310	31	24	logical	logical	ADJ
ijassa-310	31	25	network	network	NOUN
ijassa-310	31	26	of	of	ADP
ijassa-310	31	27	genes	gene	NOUN
ijassa-310	31	28	.	.	PUNCT
ijassa-310	32	1	in	in	ADP
ijassa-310	32	2	the	the	DET
ijassa-310	32	3	second	second	ADJ
ijassa-310	32	4	part	part	NOUN
ijassa-310	32	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	32	6	the	the	DET
ijassa-310	32	7	method	method	NOUN
ijassa-310	32	8	of	of	ADP
ijassa-310	32	9	lapp	lapp	NOUN
ijassa-310	32	10	is	be	AUX
ijassa-310	32	11	clarified	clarify	VERB
ijassa-310	32	12	briefly	briefly	ADV
ijassa-310	32	13	and	and	CCONJ
ijassa-310	32	14	the	the	DET
ijassa-310	32	15	data	datum	NOUN
ijassa-310	32	16	sources	source	NOUN
ijassa-310	32	17	and	and	CCONJ
ijassa-310	32	18	the	the	DET
ijassa-310	32	19	processing	processing	NOUN
ijassa-310	32	20	methods	method	NOUN
ijassa-310	32	21	of	of	ADP
ijassa-310	32	22	the	the	DET
ijassa-310	32	23	data	datum	NOUN
ijassa-310	32	24	are	be	AUX
ijassa-310	32	25	given	give	VERB
ijassa-310	32	26	in	in	ADP
ijassa-310	32	27	the	the	DET
ijassa-310	32	28	third	third	ADJ
ijassa-310	32	29	part	part	NOUN
ijassa-310	32	30	.	.	PUNCT
ijassa-310	33	1	the	the	DET
ijassa-310	33	2	logical	logical	ADJ
ijassa-310	33	3	networks	network	NOUN
ijassa-310	33	4	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	33	5	to	to	ADP
ijassa-310	33	6	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	33	7	and	and	CCONJ
ijassa-310	33	8	control	control	NOUN
ijassa-310	33	9	groups	group	NOUN
ijassa-310	33	10	are	be	AUX
ijassa-310	33	11	constructed	construct	VERB
ijassa-310	33	12	using	use	VERB
ijassa-310	33	13	lapp	lapp	NOUN
ijassa-310	33	14	method	method	NOUN
ijassa-310	33	15	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	33	16	and	and	CCONJ
ijassa-310	33	17	the	the	DET
ijassa-310	33	18	structural	structural	ADJ
ijassa-310	33	19	components	component	NOUN
ijassa-310	33	20	of	of	ADP
ijassa-310	33	21	networks	network	NOUN
ijassa-310	33	22	are	be	AUX
ijassa-310	33	23	contrasted	contrast	VERB
ijassa-310	33	24	and	and	CCONJ
ijassa-310	33	25	analyzed	analyze	VERB
ijassa-310	33	26	.	.	PUNCT
ijassa-310	34	1	the	the	DET
ijassa-310	34	2	dynamical	dynamical	ADJ
ijassa-310	34	3	attractors	attractor	NOUN
ijassa-310	34	4	of	of	ADP
ijassa-310	34	5	logical	logical	ADJ
ijassa-310	34	6	networks	network	NOUN
ijassa-310	34	7	of	of	ADP
ijassa-310	34	8	the	the	DET
ijassa-310	34	9	commander	commander	NOUN
ijassa-310	34	10	genes	gene	NOUN
ijassa-310	34	11	in	in	ADP
ijassa-310	34	12	the	the	DET
ijassa-310	34	13	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	34	14	and	and	CCONJ
ijassa-310	34	15	control	control	NOUN
ijassa-310	34	16	groups	group	NOUN
ijassa-310	34	17	are	be	AUX
ijassa-310	34	18	contrasted	contrast	VERB
ijassa-310	34	19	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	34	20	in	in	ADP
ijassa-310	34	21	the	the	DET
ijassa-310	34	22	fifth	fifth	ADJ
ijassa-310	34	23	part	part	NOUN
ijassa-310	34	24	.	.	PUNCT
ijassa-310	35	1	the	the	DET
ijassa-310	35	2	above	above	ADJ
ijassa-310	35	3	results	result	NOUN
ijassa-310	35	4	are	be	AUX
ijassa-310	35	5	analyzed	analyze	VERB
ijassa-310	35	6	and	and	CCONJ
ijassa-310	35	7	discussed	discuss	VERB
ijassa-310	35	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	35	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	35	10	the	the	DET
ijassa-310	35	11	problems	problem	NOUN
ijassa-310	35	12	to	to	PART
ijassa-310	35	13	be	be	AUX
ijassa-310	35	14	solved	solve	VERB
ijassa-310	35	15	further	far	ADV
ijassa-310	35	16	are	be	AUX
ijassa-310	35	17	put	put	VERB
ijassa-310	35	18	forward	forward	ADV
ijassa-310	35	19	in	in	ADP
ijassa-310	35	20	the	the	DET
ijassa-310	35	21	sixth	sixth	ADJ
ijassa-310	35	22	part	part	NOUN
ijassa-310	35	23	.	.	PUNCT
ijassa-310	36	1	2	2	X
ijassa-310	36	2	.	.	X
ijassa-310	36	3	the	the	DET
ijassa-310	36	4	method	method	NOUN
ijassa-310	36	5	of	of	ADP
ijassa-310	36	6	lapp	lapp	NOUN
ijassa-310	36	7	in	in	ADP
ijassa-310	36	8	order	order	NOUN
ijassa-310	36	9	to	to	PART
ijassa-310	36	10	understand	understand	VERB
ijassa-310	36	11	and	and	CCONJ
ijassa-310	36	12	predict	predict	VERB
ijassa-310	36	13	the	the	DET
ijassa-310	36	14	functions	function	NOUN
ijassa-310	36	15	of	of	ADP
ijassa-310	36	16	biological	biological	ADJ
ijassa-310	36	17	systems	system	NOUN
ijassa-310	36	18	,	,	PUNCT
ijassa-310	36	19	we	we	PRON
ijassa-310	36	20	must	must	AUX
ijassa-310	36	21	first	first	ADV
ijassa-310	36	22	identify	identify	VERB
ijassa-310	36	23	the	the	DET
ijassa-310	36	24	structure	structure	NOUN
ijassa-310	36	25	of	of	ADP
ijassa-310	36	26	the	the	DET
ijassa-310	36	27	system	system	NOUN
ijassa-310	36	28	.	.	PUNCT
ijassa-310	37	1	for	for	ADP
ijassa-310	37	2	example	example	NOUN
ijassa-310	37	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	37	4	in	in	ADP
ijassa-310	37	5	order	order	NOUN
ijassa-310	37	6	to	to	PART
ijassa-310	37	7	show	show	VERB
ijassa-310	37	8	the	the	DET
ijassa-310	37	9	regulatory	regulatory	ADJ
ijassa-310	37	10	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	37	11	among	among	ADP
ijassa-310	37	12	the	the	DET
ijassa-310	37	13	genes	gene	NOUN
ijassa-310	37	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	37	15	we	we	PRON
ijassa-310	37	16	must	must	AUX
ijassa-310	37	17	identify	identify	VERB
ijassa-310	37	18	all	all	DET
ijassa-310	37	19	the	the	DET
ijassa-310	37	20	components	component	NOUN
ijassa-310	37	21	,	,	PUNCT
ijassa-310	37	22	the	the	DET
ijassa-310	37	23	functions	function	NOUN
ijassa-310	37	24	of	of	ADP
ijassa-310	37	25	every	every	DET
ijassa-310	37	26	component	component	NOUN
ijassa-310	37	27	,	,	PUNCT
ijassa-310	37	28	their	their	PRON
ijassa-310	37	29	interrelations	interrelation	NOUN
ijassa-310	37	30	and	and	CCONJ
ijassa-310	37	31	all	all	DET
ijassa-310	37	32	the	the	DET
ijassa-310	37	33	parameters	parameter	NOUN
ijassa-310	37	34	related	relate	VERB
ijassa-310	37	35	in	in	ADP
ijassa-310	37	36	the	the	DET
ijassa-310	37	37	system	system	NOUN
ijassa-310	37	38	.	.	PUNCT
ijassa-310	38	1	now	now	ADV
ijassa-310	38	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	38	3	there	there	PRON
ijassa-310	38	4	are	be	VERB
ijassa-310	38	5	two	two	NUM
ijassa-310	38	6	main	main	ADJ
ijassa-310	38	7	methods	method	NOUN
ijassa-310	38	8	to	to	ADP
ijassa-310	38	9	http://dict.cnki.net/dict_source.aspx?searchword=profiles	http://dict.cnki.net/dict_source.aspx?searchword=profile	NOUN
ijassa-310	38	10	http://dict.cnki.net/dict_source.aspx?searchword=profiles	http://dict.cnki.net/dict_source.aspx?searchword=profiles	NUM
ijassa-310	38	11	app	app	ADJ
ijassa-310	38	12	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	13	ds	ds	ADJ
ijassa-310	38	14	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	15	contrast	contrast	NOUN
ijassa-310	38	16	app	app	ADJ
ijassa-310	38	17	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	18	ds	ds	ADJ
ijassa-310	38	19	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	20	structural	structural	ADJ
ijassa-310	38	21	javascript	javascript	NOUN
ijassa-310	38	22	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	23	void(0	void(0	NOUN
ijassa-310	38	24	)	)	PUNCT
ijassa-310	38	25	javascript	javascript	NOUN
ijassa-310	38	26	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	27	void(0	void(0	NOUN
ijassa-310	38	28	)	)	PUNCT
ijassa-310	38	29	javascript	javascript	NOUN
ijassa-310	38	30	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	31	void(0	void(0	NOUN
ijassa-310	38	32	)	)	PUNCT
ijassa-310	38	33	app	app	NOUN
ijassa-310	38	34	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	35	ds	ds	ADJ
ijassa-310	38	36	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	37	structural	structural	ADJ
ijassa-310	38	38	app	app	NOUN
ijassa-310	38	39	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	40	ds	ds	ADJ
ijassa-310	38	41	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	42	contrast	contrast	NOUN
ijassa-310	38	43	app	app	ADJ
ijassa-310	38	44	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	45	ds	ds	ADJ
ijassa-310	38	46	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	47	contrast	contrast	NOUN
ijassa-310	38	48	build	build	VERB
ijassa-310	38	49	the	the	DET
ijassa-310	38	50	model	model	NOUN
ijassa-310	38	51	of	of	ADP
ijassa-310	38	52	biological	biological	ADJ
ijassa-310	38	53	system	system	NOUN
ijassa-310	38	54	structure	structure	NOUN
ijassa-310	38	55	:	:	PUNCT
ijassa-310	38	56	forward	forward	ADV
ijassa-310	38	57	and	and	CCONJ
ijassa-310	38	58	reverse	reverse	VERB
ijassa-310	38	59	network	network	NOUN
ijassa-310	38	60	modelings	modeling	NOUN
ijassa-310	38	61	.	.	PUNCT
ijassa-310	39	1	reverse	reverse	VERB
ijassa-310	39	2	logical	logical	ADJ
ijassa-310	39	3	network	network	NOUN
ijassa-310	39	4	modeling	modeling	NOUN
ijassa-310	39	5	is	be	AUX
ijassa-310	39	6	a	a	DET
ijassa-310	39	7	method	method	NOUN
ijassa-310	39	8	of	of	ADP
ijassa-310	39	9	reverse	reverse	ADJ
ijassa-310	39	10	network	network	NOUN
ijassa-310	39	11	modeling	modeling	NOUN
ijassa-310	39	12	and	and	CCONJ
ijassa-310	39	13	can	can	AUX
ijassa-310	39	14	determine	determine	VERB
ijassa-310	39	15	the	the	DET
ijassa-310	39	16	logical	logical	ADJ
ijassa-310	39	17	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	39	18	and	and	CCONJ
ijassa-310	39	19	types	type	NOUN
ijassa-310	39	20	among	among	ADP
ijassa-310	39	21	elements	element	NOUN
ijassa-310	39	22	of	of	ADP
ijassa-310	39	23	systems	system	NOUN
ijassa-310	39	24	.	.	PUNCT
ijassa-310	40	1	in	in	ADP
ijassa-310	40	2	this	this	DET
ijassa-310	40	3	work	work	NOUN
ijassa-310	40	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	40	5	we	we	PRON
ijassa-310	40	6	identify	identify	VERB
ijassa-310	40	7	the	the	DET
ijassa-310	40	8	logical	logical	ADJ
ijassa-310	40	9	structure	structure	NOUN
ijassa-310	40	10	of	of	ADP
ijassa-310	40	11	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	40	12	-	-	PUNCT
ijassa-310	40	13	related	relate	VERB
ijassa-310	40	14	genome	genome	NOUN
ijassa-310	40	15	using	use	VERB
ijassa-310	40	16	lapp	lapp	NOUN
ijassa-310	40	17	method	method	NOUN
ijassa-310	40	18	based	base	VERB
ijassa-310	40	19	on	on	ADP
ijassa-310	40	20	the	the	DET
ijassa-310	40	21	data	datum	NOUN
ijassa-310	40	22	of	of	ADP
ijassa-310	40	23	gene	gene	NOUN
ijassa-310	40	24	expression	expression	NOUN
ijassa-310	40	25	profile	profile	NOUN
ijassa-310	40	26	.	.	PUNCT
ijassa-310	41	1	we	we	PRON
ijassa-310	41	2	entitle	entitle	VERB
ijassa-310	41	3	the	the	DET
ijassa-310	41	4	sample	sample	NOUN
ijassa-310	41	5	data	datum	NOUN
ijassa-310	41	6	of	of	ADP
ijassa-310	41	7	gene	gene	NOUN
ijassa-310	41	8	obtained	obtain	VERB
ijassa-310	41	9	in	in	ADP
ijassa-310	41	10	many	many	ADJ
ijassa-310	41	11	different	different	ADJ
ijassa-310	41	12	experiments	experiment	NOUN
ijassa-310	41	13	as	as	ADP
ijassa-310	41	14	its	its	PRON
ijassa-310	41	15	expression	expression	NOUN
ijassa-310	41	16	profile	profile	NOUN
ijassa-310	41	17	.	.	PUNCT
ijassa-310	42	1	for	for	ADP
ijassa-310	42	2	the	the	DET
ijassa-310	42	3	convenience	convenience	NOUN
ijassa-310	42	4	of	of	ADP
ijassa-310	42	5	writing	writing	NOUN
ijassa-310	42	6	and	and	CCONJ
ijassa-310	42	7	computing	computing	NOUN
ijassa-310	42	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	42	9	we	we	PRON
ijassa-310	42	10	also	also	ADV
ijassa-310	42	11	denote	denote	VERB
ijassa-310	42	12	the	the	DET
ijassa-310	42	13	sample	sample	NOUN
ijassa-310	42	14	data	datum	NOUN
ijassa-310	42	15	by	by	ADP
ijassa-310	42	16	the	the	DET
ijassa-310	42	17	genes	gene	NOUN
ijassa-310	42	18	.	.	PUNCT
ijassa-310	43	1	for	for	ADP
ijassa-310	43	2	example	example	NOUN
ijassa-310	43	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	43	4	the	the	DET
ijassa-310	43	5	logic	logic	NOUN
ijassa-310	43	6	of	of	ADP
ijassa-310	43	7	genes	gene	NOUN
ijassa-310	43	8	a	a	PRON
ijassa-310	43	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	43	10	b	b	NOUN
ijassa-310	43	11	indicates	indicate	VERB
ijassa-310	43	12	the	the	DET
ijassa-310	43	13	logical	logical	ADJ
ijassa-310	43	14	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	43	15	of	of	ADP
ijassa-310	43	16	expression	expression	NOUN
ijassa-310	43	17	data	datum	NOUN
ijassa-310	43	18	of	of	ADP
ijassa-310	43	19	genes	gene	NOUN
ijassa-310	43	20	a	a	DET
ijassa-310	43	21	and	and	CCONJ
ijassa-310	43	22	b.	b.	PROPN
ijassa-310	43	23	lapp	lapp	PROPN
ijassa-310	43	24	method	method	NOUN
ijassa-310	43	25	is	be	AUX
ijassa-310	43	26	determining	determine	VERB
ijassa-310	43	27	the	the	DET
ijassa-310	43	28	logical	logical	ADJ
ijassa-310	43	29	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	43	30	of	of	ADP
ijassa-310	43	31	1-	1-	PROPN
ijassa-310	43	32	,	,	PUNCT
ijassa-310	43	33	2-	2-	NOUN
ijassa-310	43	34	,	,	PUNCT
ijassa-310	43	35	and	and	CCONJ
ijassa-310	43	36	3	3	NUM
ijassa-310	43	37	-	-	PUNCT
ijassa-310	43	38	order	order	NOUN
ijassa-310	43	39	by	by	ADP
ijassa-310	43	40	calculating	calculate	VERB
ijassa-310	43	41	the	the	DET
ijassa-310	43	42	uncertainty	uncertainty	NOUN
ijassa-310	43	43	coefficient	coefficient	NOUN
ijassa-310	43	44	(	(	PUNCT
ijassa-310	43	45	abbreviated	abbreviate	VERB
ijassa-310	43	46	as	as	ADP
ijassa-310	43	47	u	u	NOUN
ijassa-310	43	48	)	)	PUNCT
ijassa-310	43	49	of	of	ADP
ijassa-310	43	50	logical	logical	ADJ
ijassa-310	43	51	functions	function	NOUN
ijassa-310	43	52	of	of	ADP
ijassa-310	43	53	every	every	DET
ijassa-310	43	54	order	order	NOUN
ijassa-310	43	55	among	among	ADP
ijassa-310	43	56	the	the	DET
ijassa-310	43	57	genes	gene	NOUN
ijassa-310	43	58	based	base	VERB
ijassa-310	43	59	on	on	ADP
ijassa-310	43	60	the	the	DET
ijassa-310	43	61	expression	expression	NOUN
ijassa-310	43	62	profiles	profile	NOUN
ijassa-310	43	63	of	of	ADP
ijassa-310	43	64	genes	gene	NOUN
ijassa-310	43	65	.	.	PUNCT
ijassa-310	44	1	the	the	DET
ijassa-310	44	2	1	1	NUM
ijassa-310	44	3	-	-	PUNCT
ijassa-310	44	4	order	order	NOUN
ijassa-310	44	5	logical	logical	ADJ
ijassa-310	44	6	relationship	relationship	NOUN
ijassa-310	44	7	between	between	ADP
ijassa-310	44	8	genes	gene	NOUN
ijassa-310	44	9	a	a	PRON
ijassa-310	44	10	and	and	CCONJ
ijassa-310	44	11	b	b	NOUN
ijassa-310	44	12	is	be	AUX
ijassa-310	44	13	determined	determine	VERB
ijassa-310	44	14	as	as	SCONJ
ijassa-310	44	15	follows	follow	VERB
ijassa-310	44	16	:	:	PUNCT
ijassa-310	44	17			PROPN
ijassa-310	44	18			NOUN
ijassa-310	45	1			PROPN
ijassa-310	45	2			NOUN
ijassa-310	45	3			PUNCT
ijassa-310	45	4			NOUN
ijassa-310	45	5			NOUN
ijassa-310	46	1			PUNCT
ijassa-310	46	2			PROPN
ijassa-310	46	3			NOUN
ijassa-310	46	4			PROPN
ijassa-310	46	5	)	)	PUNCT
ijassa-310	46	6	(	(	PUNCT
ijassa-310	46	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	46	8	|	|	ADV
ijassa-310	46	9	11	11	NUM
ijassa-310	46	10	1	1	NUM
ijassa-310	46	11	bh	bh	NOUN
ijassa-310	46	12	afbhafhbh	afbhafhbh	NOUN
ijassa-310	46	13	afbu	afbu	PROPN
ijassa-310	46	14			PROPN
ijassa-310	46	15			PROPN
ijassa-310	46	16	,	,	PUNCT
ijassa-310	46	17	(	(	PUNCT
ijassa-310	46	18	1	1	X
ijassa-310	46	19	)	)	PUNCT
ijassa-310	46	20	where	where	SCONJ
ijassa-310	46	21	h	h	NOUN
ijassa-310	46	22	refers	refer	VERB
ijassa-310	46	23	to	to	ADP
ijassa-310	46	24	the	the	DET
ijassa-310	46	25	entropy	entropy	NOUN
ijassa-310	46	26	of	of	ADP
ijassa-310	46	27	the	the	DET
ijassa-310	46	28	individual	individual	ADJ
ijassa-310	46	29	or	or	CCONJ
ijassa-310	46	30	joint	joint	ADJ
ijassa-310	46	31	distributions	distribution	NOUN
ijassa-310	46	32	.	.	PUNCT
ijassa-310	46	33	)	)	PUNCT
ijassa-310	47	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	47	2	xyu	xyu	PROPN
ijassa-310	47	3	denotes	denote	VERB
ijassa-310	47	4	the	the	DET
ijassa-310	47	5	uncertainty	uncertainty	NOUN
ijassa-310	47	6	coefficient	coefficient	NOUN
ijassa-310	47	7	of	of	ADP
ijassa-310	47	8	the	the	DET
ijassa-310	47	9	influence	influence	NOUN
ijassa-310	47	10	of	of	ADP
ijassa-310	47	11	x	x	PUNCT
ijassa-310	47	12	on	on	ADP
ijassa-310	47	13	y	y	PROPN
ijassa-310	47	14	.	.	PUNCT
ijassa-310	48	1	the	the	DET
ijassa-310	48	2	size	size	NOUN
ijassa-310	48	3	of	of	ADP
ijassa-310	48	4	u	u	NOUN
ijassa-310	48	5	value	value	NOUN
ijassa-310	48	6	denotes	denote	VERB
ijassa-310	48	7	the	the	DET
ijassa-310	48	8	statistical	statistical	ADJ
ijassa-310	48	9	possibility	possibility	NOUN
ijassa-310	48	10	of	of	ADP
ijassa-310	48	11	the	the	DET
ijassa-310	48	12	uncertainty	uncertainty	NOUN
ijassa-310	48	13	logic	logic	NOUN
ijassa-310	48	14	of	of	ADP
ijassa-310	48	15	1	1	NUM
ijassa-310	48	16	-	-	PUNCT
ijassa-310	48	17	order	order	NOUN
ijassa-310	48	18	of	of	ADP
ijassa-310	48	19	x	x	PUNCT
ijassa-310	48	20	to	to	ADP
ijassa-310	48	21	y	y	PROPN
ijassa-310	48	22	.	.	PUNCT
ijassa-310	49	1	1f	1f	PROPN
ijassa-310	49	2	is	be	AUX
ijassa-310	49	3	one	one	NUM
ijassa-310	49	4	of	of	ADP
ijassa-310	49	5	the	the	DET
ijassa-310	49	6	proper	proper	ADJ
ijassa-310	49	7	functions	function	NOUN
ijassa-310	49	8	of	of	ADP
ijassa-310	49	9	1	1	NUM
ijassa-310	49	10	-	-	PUNCT
ijassa-310	49	11	order	order	NOUN
ijassa-310	49	12	logic	logic	NOUN
ijassa-310	49	13	of	of	ADP
ijassa-310	49	14	a	a	DET
ijassa-310	49	15	to	to	PART
ijassa-310	49	16	b.	b.	PROPN
ijassa-310	49	17	the	the	DET
ijassa-310	49	18	proper	proper	ADJ
ijassa-310	49	19	functions	function	NOUN
ijassa-310	49	20	of	of	ADP
ijassa-310	49	21	1	1	NUM
ijassa-310	49	22	-	-	PUNCT
ijassa-310	49	23	order	order	NOUN
ijassa-310	49	24	logic	logic	NOUN
ijassa-310	49	25	are	be	AUX
ijassa-310	49	26	divided	divide	VERB
ijassa-310	49	27	into	into	ADP
ijassa-310	49	28	two	two	NUM
ijassa-310	49	29	types	type	NOUN
ijassa-310	49	30	(	(	PUNCT
ijassa-310	49	31	table	table	NOUN
ijassa-310	49	32	1	1	NUM
ijassa-310	49	33	):	):	PUNCT
ijassa-310	49	34	ab	ab	PROPN
ijassa-310	49	35			PROPN
ijassa-310	49	36	,	,	PUNCT
ijassa-310	49	37	namely	namely	ADV
ijassa-310	49	38	,	,	PUNCT
ijassa-310	49	39	the	the	DET
ijassa-310	49	40	presence	presence	NOUN
ijassa-310	49	41	of	of	ADP
ijassa-310	49	42	a	a	DET
ijassa-310	49	43	leads	lead	NOUN
ijassa-310	49	44	to	to	ADP
ijassa-310	49	45	the	the	DET
ijassa-310	49	46	presence	presence	NOUN
ijassa-310	49	47	of	of	ADP
ijassa-310	49	48	b	b	PROPN
ijassa-310	49	49	,	,	PUNCT
ijassa-310	49	50	which	which	PRON
ijassa-310	49	51	is	be	AUX
ijassa-310	49	52	called	call	VERB
ijassa-310	49	53	the	the	DET
ijassa-310	49	54	synchronization	synchronization	NOUN
ijassa-310	49	55	(	(	PUNCT
ijassa-310	49	56	equivalent	equivalent	ADJ
ijassa-310	49	57	with	with	ADP
ijassa-310	49	58	ab	ab	PROPN
ijassa-310	49	59			PROPN
ijassa-310	49	60	)	)	PUNCT
ijassa-310	49	61	;	;	PUNCT
ijassa-310	49	62	and	and	CCONJ
ijassa-310	49	63	ab	ab	PROPN
ijassa-310	49	64			PROPN
ijassa-310	49	65	,	,	PUNCT
ijassa-310	49	66	namely	namely	ADV
ijassa-310	49	67	,	,	PUNCT
ijassa-310	49	68	the	the	DET
ijassa-310	49	69	presence	presence	NOUN
ijassa-310	49	70	of	of	ADP
ijassa-310	49	71	a	a	DET
ijassa-310	49	72	leads	lead	NOUN
ijassa-310	49	73	to	to	ADP
ijassa-310	49	74	the	the	DET
ijassa-310	49	75	absence	absence	NOUN
ijassa-310	49	76	of	of	ADP
ijassa-310	49	77	b	b	NOUN
ijassa-310	49	78	,	,	PUNCT
ijassa-310	49	79	which	which	PRON
ijassa-310	49	80	is	be	AUX
ijassa-310	49	81	called	call	VERB
ijassa-310	49	82	the	the	DET
ijassa-310	49	83	asynchronization	asynchronization	NOUN
ijassa-310	49	84	(	(	PUNCT
ijassa-310	49	85	equivalent	equivalent	ADJ
ijassa-310	49	86	with	with	ADP
ijassa-310	49	87	ab	ab	PROPN
ijassa-310	49	88			PROPN
ijassa-310	49	89	)	)	PUNCT
ijassa-310	49	90	.	.	PUNCT
ijassa-310	50	1	table	table	NOUN
ijassa-310	50	2	1	1	NUM
ijassa-310	50	3	the	the	DET
ijassa-310	50	4	list	list	NOUN
ijassa-310	50	5	of	of	ADP
ijassa-310	50	6	the	the	DET
ijassa-310	50	7	proper	proper	ADJ
ijassa-310	50	8	functions	function	NOUN
ijassa-310	50	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	50	10	logic	logic	NOUN
ijassa-310	50	11	types	type	NOUN
ijassa-310	50	12	of	of	ADP
ijassa-310	50	13	1-	1-	NUM
ijassa-310	50	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	50	15	2	2	NUM
ijassa-310	50	16	-	-	PUNCT
ijassa-310	50	17	order	order	NOUN
ijassa-310	50	18	.	.	PUNCT
ijassa-310	51	1	obviously	obviously	ADV
ijassa-310	51	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	51	3	the	the	DET
ijassa-310	51	4	proper	proper	ADJ
ijassa-310	51	5	functions	function	NOUN
ijassa-310	51	6	of	of	ADP
ijassa-310	51	7	1	1	NUM
ijassa-310	51	8	-	-	PUNCT
ijassa-310	51	9	order	order	NOUN
ijassa-310	51	10	and	and	CCONJ
ijassa-310	51	11	logic	logic	NOUN
ijassa-310	51	12	types	type	NOUN
ijassa-310	51	13	are	be	AUX
ijassa-310	51	14	the	the	DET
ijassa-310	51	15	same	same	ADJ
ijassa-310	51	16	.	.	PUNCT
ijassa-310	52	1	order	order	VERB
ijassa-310	52	2	the	the	DET
ijassa-310	52	3	proper	proper	ADJ
ijassa-310	52	4	function	function	NOUN
ijassa-310	52	5	and	and	CCONJ
ijassa-310	52	6	its	its	PRON
ijassa-310	52	7	serial	serial	ADJ
ijassa-310	52	8	number	number	NOUN
ijassa-310	52	9	the	the	DET
ijassa-310	52	10	logic	logic	NOUN
ijassa-310	52	11	type	type	NOUN
ijassa-310	52	12	and	and	CCONJ
ijassa-310	52	13	its	its	PRON
ijassa-310	52	14	serial	serial	ADJ
ijassa-310	52	15	number	number	NOUN
ijassa-310	52	16	1	1	NUM
ijassa-310	52	17	-	-	PUNCT
ijassa-310	52	18	order	order	NOUN
ijassa-310	52	19	1．b	1．b	NOUN
ijassa-310	52	20	a	a	VERB
ijassa-310	52	21	1．b	1．b	NUM
ijassa-310	52	22	a	a	NOUN
ijassa-310	52	23	2．b	2．b	NUM
ijassa-310	52	24	a	a	PROPN
ijassa-310	52	25	2．b	2．b	NUM
ijassa-310	52	26	a	a	PROPN
ijassa-310	52	27	2	2	NUM
ijassa-310	52	28	-	-	PUNCT
ijassa-310	52	29	order	order	NOUN
ijassa-310	52	30	1．	1．	PROPN
ijassa-310	52	31	bac	bac	PROPN
ijassa-310	52	32			PROPN
ijassa-310	52	33	1．	1．	PROPN
ijassa-310	52	34	bac	bac	NOUN
ijassa-310	52	35			NOUN
ijassa-310	52	36	2．	2．	PROPN
ijassa-310	52	37	)	)	PUNCT
ijassa-310	53	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	53	2	bac	bac	NOUN
ijassa-310	53	3			X
ijassa-310	54	1	2．	2．	NUM
ijassa-310	54	2	)	)	PUNCT
ijassa-310	55	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	55	2	bac	bac	NOUN
ijassa-310	55	3			X
ijassa-310	56	1	3．	3．	NUM
ijassa-310	56	2	bac	bac	NOUN
ijassa-310	56	3			PROPN
ijassa-310	57	1	3．	3．	NUM
ijassa-310	57	2	bac	bac	PROPN
ijassa-310	57	3			PROPN
ijassa-310	57	4	4．	4．	PROPN
ijassa-310	57	5	)	)	PUNCT
ijassa-310	57	6	(	(	PUNCT
ijassa-310	57	7	bac	bac	NOUN
ijassa-310	57	8			PROPN
ijassa-310	57	9	4．	4．	PROPN
ijassa-310	57	10	)	)	PUNCT
ijassa-310	57	11	(	(	PUNCT
ijassa-310	57	12	bac	bac	NOUN
ijassa-310	57	13			PROPN
ijassa-310	57	14	5．	5．	NUM
ijassa-310	57	15	bac	bac	NOUN
ijassa-310	58	1			PROPN
ijassa-310	58	2	6．	6．	NUM
ijassa-310	58	3	bac	bac	NOUN
ijassa-310	58	4			X
ijassa-310	59	1	5．	5．	NUM
ijassa-310	59	2	bac	bac	NOUN
ijassa-310	59	3			PROPN
ijassa-310	59	4	bac	bac	PROPN
ijassa-310	60	1			X
ijassa-310	60	2	7．	7．	PROPN
ijassa-310	60	3	bac	bac	NOUN
ijassa-310	60	4			NUM
ijassa-310	60	5	8．	8．	PROPN
ijassa-310	60	6	bac	bac	NOUN
ijassa-310	60	7			PUNCT
ijassa-310	61	1	6．	6．	NUM
ijassa-310	61	2	bac	bac	NOUN
ijassa-310	61	3			NUM
ijassa-310	61	4	bac	bac	NOUN
ijassa-310	61	5			PROPN
ijassa-310	61	6	9．	9．	NOUN
ijassa-310	61	7	)	)	PUNCT
ijassa-310	61	8	(	(	PUNCT
ijassa-310	61	9	bac	bac	PROPN
ijassa-310	61	10			VERB
ijassa-310	61	11	7．	7．	PROPN
ijassa-310	61	12	)	)	PUNCT
ijassa-310	61	13	(	(	PUNCT
ijassa-310	61	14	bac	bac	PROPN
ijassa-310	61	15			VERB
ijassa-310	61	16	10．	10．	NUM
ijassa-310	61	17	bac	bac	NOUN
ijassa-310	61	18			PROPN
ijassa-310	61	19	8．	8．	PROPN
ijassa-310	61	20	bac	bac	NOUN
ijassa-310	61	21			PROPN
ijassa-310	61	22	similarly	similarly	ADV
ijassa-310	61	23	,	,	PUNCT
ijassa-310	61	24	the	the	DET
ijassa-310	61	25	expressions	expression	NOUN
ijassa-310	61	26	of	of	ADP
ijassa-310	61	27	2-	2-	PROPN
ijassa-310	61	28	,	,	PUNCT
ijassa-310	61	29	3	3	NUM
ijassa-310	61	30	-	-	PUNCT
ijassa-310	61	31	order	order	NOUN
ijassa-310	61	32	logics	logic	NOUN
ijassa-310	61	33	are	be	AUX
ijassa-310	61	34	as	as	SCONJ
ijassa-310	61	35	follows	follow	VERB
ijassa-310	61	36	:	:	PUNCT
ijassa-310	61	37			PROPN
ijassa-310	61	38			NOUN
ijassa-310	62	1			PROPN
ijassa-310	62	2			NOUN
ijassa-310	62	3			PUNCT
ijassa-310	62	4			NOUN
ijassa-310	62	5			NOUN
ijassa-310	62	6			PUNCT
ijassa-310	62	7			PROPN
ijassa-310	63	1			NOUN
ijassa-310	63	2			PROPN
ijassa-310	63	3			PROPN
ijassa-310	63	4	ch	ch	NOUN
ijassa-310	63	5	bafchbafhch	bafchbafhch	NOUN
ijassa-310	63	6	bafcu	bafcu	VERB
ijassa-310	63	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	63	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	63	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	63	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	63	11	|	|	ADV
ijassa-310	63	12	22	22	NUM
ijassa-310	63	13	2	2	NUM
ijassa-310	63	14			PROPN
ijassa-310	63	15			NOUN
ijassa-310	63	16	,	,	PUNCT
ijassa-310	63	17	(	(	PUNCT
ijassa-310	63	18	2	2	NUM
ijassa-310	63	19	)	)	PUNCT
ijassa-310	63	20			NOUN
ijassa-310	63	21			NOUN
ijassa-310	64	1			PUNCT
ijassa-310	64	2			NOUN
ijassa-310	64	3			PUNCT
ijassa-310	64	4			NOUN
ijassa-310	64	5			NOUN
ijassa-310	65	1			PUNCT
ijassa-310	65	2			PROPN
ijassa-310	65	3			NOUN
ijassa-310	66	1			PROPN
ijassa-310	66	2			PROPN
ijassa-310	66	3	dh	dh	X
ijassa-310	66	4	cbafchcbafhdh	cbafchcbafhdh	ADJ
ijassa-310	66	5	cbafdu	cbafdu	ADJ
ijassa-310	66	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	66	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	66	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	66	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	66	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	66	11	,	,	PUNCT
ijassa-310	66	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	66	13	|	|	ADV
ijassa-310	66	14	33	33	NUM
ijassa-310	66	15	3	3	NUM
ijassa-310	66	16			PROPN
ijassa-310	66	17			NOUN
ijassa-310	66	18	,	,	PUNCT
ijassa-310	66	19	(	(	PUNCT
ijassa-310	66	20	3	3	X
ijassa-310	66	21	)	)	PUNCT
ijassa-310	66	22	where	where	SCONJ
ijassa-310	66	23	32	32	NUM
ijassa-310	66	24	,	,	PUNCT
ijassa-310	66	25	ff	ff	NOUN
ijassa-310	66	26	are	be	AUX
ijassa-310	66	27	one	one	NUM
ijassa-310	66	28	of	of	ADP
ijassa-310	66	29	the	the	DET
ijassa-310	66	30	proper	proper	ADJ
ijassa-310	66	31	functions	function	NOUN
ijassa-310	66	32	of	of	ADP
ijassa-310	66	33	2-	2-	NUM
ijassa-310	66	34	,	,	PUNCT
ijassa-310	66	35	3	3	NUM
ijassa-310	66	36	-	-	PUNCT
ijassa-310	66	37	order	order	NOUN
ijassa-310	66	38	logics	logic	NOUN
ijassa-310	66	39	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	66	40	.	.	PUNCT
ijassa-310	67	1	the	the	DET
ijassa-310	67	2	logics	logic	NOUN
ijassa-310	67	3	of	of	ADP
ijassa-310	67	4	190	190	NUM
ijassa-310	67	5	xu	xu	NUM
ijassa-310	67	6	:	:	PUNCT
ijassa-310	67	7	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	67	8	for	for	ADP
ijassa-310	67	9	gene	gene	NOUN
ijassa-310	67	10	networks	network	NOUN
ijassa-310	67	11	of	of	ADP
ijassa-310	67	12	colon	colon	NOUN
ijassa-310	67	13	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	67	14	based	base	VERB
ijassa-310	67	15	on	on	ADP
ijassa-310	67	16	logical	logical	ADJ
ijassa-310	67	17	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	67	18	190	190	NUM
ijassa-310	67	19	xu	xu	NUM
ijassa-310	67	20	:	:	PUNCT
ijassa-310	67	21	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	67	22	for	for	ADP
ijassa-310	67	23	gene	gene	NOUN
ijassa-310	67	24	networks	network	NOUN
ijassa-310	67	25	of	of	ADP
ijassa-310	67	26	colon	colon	NOUN
ijassa-310	67	27	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	67	28	based	base	VERB
ijassa-310	67	29	on	on	ADP
ijassa-310	67	30	logical	logical	ADJ
ijassa-310	67	31	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	67	32	190	190	NUM
ijassa-310	67	33	xu	xu	NUM
ijassa-310	67	34	:	:	PUNCT
ijassa-310	67	35	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	67	36	for	for	ADP
ijassa-310	67	37	gene	gene	NOUN
ijassa-310	67	38	networks	network	NOUN
ijassa-310	67	39	of	of	ADP
ijassa-310	67	40	colon	colon	NOUN
ijassa-310	67	41	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	67	42	based	base	VERB
ijassa-310	67	43	on	on	ADP
ijassa-310	67	44	logical	logical	ADJ
ijassa-310	67	45	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	67	46	190	190	NUM
ijassa-310	67	47	xu	xu	NUM
ijassa-310	67	48	:	:	PUNCT
ijassa-310	67	49	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	67	50	for	for	ADP
ijassa-310	67	51	gene	gene	NOUN
ijassa-310	67	52	networks	network	NOUN
ijassa-310	67	53	of	of	ADP
ijassa-310	67	54	colon	colon	NOUN
ijassa-310	67	55	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	67	56	based	base	VERB
ijassa-310	67	57	on	on	ADP
ijassa-310	67	58	logical	logical	ADJ
ijassa-310	67	59	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	67	60	190	190	NUM
ijassa-310	67	61	xu	xu	NUM
ijassa-310	67	62	:	:	PUNCT
ijassa-310	67	63	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	67	64	for	for	ADP
ijassa-310	67	65	gene	gene	NOUN
ijassa-310	67	66	networks	network	NOUN
ijassa-310	67	67	of	of	ADP
ijassa-310	67	68	colon	colon	NOUN
ijassa-310	67	69	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	67	70	based	base	VERB
ijassa-310	67	71	on	on	ADP
ijassa-310	67	72	logical	logical	ADJ
ijassa-310	67	73	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	67	74	http://www.iciba.com/expression/	http://www.iciba.com/expression/	NOUN
ijassa-310	67	75	191	191	NUM
ijassa-310	67	76	2	2	NUM
ijassa-310	67	77	-	-	PUNCT
ijassa-310	67	78	order	order	NOUN
ijassa-310	67	79	among	among	ADP
ijassa-310	67	80	a	a	DET
ijassa-310	67	81	,	,	PUNCT
ijassa-310	67	82	b	b	PROPN
ijassa-310	67	83	and	and	CCONJ
ijassa-310	67	84	c	c	PROPN
ijassa-310	67	85	contain	contain	VERB
ijassa-310	67	86	10	10	NUM
ijassa-310	67	87	proper	proper	ADJ
ijassa-310	67	88	functions	function	NOUN
ijassa-310	67	89	and	and	CCONJ
ijassa-310	67	90	8	8	NUM
ijassa-310	67	91	logic	logic	NOUN
ijassa-310	67	92	types	type	NOUN
ijassa-310	67	93	(	(	PUNCT
ijassa-310	67	94	table	table	NOUN
ijassa-310	67	95	1	1	NUM
ijassa-310	67	96	)	)	PUNCT
ijassa-310	67	97	.	.	PUNCT
ijassa-310	68	1	the	the	DET
ijassa-310	68	2	logics	logic	NOUN
ijassa-310	68	3	of	of	ADP
ijassa-310	68	4	3	3	NUM
ijassa-310	68	5	-	-	PUNCT
ijassa-310	68	6	order	order	NOUN
ijassa-310	68	7	among	among	ADP
ijassa-310	68	8	a	a	DET
ijassa-310	68	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	68	10	b	b	NOUN
ijassa-310	68	11	,	,	PUNCT
ijassa-310	68	12	c	c	PROPN
ijassa-310	68	13	and	and	CCONJ
ijassa-310	68	14	d	d	NOUN
ijassa-310	68	15	contain	contain	VERB
ijassa-310	68	16	218	218	NUM
ijassa-310	68	17	proper	proper	ADJ
ijassa-310	68	18	functions	function	NOUN
ijassa-310	68	19	and	and	CCONJ
ijassa-310	68	20	68	68	NUM
ijassa-310	68	21	logic	logic	NOUN
ijassa-310	68	22	types	type	NOUN
ijassa-310	68	23	.	.	PUNCT
ijassa-310	69	1	of	of	ADP
ijassa-310	69	2	course	course	NOUN
ijassa-310	69	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	69	4	the	the	DET
ijassa-310	69	5	higher	high	ADJ
ijassa-310	69	6	order	order	NOUN
ijassa-310	69	7	logics	logic	NOUN
ijassa-310	69	8	can	can	AUX
ijassa-310	69	9	be	be	AUX
ijassa-310	69	10	calculated	calculate	VERB
ijassa-310	69	11	,	,	PUNCT
ijassa-310	69	12	but	but	CCONJ
ijassa-310	69	13	the	the	DET
ijassa-310	69	14	complexities	complexity	NOUN
ijassa-310	69	15	are	be	AUX
ijassa-310	69	16	higher	high	ADJ
ijassa-310	69	17	.	.	PUNCT
ijassa-310	70	1	in	in	ADP
ijassa-310	70	2	this	this	DET
ijassa-310	70	3	research	research	NOUN
ijassa-310	70	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	70	5	we	we	PRON
ijassa-310	70	6	only	only	ADV
ijassa-310	70	7	consider	consider	VERB
ijassa-310	70	8	1-	1-	NUM
ijassa-310	70	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	70	10	2-	2-	NOUN
ijassa-310	70	11	,	,	PUNCT
ijassa-310	70	12	and	and	CCONJ
ijassa-310	70	13	3	3	NUM
ijassa-310	70	14	-	-	PUNCT
ijassa-310	70	15	order	order	NOUN
ijassa-310	70	16	boolean	boolean	ADJ
ijassa-310	70	17	logics	logic	NOUN
ijassa-310	70	18	among	among	ADP
ijassa-310	70	19	genes	gene	NOUN
ijassa-310	70	20	.	.	PUNCT
ijassa-310	71	1	the	the	DET
ijassa-310	71	2	detailed	detailed	ADJ
ijassa-310	71	3	can	can	AUX
ijassa-310	71	4	be	be	AUX
ijassa-310	71	5	found	find	VERB
ijassa-310	71	6	in	in	ADP
ijassa-310	71	7	references	reference	NOUN
ijassa-310	71	8	[	[	X
ijassa-310	71	9	15]-[17	15]-[17	X
ijassa-310	71	10	]	]	PUNCT
ijassa-310	71	11	.	.	PUNCT
ijassa-310	72	1	3	3	X
ijassa-310	72	2	.	.	X
ijassa-310	72	3	data	datum	NOUN
ijassa-310	72	4	source	source	NOUN
ijassa-310	72	5	and	and	CCONJ
ijassa-310	72	6	processing	process	VERB
ijassa-310	72	7	3.1	3.1	NUM
ijassa-310	72	8	data	datum	NOUN
ijassa-310	72	9	source	source	NOUN
ijassa-310	72	10	national	national	ADJ
ijassa-310	72	11	center	center	NOUN
ijassa-310	72	12	for	for	ADP
ijassa-310	72	13	biotechnology	biotechnology	NOUN
ijassa-310	72	14	information	information	NOUN
ijassa-310	72	15	(	(	PUNCT
ijassa-310	72	16	ncbi	ncbi	NOUN
ijassa-310	72	17	)	)	PUNCT
ijassa-310	72	18	and	and	CCONJ
ijassa-310	72	19	the	the	DET
ijassa-310	72	20	european	european	PROPN
ijassa-310	72	21	bioinformatics	bioinformatics	PROPN
ijassa-310	72	22	institute	institute	PROPN
ijassa-310	72	23	(	(	PUNCT
ijassa-310	72	24	embl	embl	PROPN
ijassa-310	72	25	-	-	PUNCT
ijassa-310	72	26	ebi	ebi	PROPN
ijassa-310	72	27	)	)	PUNCT
ijassa-310	72	28	provide	provide	VERB
ijassa-310	72	29	the	the	DET
ijassa-310	72	30	database	database	NOUN
ijassa-310	72	31	generally	generally	ADV
ijassa-310	72	32	used	use	VERB
ijassa-310	72	33	in	in	ADP
ijassa-310	72	34	field	field	NOUN
ijassa-310	72	35	of	of	ADP
ijassa-310	72	36	bioinformations	bioinformation	NOUN
ijassa-310	72	37	.	.	PUNCT
ijassa-310	73	1	for	for	ADP
ijassa-310	73	2	description	description	NOUN
ijassa-310	73	3	convenience	convenience	NOUN
ijassa-310	73	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	73	5	we	we	PRON
ijassa-310	73	6	refer	refer	VERB
ijassa-310	73	7	to	to	ADP
ijassa-310	73	8	the	the	DET
ijassa-310	73	9	sample	sample	NOUN
ijassa-310	73	10	data	datum	NOUN
ijassa-310	73	11	of	of	ADP
ijassa-310	73	12	stage	stage	NOUN
ijassa-310	73	13	a	a	DET
ijassa-310	73	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	73	15	b	b	NOUN
ijassa-310	73	16	and	and	CCONJ
ijassa-310	73	17	c	c	PROPN
ijassa-310	73	18	of	of	ADP
ijassa-310	73	19	colon	colon	NOUN
ijassa-310	73	20	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	73	21	as	as	ADP
ijassa-310	73	22	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	73	23	groups	group	NOUN
ijassa-310	73	24	,	,	PUNCT
ijassa-310	73	25	normal	normal	ADJ
ijassa-310	73	26	stage	stage	NOUN
ijassa-310	73	27	as	as	ADP
ijassa-310	73	28	control	control	NOUN
ijassa-310	73	29	group	group	NOUN
ijassa-310	73	30	.	.	PUNCT
ijassa-310	74	1	the	the	DET
ijassa-310	74	2	sample	sample	NOUN
ijassa-310	74	3	data	data	NOUN
ijassa-310	74	4	is	be	AUX
ijassa-310	74	5	selected	select	VERB
ijassa-310	74	6	from	from	ADP
ijassa-310	74	7	gpl570	gpl570	NOUN
ijassa-310	74	8	in	in	ADP
ijassa-310	74	9	ncbi	ncbi	NOUN
ijassa-310	74	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	75	1	the	the	DET
ijassa-310	75	2	sample	sample	NOUN
ijassa-310	75	3	numbers	number	NOUN
ijassa-310	75	4	of	of	ADP
ijassa-310	75	5	stage	stage	NOUN
ijassa-310	75	6	a	a	DET
ijassa-310	75	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	75	8	b	b	NOUN
ijassa-310	75	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	75	10	c	c	PROPN
ijassa-310	75	11	are	be	AUX
ijassa-310	75	12	39	39	NUM
ijassa-310	75	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	75	14	103	103	NUM
ijassa-310	75	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	75	16	and	and	CCONJ
ijassa-310	75	17	92	92	NUM
ijassa-310	75	18	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	75	19	.	.	PUNCT
ijassa-310	76	1	they	they	PRON
ijassa-310	76	2	are	be	AUX
ijassa-310	76	3	all	all	ADV
ijassa-310	76	4	from	from	ADP
ijassa-310	76	5	gse2109	gse2109	NOUN
ijassa-310	76	6	in	in	ADP
ijassa-310	76	7	gpl570	gpl570	NOUN
ijassa-310	76	8	.	.	PUNCT
ijassa-310	77	1	the	the	DET
ijassa-310	77	2	53	53	NUM
ijassa-310	77	3	samples	sample	NOUN
ijassa-310	77	4	of	of	ADP
ijassa-310	77	5	normal	normal	ADJ
ijassa-310	77	6	stage	stage	NOUN
ijassa-310	77	7	consist	consist	NOUN
ijassa-310	77	8	of	of	ADP
ijassa-310	77	9	10	10	NUM
ijassa-310	77	10	samples	sample	NOUN
ijassa-310	77	11	of	of	ADP
ijassa-310	77	12	gds2609	gds2609	NOUN
ijassa-310	77	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	77	14	11	11	NUM
ijassa-310	77	15	samples	sample	NOUN
ijassa-310	77	16	of	of	ADP
ijassa-310	77	17	gse10715	gse10715	NOUN
ijassa-310	77	18	and	and	CCONJ
ijassa-310	77	19	32	32	NUM
ijassa-310	77	20	samples	sample	NOUN
ijassa-310	77	21	of	of	ADP
ijassa-310	77	22	gse8671	gse8671	NOUN
ijassa-310	77	23	.	.	PUNCT
ijassa-310	78	1	the	the	DET
ijassa-310	78	2	data	datum	NOUN
ijassa-310	78	3	mentioned	mention	VERB
ijassa-310	78	4	above	above	ADV
ijassa-310	78	5	include	include	VERB
ijassa-310	78	6	p_value	p_value	NOUN
ijassa-310	78	7	and	and	CCONJ
ijassa-310	78	8	p	p	PROPN
ijassa-310	78	9	-	-	PUNCT
ijassa-310	78	10	m	m	NOUN
ijassa-310	78	11	-	-	PUNCT
ijassa-310	78	12	a	a	NOUN
ijassa-310	78	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	78	14	where	where	SCONJ
ijassa-310	78	15	p	p	X
ijassa-310	78	16	,	,	PUNCT
ijassa-310	78	17	a	a	PRON
ijassa-310	78	18	and	and	CCONJ
ijassa-310	78	19	m	m	PROPN
ijassa-310	78	20	indicate	indicate	VERB
ijassa-310	78	21	presence	presence	NOUN
ijassa-310	78	22	,	,	PUNCT
ijassa-310	78	23	absence	absence	NOUN
ijassa-310	78	24	and	and	CCONJ
ijassa-310	78	25	margin	margin	VERB
ijassa-310	78	26	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	78	27	.	.	PUNCT
ijassa-310	79	1	we	we	PRON
ijassa-310	79	2	represent	represent	VERB
ijassa-310	79	3	p	p	NOUN
ijassa-310	79	4	with	with	ADP
ijassa-310	79	5	1	1	NUM
ijassa-310	79	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	79	7	a	a	PRON
ijassa-310	79	8	and	and	CCONJ
ijassa-310	79	9	m	m	VERB
ijassa-310	79	10	with	with	ADP
ijassa-310	79	11	0	0	NUM
ijassa-310	79	12	.	.	PUNCT
ijassa-310	80	1	every	every	DET
ijassa-310	80	2	sample	sample	NOUN
ijassa-310	80	3	database	database	NOUN
ijassa-310	80	4	includes	include	VERB
ijassa-310	80	5	p_values	p_value	NOUN
ijassa-310	80	6	and	and	CCONJ
ijassa-310	80	7	0	0	NUM
ijassa-310	80	8	-	-	SYM
ijassa-310	80	9	1	1	NUM
ijassa-310	80	10	expression	expression	NOUN
ijassa-310	80	11	profiles	profile	NOUN
ijassa-310	80	12	of	of	ADP
ijassa-310	80	13	20827	20827	NUM
ijassa-310	80	14	genes	gene	NOUN
ijassa-310	80	15	of	of	ADP
ijassa-310	80	16	human	human	NOUN
ijassa-310	80	17	(	(	PUNCT
ijassa-310	80	18	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	80	19	to	to	ADP
ijassa-310	80	20	54676	54676	NUM
ijassa-310	80	21	probes	probe	NOUN
ijassa-310	80	22	)	)	PUNCT
ijassa-310	80	23	.	.	PUNCT
ijassa-310	81	1	the	the	DET
ijassa-310	81	2	four	four	NUM
ijassa-310	81	3	databases	database	NOUN
ijassa-310	81	4	(	(	PUNCT
ijassa-310	81	5	normal	normal	ADJ
ijassa-310	81	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	81	7	stage	stage	NOUN
ijassa-310	81	8	a	a	DET
ijassa-310	81	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	81	10	b	b	NOUN
ijassa-310	81	11	and	and	CCONJ
ijassa-310	81	12	c	c	X
ijassa-310	81	13	)	)	PUNCT
ijassa-310	81	14	mentioned	mention	VERB
ijassa-310	81	15	above	above	ADP
ijassa-310	81	16	form	form	VERB
ijassa-310	81	17	the	the	DET
ijassa-310	81	18	original	original	ADJ
ijassa-310	81	19	database	database	NOUN
ijassa-310	81	20	used	use	VERB
ijassa-310	81	21	in	in	ADP
ijassa-310	81	22	this	this	DET
ijassa-310	81	23	work	work	NOUN
ijassa-310	81	24	.	.	PUNCT
ijassa-310	82	1	3.2	3.2	NUM
ijassa-310	82	2	selection	selection	NOUN
ijassa-310	82	3	of	of	ADP
ijassa-310	82	4	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	82	5	-	-	PUNCT
ijassa-310	82	6	related	relate	VERB
ijassa-310	82	7	genes	gene	NOUN
ijassa-310	82	8	in	in	ADP
ijassa-310	82	9	the	the	DET
ijassa-310	82	10	original	original	ADJ
ijassa-310	82	11	database	database	NOUN
ijassa-310	82	12	mentioned	mention	VERB
ijassa-310	82	13	above	above	ADV
ijassa-310	82	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	82	15	every	every	DET
ijassa-310	82	16	database	database	NOUN
ijassa-310	82	17	includes	include	VERB
ijassa-310	82	18	the	the	DET
ijassa-310	82	19	sample	sample	NOUN
ijassa-310	82	20	data	datum	NOUN
ijassa-310	82	21	of	of	ADP
ijassa-310	82	22	more	more	ADJ
ijassa-310	82	23	than	than	ADP
ijassa-310	82	24	20,000	20,000	NUM
ijassa-310	82	25	genes	gene	NOUN
ijassa-310	82	26	of	of	ADP
ijassa-310	82	27	human	human	ADJ
ijassa-310	82	28	genome	genome	NOUN
ijassa-310	82	29	.	.	PUNCT
ijassa-310	83	1	to	to	PART
ijassa-310	83	2	construct	construct	VERB
ijassa-310	83	3	and	and	CCONJ
ijassa-310	83	4	analyze	analyze	VERB
ijassa-310	83	5	the	the	DET
ijassa-310	83	6	logical	logical	ADJ
ijassa-310	83	7	networks	network	NOUN
ijassa-310	83	8	of	of	ADP
ijassa-310	83	9	more	more	ADJ
ijassa-310	83	10	than	than	ADP
ijassa-310	83	11	20,000	20,000	NUM
ijassa-310	83	12	genes	gene	NOUN
ijassa-310	83	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	83	14	the	the	DET
ijassa-310	83	15	computational	computational	ADJ
ijassa-310	83	16	complexity	complexity	NOUN
ijassa-310	83	17	is	be	AUX
ijassa-310	83	18	so	so	ADV
ijassa-310	83	19	high	high	ADJ
ijassa-310	83	20	that	that	SCONJ
ijassa-310	83	21	it	it	PRON
ijassa-310	83	22	is	be	AUX
ijassa-310	83	23	beyond	beyond	ADP
ijassa-310	83	24	our	our	PRON
ijassa-310	83	25	computational	computational	ADJ
ijassa-310	83	26	ability	ability	NOUN
ijassa-310	83	27	.	.	PUNCT
ijassa-310	84	1	in	in	ADP
ijassa-310	84	2	order	order	NOUN
ijassa-310	84	3	to	to	PART
ijassa-310	84	4	simplify	simplify	VERB
ijassa-310	84	5	the	the	DET
ijassa-310	84	6	computation	computation	NOUN
ijassa-310	84	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	84	8	take	take	VERB
ijassa-310	84	9	the	the	DET
ijassa-310	84	10	genes	gene	NOUN
ijassa-310	84	11	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	84	12	to	to	ADP
ijassa-310	84	13	801	801	NUM
ijassa-310	84	14	probes	probe	NOUN
ijassa-310	84	15	into	into	ADP
ijassa-310	84	16	account	account	NOUN
ijassa-310	84	17	according	accord	VERB
ijassa-310	84	18	to	to	ADP
ijassa-310	84	19	the	the	DET
ijassa-310	84	20	known	know	VERB
ijassa-310	84	21	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	84	22	-	-	PUNCT
ijassa-310	84	23	related	relate	VERB
ijassa-310	84	24	genes	gene	NOUN
ijassa-310	84	25	[	[	X
ijassa-310	84	26	21	21	NUM
ijassa-310	84	27	]	]	PUNCT
ijassa-310	84	28	.	.	PUNCT
ijassa-310	85	1	if	if	SCONJ
ijassa-310	85	2	several	several	ADJ
ijassa-310	85	3	probes	probe	NOUN
ijassa-310	85	4	correspond	correspond	VERB
ijassa-310	85	5	to	to	ADP
ijassa-310	85	6	the	the	DET
ijassa-310	85	7	same	same	ADJ
ijassa-310	85	8	gene	gene	NOUN
ijassa-310	85	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	85	10	then	then	ADV
ijassa-310	85	11	we	we	PRON
ijassa-310	85	12	choose	choose	VERB
ijassa-310	85	13	the	the	DET
ijassa-310	85	14	data	datum	NOUN
ijassa-310	85	15	expressing	express	VERB
ijassa-310	85	16	the	the	DET
ijassa-310	85	17	most	most	ADJ
ijassa-310	85	18	in	in	ADP
ijassa-310	85	19	probes	probe	NOUN
ijassa-310	85	20	as	as	ADP
ijassa-310	85	21	the	the	DET
ijassa-310	85	22	expression	expression	NOUN
ijassa-310	85	23	profile	profile	NOUN
ijassa-310	85	24	data	datum	NOUN
ijassa-310	85	25	of	of	ADP
ijassa-310	85	26	the	the	DET
ijassa-310	85	27	gene	gene	NOUN
ijassa-310	85	28	.	.	PUNCT
ijassa-310	86	1	thus	thus	ADV
ijassa-310	86	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	86	3	286	286	NUM
ijassa-310	86	4	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	86	5	-	-	PUNCT
ijassa-310	86	6	related	relate	VERB
ijassa-310	86	7	genes	gene	NOUN
ijassa-310	86	8	in	in	ADP
ijassa-310	86	9	the	the	DET
ijassa-310	86	10	original	original	ADJ
ijassa-310	86	11	database	database	NOUN
ijassa-310	86	12	are	be	AUX
ijassa-310	86	13	obtained	obtain	VERB
ijassa-310	86	14	.	.	PUNCT
ijassa-310	87	1	because	because	SCONJ
ijassa-310	87	2	we	we	PRON
ijassa-310	87	3	are	be	AUX
ijassa-310	87	4	concerned	concerned	ADJ
ijassa-310	87	5	about	about	ADP
ijassa-310	87	6	the	the	DET
ijassa-310	87	7	structure	structure	NOUN
ijassa-310	87	8	of	of	ADP
ijassa-310	87	9	the	the	DET
ijassa-310	87	10	gene	gene	NOUN
ijassa-310	87	11	network	network	NOUN
ijassa-310	87	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	87	13	among	among	ADP
ijassa-310	87	14	these	these	DET
ijassa-310	87	15	286	286	NUM
ijassa-310	87	16	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	87	17	-	-	PUNCT
ijassa-310	87	18	related	relate	VERB
ijassa-310	87	19	genes	gene	NOUN
ijassa-310	87	20	,	,	PUNCT
ijassa-310	87	21	the	the	DET
ijassa-310	87	22	data	datum	NOUN
ijassa-310	87	23	almost	almost	ADV
ijassa-310	87	24	0	0	NUM
ijassa-310	87	25	or	or	CCONJ
ijassa-310	87	26	1	1	NUM
ijassa-310	87	27	contribute	contribute	VERB
ijassa-310	87	28	very	very	ADV
ijassa-310	87	29	little	little	ADJ
ijassa-310	87	30	to	to	ADP
ijassa-310	87	31	the	the	DET
ijassa-310	87	32	difference	difference	NOUN
ijassa-310	87	33	of	of	ADP
ijassa-310	87	34	the	the	DET
ijassa-310	87	35	network	network	NOUN
ijassa-310	87	36	structure	structure	NOUN
ijassa-310	87	37	.	.	PUNCT
ijassa-310	88	1	hence	hence	ADV
ijassa-310	88	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	88	3	we	we	PRON
ijassa-310	88	4	delete	delete	VERB
ijassa-310	88	5	these	these	DET
ijassa-310	88	6	genes	gene	NOUN
ijassa-310	88	7	in	in	ADP
ijassa-310	88	8	whose	whose	DET
ijassa-310	88	9	expression	expression	NOUN
ijassa-310	88	10	profile	profile	VERB
ijassa-310	88	11	the	the	DET
ijassa-310	88	12	numbers	number	NOUN
ijassa-310	88	13	of	of	ADP
ijassa-310	88	14	1	1	NUM
ijassa-310	88	15	are	be	AUX
ijassa-310	88	16	less	less	ADJ
ijassa-310	88	17	than	than	ADP
ijassa-310	88	18	15	15	NUM
ijassa-310	88	19	%	%	NOUN
ijassa-310	88	20	or	or	CCONJ
ijassa-310	88	21	more	more	ADJ
ijassa-310	88	22	than	than	ADP
ijassa-310	88	23	90	90	NUM
ijassa-310	88	24	%	%	NOUN
ijassa-310	88	25	.	.	PUNCT
ijassa-310	89	1	and	and	CCONJ
ijassa-310	89	2	then	then	ADV
ijassa-310	89	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	89	4	the	the	DET
ijassa-310	89	5	numbers	number	NOUN
ijassa-310	89	6	of	of	ADP
ijassa-310	89	7	the	the	DET
ijassa-310	89	8	remaining	remain	VERB
ijassa-310	89	9	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	89	10	-	-	PUNCT
ijassa-310	89	11	related	relate	VERB
ijassa-310	89	12	genes	gene	NOUN
ijassa-310	89	13	of	of	ADP
ijassa-310	89	14	these	these	DET
ijassa-310	89	15	four	four	NUM
ijassa-310	89	16	databases	database	NOUN
ijassa-310	89	17	is	be	AUX
ijassa-310	89	18	normal	normal	ADJ
ijassa-310	89	19	:	:	PUNCT
ijassa-310	89	20	91	91	NUM
ijassa-310	89	21	,	,	PUNCT
ijassa-310	89	22	stage	stage	VERB
ijassa-310	89	23	a	a	DET
ijassa-310	89	24	:	:	SYM
ijassa-310	89	25	79	79	NUM
ijassa-310	89	26	,	,	PUNCT
ijassa-310	89	27	b	b	NOUN
ijassa-310	89	28	:	:	PUNCT
ijassa-310	89	29	70	70	NUM
ijassa-310	89	30	,	,	PUNCT
ijassa-310	89	31	c	c	NOUN
ijassa-310	89	32	:	:	PUNCT
ijassa-310	89	33	60	60	NUM
ijassa-310	89	34	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	89	35	.	.	PUNCT
ijassa-310	90	1	after	after	ADP
ijassa-310	90	2	the	the	DET
ijassa-310	90	3	above	above	ADJ
ijassa-310	90	4	processing	processing	NOUN
ijassa-310	90	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	90	6	there	there	PRON
ijassa-310	90	7	are	be	VERB
ijassa-310	90	8	some	some	DET
ijassa-310	90	9	genes	gene	NOUN
ijassa-310	90	10	with	with	ADP
ijassa-310	90	11	the	the	DET
ijassa-310	90	12	same	same	ADJ
ijassa-310	90	13	0	0	NUM
ijassa-310	90	14	-	-	SYM
ijassa-310	90	15	1	1	NUM
ijassa-310	90	16	expression	expression	NOUN
ijassa-310	90	17	profiles	profile	NOUN
ijassa-310	90	18	,	,	PUNCT
ijassa-310	90	19	which	which	PRON
ijassa-310	90	20	contribute	contribute	VERB
ijassa-310	90	21	equally	equally	ADV
ijassa-310	90	22	the	the	DET
ijassa-310	90	23	construction	construction	NOUN
ijassa-310	90	24	of	of	ADP
ijassa-310	90	25	network	network	NOUN
ijassa-310	90	26	.	.	PUNCT
ijassa-310	91	1	hence	hence	ADV
ijassa-310	91	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	91	3	we	we	PRON
ijassa-310	91	4	preserve	preserve	VERB
ijassa-310	91	5	one	one	NUM
ijassa-310	91	6	of	of	ADP
ijassa-310	91	7	them	they	PRON
ijassa-310	91	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	91	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	91	10	delete	delete	VERB
ijassa-310	91	11	other	other	ADJ
ijassa-310	91	12	genes	gene	NOUN
ijassa-310	91	13	with	with	ADP
ijassa-310	91	14	the	the	DET
ijassa-310	91	15	same	same	ADJ
ijassa-310	91	16	expression	expression	NOUN
ijassa-310	91	17	profiles	profile	NOUN
ijassa-310	91	18	.	.	PUNCT
ijassa-310	92	1	thus	thus	ADV
ijassa-310	92	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	92	3	the	the	DET
ijassa-310	92	4	number	number	NOUN
ijassa-310	92	5	of	of	ADP
ijassa-310	92	6	genes	gene	NOUN
ijassa-310	92	7	in	in	ADP
ijassa-310	92	8	normal	normal	ADJ
ijassa-310	92	9	database	database	NOUN
ijassa-310	92	10	is	be	AUX
ijassa-310	92	11	reduced	reduce	VERB
ijassa-310	92	12	to	to	ADP
ijassa-310	92	13	79	79	NUM
ijassa-310	92	14	.	.	PUNCT
ijassa-310	93	1	after	after	ADP
ijassa-310	93	2	simplifying	simplify	VERB
ijassa-310	93	3	the	the	DET
ijassa-310	93	4	samples	sample	NOUN
ijassa-310	93	5	treated	treat	VERB
ijassa-310	93	6	as	as	ADP
ijassa-310	93	7	above	above	ADV
ijassa-310	93	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	93	9	the	the	DET
ijassa-310	93	10	obtained	obtain	VERB
ijassa-310	93	11	databases	database	NOUN
ijassa-310	93	12	are	be	AUX
ijassa-310	93	13	the	the	DET
ijassa-310	93	14	working	working	NOUN
ijassa-310	93	15	databases	database	NOUN
ijassa-310	93	16	.	.	PUNCT
ijassa-310	94	1	4	4	X
ijassa-310	94	2	.	.	NOUN
ijassa-310	94	3	numerical	numerical	ADJ
ijassa-310	94	4	experiments	experiment	NOUN
ijassa-310	94	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	94	6	methods	method	NOUN
ijassa-310	94	7	and	and	CCONJ
ijassa-310	94	8	results	result	VERB
ijassa-310	94	9	4.1	4.1	NUM
ijassa-310	94	10	determination	determination	NOUN
ijassa-310	94	11	of	of	ADP
ijassa-310	94	12	every	every	DET
ijassa-310	94	13	order	order	NOUN
ijassa-310	94	14	logics	logic	NOUN
ijassa-310	94	15	based	base	VERB
ijassa-310	94	16	on	on	ADP
ijassa-310	94	17	the	the	DET
ijassa-310	94	18	above	above	ADJ
ijassa-310	94	19	working	working	NOUN
ijassa-310	94	20	databases	database	NOUN
ijassa-310	94	21	,	,	PUNCT
ijassa-310	94	22	all	all	DET
ijassa-310	94	23	the	the	DET
ijassa-310	94	24	1	1	NUM
ijassa-310	94	25	-	-	PUNCT
ijassa-310	94	26	order	order	NOUN
ijassa-310	94	27	u	u	NOUN
ijassa-310	94	28	values	value	NOUN
ijassa-310	94	29	between	between	ADP
ijassa-310	94	30	genes	gene	NOUN
ijassa-310	94	31	are	be	AUX
ijassa-310	94	32	calculated	calculate	VERB
ijassa-310	94	33	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	94	34	by	by	ADP
ijassa-310	94	35	the	the	DET
ijassa-310	94	36	formula	formula	NOUN
ijassa-310	94	37	(	(	PUNCT
ijassa-310	94	38	1	1	NUM
ijassa-310	94	39	)	)	PUNCT
ijassa-310	94	40	.	.	PUNCT
ijassa-310	95	1	obviously	obviously	ADV
ijassa-310	95	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	95	3	there	there	PRON
ijassa-310	95	4	are	be	VERB
ijassa-310	95	5	1	1	NUM
ijassa-310	95	6	-	-	PUNCT
ijassa-310	95	7	order	order	NOUN
ijassa-310	95	8	u	u	NOUN
ijassa-310	95	9	values	value	NOUN
ijassa-310	95	10	of	of	ADP
ijassa-310	95	11	two	two	NUM
ijassa-310	95	12	directions	direction	NOUN
ijassa-310	95	13	between	between	ADP
ijassa-310	95	14	any	any	DET
ijassa-310	95	15	two	two	NUM
ijassa-310	95	16	genes	gene	NOUN
ijassa-310	95	17	,	,	PUNCT
ijassa-310	95	18	denoted	denote	VERB
ijassa-310	95	19	by	by	ADP
ijassa-310	95	20			NOUN
ijassa-310	95	21	abu	abu	ADV
ijassa-310	95	22	and	and	CCONJ
ijassa-310	95	23			NOUN
ijassa-310	95	24	bau	bau	PUNCT
ijassa-310	95	25	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	95	26	.	.	PUNCT
ijassa-310	96	1	if	if	SCONJ
ijassa-310	96	2	the	the	DET
ijassa-310	96	3	absolute	absolute	ADJ
ijassa-310	96	4	value	value	NOUN
ijassa-310	96	5	of	of	ADP
ijassa-310	96	6	the	the	DET
ijassa-310	96	7	ratio	ratio	NOUN
ijassa-310	96	8	of	of	ADP
ijassa-310	96	9	the	the	DET
ijassa-310	96	10	difference	difference	NOUN
ijassa-310	96	11	between	between	ADP
ijassa-310	96	12	the	the	DET
ijassa-310	96	13	two	two	NUM
ijassa-310	96	14	directions	direction	NOUN
ijassa-310	96	15	and	and	CCONJ
ijassa-310	96	16	the	the	DET
ijassa-310	96	17	average	average	ADJ
ijassa-310	96	18	value	value	NOUN
ijassa-310	96	19	is	be	AUX
ijassa-310	96	20	less	less	ADJ
ijassa-310	96	21	than	than	ADP
ijassa-310	96	22	advances	advance	NOUN
ijassa-310	96	23	in	in	ADP
ijassa-310	96	24	systems	system	NOUN
ijassa-310	96	25	science	science	NOUN
ijassa-310	96	26	and	and	CCONJ
ijassa-310	96	27	applications	application	NOUN
ijassa-310	96	28	(	(	PUNCT
ijassa-310	96	29	2011	2011	NUM
ijassa-310	96	30	)	)	PUNCT
ijassa-310	96	31	,	,	PUNCT
ijassa-310	96	32	vol	vol	NOUN
ijassa-310	96	33	.	.	PROPN
ijassa-310	97	1	11	11	NUM
ijassa-310	97	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	97	3	no	no	INTJ
ijassa-310	97	4	.	.	NOUN
ijassa-310	97	5	1	1	NUM
ijassa-310	97	6	-	-	SYM
ijassa-310	97	7	2	2	NUM
ijassa-310	97	8	http://www.iciba.com/contribute/	http://www.iciba.com/contribute/	ADP
ijassa-310	97	9	http://www.iciba.com/absolute%20value/	http://www.iciba.com/absolute%20value/	X
ijassa-310	97	10	http://www.iciba.com/less/	http://www.iciba.com/less/	X
ijassa-310	97	11	certain	certain	ADJ
ijassa-310	97	12	threshold	threshold	NOUN
ijassa-310	97	13	d	d	NOUN
ijassa-310	97	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	97	15	namely	namely	ADV
ijassa-310	97	16	,	,	PUNCT
ijassa-310	97	17			PROPN
ijassa-310	97	18			SYM
ijassa-310	97	19			NOUN
ijassa-310	97	20			SYM
ijassa-310	97	21			NOUN
ijassa-310	97	22			PUNCT
ijassa-310	97	23			NOUN
ijassa-310	97	24			PROPN
ijassa-310	97	25	2	2	NUM
ijassa-310	97	26	b	b	NOUN
ijassa-310	97	27	a	a	DET
ijassa-310	97	28	a	a	DET
ijassa-310	97	29	b	b	PROPN
ijassa-310	97	30	b	b	PROPN
ijassa-310	97	31	a	a	DET
ijassa-310	97	32	a	a	PRON
ijassa-310	97	33	b	b	X
ijassa-310	97	34	u	u	X
ijassa-310	97	35	u	u	NOUN
ijassa-310	97	36	d	d	X
ijassa-310	97	37	u	u	X
ijassa-310	97	38	u	u	PROPN
ijassa-310	97	39			PROPN
ijassa-310	97	40			PROPN
ijassa-310	97	41			ADV
ijassa-310	97	42	,	,	PUNCT
ijassa-310	97	43	then	then	ADV
ijassa-310	97	44	by	by	ADP
ijassa-310	97	45	the	the	DET
ijassa-310	97	46	certainty	certainty	NOUN
ijassa-310	97	47	of	of	ADP
ijassa-310	97	48	logical	logical	ADJ
ijassa-310	97	49	relationship	relationship	NOUN
ijassa-310	97	50	,	,	PUNCT
ijassa-310	97	51	there	there	PRON
ijassa-310	97	52	is	be	VERB
ijassa-310	97	53	not	not	PART
ijassa-310	97	54	1	1	NUM
ijassa-310	97	55	-	-	PUNCT
ijassa-310	97	56	order	order	NOUN
ijassa-310	97	57	logic	logic	NOUN
ijassa-310	97	58	between	between	ADP
ijassa-310	97	59	the	the	DET
ijassa-310	97	60	two	two	NUM
ijassa-310	97	61	genes	gene	NOUN
ijassa-310	97	62	.	.	PUNCT
ijassa-310	98	1	only	only	ADV
ijassa-310	98	2	when	when	SCONJ
ijassa-310	98	3			NOUN
ijassa-310	98	4			PROPN
ijassa-310	98	5			NOUN
ijassa-310	98	6			SYM
ijassa-310	98	7			NOUN
ijassa-310	98	8			PUNCT
ijassa-310	98	9			NOUN
ijassa-310	98	10			PROPN
ijassa-310	98	11	2	2	NUM
ijassa-310	98	12	b	b	NOUN
ijassa-310	98	13	a	a	DET
ijassa-310	98	14	a	a	DET
ijassa-310	98	15	b	b	PROPN
ijassa-310	98	16	b	b	PROPN
ijassa-310	98	17	a	a	DET
ijassa-310	98	18	a	a	PRON
ijassa-310	98	19	b	b	X
ijassa-310	98	20	u	u	X
ijassa-310	98	21	u	u	NOUN
ijassa-310	98	22	d	d	X
ijassa-310	98	23	u	u	X
ijassa-310	98	24	u	u	PROPN
ijassa-310	98	25			PROPN
ijassa-310	98	26			PROPN
ijassa-310	98	27			PUNCT
ijassa-310	98	28	and	and	CCONJ
ijassa-310	98	29	the	the	DET
ijassa-310	98	30	u	u	NOUN
ijassa-310	98	31	value	value	NOUN
ijassa-310	98	32	is	be	AUX
ijassa-310	98	33	greater	great	ADJ
ijassa-310	98	34	than	than	ADP
ijassa-310	98	35	1	1	NUM
ijassa-310	98	36	-	-	PUNCT
ijassa-310	98	37	order	order	NOUN
ijassa-310	98	38	threshold	threshold	NOUN
ijassa-310	98	39	,	,	PUNCT
ijassa-310	98	40	there	there	PRON
ijassa-310	98	41	is	be	VERB
ijassa-310	98	42	1	1	NUM
ijassa-310	98	43	-	-	PUNCT
ijassa-310	98	44	order	order	NOUN
ijassa-310	98	45	logic	logic	NOUN
ijassa-310	98	46	between	between	ADP
ijassa-310	98	47	genes	gene	NOUN
ijassa-310	98	48	a	a	PRON
ijassa-310	98	49	and	and	CCONJ
ijassa-310	98	50	b.	b.	PROPN
ijassa-310	99	1	if	if	SCONJ
ijassa-310	99	2			NOUN
ijassa-310	99	3			SYM
ijassa-310	99	4			NOUN
ijassa-310	100	1	baab	baab	INTJ
ijassa-310	100	2	uu	uu	INTJ
ijassa-310	101	1			INTJ
ijassa-310	101	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	101	3	then	then	ADV
ijassa-310	101	4	we	we	PRON
ijassa-310	101	5	consider	consider	VERB
ijassa-310	101	6	that	that	SCONJ
ijassa-310	101	7	a	a	DET
ijassa-310	101	8	regulates	regulate	VERB
ijassa-310	101	9	b	b	NOUN
ijassa-310	101	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	101	11	otherwise	otherwise	ADV
ijassa-310	101	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	101	13	b	b	PROPN
ijassa-310	101	14	regulates	regulate	VERB
ijassa-310	101	15	a.	a.	NOUN
ijassa-310	101	16	by	by	ADP
ijassa-310	101	17	the	the	DET
ijassa-310	101	18	formula	formula	NOUN
ijassa-310	101	19	(	(	PUNCT
ijassa-310	101	20	1	1	NUM
ijassa-310	101	21	)	)	PUNCT
ijassa-310	101	22	in	in	ADP
ijassa-310	101	23	the	the	DET
ijassa-310	101	24	algorithm	algorithm	NOUN
ijassa-310	101	25	of	of	ADP
ijassa-310	101	26	u	u	PROPN
ijassa-310	101	27	value	value	NOUN
ijassa-310	101	28	,	,	PUNCT
ijassa-310	101	29			PROPN
ijassa-310	101	30			PROPN
ijassa-310	101	31			NOUN
ijassa-310	101	32	a|ba|b	a|ba|b	NOUN
ijassa-310	101	33	uu	uu	PROPN
ijassa-310	101	34	,	,	PUNCT
ijassa-310	101	35	which	which	PRON
ijassa-310	101	36	means	mean	VERB
ijassa-310	101	37	that	that	SCONJ
ijassa-310	101	38	the	the	DET
ijassa-310	101	39	logic	logic	NOUN
ijassa-310	101	40	type	type	NOUN
ijassa-310	101	41	between	between	ADP
ijassa-310	101	42	a	a	PRON
ijassa-310	101	43	and	and	CCONJ
ijassa-310	101	44	b	b	NOUN
ijassa-310	101	45	might	might	AUX
ijassa-310	101	46	be	be	AUX
ijassa-310	101	47	ba	ba	NOUN
ijassa-310	101	48			PUNCT
ijassa-310	101	49	or	or	CCONJ
ijassa-310	101	50	ba	ba	PROPN
ijassa-310	101	51	.	.	PUNCT
ijassa-310	102	1	then	then	ADV
ijassa-310	102	2	we	we	PRON
ijassa-310	102	3	determine	determine	VERB
ijassa-310	102	4	the	the	DET
ijassa-310	102	5	logic	logic	NOUN
ijassa-310	102	6	type	type	NOUN
ijassa-310	102	7	between	between	ADP
ijassa-310	102	8	a	a	PRON
ijassa-310	102	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	102	10	b	b	NOUN
ijassa-310	102	11	according	accord	VERB
ijassa-310	102	12	to	to	ADP
ijassa-310	102	13	the	the	DET
ijassa-310	102	14	support	support	NOUN
ijassa-310	102	15	of	of	ADP
ijassa-310	102	16	ba	ba	PROPN
ijassa-310	102	17			PUNCT
ijassa-310	102	18	and	and	CCONJ
ijassa-310	102	19	ba	ba	PROPN
ijassa-310	102	20	,	,	PUNCT
ijassa-310	102	21	namely	namely	ADV
ijassa-310	102	22	,	,	PUNCT
ijassa-310	102	23	the	the	DET
ijassa-310	102	24	logic	logic	NOUN
ijassa-310	102	25	type	type	NOUN
ijassa-310	102	26	with	with	ADP
ijassa-310	102	27	greater	great	ADJ
ijassa-310	102	28	support	support	NOUN
ijassa-310	102	29	is	be	AUX
ijassa-310	102	30	the	the	DET
ijassa-310	102	31	one	one	NUM
ijassa-310	102	32	between	between	ADP
ijassa-310	102	33	a	a	PRON
ijassa-310	102	34	and	and	CCONJ
ijassa-310	102	35	b.	b.	PROPN
ijassa-310	102	36	here	here	ADV
ijassa-310	102	37	,	,	PUNCT
ijassa-310	102	38	the	the	DET
ijassa-310	102	39	support	support	NOUN
ijassa-310	102	40	refers	refer	VERB
ijassa-310	102	41	the	the	DET
ijassa-310	102	42	ratio	ratio	NOUN
ijassa-310	102	43	of	of	ADP
ijassa-310	102	44	the	the	DET
ijassa-310	102	45	number	number	NOUN
ijassa-310	102	46	of	of	ADP
ijassa-310	102	47	the	the	DET
ijassa-310	102	48	two	two	NUM
ijassa-310	102	49	states	state	NOUN
ijassa-310	102	50	being	be	AUX
ijassa-310	102	51	1	1	NUM
ijassa-310	102	52	in	in	ADP
ijassa-310	102	53	the	the	DET
ijassa-310	102	54	expression	expression	NOUN
ijassa-310	102	55	profile	profile	NOUN
ijassa-310	102	56	data	datum	NOUN
ijassa-310	102	57	of	of	ADP
ijassa-310	102	58	the	the	DET
ijassa-310	102	59	genes	gene	NOUN
ijassa-310	102	60	and	and	CCONJ
ijassa-310	102	61	the	the	DET
ijassa-310	102	62	total	total	ADJ
ijassa-310	102	63	number	number	NOUN
ijassa-310	102	64	of	of	ADP
ijassa-310	102	65	samples	sample	NOUN
ijassa-310	102	66	.	.	PUNCT
ijassa-310	103	1	for	for	ADP
ijassa-310	103	2	instance	instance	NOUN
ijassa-310	103	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	103	4	suppose	suppose	VERB
ijassa-310	103	5	the	the	DET
ijassa-310	103	6	expression	expression	NOUN
ijassa-310	103	7	profiles	profile	NOUN
ijassa-310	103	8	of	of	ADP
ijassa-310	103	9	the	the	DET
ijassa-310	103	10	genes	gene	NOUN
ijassa-310	103	11	m	m	VERB
ijassa-310	103	12	and	and	CCONJ
ijassa-310	103	13	n	n	PRON
ijassa-310	103	14	are	be	AUX
ijassa-310	103	15			PROPN
ijassa-310	103	16	0,0,0,1,1	0,0,0,1,1	NOUN
ijassa-310	103	17	and	and	CCONJ
ijassa-310	103	18			PROPN
ijassa-310	103	19	1,0,0,1,1	1,0,0,1,1	PUNCT
ijassa-310	103	20	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	103	21	,	,	PUNCT
ijassa-310	103	22	then	then	ADV
ijassa-310	103	23	the	the	DET
ijassa-310	103	24	supports	support	NOUN
ijassa-310	103	25	of	of	ADP
ijassa-310	103	26	logic	logic	NOUN
ijassa-310	103	27	type	type	NOUN
ijassa-310	103	28	m	m	PROPN
ijassa-310	103	29	=	=	NOUN
ijassa-310	103	30	n	n	NOUN
ijassa-310	103	31	and	and	CCONJ
ijassa-310	103	32	m=	m=	VERB
ijassa-310	103	33	n	n	NOUN
ijassa-310	103	34	are	be	AUX
ijassa-310	103	35	5	5	NUM
ijassa-310	103	36	2	2	NUM
ijassa-310	103	37	and	and	CCONJ
ijassa-310	103	38	5	5	NUM
ijassa-310	103	39	1	1	NUM
ijassa-310	103	40	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	103	41	.	.	PUNCT
ijassa-310	104	1	take	take	VERB
ijassa-310	104	2	the	the	DET
ijassa-310	104	3	threshold	threshold	NOUN
ijassa-310	104	4	of	of	ADP
ijassa-310	104	5	1	1	NUM
ijassa-310	104	6	-	-	PUNCT
ijassa-310	104	7	order	order	NOUN
ijassa-310	104	8	3.01	3.01	NUM
ijassa-310	104	9	u	u	NOUN
ijassa-310	104	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	104	11	then	then	ADV
ijassa-310	104	12	143.0)m|n()m|n	143.0)m|n()m|n	NUM
ijassa-310	104	13	(	(	PUNCT
ijassa-310	104	14	uuu	uuu	PROPN
ijassa-310	104	15			PROPN
ijassa-310	104	16	,	,	PUNCT
ijassa-310	104	17	the	the	DET
ijassa-310	104	18	support	support	NOUN
ijassa-310	104	19	m	m	NOUN
ijassa-310	104	20	=	=	NOUN
ijassa-310	104	21	n	n	X
ijassa-310	104	22	m=	m=	X
ijassa-310	104	23	n	n	CCONJ
ijassa-310	104	24	2	2	NUM
ijassa-310	104	25	1	1	NUM
ijassa-310	104	26	5	5	NUM
ijassa-310	104	27	5	5	NUM
ijassa-310	104	28	s	s	NOUN
ijassa-310	104	29	s	s	NOUN
ijassa-310	104	30			PROPN
ijassa-310	104	31			PROPN
ijassa-310	104	32			ADV
ijassa-310	104	33	,	,	PUNCT
ijassa-310	104	34	thus	thus	ADV
ijassa-310	104	35	we	we	PRON
ijassa-310	104	36	think	think	VERB
ijassa-310	104	37	the	the	DET
ijassa-310	104	38	logic	logic	ADJ
ijassa-310	104	39	type	type	NOUN
ijassa-310	104	40	of	of	ADP
ijassa-310	104	41	genes	gene	NOUN
ijassa-310	104	42	m	m	VERB
ijassa-310	104	43	and	and	CCONJ
ijassa-310	104	44	n	n	PROPN
ijassa-310	104	45	is	be	AUX
ijassa-310	104	46	m	m	NOUN
ijassa-310	104	47	=	=	NOUN
ijassa-310	104	48	n	n	NUM
ijassa-310	104	49	.	.	PUNCT
ijassa-310	105	1	the	the	DET
ijassa-310	105	2	proper	proper	ADJ
ijassa-310	105	3	functions	function	NOUN
ijassa-310	105	4	of	of	ADP
ijassa-310	105	5	2-	2-	NUM
ijassa-310	105	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	105	7	3	3	NUM
ijassa-310	105	8	-	-	PUNCT
ijassa-310	105	9	order	order	NOUN
ijassa-310	105	10	among	among	ADP
ijassa-310	105	11	genes	gene	NOUN
ijassa-310	105	12	in	in	ADP
ijassa-310	105	13	every	every	DET
ijassa-310	105	14	database	database	NOUN
ijassa-310	105	15	are	be	AUX
ijassa-310	105	16	determined	determine	VERB
ijassa-310	105	17	by	by	ADP
ijassa-310	105	18	the	the	DET
ijassa-310	105	19	formula	formula	NOUN
ijassa-310	105	20	(	(	PUNCT
ijassa-310	105	21	2	2	NUM
ijassa-310	105	22	)	)	PUNCT
ijassa-310	105	23	,	,	PUNCT
ijassa-310	105	24	(	(	PUNCT
ijassa-310	105	25	3	3	X
ijassa-310	105	26	)	)	PUNCT
ijassa-310	105	27	and	and	CCONJ
ijassa-310	105	28	the	the	DET
ijassa-310	105	29	support	support	NOUN
ijassa-310	105	30	.	.	PUNCT
ijassa-310	106	1	that	that	PRON
ijassa-310	106	2	is	be	AUX
ijassa-310	106	3	to	to	PART
ijassa-310	106	4	say	say	VERB
ijassa-310	106	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	6	for	for	ADP
ijassa-310	106	7	any	any	DET
ijassa-310	106	8	three	three	NUM
ijassa-310	106	9	genes	gene	NOUN
ijassa-310	106	10	a	a	DET
ijassa-310	106	11	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	12	b	b	PROPN
ijassa-310	106	13	and	and	CCONJ
ijassa-310	106	14	c	c	NOUN
ijassa-310	106	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	16	calculating	calculate	VERB
ijassa-310	106	17	the	the	DET
ijassa-310	106	18	u	u	PROPN
ijassa-310	106	19	values	value	NOUN
ijassa-310	106	20	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	106	21	to	to	ADP
ijassa-310	106	22	the	the	DET
ijassa-310	106	23	10	10	NUM
ijassa-310	106	24	proper	proper	ADJ
ijassa-310	106	25	functions	function	NOUN
ijassa-310	106	26	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	27	then	then	ADV
ijassa-310	106	28	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	29	the	the	DET
ijassa-310	106	30	function	function	NOUN
ijassa-310	106	31	2f	2f	NUM
ijassa-310	106	32	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	106	33	to	to	ADP
ijassa-310	106	34	the	the	DET
ijassa-310	106	35	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	106	36	u	u	NOUN
ijassa-310	106	37	value	value	NOUN
ijassa-310	106	38	is	be	AUX
ijassa-310	106	39	the	the	DET
ijassa-310	106	40	proper	proper	ADJ
ijassa-310	106	41	function	function	NOUN
ijassa-310	106	42	of	of	ADP
ijassa-310	106	43	a	a	DET
ijassa-310	106	44	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	45	b	b	NOUN
ijassa-310	106	46	to	to	ADP
ijassa-310	106	47	c.	c.	NOUN
ijassa-310	106	48	similarly	similarly	ADV
ijassa-310	106	49	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	50	for	for	ADP
ijassa-310	106	51	any	any	DET
ijassa-310	106	52	four	four	NUM
ijassa-310	106	53	genes	gene	NOUN
ijassa-310	106	54	a	a	PRON
ijassa-310	106	55	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	56	b	b	NOUN
ijassa-310	106	57	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	58	c	c	PROPN
ijassa-310	106	59	and	and	CCONJ
ijassa-310	106	60	d	d	PROPN
ijassa-310	106	61	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	62	calculating	calculate	VERB
ijassa-310	106	63	the	the	DET
ijassa-310	106	64	u	u	PROPN
ijassa-310	106	65	values	value	NOUN
ijassa-310	106	66	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	106	67	to	to	ADP
ijassa-310	106	68	the	the	DET
ijassa-310	106	69	218	218	NUM
ijassa-310	106	70	proper	proper	ADJ
ijassa-310	106	71	functions	function	NOUN
ijassa-310	106	72	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	73	then	then	ADV
ijassa-310	106	74	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	75	the	the	DET
ijassa-310	106	76	function	function	NOUN
ijassa-310	106	77	3f	3f	PROPN
ijassa-310	106	78	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	106	79	to	to	ADP
ijassa-310	106	80	the	the	DET
ijassa-310	106	81	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	106	82	u	u	NOUN
ijassa-310	106	83	value	value	NOUN
ijassa-310	106	84	is	be	AUX
ijassa-310	106	85	the	the	DET
ijassa-310	106	86	proper	proper	ADJ
ijassa-310	106	87	function	function	NOUN
ijassa-310	106	88	of	of	ADP
ijassa-310	106	89	a	a	DET
ijassa-310	106	90	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	91	b	b	NOUN
ijassa-310	106	92	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	93	c	c	PROPN
ijassa-310	106	94	and	and	CCONJ
ijassa-310	106	95	d.	d.	PROPN
ijassa-310	106	96	if	if	SCONJ
ijassa-310	106	97	the	the	DET
ijassa-310	106	98	u	u	PROPN
ijassa-310	106	99	values	value	VERB
ijassa-310	106	100	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	106	101	to	to	ADP
ijassa-310	106	102	several	several	ADJ
ijassa-310	106	103	proper	proper	ADJ
ijassa-310	106	104	functions	function	NOUN
ijassa-310	106	105	are	be	AUX
ijassa-310	106	106	the	the	DET
ijassa-310	106	107	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	106	108	value	value	NOUN
ijassa-310	106	109	,	,	PUNCT
ijassa-310	106	110	then	then	ADV
ijassa-310	106	111	take	take	VERB
ijassa-310	106	112	the	the	DET
ijassa-310	106	113	proper	proper	ADJ
ijassa-310	106	114	function	function	NOUN
ijassa-310	106	115	with	with	ADP
ijassa-310	106	116	greater	great	ADJ
ijassa-310	106	117	support	support	NOUN
ijassa-310	106	118	as	as	ADP
ijassa-310	106	119	the	the	DET
ijassa-310	106	120	one	one	NOUN
ijassa-310	106	121	among	among	ADP
ijassa-310	106	122	genes	gene	NOUN
ijassa-310	106	123	(	(	PUNCT
ijassa-310	106	124	similarly	similarly	ADV
ijassa-310	106	125	to	to	ADP
ijassa-310	106	126	determining	determine	VERB
ijassa-310	106	127	the	the	DET
ijassa-310	106	128	logic	logic	ADJ
ijassa-310	106	129	type	type	NOUN
ijassa-310	106	130	(	(	PUNCT
ijassa-310	106	131	or	or	CCONJ
ijassa-310	106	132	proper	proper	ADJ
ijassa-310	106	133	function	function	NOUN
ijassa-310	106	134	)	)	PUNCT
ijassa-310	106	135	of	of	ADP
ijassa-310	106	136	1	1	NUM
ijassa-310	106	137	-	-	PUNCT
ijassa-310	106	138	order	order	NOUN
ijassa-310	106	139	)	)	PUNCT
ijassa-310	106	140	.	.	PUNCT
ijassa-310	107	1	by	by	ADP
ijassa-310	107	2	the	the	DET
ijassa-310	107	3	above	above	ADJ
ijassa-310	107	4	numerical	numerical	ADJ
ijassa-310	107	5	calculation	calculation	NOUN
ijassa-310	107	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	107	7	the	the	DET
ijassa-310	107	8	complete	complete	ADJ
ijassa-310	107	9	directed	direct	VERB
ijassa-310	107	10	logical	logical	ADJ
ijassa-310	107	11	networks	network	NOUN
ijassa-310	107	12	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	107	13	to	to	ADP
ijassa-310	107	14	four	four	NUM
ijassa-310	107	15	databases	database	NOUN
ijassa-310	107	16	of	of	ADP
ijassa-310	107	17	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	107	18	and	and	CCONJ
ijassa-310	107	19	control	control	NOUN
ijassa-310	107	20	groups	group	NOUN
ijassa-310	107	21	,	,	PUNCT
ijassa-310	107	22	namely	namely	ADV
ijassa-310	107	23	,	,	PUNCT
ijassa-310	107	24	each	each	DET
ijassa-310	107	25	network	network	NOUN
ijassa-310	107	26	contains	contain	VERB
ijassa-310	107	27	all	all	DET
ijassa-310	107	28	the	the	DET
ijassa-310	107	29	proper	proper	ADJ
ijassa-310	107	30	functions	function	NOUN
ijassa-310	107	31	of	of	ADP
ijassa-310	107	32	1-	1-	NUM
ijassa-310	107	33	,	,	PUNCT
ijassa-310	107	34	2-	2-	NOUN
ijassa-310	107	35	,	,	PUNCT
ijassa-310	107	36	3	3	NUM
ijassa-310	107	37	-	-	PUNCT
ijassa-310	107	38	order	order	NOUN
ijassa-310	107	39	of	of	ADP
ijassa-310	107	40	its	its	PRON
ijassa-310	107	41	own	own	ADJ
ijassa-310	107	42	database	database	NOUN
ijassa-310	107	43	.	.	PUNCT
ijassa-310	108	1	4.2	4.2	NUM
ijassa-310	108	2	determination	determination	NOUN
ijassa-310	108	3	of	of	ADP
ijassa-310	108	4	threshold	threshold	NOUN
ijassa-310	108	5	of	of	ADP
ijassa-310	108	6	every	every	DET
ijassa-310	108	7	order	order	NOUN
ijassa-310	108	8	in	in	ADP
ijassa-310	108	9	order	order	NOUN
ijassa-310	108	10	to	to	PART
ijassa-310	108	11	highlight	highlight	VERB
ijassa-310	108	12	the	the	DET
ijassa-310	108	13	characteristics	characteristic	NOUN
ijassa-310	108	14	of	of	ADP
ijassa-310	108	15	the	the	DET
ijassa-310	108	16	network	network	NOUN
ijassa-310	108	17	and	and	CCONJ
ijassa-310	108	18	obtain	obtain	VERB
ijassa-310	108	19	the	the	DET
ijassa-310	108	20	valuable	valuable	ADJ
ijassa-310	108	21	biological	biological	ADJ
ijassa-310	108	22	information	information	NOUN
ijassa-310	108	23	,	,	PUNCT
ijassa-310	108	24	we	we	PRON
ijassa-310	108	25	need	need	VERB
ijassa-310	108	26	to	to	PART
ijassa-310	108	27	choose	choose	VERB
ijassa-310	108	28	a	a	DET
ijassa-310	108	29	threshold	threshold	NOUN
ijassa-310	108	30	to	to	PART
ijassa-310	108	31	carry	carry	VERB
ijassa-310	108	32	out	out	ADP
ijassa-310	108	33	coarse	coarse	ADJ
ijassa-310	108	34	graining	graining	NOUN
ijassa-310	108	35	to	to	ADP
ijassa-310	108	36	the	the	DET
ijassa-310	108	37	complete	complete	ADJ
ijassa-310	108	38	directed	direct	VERB
ijassa-310	108	39	logical	logical	ADJ
ijassa-310	108	40	networks	network	NOUN
ijassa-310	108	41	mentioned	mention	VERB
ijassa-310	108	42	above	above	ADV
ijassa-310	108	43	.	.	PUNCT
ijassa-310	109	1	the	the	DET
ijassa-310	109	2	threshold	threshold	NOUN
ijassa-310	109	3	is	be	AUX
ijassa-310	109	4	the	the	DET
ijassa-310	109	5	expression	expression	NOUN
ijassa-310	109	6	of	of	ADP
ijassa-310	109	7	coarse	coarse	NOUN
ijassa-310	109	8	-	-	PUNCT
ijassa-310	109	9	grained	grain	VERB
ijassa-310	109	10	level	level	NOUN
ijassa-310	109	11	and	and	CCONJ
ijassa-310	109	12	the	the	DET
ijassa-310	109	13	structural	structural	ADJ
ijassa-310	109	14	difference	difference	NOUN
ijassa-310	109	15	between	between	ADP
ijassa-310	109	16	logical	logical	ADJ
ijassa-310	109	17	network	network	NOUN
ijassa-310	109	18	structures	structure	NOUN
ijassa-310	109	19	should	should	AUX
ijassa-310	109	20	be	be	AUX
ijassa-310	109	21	contrasted	contrast	VERB
ijassa-310	109	22	in	in	ADP
ijassa-310	109	23	the	the	DET
ijassa-310	109	24	same	same	ADJ
ijassa-310	109	25	coarse	coarse	ADV
ijassa-310	109	26	-	-	PUNCT
ijassa-310	109	27	grained	grain	VERB
ijassa-310	109	28	level	level	NOUN
ijassa-310	109	29	.	.	PUNCT
ijassa-310	110	1	in	in	ADP
ijassa-310	110	2	order	order	NOUN
ijassa-310	110	3	to	to	PART
ijassa-310	110	4	make	make	VERB
ijassa-310	110	5	the	the	DET
ijassa-310	110	6	logical	logical	ADJ
ijassa-310	110	7	network	network	NOUN
ijassa-310	110	8	structures	structure	NOUN
ijassa-310	110	9	for	for	ADP
ijassa-310	110	10	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	110	11	and	and	CCONJ
ijassa-310	110	12	control	control	NOUN
ijassa-310	110	13	groups	group	NOUN
ijassa-310	110	14	comparable	comparable	ADJ
ijassa-310	110	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	110	16	we	we	PRON
ijassa-310	110	17	normalize	normalize	VERB
ijassa-310	110	18	the	the	DET
ijassa-310	110	19	u	u	PROPN
ijassa-310	110	20	values	value	NOUN
ijassa-310	110	21	of	of	ADP
ijassa-310	110	22	1-	1-	NUM
ijassa-310	110	23	,	,	PUNCT
ijassa-310	110	24	2-	2-	NOUN
ijassa-310	110	25	,	,	PUNCT
ijassa-310	110	26	3	3	NUM
ijassa-310	110	27	-	-	PUNCT
ijassa-310	110	28	order	order	NOUN
ijassa-310	110	29	of	of	ADP
ijassa-310	110	30	the	the	DET
ijassa-310	110	31	four	four	NUM
ijassa-310	110	32	networks	network	NOUN
ijassa-310	110	33	,	,	PUNCT
ijassa-310	110	34	namely	namely	ADV
ijassa-310	110	35	:	:	PUNCT
ijassa-310	110	36	logic	logic	NOUN
ijassa-310	110	37	u	u	NOUN
ijassa-310	110	38	values	value	NOUN
ijassa-310	110	39	of	of	ADP
ijassa-310	110	40	every	every	DET
ijassa-310	110	41	order	order	NOUN
ijassa-310	110	42	of	of	ADP
ijassa-310	110	43	each	each	DET
ijassa-310	110	44	database	database	NOUN
ijassa-310	110	45	are	be	AUX
ijassa-310	110	46	replaced	replace	VERB
ijassa-310	110	47	with	with	ADP
ijassa-310	110	48	u	u	PROPN
ijassa-310	110	49	max	max	PROPN
ijassa-310	110	50	u	u	PROPN
ijassa-310	110	51	,	,	PUNCT
ijassa-310	110	52	where	where	SCONJ
ijassa-310	110	53	max	max	PROPN
ijassa-310	110	54	u	u	PROPN
ijassa-310	110	55	is	be	AUX
ijassa-310	110	56	the	the	DET
ijassa-310	110	57	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	110	58	u	u	NOUN
ijassa-310	110	59	value	value	NOUN
ijassa-310	110	60	of	of	ADP
ijassa-310	110	61	each	each	DET
ijassa-310	110	62	order	order	NOUN
ijassa-310	110	63	in	in	ADP
ijassa-310	110	64	the	the	DET
ijassa-310	110	65	own	own	ADJ
ijassa-310	110	66	database	database	NOUN
ijassa-310	110	67	.	.	PUNCT
ijassa-310	111	1	for	for	ADP
ijassa-310	111	2	simplicity	simplicity	NOUN
ijassa-310	111	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	111	4	the	the	DET
ijassa-310	111	5	normalized	normalize	VERB
ijassa-310	111	6	values	value	NOUN
ijassa-310	111	7	are	be	AUX
ijassa-310	111	8	also	also	ADV
ijassa-310	111	9	denoted	denote	VERB
ijassa-310	111	10	by	by	ADP
ijassa-310	111	11	the	the	DET
ijassa-310	111	12	u	u	PROPN
ijassa-310	111	13	values	value	NOUN
ijassa-310	111	14	.	.	PUNCT
ijassa-310	112	1	let	let	VERB
ijassa-310	112	2	the	the	DET
ijassa-310	112	3	thresholds	threshold	NOUN
ijassa-310	112	4	of	of	ADP
ijassa-310	112	5	1-	1-	PROPN
ijassa-310	112	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	112	7	2-	2-	NOUN
ijassa-310	112	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	112	9	3	3	NUM
ijassa-310	112	10	-	-	PUNCT
ijassa-310	112	11	order	order	NOUN
ijassa-310	112	12	be	be	AUX
ijassa-310	112	13	321	321	NUM
ijassa-310	112	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	112	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	112	16	uuu	uuu	PROPN
ijassa-310	112	17	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	112	18	.	.	PUNCT
ijassa-310	113	1	the	the	DET
ijassa-310	113	2	2	2	NUM
ijassa-310	113	3	-	-	PUNCT
ijassa-310	113	4	order	order	NOUN
ijassa-310	113	5	logic	logic	NOUN
ijassa-310	113	6	of	of	ADP
ijassa-310	113	7	a	a	PRON
ijassa-310	113	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	113	9	b	b	NOUN
ijassa-310	113	10	to	to	ADP
ijassa-310	113	11	c	c	PROPN
ijassa-310	113	12	is	be	AUX
ijassa-310	113	13	considered	consider	VERB
ijassa-310	113	14	only	only	ADV
ijassa-310	113	15	when	when	SCONJ
ijassa-310	113	16	the	the	DET
ijassa-310	113	17	1	1	NUM
ijassa-310	113	18	-	-	PUNCT
ijassa-310	113	19	order	order	NOUN
ijassa-310	113	20	logics	logic	NOUN
ijassa-310	113	21	of	of	ADP
ijassa-310	113	22	a	a	DET
ijassa-310	113	23	to	to	ADP
ijassa-310	113	24	c	c	PROPN
ijassa-310	113	25	and	and	CCONJ
ijassa-310	113	26	b	b	NOUN
ijassa-310	113	27	to	to	PART
ijassa-310	113	28	c	c	PROPN
ijassa-310	113	29	do	do	AUX
ijassa-310	113	30	not	not	PART
ijassa-310	113	31	exist	exist	VERB
ijassa-310	113	32	,	,	PUNCT
ijassa-310	113	33	and	and	CCONJ
ijassa-310	113	34	claim	claim	VERB
ijassa-310	113	35	that	that	SCONJ
ijassa-310	113	36	192	192	NUM
ijassa-310	113	37	xu	xu	NUM
ijassa-310	113	38	:	:	PUNCT
ijassa-310	113	39	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	113	40	for	for	ADP
ijassa-310	113	41	gene	gene	NOUN
ijassa-310	113	42	networks	network	NOUN
ijassa-310	113	43	of	of	ADP
ijassa-310	113	44	colon	colon	NOUN
ijassa-310	113	45	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	113	46	based	base	VERB
ijassa-310	113	47	on	on	ADP
ijassa-310	113	48	logical	logical	ADJ
ijassa-310	113	49	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	113	50	http://www.iciba.com/consider/	http://www.iciba.com/consider/	PUNCT
ijassa-310	113	51	193	193	NUM
ijassa-310	113	52	2u	2u	NOUN
ijassa-310	113	53	is	be	AUX
ijassa-310	113	54	greater	great	ADJ
ijassa-310	113	55	than	than	ADP
ijassa-310	113	56	1u	1u	NUM
ijassa-310	113	57	:	:	PUNCT
ijassa-310	113	58			NOUN
ijassa-310	113	59			SYM
ijassa-310	113	60			NOUN
ijassa-310	114	1			PROPN
ijassa-310	114	2			NUM
ijassa-310	114	3			NUM
ijassa-310	114	4			PROPN
ijassa-310	114	5			NUM
ijassa-310	114	6			NUM
ijassa-310	114	7			NUM
ijassa-310	114	8			ADP
ijassa-310	115	1			VERB
ijassa-310	115	2			PROPN
ijassa-310	115	3			PROPN
ijassa-310	116	1			VERB
ijassa-310	116	2	12	12	NUM
ijassa-310	116	3	11	11	NUM
ijassa-310	116	4	11	11	NUM
ijassa-310	116	5	22	22	NUM
ijassa-310	116	6	)	)	PUNCT
ijassa-310	116	7	(	(	PUNCT
ijassa-310	116	8	)	)	PUNCT
ijassa-310	116	9	(	(	PUNCT
ijassa-310	116	10	)	)	PUNCT
ijassa-310	116	11	)	)	PUNCT
ijassa-310	116	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	116	13	(	(	PUNCT
ijassa-310	116	14	(	(	PUNCT
ijassa-310	116	15	uu	uu	INTJ
ijassa-310	116	16	ubfcu	ubfcu	NOUN
ijassa-310	116	17	uafcu	uafcu	VERB
ijassa-310	116	18	ubafcu	ubafcu	NOUN
ijassa-310	116	19	，	，	PUNCT
ijassa-310	116	20	(	(	PUNCT
ijassa-310	116	21	4	4	X
ijassa-310	116	22	)	)	PUNCT
ijassa-310	116	23	the	the	DET
ijassa-310	116	24	3	3	NUM
ijassa-310	116	25	-	-	PUNCT
ijassa-310	116	26	order	order	NOUN
ijassa-310	116	27	logic	logic	NOUN
ijassa-310	116	28	of	of	ADP
ijassa-310	116	29	a	a	DET
ijassa-310	116	30	,	,	PUNCT
ijassa-310	116	31	b	b	PROPN
ijassa-310	116	32	,	,	PUNCT
ijassa-310	116	33	c	c	NOUN
ijassa-310	116	34	to	to	ADP
ijassa-310	116	35	d	d	PROPN
ijassa-310	116	36	is	be	AUX
ijassa-310	116	37	considered	consider	VERB
ijassa-310	116	38	only	only	ADV
ijassa-310	116	39	when	when	SCONJ
ijassa-310	116	40	the	the	DET
ijassa-310	116	41	1	1	NUM
ijassa-310	116	42	-	-	PUNCT
ijassa-310	116	43	order	order	NOUN
ijassa-310	116	44	logics	logic	NOUN
ijassa-310	116	45	of	of	ADP
ijassa-310	116	46	a	a	PRON
ijassa-310	116	47	to	to	ADP
ijassa-310	116	48	d	d	PROPN
ijassa-310	116	49	,	,	PUNCT
ijassa-310	116	50	b	b	PROPN
ijassa-310	116	51	to	to	ADP
ijassa-310	116	52	d	d	PROPN
ijassa-310	116	53	,	,	PUNCT
ijassa-310	116	54	c	c	NOUN
ijassa-310	116	55	to	to	ADP
ijassa-310	116	56	d	d	PROPN
ijassa-310	116	57	,	,	PUNCT
ijassa-310	116	58	and	and	CCONJ
ijassa-310	116	59	the	the	DET
ijassa-310	116	60	2	2	NUM
ijassa-310	116	61	-	-	PUNCT
ijassa-310	116	62	order	order	NOUN
ijassa-310	116	63	logics	logic	NOUN
ijassa-310	116	64	of	of	ADP
ijassa-310	116	65	any	any	DET
ijassa-310	116	66	two	two	NUM
ijassa-310	116	67	of	of	ADP
ijassa-310	116	68	a	a	DET
ijassa-310	116	69	,	,	PUNCT
ijassa-310	116	70	b	b	NOUN
ijassa-310	116	71	,	,	PUNCT
ijassa-310	116	72	c	c	NOUN
ijassa-310	116	73	to	to	PART
ijassa-310	116	74	d	d	PROPN
ijassa-310	116	75	do	do	AUX
ijassa-310	116	76	not	not	PART
ijassa-310	116	77	exist	exist	VERB
ijassa-310	116	78	,	,	PUNCT
ijassa-310	116	79	and	and	CCONJ
ijassa-310	116	80	3u	3u	NUM
ijassa-310	116	81	is	be	AUX
ijassa-310	116	82	not	not	PART
ijassa-310	116	83	less	less	ADJ
ijassa-310	116	84	than	than	ADP
ijassa-310	116	85	2u	2u	NOUN
ijassa-310	116	86	:	:	PUNCT
ijassa-310	116	87			NOUN
ijassa-310	117	1			SYM
ijassa-310	117	2			NOUN
ijassa-310	117	3			PUNCT
ijassa-310	117	4			NOUN
ijassa-310	117	5			PROPN
ijassa-310	117	6			NUM
ijassa-310	117	7			NUM
ijassa-310	117	8			PROPN
ijassa-310	117	9			NUM
ijassa-310	117	10			NUM
ijassa-310	117	11			NUM
ijassa-310	117	12			ADP
ijassa-310	117	13			X
ijassa-310	117	14			SYM
ijassa-310	117	15			X
ijassa-310	117	16			VERB
ijassa-310	117	17	23	23	NUM
ijassa-310	117	18	111111	111111	NUM
ijassa-310	117	19	222222	222222	NUM
ijassa-310	117	20	33	33	NUM
ijassa-310	117	21	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	22	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	23	&	&	CCONJ
ijassa-310	117	24	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	25	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	26	&	&	CCONJ
ijassa-310	117	27	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	28	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	29	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	30	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	31	,	,	PUNCT
ijassa-310	117	32	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	33	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	34	&	&	CCONJ
ijassa-310	117	35	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	36	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	37	,	,	PUNCT
ijassa-310	117	38	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	39	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	40	&	&	CCONJ
ijassa-310	117	41	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	42	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	43	,	,	PUNCT
ijassa-310	117	44	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	45	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	46	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	47	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	48	,	,	PUNCT
ijassa-310	117	49	,	,	PUNCT
ijassa-310	117	50	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	51	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	52	uu	uu	INTJ
ijassa-310	117	53	ucfduubfduuafdu	ucfduubfduuafdu	ADJ
ijassa-310	117	54	ucbfduucafduubafdu	ucbfduucafduubafdu	ADJ
ijassa-310	117	55	ucbafdu	ucbafdu	ADJ
ijassa-310	117	56	，	，	PUNCT
ijassa-310	117	57	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	58	5	5	NUM
ijassa-310	117	59	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	60	through	through	ADP
ijassa-310	117	61	the	the	DET
ijassa-310	117	62	above	above	ADJ
ijassa-310	117	63	numerical	numerical	ADJ
ijassa-310	117	64	calculation	calculation	NOUN
ijassa-310	117	65	,	,	PUNCT
ijassa-310	117	66	the	the	DET
ijassa-310	117	67	four	four	NUM
ijassa-310	117	68	logical	logical	ADJ
ijassa-310	117	69	networks	network	NOUN
ijassa-310	117	70	for	for	ADP
ijassa-310	117	71	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	117	72	and	and	CCONJ
ijassa-310	117	73	control	control	NOUN
ijassa-310	117	74	groups	group	NOUN
ijassa-310	117	75	are	be	AUX
ijassa-310	117	76	obtained	obtain	VERB
ijassa-310	117	77	(	(	PUNCT
ijassa-310	117	78	fig	fig	NOUN
ijassa-310	117	79	.	.	NOUN
ijassa-310	117	80	1	1	NUM
ijassa-310	117	81	)	)	PUNCT
ijassa-310	117	82	.	.	PUNCT
ijassa-310	118	1	the	the	DET
ijassa-310	118	2	detailed	detailed	ADJ
ijassa-310	118	3	situations	situation	NOUN
ijassa-310	118	4	can	can	AUX
ijassa-310	118	5	be	be	AUX
ijassa-310	118	6	seen	see	VERB
ijassa-310	118	7	in	in	ADP
ijassa-310	118	8	table	table	NOUN
ijassa-310	118	9	2	2	NUM
ijassa-310	118	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	119	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	119	2	a	a	X
ijassa-310	119	3	)	)	PUNCT
ijassa-310	119	4	normal	normal	ADJ
ijassa-310	119	5	(	(	PUNCT
ijassa-310	119	6	b	b	NOUN
ijassa-310	119	7	)	)	PUNCT
ijassa-310	119	8	stage	stage	NOUN
ijassa-310	119	9	a	a	DET
ijassa-310	119	10	(	(	PUNCT
ijassa-310	119	11	c	c	NOUN
ijassa-310	119	12	)	)	PUNCT
ijassa-310	119	13	stage	stage	NOUN
ijassa-310	119	14	b	b	PROPN
ijassa-310	119	15	(	(	PUNCT
ijassa-310	119	16	d	d	NOUN
ijassa-310	119	17	)	)	PUNCT
ijassa-310	119	18	stage	stage	NOUN
ijassa-310	119	19	c	c	PROPN
ijassa-310	119	20	fig	fig	NOUN
ijassa-310	119	21	.	.	PUNCT
ijassa-310	120	1	1	1	NUM
ijassa-310	120	2	taking	take	VERB
ijassa-310	120	3	0.42	0.42	NUM
ijassa-310	120	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	120	5	0.75	0.75	NUM
ijassa-310	120	6	and	and	CCONJ
ijassa-310	120	7	0.85	0.85	NUM
ijassa-310	120	8	as	as	ADP
ijassa-310	120	9	the	the	DET
ijassa-310	120	10	threshold	threshold	NOUN
ijassa-310	120	11	of	of	ADP
ijassa-310	120	12	1-	1-	PROPN
ijassa-310	120	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	120	14	2-	2-	NOUN
ijassa-310	120	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	120	16	3	3	NUM
ijassa-310	120	17	-	-	PUNCT
ijassa-310	120	18	order	order	NOUN
ijassa-310	120	19	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	120	20	,	,	PUNCT
ijassa-310	120	21	the	the	DET
ijassa-310	120	22	logical	logical	ADJ
ijassa-310	120	23	networks	network	NOUN
ijassa-310	120	24	of	of	ADP
ijassa-310	120	25	111	111	NUM
ijassa-310	120	26	genes	gene	NOUN
ijassa-310	120	27	of	of	ADP
ijassa-310	120	28	the	the	DET
ijassa-310	120	29	four	four	NUM
ijassa-310	120	30	databases	database	NOUN
ijassa-310	120	31	are	be	AUX
ijassa-310	120	32	located	locate	VERB
ijassa-310	120	33	,	,	PUNCT
ijassa-310	120	34	where	where	SCONJ
ijassa-310	120	35	(	(	PUNCT
ijassa-310	120	36	a	a	NOUN
ijassa-310	120	37	)	)	PUNCT
ijassa-310	120	38	,	,	PUNCT
ijassa-310	120	39	(	(	PUNCT
ijassa-310	120	40	b	b	NOUN
ijassa-310	120	41	)	)	PUNCT
ijassa-310	120	42	,	,	PUNCT
ijassa-310	120	43	(	(	PUNCT
ijassa-310	120	44	c	c	X
ijassa-310	120	45	)	)	PUNCT
ijassa-310	120	46	and	and	CCONJ
ijassa-310	120	47	(	(	PUNCT
ijassa-310	120	48	d	d	X
ijassa-310	120	49	)	)	PUNCT
ijassa-310	120	50	represent	represent	VERB
ijassa-310	120	51	the	the	DET
ijassa-310	120	52	logical	logical	ADJ
ijassa-310	120	53	networks	network	NOUN
ijassa-310	120	54	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	120	55	to	to	ADP
ijassa-310	120	56	normal	normal	ADJ
ijassa-310	120	57	,	,	PUNCT
ijassa-310	120	58	stage	stage	VERB
ijassa-310	120	59	a	a	DET
ijassa-310	120	60	,	,	PUNCT
ijassa-310	120	61	b	b	NOUN
ijassa-310	120	62	and	and	CCONJ
ijassa-310	120	63	c	c	NOUN
ijassa-310	120	64	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	120	65	.	.	PUNCT
ijassa-310	121	1	the	the	DET
ijassa-310	121	2	nodes	node	NOUN
ijassa-310	121	3	in	in	ADP
ijassa-310	121	4	the	the	DET
ijassa-310	121	5	networks	network	NOUN
ijassa-310	121	6	are	be	AUX
ijassa-310	121	7	divided	divide	VERB
ijassa-310	121	8	into	into	ADP
ijassa-310	121	9	two	two	NUM
ijassa-310	121	10	types	type	NOUN
ijassa-310	121	11	:	:	PUNCT
ijassa-310	121	12	the	the	DET
ijassa-310	121	13	node	node	ADJ
ijassa-310	121	14	labeling	labeling	NOUN
ijassa-310	121	15	i	i	PRON
ijassa-310	121	16	denotes	denote	VERB
ijassa-310	121	17	gene	gene	NOUN
ijassa-310	121	18	i	i	PRON
ijassa-310	121	19	,	,	PUNCT
ijassa-310	121	20	the	the	DET
ijassa-310	121	21	node	node	ADJ
ijassa-310	121	22	labeling	labeling	NOUN
ijassa-310	121	23	“	"	PUNCT
ijassa-310	121	24	j	j	PROPN
ijassa-310	121	25	(	(	PUNCT
ijassa-310	121	26	.	.	PUNCT
ijassa-310	121	27	.	.	PUNCT
ijassa-310	121	28	.	.	PUNCT
ijassa-310	121	29	)	)	PUNCT
ijassa-310	121	30	”	"	PUNCT
ijassa-310	122	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	122	2	j	j	NOUN
ijassa-310	122	3	=	=	SYM
ijassa-310	122	4	2	2	NUM
ijassa-310	122	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	122	6	3	3	X
ijassa-310	122	7	)	)	PUNCT
ijassa-310	122	8	denotes	denote	VERB
ijassa-310	122	9	the	the	DET
ijassa-310	122	10	intermediate	intermediate	ADJ
ijassa-310	122	11	node	node	NOUN
ijassa-310	122	12	of	of	ADP
ijassa-310	122	13	j	j	PROPN
ijassa-310	122	14	-	-	PUNCT
ijassa-310	122	15	order	order	NOUN
ijassa-310	122	16	logical	logical	ADJ
ijassa-310	122	17	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	122	18	.	.	PUNCT
ijassa-310	123	1	for	for	ADP
ijassa-310	123	2	example	example	NOUN
ijassa-310	123	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	123	4	“	"	PUNCT
ijassa-310	123	5	2(5_1	2(5_1	NUM
ijassa-310	123	6	)	)	PUNCT
ijassa-310	123	7	”	"	PUNCT
ijassa-310	123	8	denotes	denote	VERB
ijassa-310	123	9	logic	logic	NOUN
ijassa-310	123	10	type	type	NOUN
ijassa-310	123	11	5_1	5_1	NUM
ijassa-310	123	12	of	of	ADP
ijassa-310	123	13	2	2	NUM
ijassa-310	123	14	-	-	PUNCT
ijassa-310	123	15	order	order	NOUN
ijassa-310	123	16	.	.	PUNCT
ijassa-310	124	1	the	the	DET
ijassa-310	124	2	out	out	ADJ
ijassa-310	124	3	-	-	PUNCT
ijassa-310	124	4	degree	degree	NOUN
ijassa-310	124	5	and	and	CCONJ
ijassa-310	124	6	in	in	ADP
ijassa-310	124	7	-	-	PUNCT
ijassa-310	124	8	degree	degree	NOUN
ijassa-310	124	9	of	of	ADP
ijassa-310	124	10	the	the	DET
ijassa-310	124	11	intermediate	intermediate	ADJ
ijassa-310	124	12	nodes	node	NOUN
ijassa-310	124	13	are	be	AUX
ijassa-310	124	14	fixed	fix	VERB
ijassa-310	124	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	124	16	i.e.	i.e.	X
ijassa-310	124	17	when	when	SCONJ
ijassa-310	124	18	j	j	PROPN
ijassa-310	124	19	=	=	PROPN
ijassa-310	124	20	2	2	NUM
ijassa-310	124	21	,	,	PUNCT
ijassa-310	124	22	the	the	DET
ijassa-310	124	23	in	in	NOUN
ijassa-310	124	24	-	-	PUNCT
ijassa-310	124	25	degree	degree	NOUN
ijassa-310	124	26	and	and	CCONJ
ijassa-310	124	27	out	out	NOUN
ijassa-310	124	28	-	-	PUNCT
ijassa-310	124	29	degree	degree	NOUN
ijassa-310	124	30	of	of	ADP
ijassa-310	124	31	the	the	DET
ijassa-310	124	32	node	node	NOUN
ijassa-310	124	33	is	be	AUX
ijassa-310	124	34	2	2	NUM
ijassa-310	124	35	and	and	CCONJ
ijassa-310	124	36	1	1	NUM
ijassa-310	124	37	,	,	PUNCT
ijassa-310	124	38	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	124	39	;	;	PUNCT
ijassa-310	124	40	when	when	SCONJ
ijassa-310	124	41	j	j	PROPN
ijassa-310	124	42	=	=	SYM
ijassa-310	124	43	3	3	NUM
ijassa-310	124	44	,	,	PUNCT
ijassa-310	124	45	the	the	DET
ijassa-310	124	46	in	in	NOUN
ijassa-310	124	47	-	-	PUNCT
ijassa-310	124	48	degree	degree	NOUN
ijassa-310	124	49	and	and	CCONJ
ijassa-310	124	50	out	out	NOUN
ijassa-310	124	51	-	-	PUNCT
ijassa-310	124	52	degree	degree	NOUN
ijassa-310	124	53	of	of	ADP
ijassa-310	124	54	the	the	DET
ijassa-310	124	55	node	node	NOUN
ijassa-310	124	56	is	be	AUX
ijassa-310	124	57	3	3	NUM
ijassa-310	124	58	and	and	CCONJ
ijassa-310	124	59	1	1	NUM
ijassa-310	124	60	,	,	PUNCT
ijassa-310	124	61	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	124	62	.	.	PUNCT
ijassa-310	125	1	for	for	ADP
ijassa-310	125	2	instance	instance	NOUN
ijassa-310	125	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	125	4	the	the	DET
ijassa-310	125	5	node	node	ADJ
ijassa-310	125	6	“	"	PUNCT
ijassa-310	125	7	2(3	2(3	NUM
ijassa-310	125	8	)	)	PUNCT
ijassa-310	125	9	”	"	PUNCT
ijassa-310	125	10	in	in	ADP
ijassa-310	125	11	fig	fig	NOUN
ijassa-310	125	12	.	.	PUNCT
ijassa-310	126	1	1(b	1(b	NUM
ijassa-310	126	2	)	)	PUNCT
ijassa-310	126	3	denotes	denote	NOUN
ijassa-310	126	4	that	that	SCONJ
ijassa-310	126	5	gene	gene	NOUN
ijassa-310	126	6	cxcl	cxcl	NOUN
ijassa-310	126	7	and	and	CCONJ
ijassa-310	126	8	mmp2	mmp2	ADJ
ijassa-310	126	9	regulate	regulate	VERB
ijassa-310	126	10	gene	gene	NOUN
ijassa-310	126	11	extl3	extl3	NOUN
ijassa-310	126	12	through	through	ADP
ijassa-310	126	13	logic	logic	ADJ
ijassa-310	126	14	type	type	NOUN
ijassa-310	126	15	3	3	NUM
ijassa-310	126	16	of	of	ADP
ijassa-310	126	17	2	2	NUM
ijassa-310	126	18	-	-	PUNCT
ijassa-310	126	19	order	order	NOUN
ijassa-310	126	20	.	.	PUNCT
ijassa-310	127	1	table	table	NOUN
ijassa-310	127	2	2	2	NUM
ijassa-310	127	3	the	the	DET
ijassa-310	127	4	detailed	detailed	ADJ
ijassa-310	127	5	list	list	NOUN
ijassa-310	127	6	of	of	ADP
ijassa-310	127	7	the	the	DET
ijassa-310	127	8	logical	logical	ADJ
ijassa-310	127	9	networks	network	NOUN
ijassa-310	127	10	for	for	ADP
ijassa-310	127	11	control	control	NOUN
ijassa-310	127	12	and	and	CCONJ
ijassa-310	127	13	three	three	NUM
ijassa-310	127	14	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	127	15	groups	group	NOUN
ijassa-310	127	16	stage	stage	VERB
ijassa-310	127	17	no	no	INTJ
ijassa-310	127	18	.	.	PUNCT
ijassa-310	128	1	of	of	ADP
ijassa-310	128	2	1	1	NUM
ijassa-310	128	3	-	-	PUNCT
ijassa-310	128	4	order	order	NOUN
ijassa-310	128	5	logics	logic	NOUN
ijassa-310	128	6	no	no	INTJ
ijassa-310	128	7	.	.	NOUN
ijassa-310	129	1	of	of	ADP
ijassa-310	129	2	2	2	NUM
ijassa-310	129	3	-	-	PUNCT
ijassa-310	129	4	order	order	NOUN
ijassa-310	129	5	logics	logic	NOUN
ijassa-310	129	6	no	no	INTJ
ijassa-310	129	7	.	.	NOUN
ijassa-310	130	1	of	of	ADP
ijassa-310	130	2	of	of	ADP
ijassa-310	130	3	3	3	NUM
ijassa-310	130	4	-	-	PUNCT
ijassa-310	130	5	order	order	NOUN
ijassa-310	130	6	logics	logic	NOUN
ijassa-310	130	7	no	no	INTJ
ijassa-310	130	8	.	.	PUNCT
ijassa-310	131	1	of	of	ADP
ijassa-310	131	2	all	all	DET
ijassa-310	131	3	the	the	DET
ijassa-310	131	4	logics	logic	NOUN
ijassa-310	131	5	no	no	INTJ
ijassa-310	131	6	.	.	PUNCT
ijassa-310	132	1	of	of	ADP
ijassa-310	132	2	genes	gene	NOUN
ijassa-310	132	3	no	no	INTJ
ijassa-310	132	4	.	.	PUNCT
ijassa-310	133	1	of	of	ADP
ijassa-310	133	2	the	the	DET
ijassa-310	133	3	non	non	ADJ
ijassa-310	133	4	-	-	ADJ
ijassa-310	133	5	isolated	isolated	ADJ
ijassa-310	133	6	nodes	node	NOUN
ijassa-310	133	7	normal	normal	ADJ
ijassa-310	133	8	90	90	NUM
ijassa-310	133	9	1614	1614	NUM
ijassa-310	133	10	39	39	NUM
ijassa-310	133	11	1743	1743	NUM
ijassa-310	133	12	79	79	NUM
ijassa-310	133	13	74	74	NUM
ijassa-310	133	14	stage	stage	NOUN
ijassa-310	133	15	a	a	DET
ijassa-310	133	16	22	22	NUM
ijassa-310	133	17	33	33	NUM
ijassa-310	133	18	18	18	NUM
ijassa-310	133	19	73	73	NUM
ijassa-310	133	20	79	79	NUM
ijassa-310	133	21	60	60	NUM
ijassa-310	133	22	stage	stage	NOUN
ijassa-310	133	23	b	b	NOUN
ijassa-310	133	24	37	37	NUM
ijassa-310	133	25	51	51	NUM
ijassa-310	133	26	2	2	NUM
ijassa-310	133	27	90	90	NUM
ijassa-310	133	28	70	70	NUM
ijassa-310	133	29	55	55	NUM
ijassa-310	133	30	stage	stage	NOUN
ijassa-310	133	31	c	c	NOUN
ijassa-310	133	32	4	4	NUM
ijassa-310	133	33	32	32	NUM
ijassa-310	133	34	9	9	NUM
ijassa-310	133	35	45	45	NUM
ijassa-310	133	36	60	60	NUM
ijassa-310	133	37	35	35	NUM
ijassa-310	133	38	4.3	4.3	NUM
ijassa-310	133	39	distribution	distribution	NOUN
ijassa-310	133	40	of	of	ADP
ijassa-310	133	41	logic	logic	ADJ
ijassa-310	133	42	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	133	43	of	of	ADP
ijassa-310	133	44	2	2	NUM
ijassa-310	133	45	-	-	PUNCT
ijassa-310	133	46	order	order	NOUN
ijassa-310	133	47	the	the	DET
ijassa-310	133	48	subgraph	subgraph	NOUN
ijassa-310	133	49	with	with	ADP
ijassa-310	133	50	higher	high	ADJ
ijassa-310	133	51	frequency	frequency	NOUN
ijassa-310	133	52	in	in	ADP
ijassa-310	133	53	complex	complex	ADJ
ijassa-310	133	54	network	network	NOUN
ijassa-310	133	55	is	be	AUX
ijassa-310	133	56	called	call	VERB
ijassa-310	133	57	the	the	DET
ijassa-310	133	58	network	network	NOUN
ijassa-310	133	59	motif	motif	NOUN
ijassa-310	133	60	[	[	X
ijassa-310	133	61	22	22	NUM
ijassa-310	133	62	]	]	PUNCT
ijassa-310	133	63	.	.	PUNCT
ijassa-310	134	1	the	the	DET
ijassa-310	134	2	identification	identification	NOUN
ijassa-310	134	3	to	to	ADP
ijassa-310	134	4	the	the	DET
ijassa-310	134	5	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	134	6	of	of	ADP
ijassa-310	134	7	complex	complex	ADJ
ijassa-310	134	8	network	network	NOUN
ijassa-310	134	9	helps	help	VERB
ijassa-310	134	10	to	to	PART
ijassa-310	134	11	identify	identify	VERB
ijassa-310	134	12	the	the	DET
ijassa-310	134	13	typical	typical	ADJ
ijassa-310	134	14	local	local	ADJ
ijassa-310	134	15	connections	connection	NOUN
ijassa-310	134	16	advances	advance	NOUN
ijassa-310	134	17	in	in	ADP
ijassa-310	134	18	systems	system	NOUN
ijassa-310	134	19	science	science	NOUN
ijassa-310	134	20	and	and	CCONJ
ijassa-310	134	21	applications	application	NOUN
ijassa-310	134	22	(	(	PUNCT
ijassa-310	134	23	2011	2011	NUM
ijassa-310	134	24	)	)	PUNCT
ijassa-310	134	25	,	,	PUNCT
ijassa-310	134	26	vol	vol	NOUN
ijassa-310	134	27	.	.	PROPN
ijassa-310	135	1	11	11	NUM
ijassa-310	135	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	135	3	no	no	INTJ
ijassa-310	135	4	.	.	NOUN
ijassa-310	135	5	1	1	NUM
ijassa-310	135	6	-	-	SYM
ijassa-310	135	7	2	2	NUM
ijassa-310	135	8	of	of	ADP
ijassa-310	135	9	network	network	NOUN
ijassa-310	135	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	136	1	previous	previous	ADJ
ijassa-310	136	2	studies	study	NOUN
ijassa-310	136	3	have	have	AUX
ijassa-310	136	4	showed	show	VERB
ijassa-310	136	5	that	that	SCONJ
ijassa-310	136	6	:	:	PUNCT
ijassa-310	136	7	the	the	DET
ijassa-310	136	8	motif	motif	NOUN
ijassa-310	136	9	in	in	ADP
ijassa-310	136	10	complex	complex	ADJ
ijassa-310	136	11	biological	biological	ADJ
ijassa-310	136	12	network	network	NOUN
ijassa-310	136	13	has	have	VERB
ijassa-310	136	14	a	a	DET
ijassa-310	136	15	direct	direct	ADJ
ijassa-310	136	16	biological	biological	ADJ
ijassa-310	136	17	significance	significance	NOUN
ijassa-310	136	18	.	.	PUNCT
ijassa-310	137	1	for	for	ADP
ijassa-310	137	2	example	example	NOUN
ijassa-310	137	3	:	:	PUNCT
ijassa-310	137	4	the	the	DET
ijassa-310	137	5	motif	motif	NOUN
ijassa-310	137	6	in	in	ADP
ijassa-310	137	7	the	the	DET
ijassa-310	137	8	protein	protein	NOUN
ijassa-310	137	9	interaction	interaction	NOUN
ijassa-310	137	10	networks	network	NOUN
ijassa-310	137	11	of	of	ADP
ijassa-310	137	12	yeast	yeast	NOUN
ijassa-310	137	13	highly	highly	ADV
ijassa-310	137	14	evolves	evolve	VERB
ijassa-310	137	15	to	to	PART
ijassa-310	137	16	protect	protect	VERB
ijassa-310	137	17	the	the	DET
ijassa-310	137	18	components	component	NOUN
ijassa-310	137	19	,	,	PUNCT
ijassa-310	137	20	the	the	DET
ijassa-310	137	21	transcription	transcription	NOUN
ijassa-310	137	22	regulatory	regulatory	ADJ
ijassa-310	137	23	networks	network	NOUN
ijassa-310	137	24	of	of	ADP
ijassa-310	137	25	different	different	ADJ
ijassa-310	137	26	species	specie	NOUN
ijassa-310	137	27	have	have	VERB
ijassa-310	137	28	an	an	DET
ijassa-310	137	29	evolutionary	evolutionary	ADJ
ijassa-310	137	30	trend	trend	NOUN
ijassa-310	137	31	to	to	ADP
ijassa-310	137	32	the	the	DET
ijassa-310	137	33	same	same	ADJ
ijassa-310	137	34	motif	motif	NOUN
ijassa-310	137	35	[	[	X
ijassa-310	137	36	23	23	NUM
ijassa-310	137	37	]	]	PUNCT
ijassa-310	137	38	.	.	PUNCT
ijassa-310	138	1	in	in	ADP
ijassa-310	138	2	the	the	DET
ijassa-310	138	3	logical	logical	ADJ
ijassa-310	138	4	networks	network	NOUN
ijassa-310	138	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	138	6	each	each	PRON
ijassa-310	138	7	of	of	ADP
ijassa-310	138	8	8	8	NUM
ijassa-310	138	9	logic	logic	NOUN
ijassa-310	138	10	types	type	NOUN
ijassa-310	138	11	of	of	ADP
ijassa-310	138	12	2	2	NUM
ijassa-310	138	13	-	-	PUNCT
ijassa-310	138	14	order	order	NOUN
ijassa-310	138	15	is	be	AUX
ijassa-310	138	16	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	138	17	to	to	ADP
ijassa-310	138	18	a	a	DET
ijassa-310	138	19	motif	motif	NOUN
ijassa-310	138	20	,	,	PUNCT
ijassa-310	138	21	called	call	VERB
ijassa-310	138	22	the	the	DET
ijassa-310	138	23	logic	logic	NOUN
ijassa-310	138	24	motif	motif	NOUN
ijassa-310	138	25	.	.	PUNCT
ijassa-310	139	1	each	each	DET
ijassa-310	139	2	type	type	NOUN
ijassa-310	139	3	of	of	ADP
ijassa-310	139	4	logic	logic	NOUN
ijassa-310	139	5	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	139	6	is	be	AUX
ijassa-310	139	7	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	139	8	to	to	ADP
ijassa-310	139	9	a	a	DET
ijassa-310	139	10	typical	typical	ADJ
ijassa-310	139	11	mode	mode	NOUN
ijassa-310	139	12	of	of	ADP
ijassa-310	139	13	biochemical	biochemical	ADJ
ijassa-310	139	14	reactions	reaction	NOUN
ijassa-310	139	15	.	.	PUNCT
ijassa-310	140	1	in	in	ADP
ijassa-310	140	2	order	order	NOUN
ijassa-310	140	3	to	to	PART
ijassa-310	140	4	explore	explore	VERB
ijassa-310	140	5	the	the	DET
ijassa-310	140	6	differences	difference	NOUN
ijassa-310	140	7	of	of	ADP
ijassa-310	140	8	reaction	reaction	NOUN
ijassa-310	140	9	modes	mode	NOUN
ijassa-310	140	10	in	in	ADP
ijassa-310	140	11	the	the	DET
ijassa-310	140	12	internal	internal	ADJ
ijassa-310	140	13	mechanism	mechanism	NOUN
ijassa-310	140	14	of	of	ADP
ijassa-310	140	15	normal	normal	ADJ
ijassa-310	140	16	and	and	CCONJ
ijassa-310	140	17	diseased	diseased	ADJ
ijassa-310	140	18	organisms	organism	NOUN
ijassa-310	140	19	,	,	PUNCT
ijassa-310	140	20	we	we	PRON
ijassa-310	140	21	contrast	contrast	VERB
ijassa-310	140	22	and	and	CCONJ
ijassa-310	140	23	analyze	analyze	VERB
ijassa-310	140	24	the	the	DET
ijassa-310	140	25	logic	logic	ADJ
ijassa-310	140	26	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	140	27	of	of	ADP
ijassa-310	140	28	2	2	NUM
ijassa-310	140	29	-	-	PUNCT
ijassa-310	140	30	order	order	NOUN
ijassa-310	140	31	of	of	ADP
ijassa-310	140	32	the	the	DET
ijassa-310	140	33	logical	logical	ADJ
ijassa-310	140	34	networks	network	NOUN
ijassa-310	140	35	for	for	ADP
ijassa-310	140	36	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	140	37	and	and	CCONJ
ijassa-310	140	38	control	control	NOUN
ijassa-310	140	39	groups	group	NOUN
ijassa-310	140	40	.	.	PUNCT
ijassa-310	141	1	fig	fig	NOUN
ijassa-310	141	2	.	.	PUNCT
ijassa-310	142	1	2	2	NUM
ijassa-310	142	2	and	and	CCONJ
ijassa-310	142	3	table	table	NOUN
ijassa-310	142	4	3	3	NUM
ijassa-310	142	5	are	be	AUX
ijassa-310	142	6	the	the	DET
ijassa-310	142	7	distribution	distribution	NOUN
ijassa-310	142	8	histogram	histogram	NOUN
ijassa-310	142	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	142	10	the	the	DET
ijassa-310	142	11	detailed	detailed	ADJ
ijassa-310	142	12	list	list	NOUN
ijassa-310	142	13	about	about	ADP
ijassa-310	142	14	logic	logic	ADJ
ijassa-310	142	15	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	142	16	of	of	ADP
ijassa-310	142	17	2	2	NUM
ijassa-310	142	18	-	-	PUNCT
ijassa-310	142	19	order	order	NOUN
ijassa-310	142	20	of	of	ADP
ijassa-310	142	21	the	the	DET
ijassa-310	142	22	four	four	NUM
ijassa-310	142	23	logical	logical	ADJ
ijassa-310	142	24	networks	network	NOUN
ijassa-310	142	25	for	for	ADP
ijassa-310	142	26	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	142	27	and	and	CCONJ
ijassa-310	142	28	control	control	NOUN
ijassa-310	142	29	groups	group	NOUN
ijassa-310	142	30	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	142	31	.	.	PUNCT
ijassa-310	143	1	from	from	ADP
ijassa-310	143	2	fig	fig	NOUN
ijassa-310	143	3	.	.	PUNCT
ijassa-310	143	4	2	2	NUM
ijassa-310	143	5	and	and	CCONJ
ijassa-310	143	6	table	table	NOUN
ijassa-310	143	7	3	3	NUM
ijassa-310	143	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	143	9	we	we	PRON
ijassa-310	143	10	can	can	AUX
ijassa-310	143	11	discover	discover	VERB
ijassa-310	143	12	that	that	SCONJ
ijassa-310	143	13	the	the	DET
ijassa-310	143	14	logic	logic	ADJ
ijassa-310	143	15	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	143	16	of	of	ADP
ijassa-310	143	17	2	2	NUM
ijassa-310	143	18	-	-	PUNCT
ijassa-310	143	19	order	order	NOUN
ijassa-310	143	20	in	in	ADP
ijassa-310	143	21	control	control	NOUN
ijassa-310	143	22	network	network	NOUN
ijassa-310	143	23	cover	cover	VERB
ijassa-310	143	24	six	six	NUM
ijassa-310	143	25	logic	logic	NOUN
ijassa-310	143	26	types	type	NOUN
ijassa-310	143	27	1	1	NUM
ijassa-310	143	28	,	,	PUNCT
ijassa-310	143	29	2	2	NUM
ijassa-310	143	30	,	,	PUNCT
ijassa-310	143	31	3	3	NUM
ijassa-310	143	32	,	,	PUNCT
ijassa-310	143	33	4	4	NUM
ijassa-310	143	34	,	,	PUNCT
ijassa-310	143	35	5	5	NUM
ijassa-310	143	36	,	,	PUNCT
ijassa-310	143	37	6	6	NUM
ijassa-310	143	38	.	.	PUNCT
ijassa-310	144	1	however	however	ADV
ijassa-310	144	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	144	3	in	in	ADP
ijassa-310	144	4	the	the	DET
ijassa-310	144	5	networks	network	NOUN
ijassa-310	144	6	for	for	ADP
ijassa-310	144	7	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	144	8	groups	group	NOUN
ijassa-310	144	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	144	10	there	there	PRON
ijassa-310	144	11	only	only	ADV
ijassa-310	144	12	contain	contain	VERB
ijassa-310	144	13	three	three	NUM
ijassa-310	144	14	logic	logic	NOUN
ijassa-310	144	15	types	type	NOUN
ijassa-310	144	16	1	1	NUM
ijassa-310	144	17	,	,	PUNCT
ijassa-310	144	18	3	3	NUM
ijassa-310	144	19	,	,	PUNCT
ijassa-310	144	20	6	6	NUM
ijassa-310	144	21	(	(	PUNCT
ijassa-310	144	22	table	table	NOUN
ijassa-310	144	23	3	3	NUM
ijassa-310	144	24	)	)	PUNCT
ijassa-310	144	25	except	except	SCONJ
ijassa-310	144	26	that	that	SCONJ
ijassa-310	144	27	the	the	DET
ijassa-310	144	28	network	network	NOUN
ijassa-310	144	29	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	144	30	to	to	PART
ijassa-310	144	31	stage	stage	VERB
ijassa-310	144	32	a	a	DET
ijassa-310	144	33	contains	contain	VERB
ijassa-310	144	34	logic	logic	NOUN
ijassa-310	144	35	types	type	NOUN
ijassa-310	144	36	1，2，3，5，6，7	1，2，3，5，6，7	ADV
ijassa-310	144	37	of	of	ADP
ijassa-310	144	38	2	2	NUM
ijassa-310	144	39	-	-	PUNCT
ijassa-310	144	40	order	order	NOUN
ijassa-310	144	41	.	.	PUNCT
ijassa-310	145	1	moreover	moreover	ADV
ijassa-310	145	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	145	3	three	three	NUM
ijassa-310	145	4	logic	logic	ADJ
ijassa-310	145	5	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	145	6	of	of	ADP
ijassa-310	145	7	types	type	NOUN
ijassa-310	145	8	1	1	NUM
ijassa-310	145	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	145	10	3	3	NUM
ijassa-310	145	11	and	and	CCONJ
ijassa-310	145	12	6	6	NUM
ijassa-310	145	13	appear	appear	VERB
ijassa-310	145	14	more	more	ADV
ijassa-310	145	15	in	in	ADP
ijassa-310	145	16	the	the	DET
ijassa-310	145	17	network	network	NOUN
ijassa-310	145	18	for	for	ADP
ijassa-310	145	19	control	control	NOUN
ijassa-310	145	20	group	group	NOUN
ijassa-310	145	21	and	and	CCONJ
ijassa-310	145	22	the	the	DET
ijassa-310	145	23	corresponding	corresponding	ADJ
ijassa-310	145	24	proper	proper	ADJ
ijassa-310	145	25	functions	function	NOUN
ijassa-310	145	26	are	be	AUX
ijassa-310	145	27	bac	bac	NOUN
ijassa-310	145	28			NOUN
ijassa-310	145	29	,	,	PUNCT
ijassa-310	145	30	c	c	PROPN
ijassa-310	145	31	a	a	DET
ijassa-310	145	32	b	b	NOUN
ijassa-310	145	33			NOUN
ijassa-310	145	34	and	and	CCONJ
ijassa-310	145	35	bac	bac	NOUN
ijassa-310	145	36			PUNCT
ijassa-310	145	37	or	or	CCONJ
ijassa-310	145	38	c	c	X
ijassa-310	145	39	a	a	DET
ijassa-310	145	40	b	b	NOUN
ijassa-310	145	41			NOUN
ijassa-310	145	42	,	,	PUNCT
ijassa-310	145	43	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	145	44	;	;	PUNCT
ijassa-310	145	45	one	one	NUM
ijassa-310	145	46	logic	logic	NOUN
ijassa-310	145	47	motif	motif	NOUN
ijassa-310	145	48	of	of	ADP
ijassa-310	145	49	type	type	NOUN
ijassa-310	145	50	1	1	NUM
ijassa-310	145	51	appears	appear	VERB
ijassa-310	145	52	more	more	ADJ
ijassa-310	145	53	in	in	ADP
ijassa-310	145	54	the	the	DET
ijassa-310	145	55	network	network	NOUN
ijassa-310	145	56	for	for	ADP
ijassa-310	145	57	stage	stage	NOUN
ijassa-310	145	58	a	a	PRON
ijassa-310	145	59	and	and	CCONJ
ijassa-310	145	60	the	the	DET
ijassa-310	145	61	corresponding	corresponding	ADJ
ijassa-310	145	62	proper	proper	ADJ
ijassa-310	145	63	function	function	NOUN
ijassa-310	145	64	is	be	AUX
ijassa-310	145	65	bac	bac	PROPN
ijassa-310	145	66			NOUN
ijassa-310	145	67	;	;	PUNCT
ijassa-310	145	68	two	two	NUM
ijassa-310	145	69	logic	logic	ADJ
ijassa-310	145	70	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	145	71	of	of	ADP
ijassa-310	145	72	types	type	NOUN
ijassa-310	145	73	1	1	NUM
ijassa-310	145	74	and	and	CCONJ
ijassa-310	145	75	3	3	NUM
ijassa-310	145	76	appear	appear	VERB
ijassa-310	145	77	more	more	ADV
ijassa-310	145	78	in	in	ADP
ijassa-310	145	79	the	the	DET
ijassa-310	145	80	networks	network	NOUN
ijassa-310	145	81	for	for	ADP
ijassa-310	145	82	stage	stage	NOUN
ijassa-310	145	83	b	b	PROPN
ijassa-310	145	84	and	and	CCONJ
ijassa-310	145	85	c	c	PROPN
ijassa-310	145	86	and	and	CCONJ
ijassa-310	145	87	the	the	DET
ijassa-310	145	88	corresponding	corresponding	ADJ
ijassa-310	145	89	proper	proper	ADJ
ijassa-310	145	90	functions	function	NOUN
ijassa-310	145	91	are	be	AUX
ijassa-310	145	92	bac	bac	NOUN
ijassa-310	145	93			NOUN
ijassa-310	145	94	,	,	PUNCT
ijassa-310	145	95	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	145	96	.	.	PUNCT
ijassa-310	146	1	1	1	NUM
ijassa-310	146	2	2	2	NUM
ijassa-310	146	3	3	3	NUM
ijassa-310	146	4	4	4	NUM
ijassa-310	146	5	5	5	NUM
ijassa-310	146	6	6	6	NUM
ijassa-310	146	7	7	7	NUM
ijassa-310	146	8	8	8	NUM
ijassa-310	146	9	0	0	NUM
ijassa-310	146	10	100	100	NUM
ijassa-310	146	11	200	200	NUM
ijassa-310	146	12	300	300	NUM
ijassa-310	146	13	400	400	NUM
ijassa-310	146	14	500	500	NUM
ijassa-310	146	15	600	600	NUM
ijassa-310	146	16	logical	logical	ADJ
ijassa-310	146	17	type	type	NOUN
ijassa-310	146	18	t	t	NOUN
ijassa-310	146	19	h	h	NOUN
ijassa-310	146	20	e	e	PROPN
ijassa-310	146	21	n	n	CCONJ
ijassa-310	146	22	u	u	PROPN
ijassa-310	146	23	m	m	NOUN
ijassa-310	146	24	b	b	PROPN
ijassa-310	146	25	e	e	NOUN
ijassa-310	146	26	r	r	NOUN
ijassa-310	146	27	o	o	X
ijassa-310	146	28	f	f	X
ijassa-310	146	29	l	l	NOUN
ijassa-310	146	30	o	o	X
ijassa-310	146	31	g	g	NOUN
ijassa-310	146	32	ic	ic	PROPN
ijassa-310	146	33	t	t	PROPN
ijassa-310	146	34	y	y	PROPN
ijassa-310	146	35	p	p	PROPN
ijassa-310	146	36	e	e	PROPN
ijassa-310	146	37	stage	stage	VERB
ijassa-310	146	38	a	a	DET
ijassa-310	146	39	stage	stage	NOUN
ijassa-310	146	40	b	b	NOUN
ijassa-310	146	41	stage	stage	NOUN
ijassa-310	146	42	c	c	PROPN
ijassa-310	146	43	normal	normal	ADJ
ijassa-310	146	44	1	1	NUM
ijassa-310	146	45	2	2	NUM
ijassa-310	146	46	3	3	NUM
ijassa-310	146	47	4	4	NUM
ijassa-310	146	48	5	5	NUM
ijassa-310	146	49	6	6	NUM
ijassa-310	146	50	7	7	NUM
ijassa-310	146	51	8	8	NUM
ijassa-310	146	52	0	0	NUM
ijassa-310	146	53	1	1	NUM
ijassa-310	146	54	2	2	NUM
ijassa-310	146	55	3	3	NUM
ijassa-310	146	56	4	4	NUM
ijassa-310	146	57	5	5	NUM
ijassa-310	146	58	6	6	NUM
ijassa-310	146	59	x	x	SYM
ijassa-310	146	60	1	1	NUM
ijassa-310	146	61	0	0	NUM
ijassa-310	146	62	-3	-3	PUNCT
ijassa-310	146	63	logical	logical	ADJ
ijassa-310	146	64	type	type	NOUN
ijassa-310	147	1	l	l	NOUN
ijassa-310	147	2	o	o	NOUN
ijassa-310	148	1	g	g	NOUN
ijassa-310	148	2	ic	ic	PROPN
ijassa-310	148	3	a	a	DET
ijassa-310	148	4	l	l	NOUN
ijassa-310	148	5	ty	ty	NOUN
ijassa-310	148	6	p	p	X
ijassa-310	148	7	e	e	X
ijassa-310	148	8	f	f	X
ijassa-310	148	9	re	re	PROPN
ijassa-310	148	10	q	q	X
ijassa-310	148	11	u	u	X
ijassa-310	148	12	e	e	X
ijassa-310	148	13	n	n	PROPN
ijassa-310	148	14	c	c	PROPN
ijassa-310	148	15	y	y	PROPN
ijassa-310	148	16	stage	stage	VERB
ijassa-310	148	17	a	a	DET
ijassa-310	148	18	stage	stage	NOUN
ijassa-310	148	19	b	b	NOUN
ijassa-310	148	20	stage	stage	NOUN
ijassa-310	148	21	c	c	PROPN
ijassa-310	148	22	normal	normal	ADJ
ijassa-310	148	23	fig	fig	NOUN
ijassa-310	148	24	.	.	PUNCT
ijassa-310	149	1	2	2	NUM
ijassa-310	149	2	the	the	DET
ijassa-310	149	3	distribution	distribution	NOUN
ijassa-310	149	4	histogram	histogram	NOUN
ijassa-310	149	5	of	of	ADP
ijassa-310	149	6	logic	logic	NOUN
ijassa-310	149	7	types	type	NOUN
ijassa-310	149	8	of	of	ADP
ijassa-310	149	9	2	2	NUM
ijassa-310	149	10	-	-	PUNCT
ijassa-310	149	11	order	order	NOUN
ijassa-310	149	12	in	in	ADP
ijassa-310	149	13	the	the	DET
ijassa-310	149	14	logical	logical	ADJ
ijassa-310	149	15	networks	network	NOUN
ijassa-310	149	16	for	for	ADP
ijassa-310	149	17	control	control	NOUN
ijassa-310	149	18	and	and	CCONJ
ijassa-310	149	19	three	three	NUM
ijassa-310	149	20	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	149	21	groups	group	NOUN
ijassa-310	149	22	table	table	VERB
ijassa-310	149	23	3	3	NUM
ijassa-310	149	24	the	the	DET
ijassa-310	149	25	list	list	NOUN
ijassa-310	149	26	of	of	ADP
ijassa-310	149	27	logic	logic	NOUN
ijassa-310	149	28	types	type	NOUN
ijassa-310	149	29	of	of	ADP
ijassa-310	149	30	2	2	NUM
ijassa-310	149	31	-	-	PUNCT
ijassa-310	149	32	order	order	NOUN
ijassa-310	149	33	in	in	ADP
ijassa-310	149	34	the	the	DET
ijassa-310	149	35	logical	logical	ADJ
ijassa-310	149	36	networks	network	NOUN
ijassa-310	149	37	for	for	ADP
ijassa-310	149	38	control	control	NOUN
ijassa-310	149	39	and	and	CCONJ
ijassa-310	149	40	three	three	NUM
ijassa-310	149	41	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	149	42	groups	group	NOUN
ijassa-310	149	43	logic	logic	NOUN
ijassa-310	149	44	type	type	NOUN
ijassa-310	149	45	1	1	NUM
ijassa-310	149	46	2	2	NUM
ijassa-310	149	47	3	3	NUM
ijassa-310	149	48	4	4	NUM
ijassa-310	149	49	5	5	NUM
ijassa-310	149	50	6	6	NUM
ijassa-310	149	51	7	7	NUM
ijassa-310	149	52	8	8	NUM
ijassa-310	149	53	normal	normal	ADJ
ijassa-310	149	54	275	275	NUM
ijassa-310	149	55	177	177	NUM
ijassa-310	149	56	311	311	NUM
ijassa-310	149	57	78	78	NUM
ijassa-310	149	58	199	199	NUM
ijassa-310	149	59	574	574	NUM
ijassa-310	149	60	0	0	NUM
ijassa-310	149	61	0	0	NUM
ijassa-310	149	62	stage	stage	NOUN
ijassa-310	149	63	a	a	DET
ijassa-310	149	64	13	13	NUM
ijassa-310	149	65	1	1	NUM
ijassa-310	149	66	5	5	NUM
ijassa-310	149	67	0	0	NUM
ijassa-310	149	68	2	2	NUM
ijassa-310	149	69	7	7	NUM
ijassa-310	149	70	5	5	NUM
ijassa-310	149	71	0	0	NUM
ijassa-310	149	72	stage	stage	NOUN
ijassa-310	149	73	b	b	NOUN
ijassa-310	149	74	21	21	NUM
ijassa-310	149	75	0	0	NUM
ijassa-310	149	76	28	28	NUM
ijassa-310	149	77	0	0	NUM
ijassa-310	149	78	0	0	NUM
ijassa-310	149	79	1	1	NUM
ijassa-310	149	80	1	1	NUM
ijassa-310	149	81	0	0	NUM
ijassa-310	149	82	stage	stage	NOUN
ijassa-310	149	83	c	c	NOUN
ijassa-310	149	84	12	12	NUM
ijassa-310	149	85	0	0	NUM
ijassa-310	149	86	17	17	NUM
ijassa-310	149	87	0	0	NUM
ijassa-310	149	88	0	0	NUM
ijassa-310	149	89	3	3	NUM
ijassa-310	149	90	0	0	NUM
ijassa-310	149	91	0	0	NUM
ijassa-310	149	92	4.4	4.4	NUM
ijassa-310	149	93	dynamical	dynamical	ADJ
ijassa-310	149	94	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	149	95	of	of	ADP
ijassa-310	149	96	logical	logical	ADJ
ijassa-310	149	97	network	network	NOUN
ijassa-310	149	98	although	although	SCONJ
ijassa-310	149	99	the	the	DET
ijassa-310	149	100	study	study	NOUN
ijassa-310	149	101	and	and	CCONJ
ijassa-310	149	102	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	149	103	of	of	ADP
ijassa-310	149	104	topological	topological	ADJ
ijassa-310	149	105	structure	structure	NOUN
ijassa-310	149	106	of	of	ADP
ijassa-310	149	107	the	the	DET
ijassa-310	149	108	above	above	ADJ
ijassa-310	149	109	logical	logical	ADJ
ijassa-310	149	110	networks	network	NOUN
ijassa-310	149	111	can	can	AUX
ijassa-310	149	112	obtain	obtain	VERB
ijassa-310	149	113	some	some	DET
ijassa-310	149	114	biological	biological	ADJ
ijassa-310	149	115	principles	principle	NOUN
ijassa-310	149	116	and	and	CCONJ
ijassa-310	149	117	information	information	NOUN
ijassa-310	149	118	,	,	PUNCT
ijassa-310	149	119	the	the	DET
ijassa-310	149	120	structure	structure	NOUN
ijassa-310	149	121	of	of	ADP
ijassa-310	149	122	actual	actual	ADJ
ijassa-310	149	123	biological	biological	ADJ
ijassa-310	149	124	system	system	NOUN
ijassa-310	149	125	is	be	AUX
ijassa-310	149	126	a	a	DET
ijassa-310	149	127	changing	change	VERB
ijassa-310	149	128	network	network	NOUN
ijassa-310	149	129	over	over	ADP
ijassa-310	149	130	time	time	NOUN
ijassa-310	149	131	and	and	CCONJ
ijassa-310	149	132	the	the	DET
ijassa-310	149	133	dynamical	dynamical	ADJ
ijassa-310	149	134	behaviors	behavior	NOUN
ijassa-310	149	135	can	can	AUX
ijassa-310	149	136	not	not	PART
ijassa-310	149	137	be	be	AUX
ijassa-310	149	138	reflected	reflect	VERB
ijassa-310	149	139	by	by	ADP
ijassa-310	149	140	topological	topological	ADJ
ijassa-310	149	141	structure	structure	NOUN
ijassa-310	149	142	in	in	ADP
ijassa-310	149	143	most	most	ADJ
ijassa-310	149	144	situations	situation	NOUN
ijassa-310	149	145	.	.	PUNCT
ijassa-310	150	1	therefore	therefore	ADV
ijassa-310	150	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	150	3	we	we	PRON
ijassa-310	150	4	research	research	VERB
ijassa-310	150	5	the	the	DET
ijassa-310	150	6	evolution	evolution	NOUN
ijassa-310	150	7	of	of	ADP
ijassa-310	150	8	gene	gene	NOUN
ijassa-310	150	9	regulatory	regulatory	ADJ
ijassa-310	150	10	logical	logical	ADJ
ijassa-310	150	11	network	network	NOUN
ijassa-310	150	12	from	from	ADP
ijassa-310	150	13	the	the	DET
ijassa-310	150	14	dynamical	dynamical	ADJ
ijassa-310	150	15	point	point	NOUN
ijassa-310	150	16	of	of	ADP
ijassa-310	150	17	view	view	NOUN
ijassa-310	150	18	.	.	PUNCT
ijassa-310	151	1	because	because	SCONJ
ijassa-310	151	2	the	the	DET
ijassa-310	151	3	number	number	NOUN
ijassa-310	151	4	of	of	ADP
ijassa-310	151	5	the	the	DET
ijassa-310	151	6	non	non	ADJ
ijassa-310	151	7	-	-	ADJ
ijassa-310	151	8	isolated	isolated	ADJ
ijassa-310	151	9	nodes	node	NOUN
ijassa-310	151	10	are	be	AUX
ijassa-310	151	11	too	too	ADV
ijassa-310	151	12	great	great	ADJ
ijassa-310	151	13	in	in	ADP
ijassa-310	151	14	the	the	DET
ijassa-310	151	15	logical	logical	ADJ
ijassa-310	151	16	networks	network	NOUN
ijassa-310	151	17	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	151	18	to	to	ADP
ijassa-310	151	19	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	151	20	and	and	CCONJ
ijassa-310	151	21	control	control	NOUN
ijassa-310	151	22	groups	group	NOUN
ijassa-310	151	23	to	to	PART
ijassa-310	151	24	analyse	analyse	VERB
ijassa-310	151	25	the	the	DET
ijassa-310	151	26	dynamical	dynamical	ADJ
ijassa-310	151	27	transfer	transfer	NOUN
ijassa-310	151	28	laws	law	NOUN
ijassa-310	151	29	,	,	PUNCT
ijassa-310	151	30	“	"	PUNCT
ijassa-310	151	31	the	the	DET
ijassa-310	151	32	structural	structural	ADJ
ijassa-310	151	33	key	key	ADJ
ijassa-310	151	34	genes	gene	NOUN
ijassa-310	151	35	”	"	PUNCT
ijassa-310	151	36	must	must	AUX
ijassa-310	151	37	be	be	AUX
ijassa-310	151	38	selected	select	VERB
ijassa-310	151	39	appropriately	appropriately	ADV
ijassa-310	151	40	in	in	ADP
ijassa-310	151	41	every	every	DET
ijassa-310	151	42	stages	stage	NOUN
ijassa-310	151	43	.	.	PUNCT
ijassa-310	152	1	the	the	DET
ijassa-310	152	2	logical	logical	ADJ
ijassa-310	152	3	network	network	NOUN
ijassa-310	152	4	is	be	AUX
ijassa-310	152	5	directed	direct	VERB
ijassa-310	152	6	and	and	CCONJ
ijassa-310	152	7	every	every	DET
ijassa-310	152	8	node	node	NOUN
ijassa-310	152	9	in	in	ADP
ijassa-310	152	10	the	the	DET
ijassa-310	152	11	network	network	NOUN
ijassa-310	152	12	has	have	VERB
ijassa-310	152	13	out	out	ADJ
ijassa-310	152	14	-	-	PUNCT
ijassa-310	152	15	degrees	degree	NOUN
ijassa-310	152	16	and	and	CCONJ
ijassa-310	152	17	in	in	ADP
ijassa-310	152	18	-	-	PUNCT
ijassa-310	152	19	degrees	degree	NOUN
ijassa-310	152	20	.	.	PUNCT
ijassa-310	153	1	if	if	SCONJ
ijassa-310	153	2	node	node	NOUN
ijassa-310	153	3	i	i	PRON
ijassa-310	153	4	has	have	VERB
ijassa-310	153	5	an	an	DET
ijassa-310	153	6	out	out	ADJ
ijassa-310	153	7	-	-	PUNCT
ijassa-310	153	8	arc	arc	NOUN
ijassa-310	153	9	to	to	ADP
ijassa-310	153	10	j	j	PROPN
ijassa-310	153	11	,	,	PUNCT
ijassa-310	153	12	then	then	ADV
ijassa-310	153	13	node	node	VERB
ijassa-310	153	14	i	i	PRON
ijassa-310	153	15	has	have	VERB
ijassa-310	153	16	a	a	DET
ijassa-310	153	17	logical	logical	ADJ
ijassa-310	153	18	regulatory	regulatory	ADJ
ijassa-310	153	19	relationship	relationship	NOUN
ijassa-310	153	20	to	to	ADP
ijassa-310	153	21	j	j	PROPN
ijassa-310	153	22	.	.	PUNCT
ijassa-310	154	1	on	on	ADP
ijassa-310	154	2	the	the	DET
ijassa-310	154	3	other	other	ADJ
ijassa-310	154	4	hand	hand	NOUN
ijassa-310	154	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	154	6	if	if	SCONJ
ijassa-310	154	7	node	node	NOUN
ijassa-310	154	8	i	i	PRON
ijassa-310	154	9	has	have	VERB
ijassa-310	154	10	an	an	DET
ijassa-310	154	11	in	in	ADP
ijassa-310	154	12	-	-	PUNCT
ijassa-310	154	13	arc	arc	NOUN
ijassa-310	154	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	154	15	then	then	ADV
ijassa-310	154	16	some	some	DET
ijassa-310	154	17	node	node	NOUN
ijassa-310	154	18	has	have	VERB
ijassa-310	154	19	a	a	DET
ijassa-310	154	20	logical	logical	ADJ
ijassa-310	154	21	regulatory	regulatory	ADJ
ijassa-310	154	22	relationship	relationship	NOUN
ijassa-310	154	23	to	to	ADP
ijassa-310	154	24	i	i	PRON
ijassa-310	154	25	.	.	PUNCT
ijassa-310	155	1	the	the	DET
ijassa-310	155	2	degree	degree	NOUN
ijassa-310	155	3	-	-	PUNCT
ijassa-310	155	4	difference	difference	NOUN
ijassa-310	155	5	of	of	ADP
ijassa-310	155	6	node	node	NOUN
ijassa-310	155	7	is	be	AUX
ijassa-310	155	8	defined	define	VERB
ijassa-310	155	9	as	as	ADP
ijassa-310	155	10	the	the	DET
ijassa-310	155	11	difference	difference	NOUN
ijassa-310	155	12	of	of	ADP
ijassa-310	155	13	out	out	ADJ
ijassa-310	155	14	-	-	PUNCT
ijassa-310	155	15	degree	degree	NOUN
ijassa-310	155	16	and	and	CCONJ
ijassa-310	155	17	in	in	ADP
ijassa-310	155	18	-	-	PUNCT
ijassa-310	155	19	degree	degree	NOUN
ijassa-310	155	20	.	.	PUNCT
ijassa-310	156	1	the	the	DET
ijassa-310	156	2	nodes	node	NOUN
ijassa-310	156	3	194	194	NUM
ijassa-310	156	4	xu	xu	NUM
ijassa-310	156	5	:	:	PUNCT
ijassa-310	156	6	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	156	7	for	for	ADP
ijassa-310	156	8	gene	gene	NOUN
ijassa-310	156	9	networks	network	NOUN
ijassa-310	156	10	of	of	ADP
ijassa-310	156	11	colon	colon	NOUN
ijassa-310	156	12	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	156	13	based	base	VERB
ijassa-310	156	14	on	on	ADP
ijassa-310	156	15	logical	logical	ADJ
ijassa-310	156	16	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	156	17	app	app	ADJ
ijassa-310	156	18	:	:	PUNCT
ijassa-310	156	19	ds	ds	ADJ
ijassa-310	156	20	:	:	PUNCT
ijassa-310	156	21	on	on	ADP
ijassa-310	156	22	app	app	ADJ
ijassa-310	156	23	:	:	PUNCT
ijassa-310	156	24	ds	ds	ADJ
ijassa-310	156	25	:	:	PUNCT
ijassa-310	156	26	the	the	DET
ijassa-310	156	27	app	app	NOUN
ijassa-310	156	28	:	:	PUNCT
ijassa-310	156	29	ds	ds	ADJ
ijassa-310	156	30	:	:	PUNCT
ijassa-310	156	31	other	other	ADJ
ijassa-310	156	32	app	app	NOUN
ijassa-310	156	33	:	:	PUNCT
ijassa-310	156	34	ds	ds	ADJ
ijassa-310	156	35	:	:	PUNCT
ijassa-310	156	36	hand	hand	NOUN
ijassa-310	156	37	195	195	NUM
ijassa-310	156	38	whose	whose	DET
ijassa-310	156	39	degrees	degree	NOUN
ijassa-310	156	40	and	and	CCONJ
ijassa-310	156	41	degree	degree	NOUN
ijassa-310	156	42	-	-	PUNCT
ijassa-310	156	43	differences	difference	NOUN
ijassa-310	156	44	are	be	AUX
ijassa-310	156	45	relatively	relatively	ADV
ijassa-310	156	46	great	great	ADJ
ijassa-310	156	47	are	be	AUX
ijassa-310	156	48	called	call	VERB
ijassa-310	156	49	“	"	PUNCT
ijassa-310	156	50	the	the	DET
ijassa-310	156	51	commander	commander	NOUN
ijassa-310	156	52	genes	gene	NOUN
ijassa-310	156	53	”	"	PUNCT
ijassa-310	156	54	,	,	PUNCT
ijassa-310	156	55	and	and	CCONJ
ijassa-310	156	56	the	the	DET
ijassa-310	156	57	changes	change	NOUN
ijassa-310	156	58	of	of	ADP
ijassa-310	156	59	states	state	NOUN
ijassa-310	156	60	of	of	ADP
ijassa-310	156	61	these	these	DET
ijassa-310	156	62	genes	gene	NOUN
ijassa-310	156	63	can	can	AUX
ijassa-310	156	64	influence	influence	VERB
ijassa-310	156	65	most	most	ADJ
ijassa-310	156	66	of	of	ADP
ijassa-310	156	67	genes	gene	NOUN
ijassa-310	156	68	of	of	ADP
ijassa-310	156	69	the	the	DET
ijassa-310	156	70	network	network	NOUN
ijassa-310	156	71	.	.	PUNCT
ijassa-310	157	1	in	in	ADP
ijassa-310	157	2	this	this	DET
ijassa-310	157	3	work	work	NOUN
ijassa-310	157	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	157	5	the	the	DET
ijassa-310	157	6	method	method	NOUN
ijassa-310	157	7	of	of	ADP
ijassa-310	157	8	discovering	discover	VERB
ijassa-310	157	9	the	the	DET
ijassa-310	157	10	commander	commander	NOUN
ijassa-310	157	11	genes	gene	NOUN
ijassa-310	157	12	is	be	AUX
ijassa-310	157	13	as	as	SCONJ
ijassa-310	157	14	follows	follow	VERB
ijassa-310	157	15	:	:	PUNCT
ijassa-310	157	16	(	(	PUNCT
ijassa-310	157	17	1	1	X
ijassa-310	157	18	)	)	PUNCT
ijassa-310	157	19	calculate	calculate	NOUN
ijassa-310	157	20	the	the	DET
ijassa-310	157	21	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	157	22	degree	degree	NOUN
ijassa-310	157	23	and	and	CCONJ
ijassa-310	157	24	the	the	DET
ijassa-310	157	25	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	157	26	degree	degree	NOUN
ijassa-310	157	27	-	-	PUNCT
ijassa-310	157	28	difference	difference	NOUN
ijassa-310	157	29	of	of	ADP
ijassa-310	157	30	network	network	NOUN
ijassa-310	157	31	;	;	PUNCT
ijassa-310	157	32	(	(	PUNCT
ijassa-310	157	33	2	2	X
ijassa-310	157	34	)	)	PUNCT
ijassa-310	157	35	normalize	normalize	VERB
ijassa-310	157	36	the	the	DET
ijassa-310	157	37	the	the	DET
ijassa-310	157	38	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	157	39	degree	degree	NOUN
ijassa-310	157	40	and	and	CCONJ
ijassa-310	157	41	the	the	DET
ijassa-310	157	42	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	157	43	degree	degree	NOUN
ijassa-310	157	44	-	-	PUNCT
ijassa-310	157	45	difference	difference	NOUN
ijassa-310	157	46	of	of	ADP
ijassa-310	157	47	the	the	DET
ijassa-310	157	48	non	non	ADJ
ijassa-310	157	49	-	-	ADJ
ijassa-310	157	50	isolated	isolate	VERB
ijassa-310	157	51	nodes	node	NOUN
ijassa-310	157	52	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	157	53	,	,	PUNCT
ijassa-310	157	54	namely	namely	ADV
ijassa-310	157	55	:	:	PUNCT
ijassa-310	157	56	the	the	DET
ijassa-310	157	57	degree	degree	NOUN
ijassa-310	157	58	and	and	CCONJ
ijassa-310	157	59	degree	degree	NOUN
ijassa-310	157	60	-	-	PUNCT
ijassa-310	157	61	difference	difference	NOUN
ijassa-310	157	62	of	of	ADP
ijassa-310	157	63	each	each	DET
ijassa-310	157	64	non	non	ADJ
ijassa-310	157	65	-	-	ADJ
ijassa-310	157	66	isolated	isolated	ADJ
ijassa-310	157	67	node	node	NOUN
ijassa-310	157	68	divide	divide	VERB
ijassa-310	157	69	the	the	DET
ijassa-310	157	70	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	157	71	degree	degree	NOUN
ijassa-310	157	72	and	and	CCONJ
ijassa-310	157	73	the	the	DET
ijassa-310	157	74	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	157	75	degree	degree	NOUN
ijassa-310	157	76	-	-	PUNCT
ijassa-310	157	77	difference	difference	NOUN
ijassa-310	157	78	of	of	ADP
ijassa-310	157	79	the	the	DET
ijassa-310	157	80	network	network	NOUN
ijassa-310	157	81	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	157	82	.	.	PUNCT
ijassa-310	158	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	158	2	3	3	X
ijassa-310	158	3	)	)	PUNCT
ijassa-310	158	4	set	set	VERB
ijassa-310	158	5	the	the	DET
ijassa-310	158	6	parameters	parameter	NOUN
ijassa-310	158	7	1	1	NUM
ijassa-310	158	8	0.05c	0.05c	NUM
ijassa-310	158	9			NUM
ijassa-310	158	10	and	and	CCONJ
ijassa-310	158	11	0.15c	0.15c	PROPN
ijassa-310	158	12	2	2	PROPN
ijassa-310	158	13	.	.	PUNCT
ijassa-310	159	1	take	take	VERB
ijassa-310	159	2	these	these	DET
ijassa-310	159	3	genes	gene	NOUN
ijassa-310	159	4	with	with	ADP
ijassa-310	159	5	degree	degree	NOUN
ijassa-310	159	6	1c	1c	NOUN
ijassa-310	159	7	times	time	NOUN
ijassa-310	159	8	greater	great	ADJ
ijassa-310	159	9	than	than	ADP
ijassa-310	159	10	the	the	DET
ijassa-310	159	11	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	159	12	degree	degree	NOUN
ijassa-310	159	13	and	and	CCONJ
ijassa-310	159	14	degree	degree	NOUN
ijassa-310	159	15	-	-	PUNCT
ijassa-310	159	16	difference	difference	NOUN
ijassa-310	159	17	c2	c2	PROPN
ijassa-310	159	18	times	time	NOUN
ijassa-310	159	19	greater	great	ADJ
ijassa-310	159	20	than	than	ADP
ijassa-310	159	21	the	the	DET
ijassa-310	159	22	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	159	23	degree	degree	NOUN
ijassa-310	159	24	-	-	PUNCT
ijassa-310	159	25	difference	difference	NOUN
ijassa-310	159	26	as	as	ADP
ijassa-310	159	27	the	the	DET
ijassa-310	159	28	commander	commander	NOUN
ijassa-310	159	29	genes	gene	VERB
ijassa-310	159	30	.	.	PUNCT
ijassa-310	160	1	when	when	SCONJ
ijassa-310	160	2	taking	take	VERB
ijassa-310	160	3	the	the	DET
ijassa-310	160	4	parameters	parameter	NOUN
ijassa-310	160	5	1c	1c	NOUN
ijassa-310	160	6	and	and	CCONJ
ijassa-310	160	7	c2	c2	PROPN
ijassa-310	160	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	160	9	the	the	DET
ijassa-310	160	10	number	number	NOUN
ijassa-310	160	11	of	of	ADP
ijassa-310	160	12	commander	commander	NOUN
ijassa-310	160	13	genes	gene	NOUN
ijassa-310	160	14	must	must	AUX
ijassa-310	160	15	be	be	AUX
ijassa-310	160	16	appropriate	appropriate	ADJ
ijassa-310	160	17	,	,	PUNCT
ijassa-310	160	18	because	because	SCONJ
ijassa-310	160	19	some	some	DET
ijassa-310	160	20	key	key	ADJ
ijassa-310	160	21	genes	gene	NOUN
ijassa-310	160	22	might	might	AUX
ijassa-310	160	23	be	be	AUX
ijassa-310	160	24	lost	lose	VERB
ijassa-310	160	25	if	if	SCONJ
ijassa-310	160	26	the	the	DET
ijassa-310	160	27	commander	commander	NOUN
ijassa-310	160	28	genes	gene	NOUN
ijassa-310	160	29	are	be	AUX
ijassa-310	160	30	too	too	ADV
ijassa-310	160	31	few	few	ADJ
ijassa-310	160	32	,	,	PUNCT
ijassa-310	160	33	and	and	CCONJ
ijassa-310	160	34	we	we	PRON
ijassa-310	160	35	can	can	AUX
ijassa-310	160	36	not	not	PART
ijassa-310	160	37	calculate	calculate	VERB
ijassa-310	160	38	if	if	SCONJ
ijassa-310	160	39	the	the	DET
ijassa-310	160	40	commander	commander	NOUN
ijassa-310	160	41	genes	gene	NOUN
ijassa-310	160	42	are	be	AUX
ijassa-310	160	43	too	too	ADV
ijassa-310	160	44	many	many	ADJ
ijassa-310	160	45	.	.	PUNCT
ijassa-310	161	1	the	the	DET
ijassa-310	161	2	detailed	detailed	ADJ
ijassa-310	161	3	situations	situation	NOUN
ijassa-310	161	4	of	of	ADP
ijassa-310	161	5	the	the	DET
ijassa-310	161	6	commander	commander	NOUN
ijassa-310	161	7	genes	gene	NOUN
ijassa-310	161	8	of	of	ADP
ijassa-310	161	9	control	control	NOUN
ijassa-310	161	10	and	and	CCONJ
ijassa-310	161	11	three	three	NUM
ijassa-310	161	12	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	161	13	groups	group	NOUN
ijassa-310	161	14	can	can	AUX
ijassa-310	161	15	be	be	AUX
ijassa-310	161	16	seen	see	VERB
ijassa-310	161	17	in	in	ADP
ijassa-310	161	18	table	table	NOUN
ijassa-310	161	19	4	4	NUM
ijassa-310	161	20	and	and	CCONJ
ijassa-310	161	21	5	5	NUM
ijassa-310	161	22	.	.	NOUN
ijassa-310	161	23	table	table	NOUN
ijassa-310	161	24	4	4	NUM
ijassa-310	161	25	taking	take	VERB
ijassa-310	161	26	the	the	DET
ijassa-310	161	27	parameters	parameter	NOUN
ijassa-310	161	28	1	1	NUM
ijassa-310	161	29	0.05c	0.05c	NUM
ijassa-310	161	30			NUM
ijassa-310	161	31	and	and	CCONJ
ijassa-310	161	32	0.15c	0.15c	PROPN
ijassa-310	161	33	2	2	PROPN
ijassa-310	161	34	,	,	PUNCT
ijassa-310	161	35	the	the	DET
ijassa-310	161	36	detailed	detailed	ADJ
ijassa-310	161	37	list	list	NOUN
ijassa-310	161	38	of	of	ADP
ijassa-310	161	39	the	the	DET
ijassa-310	161	40	commander	commander	NOUN
ijassa-310	161	41	genes	gene	NOUN
ijassa-310	161	42	of	of	ADP
ijassa-310	161	43	control	control	NOUN
ijassa-310	161	44	and	and	CCONJ
ijassa-310	161	45	three	three	NUM
ijassa-310	161	46	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	161	47	groups	group	NOUN
ijassa-310	161	48	stage	stage	VERB
ijassa-310	161	49	the	the	DET
ijassa-310	161	50	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	161	51	degree	degree	NOUN
ijassa-310	161	52	the	the	DET
ijassa-310	161	53	maximum	maximum	ADJ
ijassa-310	161	54	degree	degree	NOUN
ijassa-310	161	55	-	-	PUNCT
ijassa-310	161	56	difference	difference	NOUN
ijassa-310	161	57	no	no	NOUN
ijassa-310	161	58	.	.	PUNCT
ijassa-310	162	1	of	of	ADP
ijassa-310	162	2	the	the	DET
ijassa-310	162	3	commander	commander	NOUN
ijassa-310	162	4	genes	gene	VERB
ijassa-310	162	5	no	no	INTJ
ijassa-310	162	6	.	.	PUNCT
ijassa-310	163	1	of	of	ADP
ijassa-310	163	2	the	the	DET
ijassa-310	163	3	non	non	ADJ
ijassa-310	163	4	-	-	ADJ
ijassa-310	163	5	isolated	isolated	ADJ
ijassa-310	163	6	nodes	node	NOUN
ijassa-310	163	7	normal	normal	ADJ
ijassa-310	163	8	855	855	NUM
ijassa-310	163	9	109	109	NUM
ijassa-310	163	10	12	12	NUM
ijassa-310	163	11	74	74	NUM
ijassa-310	163	12	stage	stage	NOUN
ijassa-310	163	13	a	a	DET
ijassa-310	163	14	30	30	NUM
ijassa-310	163	15	15	15	NUM
ijassa-310	163	16	12	12	NUM
ijassa-310	163	17	60	60	NUM
ijassa-310	163	18	stage	stage	NOUN
ijassa-310	163	19	b	b	NOUN
ijassa-310	163	20	42	42	NUM
ijassa-310	163	21	6	6	NUM
ijassa-310	163	22	12	12	NUM
ijassa-310	163	23	55	55	NUM
ijassa-310	163	24	stage	stage	NOUN
ijassa-310	163	25	c	c	NOUN
ijassa-310	163	26	32	32	NUM
ijassa-310	163	27	5	5	NUM
ijassa-310	163	28	13	13	NUM
ijassa-310	163	29	35	35	NUM
ijassa-310	163	30	table	table	NOUN
ijassa-310	163	31	5	5	NUM
ijassa-310	163	32	the	the	DET
ijassa-310	163	33	list	list	NOUN
ijassa-310	163	34	of	of	ADP
ijassa-310	163	35	the	the	DET
ijassa-310	163	36	commander	commander	NOUN
ijassa-310	163	37	genes	gene	NOUN
ijassa-310	163	38	of	of	ADP
ijassa-310	163	39	every	every	DET
ijassa-310	163	40	stages	stage	NOUN
ijassa-310	163	41	normal	normal	ADJ
ijassa-310	163	42	stage	stage	NOUN
ijassa-310	163	43	a	a	DET
ijassa-310	163	44	stage	stage	NOUN
ijassa-310	163	45	b	b	NOUN
ijassa-310	163	46	stage	stage	NOUN
ijassa-310	163	47	c	c	PROPN
ijassa-310	163	48	faslg	faslg	NOUN
ijassa-310	163	49	araf	araf	PROPN
ijassa-310	163	50	araf	araf	VERB
ijassa-310	163	51	ar	ar	PROPN
ijassa-310	163	52	axl	axl	PROPN
ijassa-310	163	53	bok	bok	PROPN
ijassa-310	163	54	bak1	bak1	PROPN
ijassa-310	163	55	bak1	bak1	PROPN
ijassa-310	163	56	etv3	etv3	PROPN
ijassa-310	163	57	esr2	esr2	PROPN
ijassa-310	163	58	esr1	esr1	PROPN
ijassa-310	163	59	elk1	elk1	PROPN
ijassa-310	163	60	gli3	gli3	PROPN
ijassa-310	164	1	ptk2b	ptk2b	VERB
ijassa-310	164	2	ptk2b	ptk2b	VERB
ijassa-310	164	3	erbb4	erbb4	VERB
ijassa-310	164	4	il1a	il1a	PROPN
ijassa-310	164	5	gli2	gli2	NOUN
ijassa-310	164	6	fgf2	fgf2	PROPN
ijassa-310	164	7	etv1	etv1	PROPN
ijassa-310	164	8	plag1	plag1	PROPN
ijassa-310	165	1	mafg	mafg	PROPN
ijassa-310	165	2	hnf4a	hnf4a	PROPN
ijassa-310	165	3	fgf2	fgf2	PROPN
ijassa-310	165	4	rbl1	rbl1	PROPN
ijassa-310	165	5	mdm2	mdm2	PROPN
ijassa-310	166	1	ihh	ihh	PROPN
ijassa-310	166	2	ihh	ihh	PROPN
ijassa-310	166	3	tal1	tal1	PROPN
ijassa-310	166	4	pdgfb	pdgfb	PROPN
ijassa-310	166	5	abcb1	abcb1	PROPN
ijassa-310	166	6	mapk7	mapk7	PROPN
ijassa-310	166	7	vav1	vav1	PROPN
ijassa-310	166	8	plag1	plag1	PROPN
ijassa-310	166	9	shh	shh	PROPN
ijassa-310	166	10	sele	sele	PROPN
ijassa-310	166	11	zap70	zap70	PROPN
ijassa-310	166	12	stk11	stk11	PROPN
ijassa-310	166	13	vav1	vav1	PROPN
ijassa-310	166	14	stk11	stk11	PROPN
ijassa-310	166	15	tcl1a	tcl1a	PROPN
ijassa-310	167	1	tp73	tp73	PROPN
ijassa-310	167	2	arhgef5	arhgef5	PROPN
ijassa-310	167	3	tp53bp1	tp53bp1	PROPN
ijassa-310	167	4	bag2	bag2	VERB
ijassa-310	167	5	hpse	hpse	NOUN
ijassa-310	167	6	hpse	hpse	NOUN
ijassa-310	167	7	zap70	zap70	PROPN
ijassa-310	167	8	chek2	chek2	NOUN
ijassa-310	167	9	using	use	VERB
ijassa-310	167	10	the	the	DET
ijassa-310	167	11	method	method	NOUN
ijassa-310	167	12	of	of	ADP
ijassa-310	167	13	constructing	construct	VERB
ijassa-310	167	14	the	the	DET
ijassa-310	167	15	logical	logical	ADJ
ijassa-310	167	16	networks	network	NOUN
ijassa-310	167	17	in	in	ADP
ijassa-310	167	18	(	(	PUNCT
ijassa-310	167	19	1	1	NUM
ijassa-310	167	20	)	)	PUNCT
ijassa-310	167	21	(	(	PUNCT
ijassa-310	167	22	2	2	X
ijassa-310	167	23	)	)	PUNCT
ijassa-310	167	24	of	of	ADP
ijassa-310	167	25	section	section	NOUN
ijassa-310	167	26	4	4	NUM
ijassa-310	167	27	,	,	PUNCT
ijassa-310	167	28	we	we	PRON
ijassa-310	167	29	can	can	AUX
ijassa-310	167	30	obtain	obtain	VERB
ijassa-310	167	31	the	the	DET
ijassa-310	167	32	networks	network	NOUN
ijassa-310	167	33	of	of	ADP
ijassa-310	167	34	the	the	DET
ijassa-310	167	35	commander	commander	NOUN
ijassa-310	167	36	genes	gene	NOUN
ijassa-310	167	37	of	of	ADP
ijassa-310	167	38	control	control	NOUN
ijassa-310	167	39	and	and	CCONJ
ijassa-310	167	40	three	three	NUM
ijassa-310	167	41	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	167	42	groups	group	NOUN
ijassa-310	167	43	(	(	PUNCT
ijassa-310	167	44	fig	fig	NOUN
ijassa-310	167	45	.	.	PUNCT
ijassa-310	168	1	3	3	X
ijassa-310	168	2	)	)	PUNCT
ijassa-310	168	3	advances	advance	NOUN
ijassa-310	168	4	in	in	ADP
ijassa-310	168	5	systems	system	NOUN
ijassa-310	168	6	science	science	NOUN
ijassa-310	168	7	and	and	CCONJ
ijassa-310	168	8	applications	application	NOUN
ijassa-310	168	9	(	(	PUNCT
ijassa-310	168	10	2011	2011	NUM
ijassa-310	168	11	)	)	PUNCT
ijassa-310	168	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	168	13	vol	vol	NOUN
ijassa-310	168	14	.	.	PROPN
ijassa-310	168	15	11	11	NUM
ijassa-310	168	16	,	,	PUNCT
ijassa-310	168	17	no	no	INTJ
ijassa-310	168	18	.	.	NOUN
ijassa-310	168	19	1	1	NUM
ijassa-310	168	20	-	-	SYM
ijassa-310	168	21	2	2	NUM
ijassa-310	168	22	app	app	NOUN
ijassa-310	168	23	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	24	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	25	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	26	relatively	relatively	ADV
ijassa-310	168	27	app	app	ADJ
ijassa-310	168	28	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	29	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	30	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	31	influence	influence	NOUN
ijassa-310	168	32	app	app	NOUN
ijassa-310	168	33	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	34	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	35	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	36	maximal	maximal	ADJ
ijassa-310	168	37	app	app	ADJ
ijassa-310	168	38	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	39	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	40	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	41	maximal	maximal	ADJ
ijassa-310	168	42	app	app	ADJ
ijassa-310	168	43	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	44	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	45	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	46	normalization	normalization	NOUN
ijassa-310	168	47	app	app	NOUN
ijassa-310	168	48	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	49	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	50	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	51	maximal	maximal	ADJ
ijassa-310	168	52	app	app	ADJ
ijassa-310	168	53	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	54	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	55	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	56	maximal	maximal	ADJ
ijassa-310	168	57	app	app	NOUN
ijassa-310	168	58	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	59	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	60	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	61	divide	divide	VERB
ijassa-310	168	62	app	app	ADJ
ijassa-310	168	63	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	64	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	65	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	66	maximal	maximal	ADJ
ijassa-310	168	67	app	app	ADJ
ijassa-310	168	68	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	69	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	70	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	71	maximal	maximal	ADJ
ijassa-310	168	72	app	app	ADJ
ijassa-310	168	73	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	74	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	75	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	76	maximal	maximal	ADJ
ijassa-310	168	77	app	app	ADJ
ijassa-310	168	78	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	79	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	80	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	81	maximal	maximal	ADJ
ijassa-310	168	82	app	app	NOUN
ijassa-310	168	83	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	84	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	85	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	86	maybe	maybe	ADV
ijassa-310	168	87	app	app	ADJ
ijassa-310	168	88	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	89	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	90	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	91	maximal	maximal	ADJ
ijassa-310	168	92	app	app	ADJ
ijassa-310	168	93	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	94	ds	ds	ADJ
ijassa-310	168	95	:	:	PUNCT
ijassa-310	168	96	maximal	maximal	ADJ
ijassa-310	168	97	(	(	PUNCT
ijassa-310	168	98	a	a	X
ijassa-310	168	99	)	)	PUNCT
ijassa-310	168	100	normal	normal	ADJ
ijassa-310	168	101	(	(	PUNCT
ijassa-310	168	102	b	b	NOUN
ijassa-310	168	103	)	)	PUNCT
ijassa-310	168	104	stage	stage	NOUN
ijassa-310	168	105	a	a	DET
ijassa-310	168	106	(	(	PUNCT
ijassa-310	168	107	c	c	NOUN
ijassa-310	168	108	)	)	PUNCT
ijassa-310	168	109	stage	stage	NOUN
ijassa-310	168	110	b	b	PROPN
ijassa-310	168	111	(	(	PUNCT
ijassa-310	168	112	d	d	NOUN
ijassa-310	168	113	)	)	PUNCT
ijassa-310	168	114	stage	stage	NOUN
ijassa-310	168	115	c	c	PROPN
ijassa-310	168	116	fig	fig	NOUN
ijassa-310	168	117	.	.	PUNCT
ijassa-310	169	1	3	3	NUM
ijassa-310	170	1	the	the	DET
ijassa-310	170	2	logical	logical	ADJ
ijassa-310	170	3	networks	network	NOUN
ijassa-310	170	4	of	of	ADP
ijassa-310	170	5	the	the	DET
ijassa-310	170	6	commander	commander	NOUN
ijassa-310	170	7	genes	gene	NOUN
ijassa-310	170	8	of	of	ADP
ijassa-310	170	9	control	control	NOUN
ijassa-310	170	10	and	and	CCONJ
ijassa-310	170	11	three	three	NUM
ijassa-310	170	12	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	170	13	groups	group	NOUN
ijassa-310	170	14	.	.	PUNCT
ijassa-310	171	1	now	now	ADV
ijassa-310	171	2	we	we	PRON
ijassa-310	171	3	begin	begin	VERB
ijassa-310	171	4	to	to	PART
ijassa-310	171	5	analyse	analyse	VERB
ijassa-310	171	6	the	the	DET
ijassa-310	171	7	dynamics	dynamic	NOUN
ijassa-310	171	8	of	of	ADP
ijassa-310	171	9	the	the	DET
ijassa-310	171	10	above	above	ADJ
ijassa-310	171	11	logical	logical	ADJ
ijassa-310	171	12	networks	network	NOUN
ijassa-310	171	13	of	of	ADP
ijassa-310	171	14	the	the	DET
ijassa-310	171	15	commander	commander	NOUN
ijassa-310	171	16	genes	gene	NOUN
ijassa-310	171	17	.	.	PUNCT
ijassa-310	172	1	assume	assume	VERB
ijassa-310	172	2	the	the	DET
ijassa-310	172	3	network	network	NOUN
ijassa-310	172	4	have	have	VERB
ijassa-310	172	5	n	n	NOUN
ijassa-310	172	6	genes	gene	NOUN
ijassa-310	172	7	.	.	PUNCT
ijassa-310	173	1	let	let	VERB
ijassa-310	173	2	the	the	DET
ijassa-310	173	3	state	state	NOUN
ijassa-310	173	4	of	of	ADP
ijassa-310	173	5	gene	gene	NOUN
ijassa-310	173	6	i	i	PRON
ijassa-310	173	7	at	at	ADP
ijassa-310	173	8	moment	moment	NOUN
ijassa-310	173	9	t	t	PROPN
ijassa-310	173	10	be	be	AUX
ijassa-310	173	11	}	}	PUNCT
ijassa-310	173	12	1,0	1,0	NUM
ijassa-310	173	13	{	{	PUNCT
ijassa-310	173	14	)	)	PUNCT
ijassa-310	173	15	(	(	PUNCT
ijassa-310	173	16	txi	txi	NOUN
ijassa-310	173	17	,	,	PUNCT
ijassa-310	173	18	and	and	CCONJ
ijassa-310	173	19	the	the	DET
ijassa-310	173	20	state	state	NOUN
ijassa-310	173	21	-	-	PUNCT
ijassa-310	173	22	vector	vector	NOUN
ijassa-310	173	23	of	of	ADP
ijassa-310	173	24	gene	gene	NOUN
ijassa-310	173	25	i	i	PRON
ijassa-310	173	26	at	at	ADP
ijassa-310	173	27	moment	moment	NOUN
ijassa-310	173	28	1t	1t	NUM
ijassa-310	173	29	be	be	AUX
ijassa-310	173	30	)	)	PUNCT
ijassa-310	173	31	)	)	PUNCT
ijassa-310	174	1	1(),	1(),	NUM
ijassa-310	174	2	...	...	PUNCT
ijassa-310	174	3	,1(),1(()1	,1(),1(()1	PROPN
ijassa-310	174	4	(	(	PUNCT
ijassa-310	174	5	21	21	NUM
ijassa-310	174	6			NOUN
ijassa-310	174	7	txtxtxts	txtxtxts	PROPN
ijassa-310	174	8	n	n	ADV
ijassa-310	174	9	.	.	PUNCT
ijassa-310	175	1	without	without	ADP
ijassa-310	175	2	loss	loss	NOUN
ijassa-310	175	3	of	of	ADP
ijassa-310	175	4	generality	generality	NOUN
ijassa-310	175	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	175	6	the	the	DET
ijassa-310	175	7	triple	triple	ADJ
ijassa-310	175	8	set	set	NOUN
ijassa-310	175	9	comprised	comprise	VERB
ijassa-310	175	10	of	of	ADP
ijassa-310	175	11	the	the	DET
ijassa-310	175	12	u	u	PROPN
ijassa-310	175	13	values	value	NOUN
ijassa-310	175	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	175	15	the	the	DET
ijassa-310	175	16	corresponding	corresponding	ADJ
ijassa-310	175	17	proper	proper	ADJ
ijassa-310	175	18	functions	function	NOUN
ijassa-310	175	19	of	of	ADP
ijassa-310	175	20	1	1	NUM
ijassa-310	175	21	-	-	PUNCT
ijassa-310	175	22	order	order	NOUN
ijassa-310	175	23	and	and	CCONJ
ijassa-310	175	24	the	the	DET
ijassa-310	175	25	genes	gene	NOUN
ijassa-310	175	26	affecting	affect	VERB
ijassa-310	175	27	gene	gene	NOUN
ijassa-310	176	1	i	i	PRON
ijassa-310	176	2	at	at	ADP
ijassa-310	176	3	moment	moment	NOUN
ijassa-310	176	4	t	t	PROPN
ijassa-310	176	5	is	be	AUX
ijassa-310	176	6	1	1	NUM
ijassa-310	176	7	1	1	NUM
ijassa-310	176	8	{	{	PUNCT
ijassa-310	176	9	(	(	PUNCT
ijassa-310	176	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	176	11	,	,	PUNCT
ijassa-310	176	12	)	)	PUNCT
ijassa-310	176	13	{	{	PUNCT
ijassa-310	176	14	1,2	1,2	NUM
ijassa-310	176	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	176	16	...	...	PUNCT
ijassa-310	176	17	,	,	PUNCT
ijassa-310	176	18	}	}	PUNCT
ijassa-310	176	19	,	,	PUNCT
ijassa-310	176	20	}	}	PUNCT
ijassa-310	176	21	k	k	PROPN
ijassa-310	177	1	i	i	PRON
ijassa-310	177	2	kz	kz	PROPN
ijassa-310	177	3	k	k	PROPN
ijassa-310	177	4	u	u	PROPN
ijassa-310	177	5	f	f	PROPN
ijassa-310	177	6	k	k	PROPN
ijassa-310	177	7	n	n	CCONJ
ijassa-310	177	8	k	k	PROPN
ijassa-310	177	9	i	i	PROPN
ijassa-310	177	10			PROPN
ijassa-310	177	11			PROPN
ijassa-310	177	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	13	which	which	PRON
ijassa-310	177	14	denotes	denote	VERB
ijassa-310	177	15	that	that	SCONJ
ijassa-310	177	16	gene	gene	NOUN
ijassa-310	177	17	k	k	PROPN
ijassa-310	177	18	regulates	regulate	VERB
ijassa-310	177	19	gene	gene	NOUN
ijassa-310	177	20	i	i	PRON
ijassa-310	177	21	by	by	ADP
ijassa-310	177	22	the	the	DET
ijassa-310	177	23	proper	proper	ADJ
ijassa-310	177	24	function	function	NOUN
ijassa-310	177	25	1	1	NUM
ijassa-310	177	26	kf	kf	NOUN
ijassa-310	177	27	and	and	CCONJ
ijassa-310	177	28	the	the	DET
ijassa-310	177	29	uncertainty	uncertainty	NOUN
ijassa-310	177	30	coefficient	coefficient	NOUN
ijassa-310	177	31	is	be	AUX
ijassa-310	177	32	iku	iku	PROPN
ijassa-310	177	33			NOUN
ijassa-310	177	34	;	;	PUNCT
ijassa-310	177	35	the	the	DET
ijassa-310	177	36	triple	triple	ADJ
ijassa-310	177	37	set	set	NOUN
ijassa-310	177	38	consisting	consist	VERB
ijassa-310	177	39	of	of	ADP
ijassa-310	177	40	the	the	DET
ijassa-310	177	41	u	u	PROPN
ijassa-310	177	42	values	value	NOUN
ijassa-310	177	43	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	44	the	the	DET
ijassa-310	177	45	corresponding	corresponding	ADJ
ijassa-310	177	46	proper	proper	ADJ
ijassa-310	177	47	functions	function	NOUN
ijassa-310	177	48	of	of	ADP
ijassa-310	177	49	2	2	NUM
ijassa-310	177	50	-	-	PUNCT
ijassa-310	177	51	order	order	NOUN
ijassa-310	177	52	and	and	CCONJ
ijassa-310	177	53	the	the	DET
ijassa-310	177	54	genes	gene	NOUN
ijassa-310	177	55	affecting	affect	VERB
ijassa-310	177	56	gene	gene	NOUN
ijassa-310	177	57	i	i	PRON
ijassa-310	177	58	is	be	AUX
ijassa-310	177	59	1	1	NUM
ijassa-310	177	60	2	2	NUM
ijassa-310	177	61	1	1	NUM
ijassa-310	177	62	2	2	NUM
ijassa-310	177	63	2	2	NUM
ijassa-310	177	64	2	2	NUM
ijassa-310	177	65	1	1	NUM
ijassa-310	177	66	2	2	NUM
ijassa-310	177	67	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	68	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	69	1	1	NUM
ijassa-310	177	70	2	2	NUM
ijassa-310	177	71	1	1	NUM
ijassa-310	177	72	2	2	NUM
ijassa-310	177	73	1	1	NUM
ijassa-310	177	74	2	2	NUM
ijassa-310	177	75	{	{	PUNCT
ijassa-310	177	76	(	(	PUNCT
ijassa-310	177	77	(	(	PUNCT
ijassa-310	177	78	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	79	)	)	PUNCT
ijassa-310	177	80	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	81	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	82	)	)	PUNCT
ijassa-310	177	83	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	84	{	{	PUNCT
ijassa-310	177	85	1,2	1,2	NUM
ijassa-310	177	86	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	87	...	...	PUNCT
ijassa-310	177	88	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	89	}	}	PUNCT
ijassa-310	177	90	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	91	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	92	,	,	PUNCT
ijassa-310	177	93	}	}	PUNCT
ijassa-310	177	94	k	k	X
ijassa-310	178	1	k	k	PROPN
ijassa-310	179	1	i	i	PRON
ijassa-310	179	2	k	k	PROPN
ijassa-310	180	1	kz	kz	PROPN
ijassa-310	180	2	k	k	PROPN
ijassa-310	180	3	k	k	PROPN
ijassa-310	180	4	u	u	X
ijassa-310	180	5	f	f	PROPN
ijassa-310	180	6	k	k	PROPN
ijassa-310	180	7	k	k	PROPN
ijassa-310	181	1	n	n	CCONJ
ijassa-310	181	2	k	k	NOUN
ijassa-310	182	1	i	i	PRON
ijassa-310	182	2	k	k	PROPN
ijassa-310	183	1	i	i	PRON
ijassa-310	183	2	k	k	PROPN
ijassa-310	183	3	k	k	PROPN
ijassa-310	184	1			NOUN
ijassa-310	184	2			NOUN
ijassa-310	184	3			PROPN
ijassa-310	184	4			PROPN
ijassa-310	184	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	6	which	which	PRON
ijassa-310	184	7	denotes	denote	VERB
ijassa-310	184	8	that	that	SCONJ
ijassa-310	184	9	gene	gene	NOUN
ijassa-310	184	10	21,kk	21,kk	NUM
ijassa-310	184	11	regulate	regulate	VERB
ijassa-310	184	12	gene	gene	NOUN
ijassa-310	184	13	i	i	PRON
ijassa-310	184	14	by	by	ADP
ijassa-310	184	15	the	the	DET
ijassa-310	184	16	proper	proper	ADJ
ijassa-310	184	17	function	function	NOUN
ijassa-310	184	18	1	1	NUM
ijassa-310	184	19	2	2	NUM
ijassa-310	184	20	2	2	NUM
ijassa-310	184	21	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	22	k	k	PROPN
ijassa-310	184	23	kf	kf	PROPN
ijassa-310	184	24	and	and	CCONJ
ijassa-310	184	25	the	the	DET
ijassa-310	184	26	uncertainty	uncertainty	NOUN
ijassa-310	184	27	coefficient	coefficient	NOUN
ijassa-310	184	28	is	be	AUX
ijassa-310	184	29	ikku	ikku	NOUN
ijassa-310	184	30	21	21	X
ijassa-310	184	31	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	32	;	;	PUNCT
ijassa-310	184	33	the	the	DET
ijassa-310	184	34	triple	triple	ADJ
ijassa-310	184	35	set	set	NOUN
ijassa-310	184	36	consisting	consist	VERB
ijassa-310	184	37	of	of	ADP
ijassa-310	184	38	the	the	DET
ijassa-310	184	39	u	u	PROPN
ijassa-310	184	40	values	value	NOUN
ijassa-310	184	41	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	42	the	the	DET
ijassa-310	184	43	corresponding	corresponding	ADJ
ijassa-310	184	44	proper	proper	ADJ
ijassa-310	184	45	functions	function	NOUN
ijassa-310	184	46	of	of	ADP
ijassa-310	184	47	3	3	NUM
ijassa-310	184	48	-	-	PUNCT
ijassa-310	184	49	order	order	NOUN
ijassa-310	184	50	and	and	CCONJ
ijassa-310	184	51	the	the	DET
ijassa-310	184	52	genes	gene	NOUN
ijassa-310	184	53	affecting	affect	VERB
ijassa-310	184	54	gene	gene	NOUN
ijassa-310	184	55	i	i	PRON
ijassa-310	184	56	is	be	AUX
ijassa-310	184	57	1	1	NUM
ijassa-310	184	58	2	2	NUM
ijassa-310	184	59	3	3	NUM
ijassa-310	184	60	1	1	NUM
ijassa-310	184	61	2	2	NUM
ijassa-310	184	62	3	3	NUM
ijassa-310	184	63	3	3	NUM
ijassa-310	184	64	3	3	NUM
ijassa-310	184	65	1	1	NUM
ijassa-310	184	66	2	2	NUM
ijassa-310	184	67	3	3	NUM
ijassa-310	184	68	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	69	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	70	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	71	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	72	1	1	NUM
ijassa-310	184	73	2	2	NUM
ijassa-310	184	74	3	3	NUM
ijassa-310	184	75	1	1	NUM
ijassa-310	184	76	2	2	NUM
ijassa-310	184	77	3	3	NUM
ijassa-310	184	78	1	1	NUM
ijassa-310	184	79	2	2	NUM
ijassa-310	184	80	1	1	NUM
ijassa-310	184	81	3	3	NUM
ijassa-310	184	82	2	2	NUM
ijassa-310	184	83	3	3	NUM
ijassa-310	184	84	{	{	PUNCT
ijassa-310	184	85	(	(	PUNCT
ijassa-310	184	86	(	(	PUNCT
ijassa-310	184	87	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	88	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	89	)	)	PUNCT
ijassa-310	184	90	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	91	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	92	)	)	PUNCT
ijassa-310	184	93	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	94	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	95	{	{	PUNCT
ijassa-310	184	96	1,2	1,2	NUM
ijassa-310	184	97	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	98	...	...	PUNCT
ijassa-310	184	99	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	100	}	}	PUNCT
ijassa-310	184	101	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	102	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	103	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	104	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	105	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	106	,	,	PUNCT
ijassa-310	184	107	}	}	PUNCT
ijassa-310	184	108	k	k	X
ijassa-310	185	1	k	k	PROPN
ijassa-310	185	2	k	k	PROPN
ijassa-310	186	1	i	i	PRON
ijassa-310	186	2	k	k	PROPN
ijassa-310	187	1	k	k	PROPN
ijassa-310	187	2	kz	kz	PROPN
ijassa-310	187	3	k	k	PROPN
ijassa-310	187	4	k	k	PROPN
ijassa-310	187	5	k	k	PROPN
ijassa-310	187	6	u	u	X
ijassa-310	187	7	f	f	PROPN
ijassa-310	187	8	k	k	PROPN
ijassa-310	187	9	k	k	PROPN
ijassa-310	187	10	k	k	PROPN
ijassa-310	188	1	n	n	CCONJ
ijassa-310	188	2	k	k	NOUN
ijassa-310	189	1	i	i	PRON
ijassa-310	189	2	k	k	INTJ
ijassa-310	190	1	i	i	PRON
ijassa-310	190	2	k	k	INTJ
ijassa-310	191	1	i	i	PRON
ijassa-310	191	2	k	k	PROPN
ijassa-310	192	1	k	k	PROPN
ijassa-310	193	1	k	k	PROPN
ijassa-310	193	2	k	k	PROPN
ijassa-310	194	1	k	k	PROPN
ijassa-310	194	2	k	k	PROPN
ijassa-310	194	3			NOUN
ijassa-310	194	4			NOUN
ijassa-310	194	5			PROPN
ijassa-310	194	6			NOUN
ijassa-310	194	7			NOUN
ijassa-310	194	8			NOUN
ijassa-310	194	9			NOUN
ijassa-310	194	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	194	11	which	which	PRON
ijassa-310	194	12	denotes	denote	VERB
ijassa-310	194	13	that	that	SCONJ
ijassa-310	194	14	gene	gene	VERB
ijassa-310	194	15	321	321	NUM
ijassa-310	194	16	,	,	PUNCT
ijassa-310	194	17	,	,	PUNCT
ijassa-310	194	18	kkk	kkk	NOUN
ijassa-310	194	19	regulate	regulate	NOUN
ijassa-310	194	20	gene	gene	NOUN
ijassa-310	194	21	i	i	PRON
ijassa-310	194	22	by	by	ADP
ijassa-310	194	23	the	the	DET
ijassa-310	194	24	proper	proper	ADJ
ijassa-310	194	25	function	function	NOUN
ijassa-310	194	26	1	1	NUM
ijassa-310	194	27	2	2	NUM
ijassa-310	194	28	3	3	NUM
ijassa-310	194	29	3	3	NUM
ijassa-310	194	30	,	,	PUNCT
ijassa-310	194	31	,	,	PUNCT
ijassa-310	194	32	k	k	PROPN
ijassa-310	194	33	k	k	PROPN
ijassa-310	194	34	kf	kf	PROPN
ijassa-310	194	35	and	and	CCONJ
ijassa-310	194	36	the	the	DET
ijassa-310	194	37	uncertainty	uncertainty	NOUN
ijassa-310	194	38	coefficient	coefficient	NOUN
ijassa-310	194	39	is	be	AUX
ijassa-310	194	40	ikkku	ikkku	NOUN
ijassa-310	194	41	321	321	PROPN
ijassa-310	194	42	,	,	PUNCT
ijassa-310	194	43	,	,	PUNCT
ijassa-310	194	44	.	.	PUNCT
ijassa-310	195	1	in	in	ADP
ijassa-310	195	2	this	this	DET
ijassa-310	195	3	research	research	NOUN
ijassa-310	195	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	195	5	we	we	PRON
ijassa-310	195	6	consider	consider	VERB
ijassa-310	195	7	that	that	SCONJ
ijassa-310	195	8	the	the	DET
ijassa-310	195	9	state	state	NOUN
ijassa-310	195	10	of	of	ADP
ijassa-310	195	11	gene	gene	NOUN
ijassa-310	195	12	i	i	PRON
ijassa-310	195	13	at	at	ADP
ijassa-310	195	14	moment	moment	NOUN
ijassa-310	195	15	1t	1t	NUM
ijassa-310	195	16	is	be	AUX
ijassa-310	195	17	related	relate	VERB
ijassa-310	195	18	to	to	ADP
ijassa-310	195	19	the	the	DET
ijassa-310	195	20	states	state	NOUN
ijassa-310	195	21	of	of	ADP
ijassa-310	195	22	itself	itself	PRON
ijassa-310	195	23	and	and	CCONJ
ijassa-310	195	24	its	its	PRON
ijassa-310	195	25	adjacent	adjacent	ADJ
ijassa-310	195	26	nodes	node	NOUN
ijassa-310	195	27	.	.	PUNCT
ijassa-310	196	1	at	at	ADP
ijassa-310	196	2	moment	moment	NOUN
ijassa-310	196	3	t	t	NOUN
ijassa-310	196	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	196	5	let	let	VERB
ijassa-310	196	6	genes	gene	NOUN
ijassa-310	196	7	1	1	NUM
ijassa-310	196	8	2	2	NUM
ijassa-310	196	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	196	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	196	11	,	,	PUNCT
ijassa-310	196	12	jk	jk	PROPN
ijassa-310	196	13	k	k	PROPN
ijassa-310	196	14	k	k	PUNCT
ijassa-310	196	15	regulate	regulate	VERB
ijassa-310	196	16	gene	gene	NOUN
ijassa-310	196	17	i	i	PRON
ijassa-310	196	18	by	by	ADP
ijassa-310	196	19	proper	proper	ADJ
ijassa-310	196	20	function	function	NOUN
ijassa-310	196	21	1	1	NUM
ijassa-310	196	22	2	2	NUM
ijassa-310	196	23	,	,	PUNCT
ijassa-310	196	24	,	,	PUNCT
ijassa-310	196	25	,	,	PUNCT
ijassa-310	197	1	j	j	PROPN
ijassa-310	197	2	j	j	PROPN
ijassa-310	197	3	k	k	PROPN
ijassa-310	197	4	k	k	PROPN
ijassa-310	197	5	kf	kf	PROPN
ijassa-310	197	6			NOUN
ijassa-310	197	7	（	（	PUNCT
ijassa-310	197	8			NUM
ijassa-310	197	9	3,2,1j	3,2,1j	PROPN
ijassa-310	197	10	）	）	NOUN
ijassa-310	197	11	.	.	PUNCT
ijassa-310	198	1	if	if	SCONJ
ijassa-310	198	2	the	the	DET
ijassa-310	198	3	truth	truth	NOUN
ijassa-310	198	4	-	-	PUNCT
ijassa-310	198	5	value	value	NOUN
ijassa-310	198	6	of	of	ADP
ijassa-310	198	7	proper	proper	ADJ
ijassa-310	198	8	function	function	NOUN
ijassa-310	198	9	1	1	NUM
ijassa-310	198	10	2	2	NUM
ijassa-310	198	11	,	,	PUNCT
ijassa-310	198	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	198	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	198	14	j	j	PROPN
ijassa-310	198	15	j	j	PROPN
ijassa-310	198	16	k	k	PROPN
ijassa-310	198	17	k	k	PROPN
ijassa-310	198	18	kf	kf	PROPN
ijassa-310	198	19			NOUN
ijassa-310	198	20	with	with	ADP
ijassa-310	198	21	independent	independent	ADJ
ijassa-310	198	22	variable	variable	NOUN
ijassa-310	198	23	being	be	AUX
ijassa-310	198	24	the	the	DET
ijassa-310	198	25	state	state	NOUN
ijassa-310	198	26	of	of	ADP
ijassa-310	198	27	genes	gene	NOUN
ijassa-310	198	28	jkkk	jkkk	ADV
ijassa-310	198	29	,	,	PUNCT
ijassa-310	198	30	,	,	PUNCT
ijassa-310	198	31	,	,	PUNCT
ijassa-310	198	32	21	21	NUM
ijassa-310	198	33			NOUN
ijassa-310	198	34	at	at	ADP
ijassa-310	198	35	moment	moment	NOUN
ijassa-310	198	36	t	t	NOUN
ijassa-310	198	37	is	be	AUX
ijassa-310	198	38	1	1	NUM
ijassa-310	198	39	,	,	PUNCT
ijassa-310	198	40	then	then	ADV
ijassa-310	198	41	these	these	DET
ijassa-310	198	42	j	j	PROPN
ijassa-310	198	43	genes	gene	NOUN
ijassa-310	198	44	jkkk	jkkk	ADV
ijassa-310	198	45	,	,	PUNCT
ijassa-310	198	46	,	,	PUNCT
ijassa-310	198	47	,	,	PUNCT
ijassa-310	198	48	21	21	NUM
ijassa-310	198	49			NOUN
ijassa-310	198	50	activate	activate	VERB
ijassa-310	198	51	the	the	DET
ijassa-310	198	52	expression	expression	NOUN
ijassa-310	198	53	of	of	ADP
ijassa-310	198	54	gene	gene	NOUN
ijassa-310	198	55	i	i	PRON
ijassa-310	198	56	.	.	PUNCT
ijassa-310	199	1	let	let	VERB
ijassa-310	199	2	1	1	NUM
ijassa-310	199	3	2	2	NUM
ijassa-310	199	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	199	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	199	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	199	7	sign	sign	NOUN
ijassa-310	199	8	(	(	PUNCT
ijassa-310	199	9	)	)	PUNCT
ijassa-310	199	10	1	1	NUM
ijassa-310	199	11	jk	jk	PROPN
ijassa-310	199	12	k	k	PROPN
ijassa-310	200	1	k	k	PROPN
ijassa-310	201	1	i	i	PRON
ijassa-310	201	2	t	t	X
ijassa-310	201	3			VERB
ijassa-310	202	1			ADJ
ijassa-310	202	2			NOUN
ijassa-310	202	3	.	.	PUNCT
ijassa-310	203	1	otherwise	otherwise	ADV
ijassa-310	203	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	203	3	these	these	DET
ijassa-310	203	4	j	j	PROPN
ijassa-310	203	5	genes	gene	NOUN
ijassa-310	203	6	jkkk	jkkk	VERB
ijassa-310	203	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	203	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	203	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	203	10	21	21	NUM
ijassa-310	203	11			NOUN
ijassa-310	203	12	repress	repress	NOUN
ijassa-310	203	13	the	the	DET
ijassa-310	203	14	expression	expression	NOUN
ijassa-310	203	15	of	of	ADP
ijassa-310	203	16	gene	gene	NOUN
ijassa-310	203	17	i	i	PRON
ijassa-310	203	18	.	.	PUNCT
ijassa-310	204	1	let	let	VERB
ijassa-310	204	2	1	1	NUM
ijassa-310	204	3	2	2	NUM
ijassa-310	204	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	204	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	204	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	204	7	sign	sign	NOUN
ijassa-310	204	8	(	(	PUNCT
ijassa-310	204	9	)	)	PUNCT
ijassa-310	204	10	1	1	NUM
ijassa-310	204	11	jk	jk	PROPN
ijassa-310	204	12	k	k	PROPN
ijassa-310	205	1	k	k	PROPN
ijassa-310	206	1	i	i	PRON
ijassa-310	206	2	t	t	X
ijassa-310	206	3			VERB
ijassa-310	207	1			NUM
ijassa-310	207	2			PROPN
ijassa-310	207	3			NOUN
ijassa-310	207	4	.	.	PUNCT
ijassa-310	208	1	at	at	ADP
ijassa-310	208	2	moment	moment	NOUN
ijassa-310	208	3	t	t	NOUN
ijassa-310	208	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	208	5	for	for	ADP
ijassa-310	208	6	gene	gene	NOUN
ijassa-310	208	7	i	i	PRON
ijassa-310	208	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	208	9	let	let	VERB
ijassa-310	208	10	)	)	PUNCT
ijassa-310	208	11	(	(	PUNCT
ijassa-310	208	12	sign)(sign)(sign	sign)(sign)(sign	NUM
ijassa-310	208	13	)	)	PUNCT
ijassa-310	208	14	(	(	PUNCT
ijassa-310	208	15	)	)	PUNCT
ijassa-310	208	16	(	(	PUNCT
ijassa-310	208	17	3213	3213	NUM
ijassa-310	208	18	321	321	NUM
ijassa-310	208	19	212	212	NUM
ijassa-310	208	20	21	21	NUM
ijassa-310	208	21	1	1	NUM
ijassa-310	208	22	,	,	PUNCT
ijassa-310	208	23	,	,	PUNCT
ijassa-310	208	24	,	,	PUNCT
ijassa-310	208	25	,	,	PUNCT
ijassa-310	208	26	,	,	PUNCT
ijassa-310	208	27	,	,	PUNCT
ijassa-310	208	28	tutututxtp	tutututxtp	NOUN
ijassa-310	208	29	ikkkz	ikkkz	NOUN
ijassa-310	208	30	ikkk	ikkk	PROPN
ijassa-310	208	31	ikkz	ikkz	VERB
ijassa-310	208	32	ikk	ikk	PROPN
ijassa-310	208	33	ikz	ikz	VERB
ijassa-310	208	34	ikii	ikii	PROPN
ijassa-310	208	35			NOUN
ijassa-310	208	36			NOUN
ijassa-310	209	1			NOUN
ijassa-310	209	2			NOUN
ijassa-310	209	3			NOUN
ijassa-310	209	4			PUNCT
ijassa-310	210	1			VERB
ijassa-310	210	2			NOUN
ijassa-310	210	3	.	.	PUNCT
ijassa-310	211	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	211	2	6	6	NUM
ijassa-310	211	3	)	)	PUNCT
ijassa-310	211	4	then	then	ADV
ijassa-310	211	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	211	6	the	the	DET
ijassa-310	211	7	transition	transition	NOUN
ijassa-310	211	8	rule	rule	NOUN
ijassa-310	211	9	is	be	AUX
ijassa-310	211	10	denoted	denote	VERB
ijassa-310	211	11	by	by	ADP
ijassa-310	211	12	196	196	NUM
ijassa-310	211	13	xu	xu	NUM
ijassa-310	211	14	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	15	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	211	16	for	for	ADP
ijassa-310	211	17	gene	gene	NOUN
ijassa-310	211	18	networks	network	NOUN
ijassa-310	211	19	of	of	ADP
ijassa-310	211	20	colon	colon	NOUN
ijassa-310	211	21	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	211	22	based	base	VERB
ijassa-310	211	23	on	on	ADP
ijassa-310	211	24	logical	logical	ADJ
ijassa-310	211	25	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	211	26	app	app	ADJ
ijassa-310	211	27	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	28	ds	ds	ADJ
ijassa-310	211	29	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	30	consist	consist	VERB
ijassa-310	211	31	app	app	ADJ
ijassa-310	211	32	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	33	ds	ds	ADJ
ijassa-310	211	34	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	35	of	of	ADP
ijassa-310	211	36	app	app	NOUN
ijassa-310	211	37	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	38	ds	ds	ADJ
ijassa-310	211	39	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	40	consist	consist	VERB
ijassa-310	211	41	app	app	ADJ
ijassa-310	211	42	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	43	ds	ds	ADJ
ijassa-310	211	44	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	45	of	of	ADP
ijassa-310	211	46	app	app	NOUN
ijassa-310	211	47	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	48	ds	ds	ADJ
ijassa-310	211	49	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	50	adjacent%20points	adjacent%20point	NOUN
ijassa-310	211	51	app	app	ADJ
ijassa-310	211	52	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	53	ds	ds	ADJ
ijassa-310	211	54	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	55	truth	truth	NOUN
ijassa-310	211	56	-	-	PUNCT
ijassa-310	211	57	value	value	NOUN
ijassa-310	211	58	app	app	NOUN
ijassa-310	211	59	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	60	ds	ds	ADJ
ijassa-310	211	61	:	:	PUNCT
ijassa-310	211	62	independent%20variable	independent%20variable	ADJ
ijassa-310	211	63	197	197	NUM
ijassa-310	211	64			NUM
ijassa-310	211	65			NUM
ijassa-310	211	66			ADP
ijassa-310	211	67			PROPN
ijassa-310	211	68			NUM
ijassa-310	211	69			X
ijassa-310	211	70	,	,	PUNCT
ijassa-310	211	71	5.0)(,0	5.0)(,0	NUM
ijassa-310	211	72	,	,	PUNCT
ijassa-310	211	73	5.0)(,1	5.0)(,1	NUM
ijassa-310	211	74	)	)	PUNCT
ijassa-310	211	75	1	1	NUM
ijassa-310	211	76	(	(	PUNCT
ijassa-310	211	77	tp	tp	NOUN
ijassa-310	211	78	tp	tp	ADP
ijassa-310	211	79	tx	tx	PROPN
ijassa-310	212	1	i	i	PRON
ijassa-310	213	1	i	i	PRON
ijassa-310	214	1	i	i	PRON
ijassa-310	214	2	ni	ni	PROPN
ijassa-310	214	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	214	4	...	...	PUNCT
ijassa-310	214	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	214	6	2,1	2,1	NUM
ijassa-310	214	7	.	.	PUNCT
ijassa-310	215	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	215	2	7	7	NUM
ijassa-310	215	3	)	)	PUNCT
ijassa-310	215	4	according	accord	VERB
ijassa-310	215	5	to	to	ADP
ijassa-310	215	6	the	the	DET
ijassa-310	215	7	above	above	ADJ
ijassa-310	215	8	transition	transition	NOUN
ijassa-310	215	9	rules	rule	NOUN
ijassa-310	215	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	215	11	the	the	DET
ijassa-310	215	12	state	state	NOUN
ijassa-310	215	13	transition	transition	NOUN
ijassa-310	215	14	configuration	configuration	NOUN
ijassa-310	215	15	network	network	NOUN
ijassa-310	215	16	for	for	ADP
ijassa-310	215	17	control	control	NOUN
ijassa-310	215	18	and	and	CCONJ
ijassa-310	215	19	three	three	NUM
ijassa-310	215	20	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	215	21	groups	group	NOUN
ijassa-310	215	22	are	be	AUX
ijassa-310	215	23	obtained	obtain	VERB
ijassa-310	215	24	.	.	PUNCT
ijassa-310	216	1	the	the	DET
ijassa-310	216	2	detailed	detailed	ADJ
ijassa-310	216	3	situations	situation	NOUN
ijassa-310	216	4	are	be	AUX
ijassa-310	216	5	listed	list	VERB
ijassa-310	216	6	in	in	ADP
ijassa-310	216	7	table	table	NOUN
ijassa-310	216	8	6	6	NUM
ijassa-310	216	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	216	10	fig	fig	NOUN
ijassa-310	216	11	.	.	NOUN
ijassa-310	216	12	4	4	NUM
ijassa-310	216	13	and	and	CCONJ
ijassa-310	216	14	fig	fig	NOUN
ijassa-310	216	15	.	.	PUNCT
ijassa-310	217	1	5	5	X
ijassa-310	217	2	.	.	X
ijassa-310	217	3	in	in	ADP
ijassa-310	217	4	the	the	DET
ijassa-310	217	5	networks	network	NOUN
ijassa-310	217	6	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	217	7	to	to	PART
ijassa-310	217	8	control	control	VERB
ijassa-310	217	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	217	10	three	three	NUM
ijassa-310	217	11	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	217	12	groups	group	NOUN
ijassa-310	217	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	217	14	the	the	DET
ijassa-310	217	15	numbers	number	NOUN
ijassa-310	217	16	of	of	ADP
ijassa-310	217	17	nodes	node	NOUN
ijassa-310	217	18	(	(	PUNCT
ijassa-310	217	19	genes	gene	NOUN
ijassa-310	217	20	)	)	PUNCT
ijassa-310	217	21	have	have	VERB
ijassa-310	217	22	certain	certain	ADJ
ijassa-310	217	23	differences	difference	NOUN
ijassa-310	217	24	.	.	PUNCT
ijassa-310	218	1	in	in	ADP
ijassa-310	218	2	order	order	NOUN
ijassa-310	218	3	to	to	PART
ijassa-310	218	4	eliminate	eliminate	VERB
ijassa-310	218	5	the	the	DET
ijassa-310	218	6	differences	difference	NOUN
ijassa-310	218	7	caused	cause	VERB
ijassa-310	218	8	by	by	ADP
ijassa-310	218	9	the	the	DET
ijassa-310	218	10	number	number	NOUN
ijassa-310	218	11	of	of	ADP
ijassa-310	218	12	attractors	attractor	NOUN
ijassa-310	218	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	218	14	the	the	DET
ijassa-310	218	15	stability	stability	NOUN
ijassa-310	218	16	of	of	ADP
ijassa-310	218	17	system	system	NOUN
ijassa-310	218	18	is	be	AUX
ijassa-310	218	19	measured	measure	VERB
ijassa-310	218	20	by	by	ADP
ijassa-310	218	21	the	the	DET
ijassa-310	218	22	frequency	frequency	NOUN
ijassa-310	218	23	of	of	ADP
ijassa-310	218	24	attractors	attractor	NOUN
ijassa-310	218	25	instead	instead	ADV
ijassa-310	218	26	of	of	ADP
ijassa-310	218	27	the	the	DET
ijassa-310	218	28	number	number	NOUN
ijassa-310	218	29	of	of	ADP
ijassa-310	218	30	attractors	attractor	NOUN
ijassa-310	218	31	.	.	PUNCT
ijassa-310	219	1	table	table	NOUN
ijassa-310	219	2	6	6	NUM
ijassa-310	219	3	the	the	DET
ijassa-310	219	4	situations	situation	NOUN
ijassa-310	219	5	of	of	ADP
ijassa-310	219	6	attractors	attractor	NOUN
ijassa-310	219	7	of	of	ADP
ijassa-310	219	8	control	control	NOUN
ijassa-310	219	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	219	10	three	three	NUM
ijassa-310	219	11	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	219	12	groups	group	NOUN
ijassa-310	219	13	stage	stage	VERB
ijassa-310	219	14	no	no	INTJ
ijassa-310	219	15	.	.	PUNCT
ijassa-310	220	1	of	of	ADP
ijassa-310	220	2	genes	gene	NOUN
ijassa-310	220	3	no	no	INTJ
ijassa-310	220	4	.	.	PUNCT
ijassa-310	221	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	221	2	frequency	frequency	NOUN
ijassa-310	221	3	)	)	PUNCT
ijassa-310	221	4	of	of	ADP
ijassa-310	221	5	1	1	NUM
ijassa-310	221	6	-	-	PUNCT
ijassa-310	221	7	periodic	periodic	NOUN
ijassa-310	221	8	attractor	attractor	NOUN
ijassa-310	221	9	no	no	NOUN
ijassa-310	221	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	222	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	222	2	frequency	frequency	NOUN
ijassa-310	222	3	)	)	PUNCT
ijassa-310	222	4	of	of	ADP
ijassa-310	222	5	other	other	ADJ
ijassa-310	222	6	attractor	attractor	NOUN
ijassa-310	222	7	no	no	NOUN
ijassa-310	222	8	.	.	PUNCT
ijassa-310	223	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	223	2	frequency	frequency	NOUN
ijassa-310	223	3	)	)	PUNCT
ijassa-310	223	4	of	of	ADP
ijassa-310	223	5	all	all	DET
ijassa-310	223	6	the	the	DET
ijassa-310	223	7	attractors	attractor	NOUN
ijassa-310	223	8	normal	normal	ADJ
ijassa-310	223	9	12	12	NUM
ijassa-310	223	10	262（6.40	262（6.40	NUM
ijassa-310	223	11	%	%	NOUN
ijassa-310	223	12	）	）	SYM
ijassa-310	224	1	22（0.54	22（0.54	NUM
ijassa-310	224	2	%	%	NOUN
ijassa-310	224	3	）	）	PUNCT
ijassa-310	224	4	284(6.94	284(6.94	NUM
ijassa-310	224	5	%	%	NOUN
ijassa-310	224	6	)	)	PUNCT
ijassa-310	224	7	stage	stage	NOUN
ijassa-310	224	8	a	a	DET
ijassa-310	224	9	12	12	NUM
ijassa-310	224	10	594（14.50	594（14.50	NUM
ijassa-310	224	11	%	%	NOUN
ijassa-310	224	12	）	）	PUNCT
ijassa-310	225	1	6（0.15	6（0.15	NUM
ijassa-310	225	2	%	%	NOUN
ijassa-310	225	3	）	）	PUNCT
ijassa-310	225	4	600(14.65	600(14.65	NUM
ijassa-310	225	5	%	%	NOUN
ijassa-310	225	6	)	)	PUNCT
ijassa-310	225	7	stage	stage	NOUN
ijassa-310	225	8	b	b	NOUN
ijassa-310	225	9	12	12	NUM
ijassa-310	225	10	407（9.94	407（9.94	NUM
ijassa-310	225	11	%	%	NOUN
ijassa-310	225	12	）	）	PUNCT
ijassa-310	226	1	0（0	0（0	NUM
ijassa-310	226	2	%	%	NOUN
ijassa-310	226	3	）	）	PUNCT
ijassa-310	226	4	407(9.94	407(9.94	NUM
ijassa-310	226	5	%	%	NOUN
ijassa-310	226	6	)	)	PUNCT
ijassa-310	226	7	stage	stage	NOUN
ijassa-310	226	8	c	c	PROPN
ijassa-310	226	9	13	13	NUM
ijassa-310	226	10	1812（22.12	1812（22.12	NUM
ijassa-310	226	11	%	%	NOUN
ijassa-310	226	12	）	）	PUNCT
ijassa-310	227	1	116（1.42	116（1.42	NUM
ijassa-310	227	2	%	%	NOUN
ijassa-310	227	3	）	）	SYM
ijassa-310	227	4	1928(23.54	1928(23.54	NUM
ijassa-310	227	5	%	%	NOUN
ijassa-310	227	6	)	)	PUNCT
ijassa-310	227	7	fig	fig	NOUN
ijassa-310	227	8	.	.	PUNCT
ijassa-310	228	1	4	4	NUM
ijassa-310	228	2	2	2	NUM
ijassa-310	228	3	-	-	PUNCT
ijassa-310	228	4	periodic	periodic	ADJ
ijassa-310	228	5	domain	domain	NOUN
ijassa-310	228	6	of	of	ADP
ijassa-310	228	7	attraction	attraction	NOUN
ijassa-310	228	8	with	with	ADP
ijassa-310	228	9	the	the	DET
ijassa-310	228	10	most	most	ADJ
ijassa-310	228	11	nodes	node	NOUN
ijassa-310	228	12	(	(	PUNCT
ijassa-310	228	13	46	46	NUM
ijassa-310	228	14	nodes	node	NOUN
ijassa-310	228	15	)	)	PUNCT
ijassa-310	228	16	of	of	ADP
ijassa-310	228	17	control	control	NOUN
ijassa-310	228	18	group	group	NOUN
ijassa-310	228	19	,	,	PUNCT
ijassa-310	228	20	where	where	SCONJ
ijassa-310	228	21	the	the	DET
ijassa-310	228	22	node	node	NOUN
ijassa-310	228	23	is	be	AUX
ijassa-310	228	24	labeled	label	VERB
ijassa-310	228	25	by	by	ADP
ijassa-310	228	26	the	the	DET
ijassa-310	228	27	decimal	decimal	ADJ
ijassa-310	228	28	number	number	NOUN
ijassa-310	228	29	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	228	30	to	to	ADP
ijassa-310	228	31	the	the	DET
ijassa-310	228	32	binary	binary	ADJ
ijassa-310	228	33	state	state	PROPN
ijassa-310	228	34	vertor	vertor	NOUN
ijassa-310	228	35	.	.	PUNCT
ijassa-310	229	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	229	2	a	a	X
ijassa-310	229	3	)	)	PUNCT
ijassa-310	229	4	normal	normal	ADJ
ijassa-310	229	5	(	(	PUNCT
ijassa-310	229	6	b	b	NOUN
ijassa-310	229	7	)	)	PUNCT
ijassa-310	229	8	stage	stage	NOUN
ijassa-310	229	9	a	a	DET
ijassa-310	229	10	(	(	PUNCT
ijassa-310	229	11	c	c	NOUN
ijassa-310	229	12	)	)	PUNCT
ijassa-310	229	13	stage	stage	NOUN
ijassa-310	229	14	b	b	PROPN
ijassa-310	229	15	(	(	PUNCT
ijassa-310	229	16	d	d	NOUN
ijassa-310	229	17	)	)	PUNCT
ijassa-310	229	18	stage	stage	NOUN
ijassa-310	229	19	c	c	PROPN
ijassa-310	229	20	fig	fig	NOUN
ijassa-310	229	21	.	.	PUNCT
ijassa-310	229	22	5	5	NUM
ijassa-310	229	23	in	in	ADP
ijassa-310	229	24	the	the	DET
ijassa-310	229	25	state	state	NOUN
ijassa-310	229	26	transition	transition	NOUN
ijassa-310	229	27	configuration	configuration	NOUN
ijassa-310	229	28	networks	network	NOUN
ijassa-310	229	29	for	for	ADP
ijassa-310	229	30	control	control	NOUN
ijassa-310	229	31	and	and	CCONJ
ijassa-310	229	32	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	229	33	groups	group	NOUN
ijassa-310	229	34	,	,	PUNCT
ijassa-310	229	35	the	the	DET
ijassa-310	229	36	2	2	NUM
ijassa-310	229	37	-	-	PUNCT
ijassa-310	229	38	periodic	periodic	ADJ
ijassa-310	229	39	domain	domain	NOUN
ijassa-310	229	40	of	of	ADP
ijassa-310	229	41	attraction	attraction	NOUN
ijassa-310	229	42	with	with	ADP
ijassa-310	229	43	the	the	DET
ijassa-310	229	44	most	most	ADJ
ijassa-310	229	45	nodes	node	NOUN
ijassa-310	229	46	,	,	PUNCT
ijassa-310	229	47	where	where	SCONJ
ijassa-310	229	48	the	the	DET
ijassa-310	229	49	transition	transition	NOUN
ijassa-310	229	50	networks	network	NOUN
ijassa-310	229	51	for	for	ADP
ijassa-310	229	52	normal	normal	ADJ
ijassa-310	229	53	,	,	PUNCT
ijassa-310	229	54	stage	stage	NOUN
ijassa-310	229	55	a	a	DET
ijassa-310	229	56	,	,	PUNCT
ijassa-310	229	57	b	b	NOUN
ijassa-310	229	58	and	and	CCONJ
ijassa-310	229	59	c	c	PROPN
ijassa-310	229	60	contain	contain	VERB
ijassa-310	229	61	111	111	NUM
ijassa-310	229	62	,	,	PUNCT
ijassa-310	229	63	42	42	NUM
ijassa-310	229	64	,	,	PUNCT
ijassa-310	229	65	40	40	NUM
ijassa-310	229	66	,	,	PUNCT
ijassa-310	229	67	16	16	NUM
ijassa-310	229	68	nodes	node	NOUN
ijassa-310	229	69	respectively	respectively	ADV
ijassa-310	229	70	.	.	PUNCT
ijassa-310	230	1	5	5	X
ijassa-310	230	2	.	.	X
ijassa-310	230	3	conclusions	conclusion	NOUN
ijassa-310	230	4	and	and	CCONJ
ijassa-310	230	5	discussions	discussion	NOUN
ijassa-310	230	6	in	in	ADP
ijassa-310	230	7	this	this	DET
ijassa-310	230	8	work	work	NOUN
ijassa-310	230	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	230	10	we	we	PRON
ijassa-310	230	11	construct	construct	VERB
ijassa-310	230	12	the	the	DET
ijassa-310	230	13	logical	logical	ADJ
ijassa-310	230	14	networks	network	NOUN
ijassa-310	230	15	using	use	VERB
ijassa-310	230	16	lapp	lapp	NOUN
ijassa-310	230	17	method	method	NOUN
ijassa-310	230	18	based	base	VERB
ijassa-310	230	19	on	on	ADP
ijassa-310	230	20	the	the	DET
ijassa-310	230	21	expression	expression	NOUN
ijassa-310	230	22	data	datum	NOUN
ijassa-310	230	23	of	of	ADP
ijassa-310	230	24	phylogenetic	phylogenetic	ADJ
ijassa-310	230	25	profiles	profile	NOUN
ijassa-310	230	26	of	of	ADP
ijassa-310	230	27	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	230	28	-	-	PUNCT
ijassa-310	230	29	related	relate	VERB
ijassa-310	230	30	genes	gene	NOUN
ijassa-310	230	31	in	in	ADP
ijassa-310	230	32	normal	normal	ADJ
ijassa-310	230	33	,	,	PUNCT
ijassa-310	230	34	stage	stage	NOUN
ijassa-310	230	35	a	a	DET
ijassa-310	230	36	,	,	PUNCT
ijassa-310	230	37	b	b	NOUN
ijassa-310	230	38	and	and	CCONJ
ijassa-310	230	39	c	c	PROPN
ijassa-310	230	40	of	of	ADP
ijassa-310	230	41	colon	colon	NOUN
ijassa-310	230	42	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	230	43	.	.	PUNCT
ijassa-310	231	1	through	through	ADP
ijassa-310	231	2	contrasting	contrast	VERB
ijassa-310	231	3	and	and	CCONJ
ijassa-310	231	4	analyzing	analyzing	NOUN
ijassa-310	231	5	of	of	ADP
ijassa-310	231	6	the	the	DET
ijassa-310	231	7	structures	structure	NOUN
ijassa-310	231	8	of	of	ADP
ijassa-310	231	9	four	four	NUM
ijassa-310	231	10	networks	network	NOUN
ijassa-310	231	11	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	231	12	to	to	ADP
ijassa-310	231	13	advances	advance	NOUN
ijassa-310	231	14	in	in	ADP
ijassa-310	231	15	systems	system	NOUN
ijassa-310	231	16	science	science	NOUN
ijassa-310	231	17	and	and	CCONJ
ijassa-310	231	18	applications	application	NOUN
ijassa-310	231	19	(	(	PUNCT
ijassa-310	231	20	2011	2011	NUM
ijassa-310	231	21	)	)	PUNCT
ijassa-310	231	22	,	,	PUNCT
ijassa-310	231	23	vol	vol	NOUN
ijassa-310	231	24	.	.	PROPN
ijassa-310	231	25	11	11	NUM
ijassa-310	231	26	,	,	PUNCT
ijassa-310	231	27	no	no	INTJ
ijassa-310	231	28	.	.	NOUN
ijassa-310	231	29	1	1	NUM
ijassa-310	231	30	-	-	SYM
ijassa-310	231	31	2	2	NUM
ijassa-310	231	32	app	app	NOUN
ijassa-310	231	33	:	:	PUNCT
ijassa-310	231	34	ds	ds	ADJ
ijassa-310	231	35	:	:	PUNCT
ijassa-310	231	36	eliminate	eliminate	VERB
ijassa-310	231	37	app	app	NOUN
ijassa-310	232	1	:	:	PUNCT
ijassa-310	232	2	ds	ds	ADJ
ijassa-310	232	3	:	:	PUNCT
ijassa-310	232	4	attractor	attractor	NOUN
ijassa-310	232	5	app	app	NOUN
ijassa-310	232	6	:	:	PUNCT
ijassa-310	232	7	ds	ds	ADJ
ijassa-310	232	8	:	:	PUNCT
ijassa-310	232	9	stability	stability	NOUN
ijassa-310	232	10	app	app	NOUN
ijassa-310	232	11	:	:	PUNCT
ijassa-310	232	12	ds	ds	ADJ
ijassa-310	232	13	:	:	PUNCT
ijassa-310	232	14	measure	measure	NOUN
ijassa-310	232	15	app	app	ADJ
ijassa-310	232	16	:	:	PUNCT
ijassa-310	232	17	ds	ds	ADJ
ijassa-310	232	18	:	:	PUNCT
ijassa-310	232	19	decimal%20number	decimal%20number	NOUN
ijassa-310	232	20	app	app	NOUN
ijassa-310	232	21	:	:	PUNCT
ijassa-310	232	22	ds	ds	ADJ
ijassa-310	232	23	:	:	PUNCT
ijassa-310	232	24	binary	binary	ADJ
ijassa-310	232	25	http://dict.cnki.net/dict_source.aspx?searchword=profiles	http://dict.cnki.net/dict_source.aspx?searchword=profiles	NUM
ijassa-310	233	1	app	app	ADJ
ijassa-310	233	2	:	:	PUNCT
ijassa-310	233	3	ds	ds	ADJ
ijassa-310	233	4	:	:	PUNCT
ijassa-310	233	5	colon%20cancer	colon%20cancer	NOUN
ijassa-310	233	6	app	app	PROPN
ijassa-310	233	7	:	:	PUNCT
ijassa-310	234	1	ds	ds	ADJ
ijassa-310	234	2	:	:	PUNCT
ijassa-310	234	3	colon%20cancer	colon%20cancer	NOUN
ijassa-310	234	4	app	app	PROPN
ijassa-310	234	5	:	:	PUNCT
ijassa-310	234	6	ds	ds	ADJ
ijassa-310	234	7	:	:	PUNCT
ijassa-310	234	8	colon%20cancer	colon%20cancer	NOUN
ijassa-310	234	9	app	app	PROPN
ijassa-310	234	10	:	:	PUNCT
ijassa-310	234	11	ds	ds	ADJ
ijassa-310	234	12	:	:	PUNCT
ijassa-310	234	13	contrast	contrast	VERB
ijassa-310	234	14	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	234	15	and	and	CCONJ
ijassa-310	234	16	control	control	NOUN
ijassa-310	234	17	groups	group	NOUN
ijassa-310	234	18	,	,	PUNCT
ijassa-310	234	19	we	we	PRON
ijassa-310	234	20	find	find	VERB
ijassa-310	234	21	the	the	DET
ijassa-310	234	22	significant	significant	ADJ
ijassa-310	234	23	differences	difference	NOUN
ijassa-310	234	24	in	in	ADP
ijassa-310	234	25	the	the	DET
ijassa-310	234	26	structural	structural	ADJ
ijassa-310	234	27	components	component	NOUN
ijassa-310	234	28	(	(	PUNCT
ijassa-310	234	29	fig	fig	NOUN
ijassa-310	234	30	.	.	NOUN
ijassa-310	234	31	1	1	NUM
ijassa-310	234	32	and	and	CCONJ
ijassa-310	234	33	table	table	NOUN
ijassa-310	234	34	2	2	NUM
ijassa-310	234	35	)	)	PUNCT
ijassa-310	234	36	.	.	PUNCT
ijassa-310	235	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	235	2	1	1	X
ijassa-310	235	3	)	)	PUNCT
ijassa-310	235	4	the	the	DET
ijassa-310	235	5	significant	significant	ADJ
ijassa-310	235	6	differences	difference	NOUN
ijassa-310	235	7	in	in	ADP
ijassa-310	235	8	the	the	DET
ijassa-310	235	9	number	number	NOUN
ijassa-310	235	10	of	of	ADP
ijassa-310	235	11	non	non	ADJ
ijassa-310	235	12	-	-	ADJ
ijassa-310	235	13	isolated	isolated	ADJ
ijassa-310	235	14	nodes	node	NOUN
ijassa-310	235	15	:	:	PUNCT
ijassa-310	235	16	in	in	ADP
ijassa-310	235	17	the	the	DET
ijassa-310	235	18	network	network	NOUN
ijassa-310	235	19	for	for	ADP
ijassa-310	235	20	control	control	NOUN
ijassa-310	235	21	group	group	NOUN
ijassa-310	235	22	,	,	PUNCT
ijassa-310	235	23	the	the	DET
ijassa-310	235	24	number	number	NOUN
ijassa-310	235	25	of	of	ADP
ijassa-310	235	26	non	non	ADJ
ijassa-310	235	27	-	-	ADJ
ijassa-310	235	28	isolated	isolated	ADJ
ijassa-310	235	29	nodes	node	NOUN
ijassa-310	235	30	is	be	AUX
ijassa-310	235	31	74	74	NUM
ijassa-310	235	32	;	;	PUNCT
ijassa-310	235	33	in	in	ADP
ijassa-310	235	34	stage	stage	NOUN
ijassa-310	235	35	a	a	PRON
ijassa-310	235	36	,	,	PUNCT
ijassa-310	235	37	b	b	NOUN
ijassa-310	235	38	and	and	CCONJ
ijassa-310	235	39	c	c	PROPN
ijassa-310	235	40	of	of	ADP
ijassa-310	235	41	colon	colon	NOUN
ijassa-310	235	42	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	235	43	,	,	PUNCT
ijassa-310	235	44	the	the	DET
ijassa-310	235	45	numbers	number	NOUN
ijassa-310	235	46	of	of	ADP
ijassa-310	235	47	non	non	ADJ
ijassa-310	235	48	-	-	ADJ
ijassa-310	235	49	isolated	isolated	ADJ
ijassa-310	235	50	nodes	node	NOUN
ijassa-310	235	51	are	be	AUX
ijassa-310	235	52	reduced	reduce	VERB
ijassa-310	235	53	obviously	obviously	ADV
ijassa-310	235	54	,	,	PUNCT
ijassa-310	235	55	moreover	moreover	ADV
ijassa-310	235	56	,	,	PUNCT
ijassa-310	235	57	the	the	PRON
ijassa-310	235	58	fewer	few	ADJ
ijassa-310	235	59	the	the	DET
ijassa-310	235	60	numbers	number	NOUN
ijassa-310	235	61	of	of	ADP
ijassa-310	235	62	non	non	ADJ
ijassa-310	235	63	-	-	ADJ
ijassa-310	235	64	isolated	isolated	ADJ
ijassa-310	235	65	nodes	node	NOUN
ijassa-310	235	66	are	be	AUX
ijassa-310	235	67	,	,	PUNCT
ijassa-310	235	68	the	the	PRON
ijassa-310	235	69	more	more	ADJ
ijassa-310	235	70	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	235	71	deteriorates	deteriorate	VERB
ijassa-310	235	72	.	.	PUNCT
ijassa-310	236	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	236	2	2	2	X
ijassa-310	236	3	)	)	PUNCT
ijassa-310	236	4	the	the	DET
ijassa-310	236	5	significant	significant	ADJ
ijassa-310	236	6	differences	difference	NOUN
ijassa-310	236	7	in	in	ADP
ijassa-310	236	8	the	the	DET
ijassa-310	236	9	the	the	DET
ijassa-310	236	10	number	number	NOUN
ijassa-310	236	11	of	of	ADP
ijassa-310	236	12	logical	logical	ADJ
ijassa-310	236	13	relationship	relationship	NOUN
ijassa-310	236	14	:	:	PUNCT
ijassa-310	236	15	the	the	DET
ijassa-310	236	16	number	number	NOUN
ijassa-310	236	17	of	of	ADP
ijassa-310	236	18	logics	logic	NOUN
ijassa-310	236	19	of	of	ADP
ijassa-310	236	20	the	the	DET
ijassa-310	236	21	network	network	NOUN
ijassa-310	236	22	for	for	ADP
ijassa-310	236	23	control	control	NOUN
ijassa-310	236	24	group	group	NOUN
ijassa-310	236	25	is	be	AUX
ijassa-310	236	26	far	far	ADV
ijassa-310	236	27	more	more	ADJ
ijassa-310	236	28	than	than	ADP
ijassa-310	236	29	the	the	DET
ijassa-310	236	30	one	one	NUM
ijassa-310	236	31	of	of	ADP
ijassa-310	236	32	the	the	DET
ijassa-310	236	33	three	three	NUM
ijassa-310	236	34	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	236	35	groups	group	NOUN
ijassa-310	236	36	.	.	PUNCT
ijassa-310	237	1	in	in	ADP
ijassa-310	237	2	the	the	DET
ijassa-310	237	3	complex	complex	ADJ
ijassa-310	237	4	networks	network	NOUN
ijassa-310	237	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	237	6	the	the	DET
ijassa-310	237	7	number	number	NOUN
ijassa-310	237	8	of	of	ADP
ijassa-310	237	9	non	non	ADJ
ijassa-310	237	10	-	-	ADJ
ijassa-310	237	11	isolated	isolated	ADJ
ijassa-310	237	12	nodes	node	NOUN
ijassa-310	237	13	reflects	reflect	VERB
ijassa-310	237	14	the	the	DET
ijassa-310	237	15	intensity	intensity	NOUN
ijassa-310	237	16	of	of	ADP
ijassa-310	237	17	correlation	correlation	NOUN
ijassa-310	237	18	relationship	relationship	NOUN
ijassa-310	237	19	of	of	ADP
ijassa-310	237	20	nodes	node	NOUN
ijassa-310	237	21	and	and	CCONJ
ijassa-310	237	22	the	the	DET
ijassa-310	237	23	number	number	NOUN
ijassa-310	237	24	of	of	ADP
ijassa-310	237	25	the	the	DET
ijassa-310	237	26	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	237	27	of	of	ADP
ijassa-310	237	28	nodes	node	NOUN
ijassa-310	237	29	indicates	indicate	VERB
ijassa-310	237	30	the	the	DET
ijassa-310	237	31	richness	richness	NOUN
ijassa-310	237	32	of	of	ADP
ijassa-310	237	33	the	the	DET
ijassa-310	237	34	relationship	relationship	NOUN
ijassa-310	237	35	of	of	ADP
ijassa-310	237	36	nodes	node	NOUN
ijassa-310	237	37	of	of	ADP
ijassa-310	237	38	network	network	NOUN
ijassa-310	237	39	.	.	PUNCT
ijassa-310	238	1	in	in	ADP
ijassa-310	238	2	the	the	DET
ijassa-310	238	3	complex	complex	ADJ
ijassa-310	238	4	networks	network	NOUN
ijassa-310	238	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	238	6	most	most	ADJ
ijassa-310	238	7	of	of	ADP
ijassa-310	238	8	genes	gene	NOUN
ijassa-310	238	9	in	in	ADP
ijassa-310	238	10	the	the	DET
ijassa-310	238	11	normal	normal	ADJ
ijassa-310	238	12	stage	stage	NOUN
ijassa-310	238	13	play	play	VERB
ijassa-310	238	14	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	238	15	suppression	suppression	NOUN
ijassa-310	238	16	roles	role	NOUN
ijassa-310	238	17	with	with	ADP
ijassa-310	238	18	other	other	ADJ
ijassa-310	238	19	genes	gene	NOUN
ijassa-310	238	20	cooperating	cooperate	VERB
ijassa-310	238	21	perfectly	perfectly	ADV
ijassa-310	238	22	.	.	PUNCT
ijassa-310	239	1	for	for	ADP
ijassa-310	239	2	some	some	DET
ijassa-310	239	3	(	(	PUNCT
ijassa-310	239	4	internal	internal	ADJ
ijassa-310	239	5	and	and	CCONJ
ijassa-310	239	6	external	external	ADJ
ijassa-310	239	7	)	)	PUNCT
ijassa-310	239	8	reasons	reason	NOUN
ijassa-310	239	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	239	10	the	the	DET
ijassa-310	239	11	regulatory	regulatory	ADJ
ijassa-310	239	12	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	239	13	of	of	ADP
ijassa-310	239	14	several	several	ADJ
ijassa-310	239	15	genes	gene	NOUN
ijassa-310	239	16	with	with	ADP
ijassa-310	239	17	some	some	DET
ijassa-310	239	18	other	other	ADJ
ijassa-310	239	19	genes	gene	NOUN
ijassa-310	239	20	are	be	AUX
ijassa-310	239	21	lost	lose	VERB
ijassa-310	239	22	completely	completely	ADV
ijassa-310	239	23	or	or	CCONJ
ijassa-310	239	24	the	the	DET
ijassa-310	239	25	regulatory	regulatory	ADJ
ijassa-310	239	26	pathways	pathway	NOUN
ijassa-310	239	27	malfunction	malfunction	NOUN
ijassa-310	239	28	seriously	seriously	ADV
ijassa-310	239	29	.	.	PUNCT
ijassa-310	240	1	the	the	DET
ijassa-310	240	2	normal	normal	ADJ
ijassa-310	240	3	tissue	tissue	NOUN
ijassa-310	240	4	appears	appear	VERB
ijassa-310	240	5	abnormal	abnormal	ADJ
ijassa-310	240	6	;	;	PUNCT
ijassa-310	240	7	the	the	DET
ijassa-310	240	8	organism	organism	NOUN
ijassa-310	240	9	suffers	suffer	VERB
ijassa-310	240	10	from	from	ADP
ijassa-310	240	11	the	the	DET
ijassa-310	240	12	colon	colon	NOUN
ijassa-310	240	13	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	240	14	.	.	PUNCT
ijassa-310	241	1	with	with	ADP
ijassa-310	241	2	the	the	DET
ijassa-310	241	3	intensifying	intensifying	NOUN
ijassa-310	241	4	of	of	ADP
ijassa-310	241	5	the	the	DET
ijassa-310	241	6	failure	failure	NOUN
ijassa-310	241	7	of	of	ADP
ijassa-310	241	8	regulation	regulation	NOUN
ijassa-310	241	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	241	10	broadening	broadening	NOUN
ijassa-310	241	11	of	of	ADP
ijassa-310	241	12	the	the	DET
ijassa-310	241	13	failure	failure	NOUN
ijassa-310	241	14	propagation	propagation	NOUN
ijassa-310	241	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	241	16	the	the	DET
ijassa-310	241	17	illness	illness	NOUN
ijassa-310	241	18	increase	increase	NOUN
ijassa-310	241	19	gradually	gradually	ADV
ijassa-310	241	20	.	.	PUNCT
ijassa-310	242	1	(	(	PUNCT
ijassa-310	242	2	3	3	X
ijassa-310	242	3	)	)	PUNCT
ijassa-310	242	4	the	the	DET
ijassa-310	242	5	significant	significant	ADJ
ijassa-310	242	6	differences	difference	NOUN
ijassa-310	242	7	in	in	ADP
ijassa-310	242	8	the	the	DET
ijassa-310	242	9	distribution	distribution	NOUN
ijassa-310	242	10	of	of	ADP
ijassa-310	242	11	logic	logic	ADJ
ijassa-310	242	12	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	242	13	of	of	ADP
ijassa-310	242	14	2	2	NUM
ijassa-310	242	15	-	-	PUNCT
ijassa-310	242	16	order	order	NOUN
ijassa-310	242	17	(	(	PUNCT
ijassa-310	242	18	see	see	VERB
ijassa-310	242	19	fig	fig	NOUN
ijassa-310	242	20	.	.	PUNCT
ijassa-310	242	21	2	2	NUM
ijassa-310	242	22	and	and	CCONJ
ijassa-310	242	23	table	table	NOUN
ijassa-310	242	24	3	3	NUM
ijassa-310	242	25	):	):	PUNCT
ijassa-310	242	26	in	in	ADP
ijassa-310	242	27	the	the	DET
ijassa-310	242	28	network	network	NOUN
ijassa-310	242	29	for	for	ADP
ijassa-310	242	30	control	control	NOUN
ijassa-310	242	31	group	group	NOUN
ijassa-310	242	32	,	,	PUNCT
ijassa-310	242	33	there	there	PRON
ijassa-310	242	34	are	be	VERB
ijassa-310	242	35	three	three	NUM
ijassa-310	242	36	logic	logic	ADJ
ijassa-310	242	37	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	242	38	:	:	PUNCT
ijassa-310	242	39	type	type	NOUN
ijassa-310	242	40	1	1	NUM
ijassa-310	242	41	,	,	PUNCT
ijassa-310	242	42	3	3	NUM
ijassa-310	242	43	and	and	CCONJ
ijassa-310	242	44	6	6	NUM
ijassa-310	242	45	;	;	PUNCT
ijassa-310	242	46	in	in	ADP
ijassa-310	242	47	the	the	DET
ijassa-310	242	48	network	network	NOUN
ijassa-310	242	49	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	242	50	to	to	PART
ijassa-310	242	51	stage	stage	VERB
ijassa-310	242	52	a	a	PRON
ijassa-310	242	53	,	,	PUNCT
ijassa-310	242	54	there	there	PRON
ijassa-310	242	55	are	be	VERB
ijassa-310	242	56	one	one	NUM
ijassa-310	242	57	logic	logic	NOUN
ijassa-310	242	58	motif	motif	NOUN
ijassa-310	242	59	:	:	PUNCT
ijassa-310	242	60	type	type	NOUN
ijassa-310	242	61	1	1	NUM
ijassa-310	242	62	;	;	PUNCT
ijassa-310	242	63	in	in	ADP
ijassa-310	242	64	the	the	DET
ijassa-310	242	65	networks	network	NOUN
ijassa-310	242	66	for	for	ADP
ijassa-310	242	67	stage	stage	NOUN
ijassa-310	242	68	b	b	PROPN
ijassa-310	242	69	and	and	CCONJ
ijassa-310	242	70	c	c	NOUN
ijassa-310	242	71	,	,	PUNCT
ijassa-310	242	72	there	there	PRON
ijassa-310	242	73	are	be	VERB
ijassa-310	242	74	two	two	NUM
ijassa-310	242	75	logic	logic	ADJ
ijassa-310	242	76	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	242	77	:	:	PUNCT
ijassa-310	242	78	type	type	NOUN
ijassa-310	242	79	1	1	NUM
ijassa-310	242	80	and	and	CCONJ
ijassa-310	242	81	3	3	NUM
ijassa-310	242	82	.	.	X
ijassa-310	243	1	we	we	PRON
ijassa-310	243	2	find	find	VERB
ijassa-310	243	3	from	from	ADP
ijassa-310	243	4	the	the	DET
ijassa-310	243	5	above	above	ADJ
ijassa-310	243	6	results	result	NOUN
ijassa-310	243	7	that	that	SCONJ
ijassa-310	243	8	the	the	DET
ijassa-310	243	9	logic	logic	NOUN
ijassa-310	243	10	type	type	NOUN
ijassa-310	243	11	1	1	NUM
ijassa-310	243	12	appears	appear	VERB
ijassa-310	243	13	in	in	ADP
ijassa-310	243	14	the	the	DET
ijassa-310	243	15	networks	network	NOUN
ijassa-310	243	16	for	for	ADP
ijassa-310	243	17	control	control	NOUN
ijassa-310	243	18	and	and	CCONJ
ijassa-310	243	19	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	243	20	groups	group	NOUN
ijassa-310	243	21	,	,	PUNCT
ijassa-310	243	22	yet	yet	CCONJ
ijassa-310	243	23	the	the	DET
ijassa-310	243	24	logic	logic	ADJ
ijassa-310	243	25	type	type	NOUN
ijassa-310	243	26	6	6	NUM
ijassa-310	243	27	appears	appear	VERB
ijassa-310	243	28	only	only	ADV
ijassa-310	243	29	in	in	ADP
ijassa-310	243	30	the	the	DET
ijassa-310	243	31	network	network	NOUN
ijassa-310	243	32	for	for	ADP
ijassa-310	243	33	control	control	NOUN
ijassa-310	243	34	group	group	NOUN
ijassa-310	243	35	.	.	PUNCT
ijassa-310	244	1	in	in	ADP
ijassa-310	244	2	this	this	DET
ijassa-310	244	3	research	research	NOUN
ijassa-310	244	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	244	5	we	we	PRON
ijassa-310	244	6	consider	consider	VERB
ijassa-310	244	7	that	that	DET
ijassa-310	244	8	logic	logic	NOUN
ijassa-310	244	9	types	type	NOUN
ijassa-310	244	10	(	(	PUNCT
ijassa-310	244	11	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	244	12	)	)	PUNCT
ijassa-310	244	13	of	of	ADP
ijassa-310	244	14	2	2	NUM
ijassa-310	244	15	-	-	PUNCT
ijassa-310	244	16	order	order	NOUN
ijassa-310	244	17	are	be	AUX
ijassa-310	244	18	corresponding	correspond	VERB
ijassa-310	244	19	to	to	ADP
ijassa-310	244	20	typical	typical	ADJ
ijassa-310	244	21	modes	mode	NOUN
ijassa-310	244	22	of	of	ADP
ijassa-310	244	23	biochemical	biochemical	ADJ
ijassa-310	244	24	reactions	reaction	NOUN
ijassa-310	244	25	in	in	ADP
ijassa-310	244	26	life	life	NOUN
ijassa-310	244	27	actions	action	NOUN
ijassa-310	244	28	.	.	PUNCT
ijassa-310	245	1	the	the	DET
ijassa-310	245	2	above	above	ADJ
ijassa-310	245	3	phenomena	phenomenon	NOUN
ijassa-310	245	4	might	might	AUX
ijassa-310	245	5	show	show	VERB
ijassa-310	245	6	that	that	DET
ijassa-310	245	7	logic	logic	NOUN
ijassa-310	245	8	type	type	NOUN
ijassa-310	245	9	1	1	NUM
ijassa-310	245	10	(	(	PUNCT
ijassa-310	245	11	bac	bac	NOUN
ijassa-310	245	12			NOUN
ijassa-310	245	13	)	)	PUNCT
ijassa-310	245	14	is	be	AUX
ijassa-310	245	15	the	the	DET
ijassa-310	245	16	basic	basic	ADJ
ijassa-310	245	17	mode	mode	NOUN
ijassa-310	245	18	maintaining	maintain	VERB
ijassa-310	245	19	human	human	ADJ
ijassa-310	245	20	existence	existence	NOUN
ijassa-310	245	21	and	and	CCONJ
ijassa-310	245	22	physiological	physiological	ADJ
ijassa-310	245	23	metabolism	metabolism	NOUN
ijassa-310	245	24	reactions	reaction	NOUN
ijassa-310	245	25	,	,	PUNCT
ijassa-310	245	26	yet	yet	CCONJ
ijassa-310	245	27	logic	logic	ADJ
ijassa-310	245	28	type	type	NOUN
ijassa-310	245	29	6	6	NUM
ijassa-310	245	30	(	(	PUNCT
ijassa-310	245	31	c	c	PROPN
ijassa-310	245	32	a	a	DET
ijassa-310	245	33	b	b	NOUN
ijassa-310	245	34			NOUN
ijassa-310	245	35	or	or	CCONJ
ijassa-310	245	36	c	c	X
ijassa-310	245	37	a	a	DET
ijassa-310	245	38	b	b	NOUN
ijassa-310	245	39			VERB
ijassa-310	245	40			NOUN
ijassa-310	245	41	)	)	PUNCT
ijassa-310	245	42	is	be	AUX
ijassa-310	245	43	the	the	DET
ijassa-310	245	44	reaction	reaction	NOUN
ijassa-310	245	45	mode	mode	NOUN
ijassa-310	245	46	suppressing	suppress	VERB
ijassa-310	245	47	the	the	DET
ijassa-310	245	48	normal	normal	ADJ
ijassa-310	245	49	organism	organism	NOUN
ijassa-310	245	50	not	not	PART
ijassa-310	245	51	suffering	suffer	VERB
ijassa-310	245	52	from	from	ADP
ijassa-310	245	53	the	the	DET
ijassa-310	245	54	colon	colon	NOUN
ijassa-310	245	55	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	245	56	.	.	PUNCT
ijassa-310	246	1	the	the	DET
ijassa-310	246	2	materials	material	NOUN
ijassa-310	246	3	[	[	X
ijassa-310	246	4	24	24	NUM
ijassa-310	246	5	]	]	PUNCT
ijassa-310	246	6	have	have	AUX
ijassa-310	246	7	showed	show	VERB
ijassa-310	246	8	that	that	DET
ijassa-310	246	9	logic	logic	NOUN
ijassa-310	246	10	type	type	NOUN
ijassa-310	246	11	1	1	NUM
ijassa-310	246	12	does	do	AUX
ijassa-310	246	13	appear	appear	VERB
ijassa-310	246	14	frequently	frequently	ADV
ijassa-310	246	15	in	in	ADP
ijassa-310	246	16	the	the	DET
ijassa-310	246	17	complex	complex	ADJ
ijassa-310	246	18	biochemical	biochemical	ADJ
ijassa-310	246	19	reactions	reaction	NOUN
ijassa-310	246	20	of	of	ADP
ijassa-310	246	21	the	the	DET
ijassa-310	246	22	human	human	ADJ
ijassa-310	246	23	body	body	NOUN
ijassa-310	246	24	.	.	PUNCT
ijassa-310	247	1	for	for	ADP
ijassa-310	247	2	example	example	NOUN
ijassa-310	247	3	:	:	PUNCT
ijassa-310	247	4	the	the	DET
ijassa-310	247	5	coupling	couple	VERB
ijassa-310	247	6	protein	protein	NOUN
ijassa-310	247	7	x	x	PUNCT
ijassa-310	247	8	and	and	CCONJ
ijassa-310	247	9	y	y	PROPN
ijassa-310	247	10	plays	play	VERB
ijassa-310	247	11	a	a	DET
ijassa-310	247	12	regulatory	regulatory	ADJ
ijassa-310	247	13	role	role	NOUN
ijassa-310	247	14	in	in	ADP
ijassa-310	247	15	the	the	DET
ijassa-310	247	16	expression	expression	NOUN
ijassa-310	247	17	of	of	ADP
ijassa-310	247	18	protein	protein	NOUN
ijassa-310	247	19	z	z	PROPN
ijassa-310	247	20	,	,	PUNCT
ijassa-310	247	21	where	where	SCONJ
ijassa-310	247	22	x	x	X
ijassa-310	247	23	,	,	PUNCT
ijassa-310	247	24	y	y	PROPN
ijassa-310	247	25	and	and	CCONJ
ijassa-310	247	26	z	z	NOUN
ijassa-310	247	27	are	be	AUX
ijassa-310	247	28	the	the	DET
ijassa-310	247	29	specific	specific	ADJ
ijassa-310	247	30	proteins	protein	NOUN
ijassa-310	247	31	.	.	PUNCT
ijassa-310	248	1	in	in	ADP
ijassa-310	248	2	conclusion	conclusion	NOUN
ijassa-310	248	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	248	4	the	the	DET
ijassa-310	248	5	logical	logical	ADJ
ijassa-310	248	6	networks	network	NOUN
ijassa-310	248	7	for	for	ADP
ijassa-310	248	8	control	control	NOUN
ijassa-310	248	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	248	10	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	248	11	groups	group	NOUN
ijassa-310	248	12	are	be	AUX
ijassa-310	248	13	the	the	DET
ijassa-310	248	14	models	model	NOUN
ijassa-310	248	15	of	of	ADP
ijassa-310	248	16	structural	structural	ADJ
ijassa-310	248	17	mechanism	mechanism	NOUN
ijassa-310	248	18	of	of	ADP
ijassa-310	248	19	the	the	DET
ijassa-310	248	20	normal	normal	ADJ
ijassa-310	248	21	organism	organism	NOUN
ijassa-310	248	22	suffering	suffering	NOUN
ijassa-310	248	23	from	from	ADP
ijassa-310	248	24	the	the	DET
ijassa-310	248	25	colon	colon	NOUN
ijassa-310	248	26	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	248	27	gradually	gradually	ADV
ijassa-310	248	28	.	.	PUNCT
ijassa-310	249	1	the	the	DET
ijassa-310	249	2	organism	organism	NOUN
ijassa-310	249	3	is	be	AUX
ijassa-310	249	4	normal	normal	ADJ
ijassa-310	249	5	in	in	ADP
ijassa-310	249	6	the	the	DET
ijassa-310	249	7	normal	normal	ADJ
ijassa-310	249	8	stage	stage	NOUN
ijassa-310	249	9	because	because	SCONJ
ijassa-310	249	10	the	the	DET
ijassa-310	249	11	biochemical	biochemical	ADJ
ijassa-310	249	12	reaction	reaction	NOUN
ijassa-310	249	13	mode	mode	NOUN
ijassa-310	249	14	(	(	PUNCT
ijassa-310	249	15	type	type	NOUN
ijassa-310	249	16	6	6	NUM
ijassa-310	249	17	)	)	PUNCT
ijassa-310	249	18	,	,	PUNCT
ijassa-310	249	19	the	the	DET
ijassa-310	249	20	extent	extent	NOUN
ijassa-310	249	21	of	of	ADP
ijassa-310	249	22	genes	gene	NOUN
ijassa-310	249	23	relationship	relationship	NOUN
ijassa-310	249	24	(	(	PUNCT
ijassa-310	249	25	the	the	DET
ijassa-310	249	26	number	number	NOUN
ijassa-310	249	27	of	of	ADP
ijassa-310	249	28	logical	logical	ADJ
ijassa-310	249	29	relationship	relationship	NOUN
ijassa-310	249	30	)	)	PUNCT
ijassa-310	249	31	and	and	CCONJ
ijassa-310	249	32	most	most	ADJ
ijassa-310	249	33	of	of	ADP
ijassa-310	249	34	the	the	DET
ijassa-310	249	35	genes	gene	NOUN
ijassa-310	249	36	(	(	PUNCT
ijassa-310	249	37	the	the	DET
ijassa-310	249	38	number	number	NOUN
ijassa-310	249	39	of	of	ADP
ijassa-310	249	40	non	non	ADJ
ijassa-310	249	41	-	-	ADJ
ijassa-310	249	42	isolated	isolated	ADJ
ijassa-310	249	43	nodes	node	NOUN
ijassa-310	249	44	)	)	PUNCT
ijassa-310	249	45	play	play	VERB
ijassa-310	249	46	normal	normal	ADJ
ijassa-310	249	47	roles	role	NOUN
ijassa-310	249	48	.	.	PUNCT
ijassa-310	250	1	with	with	ADP
ijassa-310	250	2	the	the	DET
ijassa-310	250	3	change	change	NOUN
ijassa-310	250	4	of	of	ADP
ijassa-310	250	5	the	the	DET
ijassa-310	250	6	reaction	reaction	NOUN
ijassa-310	250	7	mode	mode	NOUN
ijassa-310	250	8	of	of	ADP
ijassa-310	250	9	the	the	DET
ijassa-310	250	10	organism	organism	NOUN
ijassa-310	250	11	and	and	CCONJ
ijassa-310	250	12	the	the	DET
ijassa-310	250	13	decreasing	decreasing	NOUN
ijassa-310	250	14	of	of	ADP
ijassa-310	250	15	the	the	DET
ijassa-310	250	16	number	number	NOUN
ijassa-310	250	17	of	of	ADP
ijassa-310	250	18	acting	act	VERB
ijassa-310	250	19	genes	gene	NOUN
ijassa-310	250	20	and	and	CCONJ
ijassa-310	250	21	their	their	PRON
ijassa-310	250	22	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	250	23	,	,	PUNCT
ijassa-310	250	24	many	many	ADJ
ijassa-310	250	25	intrinsic	intrinsic	ADJ
ijassa-310	250	26	biological	biological	ADJ
ijassa-310	250	27	functions	function	NOUN
ijassa-310	250	28	are	be	AUX
ijassa-310	250	29	weaken	weaken	VERB
ijassa-310	250	30	or	or	CCONJ
ijassa-310	250	31	lost	lose	VERB
ijassa-310	250	32	gradually	gradually	ADV
ijassa-310	250	33	,	,	PUNCT
ijassa-310	250	34	thus	thus	ADV
ijassa-310	250	35	the	the	DET
ijassa-310	250	36	organism	organism	NOUN
ijassa-310	250	37	suffers	suffer	VERB
ijassa-310	250	38	from	from	ADP
ijassa-310	250	39	the	the	DET
ijassa-310	250	40	colon	colon	NOUN
ijassa-310	250	41	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	250	42	.	.	PUNCT
ijassa-310	251	1	however	however	ADV
ijassa-310	251	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	251	3	the	the	DET
ijassa-310	251	4	significant	significant	ADJ
ijassa-310	251	5	differences	difference	NOUN
ijassa-310	251	6	between	between	ADP
ijassa-310	251	7	the	the	DET
ijassa-310	251	8	networks	network	NOUN
ijassa-310	251	9	for	for	ADP
ijassa-310	251	10	control	control	NOUN
ijassa-310	251	11	and	and	CCONJ
ijassa-310	251	12	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	251	13	groups	group	NOUN
ijassa-310	251	14	mentioned	mention	VERB
ijassa-310	251	15	above	above	ADV
ijassa-310	251	16	are	be	AUX
ijassa-310	251	17	the	the	DET
ijassa-310	251	18	causes	cause	NOUN
ijassa-310	251	19	or	or	CCONJ
ijassa-310	251	20	the	the	DET
ijassa-310	251	21	consequences	consequence	NOUN
ijassa-310	251	22	of	of	ADP
ijassa-310	251	23	the	the	DET
ijassa-310	251	24	organism	organism	NOUN
ijassa-310	251	25	suffering	suffering	NOUN
ijassa-310	251	26	from	from	ADP
ijassa-310	251	27	the	the	DET
ijassa-310	251	28	colon	colon	NOUN
ijassa-310	251	29	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	251	30	,	,	PUNCT
ijassa-310	251	31	which	which	PRON
ijassa-310	251	32	will	will	AUX
ijassa-310	251	33	also	also	ADV
ijassa-310	251	34	need	need	VERB
ijassa-310	251	35	to	to	PART
ijassa-310	251	36	be	be	AUX
ijassa-310	251	37	verified	verify	VERB
ijassa-310	251	38	by	by	ADP
ijassa-310	251	39	the	the	DET
ijassa-310	251	40	clinical	clinical	ADJ
ijassa-310	251	41	experiments	experiment	NOUN
ijassa-310	251	42	and	and	CCONJ
ijassa-310	251	43	annlysis	annlysis	NOUN
ijassa-310	251	44	of	of	ADP
ijassa-310	251	45	biomedical	biomedical	ADJ
ijassa-310	251	46	researchers	researcher	NOUN
ijassa-310	251	47	.	.	PUNCT
ijassa-310	252	1	table	table	NOUN
ijassa-310	252	2	5	5	NUM
ijassa-310	252	3	shows	show	VERB
ijassa-310	252	4	the	the	DET
ijassa-310	252	5	commander	commander	NOUN
ijassa-310	252	6	genes	gene	NOUN
ijassa-310	252	7	of	of	ADP
ijassa-310	252	8	control	control	NOUN
ijassa-310	252	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	252	10	three	three	NUM
ijassa-310	252	11	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	252	12	groups	group	NOUN
ijassa-310	252	13	.	.	PUNCT
ijassa-310	253	1	we	we	PRON
ijassa-310	253	2	can	can	AUX
ijassa-310	253	3	find	find	VERB
ijassa-310	253	4	that	that	SCONJ
ijassa-310	253	5	:	:	PUNCT
ijassa-310	253	6	three	three	NUM
ijassa-310	253	7	genes	gene	NOUN
ijassa-310	253	8	plag1	plag1	NOUN
ijassa-310	253	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	253	10	vav1	vav1	PROPN
ijassa-310	253	11	and	and	CCONJ
ijassa-310	253	12	zap70	zap70	PROPN
ijassa-310	253	13	appearing	appear	VERB
ijassa-310	253	14	in	in	ADP
ijassa-310	253	15	control	control	NOUN
ijassa-310	253	16	group	group	NOUN
ijassa-310	253	17	are	be	AUX
ijassa-310	253	18	also	also	ADV
ijassa-310	253	19	active	active	ADJ
ijassa-310	253	20	in	in	ADP
ijassa-310	253	21	the	the	DET
ijassa-310	253	22	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	253	23	groups	group	NOUN
ijassa-310	253	24	,	,	PUNCT
ijassa-310	253	25	and	and	CCONJ
ijassa-310	253	26	the	the	DET
ijassa-310	253	27	three	three	NUM
ijassa-310	253	28	genes	gene	NOUN
ijassa-310	253	29	might	might	AUX
ijassa-310	253	30	regulate	regulate	VERB
ijassa-310	253	31	the	the	DET
ijassa-310	253	32	basic	basic	ADJ
ijassa-310	253	33	survival	survival	NOUN
ijassa-310	253	34	activities	activity	NOUN
ijassa-310	253	35	of	of	ADP
ijassa-310	253	36	human	human	NOUN
ijassa-310	253	37	.	.	PUNCT
ijassa-310	254	1	the	the	DET
ijassa-310	254	2	material	material	NOUN
ijassa-310	254	3	shows	show	VERB
ijassa-310	254	4	:	:	PUNCT
ijassa-310	254	5	gene	gene	NOUN
ijassa-310	254	6	vav1	vav1	PROPN
ijassa-310	254	7	as	as	ADP
ijassa-310	254	8	a	a	DET
ijassa-310	254	9	kind	kind	NOUN
ijassa-310	254	10	of	of	ADP
ijassa-310	254	11	signal	signal	ADJ
ijassa-310	254	12	transduction	transduction	NOUN
ijassa-310	254	13	molecule	molecule	NOUN
ijassa-310	254	14	can	can	AUX
ijassa-310	254	15	happen	happen	VERB
ijassa-310	254	16	quickly	quickly	ADV
ijassa-310	254	17	tyrosine	tyrosine	ADJ
ijassa-310	254	18	phosphorylation	phosphorylation	NOUN
ijassa-310	254	19	with	with	ADP
ijassa-310	254	20	ifn	ifn	PROPN
ijassa-310	254	21	-	-	PUNCT
ijassa-310	254	22	α	α	NOUN
ijassa-310	254	23	,	,	PUNCT
ijassa-310	254	24	il-3	il-3	PRON
ijassa-310	254	25	,	,	PUNCT
ijassa-310	254	26	gm	gm	PROPN
ijassa-310	254	27	-	-	PUNCT
ijassa-310	254	28	csf	csf	ADJ
ijassa-310	254	29	,	,	PUNCT
ijassa-310	254	30	growth	growth	NOUN
ijassa-310	254	31	factor	factor	NOUN
ijassa-310	254	32	or	or	CCONJ
ijassa-310	254	33	antigen	antigen	ADJ
ijassa-310	254	34	receptors	receptor	NOUN
ijassa-310	254	35	after	after	ADP
ijassa-310	254	36	the	the	DET
ijassa-310	254	37	activation	activation	NOUN
ijassa-310	254	38	and	and	CCONJ
ijassa-310	254	39	plays	play	VERB
ijassa-310	254	40	an	an	DET
ijassa-310	254	41	important	important	ADJ
ijassa-310	254	42	role	role	NOUN
ijassa-310	254	43	in	in	ADP
ijassa-310	254	44	the	the	DET
ijassa-310	254	45	process	process	NOUN
ijassa-310	254	46	of	of	ADP
ijassa-310	254	47	cell	cell	NOUN
ijassa-310	254	48	differentiation	differentiation	NOUN
ijassa-310	254	49	,	,	PUNCT
ijassa-310	254	50	proliferation	proliferation	NOUN
ijassa-310	254	51	[	[	X
ijassa-310	254	52	21	21	NUM
ijassa-310	254	53	]	]	PUNCT
ijassa-310	254	54	.	.	PUNCT
ijassa-310	255	1	gene	gene	PROPN
ijassa-310	255	2	zap70	zap70	PROPN
ijassa-310	255	3	plays	play	VERB
ijassa-310	255	4	a	a	DET
ijassa-310	255	5	very	very	ADV
ijassa-310	255	6	important	important	ADJ
ijassa-310	255	7	role	role	NOUN
ijassa-310	255	8	of	of	ADP
ijassa-310	255	9	transfer	transfer	NOUN
ijassa-310	255	10	signal	signal	NOUN
ijassa-310	255	11	in	in	ADP
ijassa-310	255	12	the	the	DET
ijassa-310	255	13	process	process	NOUN
ijassa-310	255	14	of	of	ADP
ijassa-310	255	15	activation	activation	NOUN
ijassa-310	255	16	of	of	ADP
ijassa-310	255	17	t	t	NOUN
ijassa-310	255	18	-	-	PUNCT
ijassa-310	255	19	cell	cell	NOUN
ijassa-310	255	20	mediated	mediate	VERB
ijassa-310	255	21	by	by	ADP
ijassa-310	255	22	cd3	cd3	PROPN
ijassa-310	255	23	and/or	and/or	CCONJ
ijassa-310	255	24	cd3	cd3	PROPN
ijassa-310	255	25	chain	chain	NOUN
ijassa-310	255	26	[	[	X
ijassa-310	255	27	21	21	NUM
ijassa-310	255	28	]	]	PUNCT
ijassa-310	255	29	.	.	PUNCT
ijassa-310	256	1	other	other	ADJ
ijassa-310	256	2	genes	gene	NOUN
ijassa-310	256	3	faslg	faslg	PROPN
ijassa-310	256	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	256	5	axl	axl	PROPN
ijassa-310	256	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	256	7	etv3	etv3	PROPN
ijassa-310	256	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	256	9	gli3	gli3	PROPN
ijassa-310	256	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	256	11	il1a	il1a	PROPN
ijassa-310	256	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	256	13	rbl1	rbl1	NOUN
ijassa-310	256	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	256	15	tal1	tal1	PROPN
ijassa-310	256	16	,	,	PUNCT
ijassa-310	256	17	tcl1a	tcl1a	PROPN
ijassa-310	256	18	,	,	PUNCT
ijassa-310	256	19	bag2	bag2	NOUN
ijassa-310	256	20	of	of	ADP
ijassa-310	256	21	control	control	NOUN
ijassa-310	256	22	group	group	NOUN
ijassa-310	256	23	do	do	AUX
ijassa-310	256	24	not	not	PART
ijassa-310	256	25	appear	appear	VERB
ijassa-310	256	26	in	in	ADP
ijassa-310	256	27	the	the	DET
ijassa-310	256	28	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	256	29	groups	group	NOUN
ijassa-310	256	30	and	and	CCONJ
ijassa-310	256	31	they	they	PRON
ijassa-310	256	32	might	might	AUX
ijassa-310	256	33	be	be	AUX
ijassa-310	256	34	the	the	DET
ijassa-310	256	35	suppressor	suppressor	NOUN
ijassa-310	256	36	genes	gene	NOUN
ijassa-310	256	37	of	of	ADP
ijassa-310	256	38	colon	colon	NOUN
ijassa-310	256	39	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	256	40	in	in	ADP
ijassa-310	256	41	human	human	ADJ
ijassa-310	256	42	genome	genome	NOUN
ijassa-310	256	43	.	.	PUNCT
ijassa-310	257	1	furthermore	furthermore	ADV
ijassa-310	257	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	257	3	genes	gene	NOUN
ijassa-310	257	4	araf，bak1，ptk2b，fgf2，ihh，stk11，hpse	araf，bak1，ptk2b，fgf2，ihh，stk11，hpse	ADV
ijassa-310	257	5	appear	appear	VERB
ijassa-310	257	6	in	in	ADP
ijassa-310	257	7	at	at	ADV
ijassa-310	257	8	least	least	ADV
ijassa-310	257	9	two	two	NUM
ijassa-310	257	10	stages	stage	NOUN
ijassa-310	257	11	of	of	ADP
ijassa-310	257	12	the	the	DET
ijassa-310	257	13	198	198	NUM
ijassa-310	257	14	xu	xu	NOUN
ijassa-310	257	15	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	16	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	257	17	for	for	ADP
ijassa-310	257	18	gene	gene	NOUN
ijassa-310	257	19	networks	network	NOUN
ijassa-310	257	20	of	of	ADP
ijassa-310	257	21	colon	colon	NOUN
ijassa-310	257	22	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	257	23	based	base	VERB
ijassa-310	257	24	on	on	ADP
ijassa-310	257	25	logical	logical	ADJ
ijassa-310	257	26	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	257	27	app	app	ADJ
ijassa-310	257	28	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	29	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	30	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	31	significant	significant	ADJ
ijassa-310	257	32	app	app	NOUN
ijassa-310	257	33	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	34	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	35	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	36	difference	difference	NOUN
ijassa-310	257	37	app	app	NOUN
ijassa-310	257	38	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	39	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	40	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	41	significant	significant	ADJ
ijassa-310	257	42	app	app	NOUN
ijassa-310	257	43	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	44	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	45	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	46	difference	difference	NOUN
ijassa-310	257	47	app	app	NOUN
ijassa-310	257	48	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	49	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	50	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	51	significant	significant	ADJ
ijassa-310	257	52	app	app	NOUN
ijassa-310	257	53	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	54	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	55	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	56	difference	difference	NOUN
ijassa-310	257	57	app	app	NOUN
ijassa-310	257	58	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	59	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	60	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	61	reflect	reflect	VERB
ijassa-310	257	62	app	app	NOUN
ijassa-310	257	63	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	64	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	65	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	66	indicate	indicate	VERB
ijassa-310	257	67	app	app	NOUN
ijassa-310	257	68	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	69	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	70	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	71	tissue	tissue	NOUN
ijassa-310	257	72	app	app	NOUN
ijassa-310	257	73	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	74	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	75	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	76	organism	organism	ADJ
ijassa-310	257	77	app	app	NOUN
ijassa-310	257	78	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	79	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	80	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	81	significant	significant	ADJ
ijassa-310	257	82	app	app	NOUN
ijassa-310	257	83	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	84	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	85	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	86	difference	difference	NOUN
ijassa-310	257	87	app	app	NOUN
ijassa-310	257	88	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	89	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	90	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	91	biological%20phenomena	biological%20phenomena	PROPN
ijassa-310	257	92	app	app	PROPN
ijassa-310	257	93	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	94	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	95	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	96	suppressor	suppressor	NOUN
ijassa-310	257	97	app	app	NOUN
ijassa-310	257	98	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	99	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	100	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	101	organism	organism	ADJ
ijassa-310	257	102	app	app	NOUN
ijassa-310	257	103	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	104	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	105	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	106	material	material	ADJ
ijassa-310	257	107	app	app	NOUN
ijassa-310	257	108	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	109	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	110	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	111	specific	specific	ADJ
ijassa-310	257	112	app	app	NOUN
ijassa-310	257	113	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	114	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	115	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	116	mechanism	mechanism	NOUN
ijassa-310	257	117	app	app	NOUN
ijassa-310	257	118	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	119	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	120	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	121	organism	organism	ADJ
ijassa-310	257	122	app	app	NOUN
ijassa-310	257	123	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	124	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	125	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	126	gradually	gradually	ADV
ijassa-310	257	127	app	app	ADJ
ijassa-310	257	128	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	129	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	130	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	131	organism	organism	ADJ
ijassa-310	257	132	app	app	NOUN
ijassa-310	257	133	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	134	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	135	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	136	extent	extent	NOUN
ijassa-310	257	137	app	app	NOUN
ijassa-310	257	138	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	139	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	140	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	141	normal	normal	ADJ
ijassa-310	257	142	app	app	NOUN
ijassa-310	257	143	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	144	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	145	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	146	change	change	VERB
ijassa-310	257	147	app	app	ADJ
ijassa-310	257	148	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	149	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	150	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	151	organism	organism	ADJ
ijassa-310	257	152	app	app	NOUN
ijassa-310	257	153	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	154	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	155	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	156	decrease	decrease	NOUN
ijassa-310	257	157	app	app	NOUN
ijassa-310	257	158	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	159	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	160	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	161	acting	act	VERB
ijassa-310	257	162	app	app	NOUN
ijassa-310	257	163	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	164	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	165	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	166	biological	biological	ADJ
ijassa-310	257	167	app	app	NOUN
ijassa-310	257	168	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	169	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	170	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	171	weaken	weaken	VERB
ijassa-310	257	172	app	app	NOUN
ijassa-310	257	173	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	174	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	175	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	176	gradually	gradually	ADV
ijassa-310	257	177	app	app	ADJ
ijassa-310	257	178	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	179	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	180	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	181	organism	organism	ADJ
ijassa-310	257	182	app	app	NOUN
ijassa-310	257	183	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	184	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	185	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	186	significant	significant	ADJ
ijassa-310	257	187	app	app	NOUN
ijassa-310	257	188	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	189	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	190	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	191	difference	difference	NOUN
ijassa-310	257	192	app	app	NOUN
ijassa-310	257	193	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	194	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	195	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	196	mention	mention	VERB
ijassa-310	257	197	app	app	ADJ
ijassa-310	257	198	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	199	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	200	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	201	organism	organism	ADJ
ijassa-310	257	202	app	app	NOUN
ijassa-310	257	203	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	204	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	205	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	206	clinical%20experiment	clinical%20experiment	NOUN
ijassa-310	257	207	app	app	NOUN
ijassa-310	257	208	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	209	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	210	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	211	active	active	ADJ
ijassa-310	257	212	app	app	NOUN
ijassa-310	257	213	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	214	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	215	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	216	material	material	ADJ
ijassa-310	257	217	app	app	NOUN
ijassa-310	257	218	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	219	ds	ds	ADJ
ijassa-310	257	220	:	:	PUNCT
ijassa-310	257	221	growth%20factor	growth%20factor	NOUN
ijassa-310	257	222	199	199	NUM
ijassa-310	257	223	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	257	224	groups	group	NOUN
ijassa-310	257	225	and	and	CCONJ
ijassa-310	257	226	not	not	PART
ijassa-310	257	227	in	in	ADP
ijassa-310	257	228	control	control	NOUN
ijassa-310	257	229	group	group	NOUN
ijassa-310	257	230	,	,	PUNCT
ijassa-310	257	231	thus	thus	ADV
ijassa-310	257	232	the	the	DET
ijassa-310	257	233	seven	seven	NUM
ijassa-310	257	234	genes	gene	NOUN
ijassa-310	257	235	might	might	AUX
ijassa-310	257	236	be	be	AUX
ijassa-310	257	237	the	the	DET
ijassa-310	257	238	oncogenes	oncogene	NOUN
ijassa-310	257	239	of	of	ADP
ijassa-310	257	240	colon	colon	NOUN
ijassa-310	257	241	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	257	242	.	.	PUNCT
ijassa-310	258	1	the	the	DET
ijassa-310	258	2	facticity	facticity	NOUN
ijassa-310	258	3	and	and	CCONJ
ijassa-310	258	4	reliability	reliability	NOUN
ijassa-310	258	5	predicted	predict	VERB
ijassa-310	258	6	in	in	ADP
ijassa-310	258	7	the	the	DET
ijassa-310	258	8	above	above	NOUN
ijassa-310	258	9	will	will	AUX
ijassa-310	258	10	also	also	ADV
ijassa-310	258	11	need	need	VERB
ijassa-310	258	12	to	to	PART
ijassa-310	258	13	be	be	AUX
ijassa-310	258	14	verified	verify	VERB
ijassa-310	258	15	by	by	ADP
ijassa-310	258	16	biological	biological	ADJ
ijassa-310	258	17	experiments	experiment	NOUN
ijassa-310	258	18	.	.	PUNCT
ijassa-310	259	1	in	in	ADP
ijassa-310	259	2	the	the	DET
ijassa-310	259	3	process	process	NOUN
ijassa-310	259	4	of	of	ADP
ijassa-310	259	5	the	the	DET
ijassa-310	259	6	dynamic	dynamic	ADJ
ijassa-310	259	7	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	259	8	of	of	ADP
ijassa-310	259	9	logical	logical	ADJ
ijassa-310	259	10	network	network	NOUN
ijassa-310	259	11	of	of	ADP
ijassa-310	259	12	the	the	DET
ijassa-310	259	13	commander	commander	NOUN
ijassa-310	259	14	genes	gene	NOUN
ijassa-310	259	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	259	16	we	we	PRON
ijassa-310	259	17	find	find	VERB
ijassa-310	259	18	from	from	ADP
ijassa-310	259	19	the	the	DET
ijassa-310	259	20	numerical	numerical	ADJ
ijassa-310	259	21	experiments	experiment	NOUN
ijassa-310	259	22	that	that	SCONJ
ijassa-310	259	23	the	the	DET
ijassa-310	259	24	number	number	NOUN
ijassa-310	259	25	of	of	ADP
ijassa-310	259	26	attractors	attractor	NOUN
ijassa-310	259	27	of	of	ADP
ijassa-310	259	28	control	control	NOUN
ijassa-310	259	29	and	and	CCONJ
ijassa-310	259	30	three	three	NUM
ijassa-310	259	31	experimental	experimental	ADJ
ijassa-310	259	32	groups	group	NOUN
ijassa-310	259	33	has	have	VERB
ijassa-310	259	34	obvious	obvious	ADJ
ijassa-310	259	35	difference	difference	NOUN
ijassa-310	259	36	(	(	PUNCT
ijassa-310	259	37	table	table	NOUN
ijassa-310	259	38	6	6	NUM
ijassa-310	259	39	)	)	PUNCT
ijassa-310	259	40	.	.	PUNCT
ijassa-310	260	1	the	the	DET
ijassa-310	260	2	former	former	ADJ
ijassa-310	260	3	is	be	AUX
ijassa-310	260	4	far	far	ADV
ijassa-310	260	5	less	less	ADJ
ijassa-310	260	6	than	than	ADP
ijassa-310	260	7	the	the	DET
ijassa-310	260	8	latter	latter	ADJ
ijassa-310	260	9	.	.	PUNCT
ijassa-310	261	1	according	accord	VERB
ijassa-310	261	2	to	to	ADP
ijassa-310	261	3	the	the	DET
ijassa-310	261	4	principle	principle	NOUN
ijassa-310	261	5	and	and	CCONJ
ijassa-310	261	6	theory	theory	NOUN
ijassa-310	261	7	of	of	ADP
ijassa-310	261	8	dynamics	dynamic	NOUN
ijassa-310	261	9	:	:	PUNCT
ijassa-310	261	10	the	the	PRON
ijassa-310	261	11	less	less	ADJ
ijassa-310	261	12	the	the	DET
ijassa-310	261	13	number	number	NOUN
ijassa-310	261	14	of	of	ADP
ijassa-310	261	15	attractors	attractor	NOUN
ijassa-310	261	16	is	be	AUX
ijassa-310	261	17	,	,	PUNCT
ijassa-310	261	18	the	the	PRON
ijassa-310	261	19	more	more	ADV
ijassa-310	261	20	stable	stable	ADJ
ijassa-310	261	21	the	the	DET
ijassa-310	261	22	system	system	NOUN
ijassa-310	261	23	is	be	AUX
ijassa-310	261	24	.	.	PUNCT
ijassa-310	262	1	from	from	ADP
ijassa-310	262	2	the	the	DET
ijassa-310	262	3	view	view	NOUN
ijassa-310	262	4	of	of	ADP
ijassa-310	262	5	biology	biology	NOUN
ijassa-310	262	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	262	7	the	the	DET
ijassa-310	262	8	construction	construction	NOUN
ijassa-310	262	9	should	should	AUX
ijassa-310	262	10	be	be	AUX
ijassa-310	262	11	more	more	ADV
ijassa-310	262	12	stable	stable	ADJ
ijassa-310	262	13	in	in	ADP
ijassa-310	262	14	the	the	DET
ijassa-310	262	15	normal	normal	ADJ
ijassa-310	262	16	organism	organism	NOUN
ijassa-310	262	17	than	than	ADP
ijassa-310	262	18	the	the	DET
ijassa-310	262	19	stages	stage	NOUN
ijassa-310	262	20	of	of	ADP
ijassa-310	262	21	colon	colon	NOUN
ijassa-310	262	22	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	262	23	.	.	PUNCT
ijassa-310	263	1	the	the	DET
ijassa-310	263	2	views	view	NOUN
ijassa-310	263	3	from	from	ADP
ijassa-310	263	4	two	two	NUM
ijassa-310	263	5	points	point	NOUN
ijassa-310	263	6	are	be	AUX
ijassa-310	263	7	just	just	ADV
ijassa-310	263	8	coincident	coincident	ADJ
ijassa-310	263	9	.	.	PUNCT
ijassa-310	264	1	thus	thus	ADV
ijassa-310	264	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	264	3	we	we	PRON
ijassa-310	264	4	conclude	conclude	VERB
ijassa-310	264	5	that	that	SCONJ
ijassa-310	264	6	the	the	DET
ijassa-310	264	7	instability	instability	NOUN
ijassa-310	264	8	of	of	ADP
ijassa-310	264	9	the	the	DET
ijassa-310	264	10	commander	commander	NOUN
ijassa-310	264	11	genes	gene	NOUN
ijassa-310	264	12	of	of	ADP
ijassa-310	264	13	organisms	organism	NOUN
ijassa-310	264	14	might	might	AUX
ijassa-310	264	15	be	be	AUX
ijassa-310	264	16	an	an	DET
ijassa-310	264	17	important	important	ADJ
ijassa-310	264	18	reason	reason	NOUN
ijassa-310	264	19	or	or	CCONJ
ijassa-310	264	20	result	result	NOUN
ijassa-310	264	21	in	in	ADP
ijassa-310	264	22	the	the	DET
ijassa-310	264	23	process	process	NOUN
ijassa-310	264	24	of	of	ADP
ijassa-310	264	25	the	the	DET
ijassa-310	264	26	colon	colon	NOUN
ijassa-310	264	27	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	264	28	disease	disease	NOUN
ijassa-310	264	29	.	.	PUNCT
ijassa-310	265	1	we	we	PRON
ijassa-310	265	2	utilize	utilize	VERB
ijassa-310	265	3	lapp	lapp	NOUN
ijassa-310	265	4	to	to	PART
ijassa-310	265	5	search	search	VERB
ijassa-310	265	6	1-	1-	PROPN
ijassa-310	265	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	265	8	2and	2and	NUM
ijassa-310	265	9	3	3	NUM
ijassa-310	265	10	-	-	PUNCT
ijassa-310	265	11	order	order	NOUN
ijassa-310	265	12	logical	logical	ADJ
ijassa-310	265	13	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	265	14	and	and	CCONJ
ijassa-310	265	15	logic	logic	NOUN
ijassa-310	265	16	types	type	NOUN
ijassa-310	265	17	among	among	ADP
ijassa-310	265	18	the	the	DET
ijassa-310	265	19	genes	gene	NOUN
ijassa-310	265	20	or	or	CCONJ
ijassa-310	265	21	proteins	protein	NOUN
ijassa-310	265	22	.	.	PUNCT
ijassa-310	266	1	using	use	VERB
ijassa-310	266	2	lapp	lapp	NOUN
ijassa-310	266	3	to	to	PART
ijassa-310	266	4	determine	determine	VERB
ijassa-310	266	5	the	the	DET
ijassa-310	266	6	logical	logical	ADJ
ijassa-310	266	7	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	266	8	of	of	ADP
ijassa-310	266	9	genes	gene	NOUN
ijassa-310	266	10	and	and	CCONJ
ijassa-310	266	11	proteins	protein	NOUN
ijassa-310	266	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	266	13	there	there	PRON
ijassa-310	266	14	might	might	AUX
ijassa-310	266	15	appear	appear	VERB
ijassa-310	266	16	„	„	PUNCT
ijassa-310	266	17	false	false	ADV
ijassa-310	266	18	-	-	PUNCT
ijassa-310	266	19	positive‟	positive‟	ADJ
ijassa-310	266	20	and	and	CCONJ
ijassa-310	266	21	„	„	PUNCT
ijassa-310	266	22	false	false	ADJ
ijassa-310	266	23	-	-	PUNCT
ijassa-310	266	24	negative‟.	negative‟.	NOUN
ijassa-310	266	25	that	that	PRON
ijassa-310	266	26	is	be	AUX
ijassa-310	266	27	to	to	PART
ijassa-310	266	28	say	say	VERB
ijassa-310	266	29	there	there	PRON
ijassa-310	266	30	exist	exist	VERB
ijassa-310	266	31	some	some	DET
ijassa-310	266	32	errors	error	NOUN
ijassa-310	266	33	during	during	ADP
ijassa-310	266	34	determining	determine	VERB
ijassa-310	266	35	logical	logical	ADJ
ijassa-310	266	36	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	266	37	.	.	PUNCT
ijassa-310	267	1	we	we	PRON
ijassa-310	267	2	do	do	AUX
ijassa-310	267	3	not	not	PART
ijassa-310	267	4	analyze	analyze	VERB
ijassa-310	267	5	the	the	DET
ijassa-310	267	6	errors	error	NOUN
ijassa-310	267	7	caused	cause	VERB
ijassa-310	267	8	by	by	ADP
ijassa-310	267	9	lapp	lapp	NOUN
ijassa-310	267	10	in	in	ADP
ijassa-310	267	11	this	this	DET
ijassa-310	267	12	paper	paper	NOUN
ijassa-310	267	13	.	.	PUNCT
ijassa-310	268	1	as	as	ADP
ijassa-310	268	2	to	to	ADP
ijassa-310	268	3	how	how	SCONJ
ijassa-310	268	4	to	to	PART
ijassa-310	268	5	overcome	overcome	VERB
ijassa-310	268	6	the	the	DET
ijassa-310	268	7	shortcomings	shortcoming	NOUN
ijassa-310	268	8	of	of	ADP
ijassa-310	268	9	lapp	lapp	NOUN
ijassa-310	268	10	method	method	NOUN
ijassa-310	268	11	and	and	CCONJ
ijassa-310	268	12	seek	seek	VERB
ijassa-310	268	13	the	the	DET
ijassa-310	268	14	better	well	ADJ
ijassa-310	268	15	algorithm	algorithm	NOUN
ijassa-310	268	16	of	of	ADP
ijassa-310	268	17	u	u	PROPN
ijassa-310	268	18	value	value	NOUN
ijassa-310	268	19	,	,	PUNCT
ijassa-310	268	20	we	we	PRON
ijassa-310	268	21	are	be	AUX
ijassa-310	268	22	making	make	VERB
ijassa-310	268	23	further	further	ADJ
ijassa-310	268	24	study	study	NOUN
ijassa-310	268	25	.	.	PUNCT
ijassa-310	269	1	references	reference	NOUN
ijassa-310	269	2	[	[	X
ijassa-310	269	3	1	1	NUM
ijassa-310	269	4	]	]	X
ijassa-310	269	5	lander	lander	X
ijassa-310	269	6	e	e	X
ijassa-310	269	7	s	s	PROPN
ijassa-310	269	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	269	9	weinberg	weinberg	PROPN
ijassa-310	269	10	r	r	NOUN
ijassa-310	269	11	a.	a.	NOUN
ijassa-310	269	12	genomics	genomic	NOUN
ijassa-310	269	13	:	:	PUNCT
ijassa-310	269	14	journey	journey	NOUN
ijassa-310	269	15	to	to	ADP
ijassa-310	269	16	the	the	DET
ijassa-310	269	17	center	center	NOUN
ijassa-310	269	18	of	of	ADP
ijassa-310	269	19	biology	biology	NOUN
ijassa-310	269	20	.	.	PUNCT
ijassa-310	270	1	science	science	NOUN
ijassa-310	270	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	270	3	2000	2000	NUM
ijassa-310	270	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	270	5	287(5459	287(5459	NUM
ijassa-310	270	6	):	):	PUNCT
ijassa-310	270	7	1777	1777	NUM
ijassa-310	270	8	-	-	SYM
ijassa-310	270	9	1782	1782	NUM
ijassa-310	270	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	271	1	[	[	X
ijassa-310	271	2	2	2	NUM
ijassa-310	271	3	]	]	PUNCT
ijassa-310	271	4	zhenfang	zhenfang	PROPN
ijassa-310	271	5	liao	liao	PROPN
ijassa-310	271	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	271	7	dean	dean	PROPN
ijassa-310	271	8	lei	lei	PROPN
ijassa-310	271	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	271	10	wei	wei	PROPN
ijassa-310	271	11	shen	shen	PROPN
ijassa-310	271	12	.	.	PUNCT
ijassa-310	272	1	the	the	DET
ijassa-310	272	2	research	research	NOUN
ijassa-310	272	3	progress	progress	NOUN
ijassa-310	272	4	of	of	ADP
ijassa-310	272	5	genes	gene	NOUN
ijassa-310	272	6	related	relate	VERB
ijassa-310	272	7	to	to	ADP
ijassa-310	272	8	the	the	DET
ijassa-310	272	9	metastasis	metastasis	NOUN
ijassa-310	272	10	of	of	ADP
ijassa-310	272	11	colon	colon	NOUN
ijassa-310	272	12	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	272	13	.	.	PUNCT
ijassa-310	273	1	modern	modern	ADJ
ijassa-310	273	2	oncology	oncology	NOUN
ijassa-310	273	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	273	4	2006	2006	NUM
ijassa-310	273	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	273	6	14(9	14(9	NUM
ijassa-310	273	7	):	):	PUNCT
ijassa-310	273	8	1174	1174	NUM
ijassa-310	273	9	-	-	SYM
ijassa-310	273	10	1176	1176	NUM
ijassa-310	273	11	.	.	PUNCT
ijassa-310	274	1	[	[	X
ijassa-310	274	2	3	3	X
ijassa-310	274	3	]	]	X
ijassa-310	274	4	zhang	zhang	PROPN
ijassa-310	274	5	h	h	PROPN
ijassa-310	274	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	274	7	yu	yu	PROPN
ijassa-310	274	8	c	c	PROPN
ijassa-310	274	9	y	y	PROPN
ijassa-310	274	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	274	11	si	si	PROPN
ijassa-310	274	12	nger	nger	PROPN
ijassa-310	274	13	b	b	PROPN
ijassa-310	274	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	274	15	et	et	PROPN
ijassa-310	274	16	al	al	PROPN
ijassa-310	274	17	..	..	PUNCT
ijassa-310	274	18	recursive	recursive	ADJ
ijassa-310	274	19	partioning	partioning	NOUN
ijassa-310	274	20	for	for	ADP
ijassa-310	274	21	tumor	tumor	NOUN
ijassa-310	274	22	classification	classification	NOUN
ijassa-310	274	23	with	with	ADP
ijassa-310	274	24	gene	gene	NOUN
ijassa-310	274	25	expression	expression	NOUN
ijassa-310	274	26	microarray	microarray	NOUN
ijassa-310	274	27	data	datum	NOUN
ijassa-310	274	28	.	.	PUNCT
ijassa-310	275	1	pnas	pnas	PROPN
ijassa-310	275	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	275	3	2001	2001	NUM
ijassa-310	275	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	275	5	98	98	NUM
ijassa-310	275	6	:	:	PUNCT
ijassa-310	275	7	6730	6730	NUM
ijassa-310	275	8	-	-	SYM
ijassa-310	275	9	6735	6735	NUM
ijassa-310	275	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	276	1	[	[	X
ijassa-310	276	2	4	4	X
ijassa-310	276	3	]	]	PUNCT
ijassa-310	276	4	xia	xia	PROPN
ijassa-310	276	5	li	li	PROPN
ijassa-310	276	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	276	7	shaoqi	shaoqi	PROPN
ijassa-310	276	8	rao	rao	PROPN
ijassa-310	276	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	276	10	tianwen	tianwen	PROPN
ijassa-310	276	11	zhang	zhang	PROPN
ijassa-310	276	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	276	13	zheng	zheng	PROPN
ijassa-310	276	14	guo	guo	PROPN
ijassa-310	276	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	276	16	qingpu	qingpu	PROPN
ijassa-310	276	17	zhang	zhang	PROPN
ijassa-310	276	18	,	,	PUNCT
ijassa-310	276	19	k.	k.	PROPN
ijassa-310	276	20	l.	l.	PROPN
ijassa-310	276	21	moser	moser	PROPN
ijassa-310	276	22	,	,	PUNCT
ijassa-310	276	23	e.	e.	PROPN
ijassa-310	276	24	j.	j.	PROPN
ijassa-310	276	25	topol	topol	PROPN
ijassa-310	276	26	.	.	PUNCT
ijassa-310	277	1	integrated	integrate	VERB
ijassa-310	277	2	decision	decision	NOUN
ijassa-310	277	3	method	method	NOUN
ijassa-310	277	4	of	of	ADP
ijassa-310	277	5	mining	mining	NOUN
ijassa-310	277	6	genes	gene	NOUN
ijassa-310	277	7	related	relate	VERB
ijassa-310	277	8	to	to	ADP
ijassa-310	277	9	complex	complex	ADJ
ijassa-310	277	10	disease	disease	NOUN
ijassa-310	277	11	appling	apple	VERB
ijassa-310	277	12	the	the	DET
ijassa-310	277	13	dna	dna	PROPN
ijassa-310	277	14	chip	chip	NOUN
ijassa-310	277	15	data	datum	NOUN
ijassa-310	277	16	.	.	PUNCT
ijassa-310	278	1	science	science	NOUN
ijassa-310	278	2	in	in	ADP
ijassa-310	278	3	china	china	PROPN
ijassa-310	278	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	278	5	ser	ser	PROPN
ijassa-310	278	6	.	.	PUNCT
ijassa-310	279	1	c	c	NOUN
ijassa-310	279	2	-	-	PUNCT
ijassa-310	279	3	life	life	NOUN
ijassa-310	279	4	science	science	NOUN
ijassa-310	279	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	279	6	2004	2004	NUM
ijassa-310	279	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	279	8	34(2):195	34(2):195	NOUN
ijassa-310	279	9	-	-	SYM
ijassa-310	279	10	202	202	NUM
ijassa-310	279	11	.	.	PUNCT
ijassa-310	280	1	[	[	X
ijassa-310	280	2	5	5	NUM
ijassa-310	280	3	]	]	PUNCT
ijassa-310	280	4	tibsh	tibsh	NOUN
ijassa-310	280	5	irani	irani	ADJ
ijassa-310	280	6	r	r	NOUN
ijassa-310	280	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	280	8	ha	ha	INTJ
ijassa-310	280	9	s	s	VERB
ijassa-310	280	10	ti	ti	NOUN
ijassa-310	280	11	e	e	PROPN
ijassa-310	280	12	t	t	PROPN
ijassa-310	280	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	280	14	narasim	narasim	PROPN
ijassa-310	280	15	han	han	PROPN
ijassa-310	280	16	b	b	PROPN
ijassa-310	280	17	,	,	PUNCT
ijassa-310	280	18	et	et	PROPN
ijassa-310	280	19	al	al	PROPN
ijassa-310	280	20	..	..	PUNCT
ijassa-310	280	21	diagnosis	diagnosis	NOUN
ijassa-310	280	22	of	of	ADP
ijassa-310	280	23	multiple	multiple	ADJ
ijassa-310	280	24	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	280	25	types	type	NOUN
ijassa-310	280	26	by	by	ADP
ijassa-310	280	27	shrunken	shrunken	ADJ
ijassa-310	280	28	centroids	centroid	NOUN
ijassa-310	280	29	of	of	ADP
ijassa-310	280	30	gene	gene	NOUN
ijassa-310	280	31	expression	expression	NOUN
ijassa-310	280	32	.	.	PUNCT
ijassa-310	281	1	pnas	pnas	PROPN
ijassa-310	281	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	281	3	2002	2002	NUM
ijassa-310	281	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	281	5	99(10	99(10	NUM
ijassa-310	281	6	):	):	PUNCT
ijassa-310	281	7	6567	6567	NUM
ijassa-310	281	8	-	-	SYM
ijassa-310	281	9	6572	6572	NUM
ijassa-310	281	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	282	1	[	[	X
ijassa-310	282	2	6	6	NUM
ijassa-310	282	3	]	]	X
ijassa-310	282	4	khan	khan	PROPN
ijassa-310	282	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	6	j.	j.	PROPN
ijassa-310	282	7	,wei	,wei	PROPN
ijassa-310	282	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	9	j.	j.	PROPN
ijassa-310	282	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	11	ringner	ringner	NOUN
ijassa-310	282	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	13	m.	m.	NOUN
ijassa-310	282	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	15	saal	saal	PROPN
ijassa-310	282	16	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	17	l.	l.	PROPN
ijassa-310	282	18	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	19	ladanyi	ladanyi	PROPN
ijassa-310	282	20	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	21	m.	m.	NOUN
ijassa-310	282	22	,westermann	,westermann	PROPN
ijassa-310	282	23	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	24	f.	f.	PROPN
ijassa-310	282	25	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	26	berthold	berthold	PROPN
ijassa-310	282	27	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	28	f.	f.	PROPN
ijassa-310	282	29	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	30	schwab	schwab	PROPN
ijassa-310	282	31	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	32	m.	m.	NOUN
ijassa-310	282	33	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	34	antonescu	antonescu	PROPN
ijassa-310	282	35	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	36	c.	c.	PROPN
ijassa-310	282	37	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	38	peterson	peterson	PROPN
ijassa-310	282	39	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	40	c.	c.	PROPN
ijassa-310	282	41	,	,	PUNCT
ijassa-310	282	42	et	et	PROPN
ijassa-310	282	43	al	al	PROPN
ijassa-310	282	44	..	..	PUNCT
ijassa-310	282	45	classification	classification	NOUN
ijassa-310	282	46	and	and	CCONJ
ijassa-310	282	47	diagnostic	diagnostic	ADJ
ijassa-310	282	48	prediction	prediction	NOUN
ijassa-310	282	49	of	of	ADP
ijassa-310	282	50	cancers	cancer	NOUN
ijassa-310	282	51	using	use	VERB
ijassa-310	282	52	gene	gene	NOUN
ijassa-310	282	53	expression	expression	NOUN
ijassa-310	282	54	profiling	profiling	NOUN
ijassa-310	282	55	and	and	CCONJ
ijassa-310	282	56	artificial	artificial	ADJ
ijassa-310	282	57	neural	neural	ADJ
ijassa-310	282	58	networks	network	NOUN
ijassa-310	282	59	.	.	PUNCT
ijassa-310	283	1	nat	nat	PROPN
ijassa-310	283	2	.	.	PUNCT
ijassa-310	284	1	med	med	PROPN
ijassa-310	284	2	.	.	PROPN
ijassa-310	284	3	,	,	PUNCT
ijassa-310	284	4	2001	2001	NUM
ijassa-310	284	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	284	6	7(6	7(6	NUM
ijassa-310	284	7	):	):	PUNCT
ijassa-310	284	8	673	673	NUM
ijassa-310	284	9	-	-	SYM
ijassa-310	284	10	679	679	NUM
ijassa-310	284	11	.	.	PUNCT
ijassa-310	285	1	[	[	X
ijassa-310	285	2	7	7	NUM
ijassa-310	285	3	]	]	SYM
ijassa-310	285	4	alon	alon	PROPN
ijassa-310	285	5	u	u	PROPN
ijassa-310	285	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	285	7	barka	barka	PROPN
ijassa-310	285	8	in	in	ADP
ijassa-310	285	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	285	10	notterman	notterman	NOUN
ijassa-310	285	11	d	d	PROPN
ijassa-310	285	12	a	a	PROPN
ijassa-310	285	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	285	14	et	et	PROPN
ijassa-310	285	15	al	al	PROPN
ijassa-310	285	16	..	..	PUNCT
ijassa-310	285	17	broad	broad	ADJ
ijassa-310	285	18	patterns	pattern	NOUN
ijassa-310	285	19	of	of	ADP
ijassa-310	285	20	gene	gene	NOUN
ijassa-310	285	21	expression	expression	NOUN
ijassa-310	285	22	revealed	reveal	VERB
ijassa-310	285	23	by	by	ADP
ijassa-310	285	24	clustering	cluster	VERB
ijassa-310	285	25	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	285	26	of	of	ADP
ijassa-310	285	27	tumor	tumor	NOUN
ijassa-310	285	28	and	and	CCONJ
ijassa-310	285	29	normal	normal	ADJ
ijassa-310	285	30	colon	colon	NOUN
ijassa-310	285	31	tissues	tissue	NOUN
ijassa-310	285	32	probed	probe	VERB
ijassa-310	285	33	by	by	ADP
ijassa-310	285	34	oligonucleotide	oligonucleotide	NOUN
ijassa-310	285	35	arrays	array	NOUN
ijassa-310	285	36	.	.	PUNCT
ijassa-310	286	1	pnas	pnas	PROPN
ijassa-310	286	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	286	3	1999	1999	NUM
ijassa-310	286	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	286	5	96	96	NUM
ijassa-310	286	6	:	:	SYM
ijassa-310	286	7	6745	6745	NUM
ijassa-310	286	8	-	-	SYM
ijassa-310	286	9	6750	6750	NUM
ijassa-310	286	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	287	1	[	[	X
ijassa-310	287	2	8	8	X
ijassa-310	287	3	]	]	X
ijassa-310	287	4	huang	huang	PROPN
ijassa-310	287	5	ds	ds	PROPN
ijassa-310	287	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	287	7	zheng	zheng	PROPN
ijassa-310	287	8	ch	ch	PROPN
ijassa-310	287	9	.	.	PUNCT
ijassa-310	287	10	independent	independent	ADJ
ijassa-310	287	11	component	component	NOUN
ijassa-310	287	12	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	287	13	-	-	PUNCT
ijassa-310	287	14	based	base	VERB
ijassa-310	287	15	penalized	penalize	VERB
ijassa-310	287	16	discriminant	discriminant	NOUN
ijassa-310	287	17	method	method	NOUN
ijassa-310	287	18	for	for	ADP
ijassa-310	287	19	tumor	tumor	NOUN
ijassa-310	287	20	classification	classification	NOUN
ijassa-310	287	21	using	use	VERB
ijassa-310	287	22	gene	gene	NOUN
ijassa-310	287	23	expression	expression	NOUN
ijassa-310	287	24	data	datum	NOUN
ijassa-310	287	25	.	.	PUNCT
ijassa-310	288	1	bioinformatics	bioinformatic	NOUN
ijassa-310	288	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	288	3	2006	2006	NUM
ijassa-310	288	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	288	5	22	22	NUM
ijassa-310	288	6	(	(	PUNCT
ijassa-310	288	7	15	15	NUM
ijassa-310	288	8	):	):	PUNCT
ijassa-310	288	9	1855	1855	NUM
ijassa-310	288	10	-	-	SYM
ijassa-310	288	11	1862	1862	NUM
ijassa-310	288	12	.	.	PUNCT
ijassa-310	289	1	[	[	X
ijassa-310	289	2	9	9	NUM
ijassa-310	289	3	]	]	SYM
ijassa-310	289	4	ambroise	ambroise	ADJ
ijassa-310	289	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	289	6	c	c	X
ijassa-310	289	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	289	8	mclachlan	mclachlan	NOUN
ijassa-310	289	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	289	10	g	g	PROPN
ijassa-310	289	11	j	j	PROPN
ijassa-310	289	12	..	..	PUNCT
ijassa-310	289	13	selection	selection	NOUN
ijassa-310	289	14	bias	bias	NOUN
ijassa-310	289	15	in	in	ADP
ijassa-310	289	16	gene	gene	NOUN
ijassa-310	289	17	extraction	extraction	NOUN
ijassa-310	289	18	on	on	ADP
ijassa-310	289	19	the	the	DET
ijassa-310	289	20	basis	basis	NOUN
ijassa-310	289	21	of	of	ADP
ijassa-310	289	22	microarray	microarray	NOUN
ijassa-310	289	23	gene	gene	NOUN
ijassa-310	289	24	-	-	PUNCT
ijassa-310	289	25	expression	expression	NOUN
ijassa-310	289	26	data	datum	NOUN
ijassa-310	289	27	.	.	PUNCT
ijassa-310	290	1	pnas	pnas	PROPN
ijassa-310	290	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	290	3	2002	2002	NUM
ijassa-310	290	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	290	5	99	99	NUM
ijassa-310	290	6	:	:	SYM
ijassa-310	290	7	6562	6562	NUM
ijassa-310	290	8	-	-	SYM
ijassa-310	290	9	6566	6566	NUM
ijassa-310	290	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	291	1	[	[	X
ijassa-310	291	2	10	10	NUM
ijassa-310	291	3	]	]	X
ijassa-310	291	4	hastie	hastie	PROPN
ijassa-310	291	5	t	t	PROPN
ijassa-310	291	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	291	7	tibshirani	tibshirani	PROPN
ijassa-310	291	8	r	r	NOUN
ijassa-310	291	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	291	10	eisen	eisen	NOUN
ijassa-310	291	11	m	m	PROPN
ijassa-310	291	12	b	b	PROPN
ijassa-310	291	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	291	14	et	et	PROPN
ijassa-310	291	15	al	al	PROPN
ijassa-310	291	16	..	..	PUNCT
ijassa-310	291	17	„	„	PUNCT
ijassa-310	291	18	gene	gene	NOUN
ijassa-310	291	19	shaving‟	shaving‟	NOUN
ijassa-310	291	20	as	as	ADP
ijassa-310	291	21	a	a	DET
ijassa-310	291	22	method	method	NOUN
ijassa-310	291	23	for	for	ADP
ijassa-310	291	24	identifying	identify	VERB
ijassa-310	291	25	distinct	distinct	ADJ
ijassa-310	291	26	sets	set	NOUN
ijassa-310	291	27	of	of	ADP
ijassa-310	291	28	genes	gene	NOUN
ijassa-310	291	29	with	with	ADP
ijassa-310	291	30	similar	similar	ADJ
ijassa-310	291	31	expression	expression	NOUN
ijassa-310	291	32	patterns	pattern	NOUN
ijassa-310	291	33	.	.	PUNCT
ijassa-310	292	1	genome	genome	NOUN
ijassa-310	292	2	biol	biol	NOUN
ijassa-310	292	3	.	.	PUNCT
ijassa-310	292	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	292	5	2000	2000	NUM
ijassa-310	292	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	292	7	1	1	NUM
ijassa-310	292	8	:	:	PUNCT
ijassa-310	292	9	research0003.1	research0003.1	VERB
ijassa-310	292	10	-	-	PUNCT
ijassa-310	292	11	21	21	NUM
ijassa-310	292	12	.	.	PUNCT
ijassa-310	293	1	[	[	X
ijassa-310	293	2	11	11	NUM
ijassa-310	293	3	]	]	X
ijassa-310	293	4	li	li	PROPN
ijassa-310	293	5	xia	xia	PROPN
ijassa-310	293	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	293	7	rao	rao	PROPN
ijassa-310	293	8	shao	shao	PROPN
ijassa-310	293	9	qi	qi	PROPN
ijassa-310	293	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	293	11	wang	wang	PROPN
ijassa-310	293	12	yadong	yadong	PROPN
ijassa-310	293	13	,	,	PUNCT
ijassa-310	293	14	et	et	PROPN
ijassa-310	293	15	al	al	PROPN
ijassa-310	293	16	..	..	PROPN
ijassa-310	293	17	gene	gene	NOUN
ijassa-310	293	18	mining	mining	NOUN
ijassa-310	293	19	:	:	PUNCT
ijassa-310	293	20	a	a	DET
ijassa-310	293	21	novel	novel	NOUN
ijassa-310	293	22	and	and	CCONJ
ijassa-310	293	23	powerful	powerful	ADJ
ijassa-310	293	24	ensemble	ensemble	ADJ
ijassa-310	293	25	decision	decision	NOUN
ijassa-310	293	26	approach	approach	NOUN
ijassa-310	293	27	to	to	ADP
ijassa-310	293	28	hunting	hunt	VERB
ijassa-310	293	29	for	for	ADP
ijassa-310	293	30	disease	disease	NOUN
ijassa-310	293	31	genes	gene	NOUN
ijassa-310	293	32	using	use	VERB
ijassa-310	293	33	microarray	microarray	NOUN
ijassa-310	293	34	expression	expression	NOUN
ijassa-310	293	35	profiling	profiling	NOUN
ijassa-310	293	36	.	.	PUNCT
ijassa-310	294	1	nucleic	nucleic	ADJ
ijassa-310	294	2	acids	acid	NOUN
ijassa-310	294	3	research	research	NOUN
ijassa-310	294	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	294	5	2004	2004	NUM
ijassa-310	294	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	294	7	32	32	NUM
ijassa-310	294	8	(	(	PUNCT
ijassa-310	294	9	9	9	NUM
ijassa-310	294	10	):	):	PUNCT
ijassa-310	294	11	2685	2685	NUM
ijassa-310	294	12	-	-	SYM
ijassa-310	294	13	2694	2694	NUM
ijassa-310	294	14	.	.	PUNCT
ijassa-310	295	1	[	[	X
ijassa-310	295	2	12	12	NUM
ijassa-310	295	3	]	]	X
ijassa-310	295	4	marcotte	marcotte	PROPN
ijassa-310	295	5	em	em	PRON
ijassa-310	295	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	295	7	pellegrini	pellegrini	PROPN
ijassa-310	295	8	m	m	PROPN
ijassa-310	295	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	295	10	ng	ng	PROPN
ijassa-310	295	11	hl	hl	PROPN
ijassa-310	295	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	295	13	rice	rice	PROPN
ijassa-310	295	14	dw	dw	PROPN
ijassa-310	295	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	295	16	yeates	yeate	VERB
ijassa-310	295	17	to	to	ADP
ijassa-310	295	18	,	,	PUNCT
ijassa-310	295	19	eisenberg	eisenberg	PROPN
ijassa-310	295	20	d.	d.	PROPN
ijassa-310	295	21	detecting	detect	VERB
ijassa-310	295	22	protein	protein	NOUN
ijassa-310	295	23	advances	advance	NOUN
ijassa-310	295	24	in	in	ADP
ijassa-310	295	25	systems	system	NOUN
ijassa-310	295	26	science	science	NOUN
ijassa-310	295	27	and	and	CCONJ
ijassa-310	295	28	applications	application	NOUN
ijassa-310	295	29	(	(	PUNCT
ijassa-310	295	30	2011	2011	NUM
ijassa-310	295	31	)	)	PUNCT
ijassa-310	295	32	,	,	PUNCT
ijassa-310	295	33	vol	vol	NOUN
ijassa-310	295	34	.	.	PROPN
ijassa-310	296	1	11	11	NUM
ijassa-310	296	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	296	3	no	no	INTJ
ijassa-310	296	4	.	.	NOUN
ijassa-310	296	5	1	1	NUM
ijassa-310	296	6	-	-	SYM
ijassa-310	296	7	2	2	NUM
ijassa-310	296	8	app	app	NOUN
ijassa-310	296	9	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	10	ds	ds	ADJ
ijassa-310	296	11	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	12	oncogene	oncogene	ADJ
ijassa-310	296	13	app	app	NOUN
ijassa-310	296	14	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	15	ds	ds	ADJ
ijassa-310	296	16	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	17	the%20latter	the%20latter	X
ijassa-310	296	18	app	app	ADJ
ijassa-310	296	19	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	20	ds	ds	ADJ
ijassa-310	296	21	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	22	organism	organism	ADJ
ijassa-310	296	23	app	app	NOUN
ijassa-310	296	24	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	25	ds	ds	ADJ
ijassa-310	296	26	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	27	point%20of%20view	point%20of%20view	NUM
ijassa-310	296	28	app	app	ADJ
ijassa-310	296	29	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	30	ds	ds	ADJ
ijassa-310	296	31	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	32	coincident	coincident	ADJ
ijassa-310	296	33	app	app	NOUN
ijassa-310	296	34	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	35	ds	ds	ADJ
ijassa-310	296	36	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	37	organism	organism	ADJ
ijassa-310	296	38	app	app	NOUN
ijassa-310	296	39	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	40	ds	ds	ADJ
ijassa-310	296	41	:	:	PUNCT
ijassa-310	296	42	algorithm	algorithm	NOUN
ijassa-310	296	43	function	function	NOUN
ijassa-310	296	44	and	and	CCONJ
ijassa-310	296	45	protein	protein	NOUN
ijassa-310	296	46	–	–	PUNCT
ijassa-310	296	47	protein	protein	NOUN
ijassa-310	296	48	interactions	interaction	NOUN
ijassa-310	296	49	from	from	ADP
ijassa-310	296	50	genome	genome	NOUN
ijassa-310	296	51	sequences	sequence	NOUN
ijassa-310	296	52	.	.	PUNCT
ijassa-310	297	1	science	science	NOUN
ijassa-310	297	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	297	3	1999	1999	NUM
ijassa-310	297	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	297	5	285	285	NUM
ijassa-310	297	6	:	:	PUNCT
ijassa-310	297	7	751	751	NUM
ijassa-310	297	8	-	-	SYM
ijassa-310	297	9	753	753	NUM
ijassa-310	297	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	298	1	[	[	X
ijassa-310	298	2	13	13	NUM
ijassa-310	298	3	]	]	X
ijassa-310	298	4	strong	strong	ADJ
ijassa-310	298	5	m	m	PROPN
ijassa-310	298	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	298	7	graeber	graeber	PROPN
ijassa-310	298	8	tg	tg	PROPN
ijassa-310	298	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	298	10	beeby	beeby	PROPN
ijassa-310	298	11	m	m	PROPN
ijassa-310	298	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	298	13	pellegrini	pellegrini	PROPN
ijassa-310	298	14	m	m	PROPN
ijassa-310	298	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	298	16	thompson	thompson	PROPN
ijassa-310	298	17	mj	mj	PROPN
ijassa-310	298	18	,	,	PUNCT
ijassa-310	298	19	yeates	yeate	NOUN
ijassa-310	298	20	to	to	ADP
ijassa-310	298	21	,	,	PUNCT
ijassa-310	298	22	eisenberg	eisenberg	PROPN
ijassa-310	298	23	d.	d.	PROPN
ijassa-310	298	24	visualization	visualization	NOUN
ijassa-310	298	25	and	and	CCONJ
ijassa-310	298	26	interpretation	interpretation	NOUN
ijassa-310	298	27	of	of	ADP
ijassa-310	298	28	protein	protein	NOUN
ijassa-310	298	29	networks	network	NOUN
ijassa-310	298	30	in	in	ADP
ijassa-310	298	31	mycobacterium	mycobacterium	NOUN
ijassa-310	298	32	tuberculosis	tuberculosis	NOUN
ijassa-310	298	33	based	base	VERB
ijassa-310	298	34	on	on	ADP
ijassa-310	298	35	hierarchical	hierarchical	ADJ
ijassa-310	298	36	clustering	clustering	NOUN
ijassa-310	298	37	of	of	ADP
ijassa-310	298	38	genome	genome	NOUN
ijassa-310	298	39	-	-	PUNCT
ijassa-310	298	40	wide	wide	ADJ
ijassa-310	298	41	functional	functional	ADJ
ijassa-310	298	42	linkage	linkage	NOUN
ijassa-310	298	43	maps	map	NOUN
ijassa-310	298	44	.	.	PUNCT
ijassa-310	299	1	nucleic	nucleic	ADJ
ijassa-310	299	2	acids	acid	NOUN
ijassa-310	299	3	res	re	NOUN
ijassa-310	299	4	.	.	PROPN
ijassa-310	299	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	299	6	2003	2003	NUM
ijassa-310	299	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	299	8	31	31	NUM
ijassa-310	299	9	:	:	PUNCT
ijassa-310	299	10	7099	7099	NUM
ijassa-310	299	11	-	-	SYM
ijassa-310	299	12	7109	7109	NUM
ijassa-310	299	13	.	.	PUNCT
ijassa-310	300	1	[	[	X
ijassa-310	300	2	14	14	NUM
ijassa-310	300	3	]	]	X
ijassa-310	300	4	zhou	zhou	PROPN
ijassa-310	301	1	x	x	PROPN
ijassa-310	301	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	301	3	kao	kao	PROPN
ijassa-310	301	4	mc	mc	PROPN
ijassa-310	301	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	301	6	wong	wong	PROPN
ijassa-310	301	7	wh	wh	PROPN
ijassa-310	301	8	.	.	PROPN
ijassa-310	301	9	transitive	transitive	ADJ
ijassa-310	301	10	functional	functional	ADJ
ijassa-310	301	11	annotation	annotation	NOUN
ijassa-310	301	12	by	by	ADP
ijassa-310	301	13	shortest	short	ADJ
ijassa-310	301	14	-	-	PUNCT
ijassa-310	301	15	path	path	NOUN
ijassa-310	301	16	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	301	17	of	of	ADP
ijassa-310	301	18	gene	gene	NOUN
ijassa-310	301	19	expression	expression	NOUN
ijassa-310	301	20	data	datum	NOUN
ijassa-310	301	21	.	.	PUNCT
ijassa-310	302	1	pnas	pnas	PROPN
ijassa-310	302	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	302	3	2002	2002	NUM
ijassa-310	302	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	302	5	102(38	102(38	NUM
ijassa-310	302	6	):	):	PUNCT
ijassa-310	302	7	12783	12783	NUM
ijassa-310	302	8	-	-	SYM
ijassa-310	302	9	12788	12788	NUM
ijassa-310	302	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	303	1	[	[	X
ijassa-310	303	2	15	15	NUM
ijassa-310	303	3	]	]	X
ijassa-310	303	4	bowers	bower	NOUN
ijassa-310	303	5	p	p	PROPN
ijassa-310	303	6	m	m	PROPN
ijassa-310	303	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	303	8	cokus	cokus	PROPN
ijassa-310	303	9	s	s	PROPN
ijassa-310	303	10	j	j	PROPN
ijassa-310	303	11	,	,	PUNCT
ijassa-310	303	12	eisenberg	eisenberg	PROPN
ijassa-310	303	13	d	d	PROPN
ijassa-310	303	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	303	15	et	et	PROPN
ijassa-310	303	16	a1	a1	NOUN
ijassa-310	303	17	..	..	PUNCT
ijassa-310	303	18	use	use	NOUN
ijassa-310	303	19	of	of	ADP
ijassa-310	303	20	logic	logic	NOUN
ijassa-310	303	21	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	303	22	to	to	ADP
ijassa-310	303	23	decipher	decipher	ADJ
ijassa-310	303	24	protein	protein	NOUN
ijassa-310	303	25	network	network	NOUN
ijassa-310	303	26	organization	organization	NOUN
ijassa-310	303	27	.	.	PUNCT
ijassa-310	304	1	science	science	NOUN
ijassa-310	304	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	304	3	2004	2004	NUM
ijassa-310	304	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	304	5	306(5706	306(5706	NUM
ijassa-310	304	6	):	):	PUNCT
ijassa-310	304	7	2246	2246	NUM
ijassa-310	304	8	-	-	SYM
ijassa-310	304	9	2249	2249	NUM
ijassa-310	304	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	305	1	[	[	X
ijassa-310	305	2	16	16	NUM
ijassa-310	305	3	]	]	PUNCT
ijassa-310	305	4	bowers	bower	NOUN
ijassa-310	305	5	p	p	PROPN
ijassa-310	305	6	m	m	PROPN
ijassa-310	305	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	305	8	o'connor	o'connor	PROPN
ijassa-310	305	9	b	b	PROPN
ijassa-310	305	10	d	d	PROPN
ijassa-310	305	11	,	,	PUNCT
ijassa-310	305	12	cokus	cokus	PROPN
ijassa-310	305	13	s	s	PROPN
ijassa-310	305	14	j	j	PROPN
ijassa-310	305	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	305	16	et	et	AUX
ijassa-310	305	17	al	al	PROPN
ijassa-310	305	18	..	..	PUNCT
ijassa-310	305	19	utilizing	utilize	VERB
ijassa-310	305	20	logical	logical	ADJ
ijassa-310	305	21	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	305	22	in	in	ADP
ijassa-310	305	23	genomic	genomic	ADJ
ijassa-310	305	24	data	datum	NOUN
ijassa-310	305	25	to	to	ADP
ijassa-310	305	26	decipher	decipher	ADJ
ijassa-310	305	27	cellular	cellular	ADJ
ijassa-310	305	28	processes	process	NOUN
ijassa-310	305	29	.	.	PUNCT
ijassa-310	306	1	the	the	DET
ijassa-310	306	2	febs	febs	NOUN
ijassa-310	306	3	journal	journal	NOUN
ijassa-310	306	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	306	5	2005	2005	NUM
ijassa-310	306	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	306	7	272	272	NUM
ijassa-310	306	8	(	(	PUNCT
ijassa-310	306	9	20	20	NUM
ijassa-310	306	10	):	):	PUNCT
ijassa-310	306	11	5110	5110	NUM
ijassa-310	306	12	-	-	SYM
ijassa-310	306	13	5118	5118	NUM
ijassa-310	306	14	.	.	PUNCT
ijassa-310	307	1	[	[	X
ijassa-310	307	2	17	17	NUM
ijassa-310	307	3	]	]	X
ijassa-310	307	4	xin	xin	PROPN
ijassa-310	307	5	zhang	zhang	PROPN
ijassa-310	307	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	307	7	seungchan	seungchan	PROPN
ijassa-310	307	8	kim	kim	PROPN
ijassa-310	307	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	307	10	tie	tie	VERB
ijassa-310	307	11	wang	wang	PROPN
ijassa-310	307	12	and	and	CCONJ
ijassa-310	307	13	chitta	chitta	PROPN
ijassa-310	307	14	baral	baral	PROPN
ijassa-310	307	15	.	.	PUNCT
ijassa-310	308	1	joint	joint	ADJ
ijassa-310	308	2	learning	learning	NOUN
ijassa-310	308	3	of	of	ADP
ijassa-310	308	4	logic	logic	NOUN
ijassa-310	308	5	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	308	6	for	for	ADP
ijassa-310	308	7	studying	study	VERB
ijassa-310	308	8	protein	protein	NOUN
ijassa-310	308	9	function	function	NOUN
ijassa-310	308	10	using	use	VERB
ijassa-310	308	11	phylogenetic	phylogenetic	ADJ
ijassa-310	308	12	profiles	profile	NOUN
ijassa-310	308	13	and	and	CCONJ
ijassa-310	308	14	the	the	DET
ijassa-310	308	15	rosetta	rosetta	PROPN
ijassa-310	308	16	stone	stone	NOUN
ijassa-310	308	17	method	method	NOUN
ijassa-310	308	18	.	.	PUNCT
ijassa-310	309	1	ieee	ieee	NOUN
ijassa-310	309	2	transactions	transaction	NOUN
ijassa-310	309	3	on	on	ADP
ijassa-310	309	4	signal	signal	ADJ
ijassa-310	309	5	processing	processing	NOUN
ijassa-310	309	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	309	7	2006	2006	NUM
ijassa-310	309	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	309	9	54	54	NUM
ijassa-310	309	10	(	(	PUNCT
ijassa-310	309	11	6	6	NUM
ijassa-310	309	12	):	):	PUNCT
ijassa-310	309	13	2427	2427	NUM
ijassa-310	309	14	-	-	SYM
ijassa-310	309	15	2435	2435	NUM
ijassa-310	309	16	.	.	PUNCT
ijassa-310	310	1	[	[	X
ijassa-310	310	2	18	18	NUM
ijassa-310	310	3	]	]	X
ijassa-310	310	4	zhang	zhang	PROPN
ijassa-310	310	5	j	j	PROPN
ijassa-310	310	6	x	x	PROPN
ijassa-310	310	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	310	8	ji	ji	PROPN
ijassa-310	310	9	y	y	PROPN
ijassa-310	310	10	,	,	PUNCT
ijassa-310	310	11	zhang	zhang	PROPN
ijassa-310	310	12	l.	l.	PROPN
ijassa-310	310	13	extracting	extract	VERB
ijassa-310	310	14	three	three	NUM
ijassa-310	310	15	-	-	PUNCT
ijassa-310	310	16	way	way	NOUN
ijassa-310	310	17	gene	gene	NOUN
ijassa-310	310	18	interactions	interaction	NOUN
ijassa-310	310	19	from	from	ADP
ijassa-310	310	20	microarray	microarray	PROPN
ijassa-310	310	21	data	datum	NOUN
ijassa-310	310	22	.	.	PUNCT
ijassa-310	311	1	bioinformatics	bioinformatic	NOUN
ijassa-310	311	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	311	3	2007	2007	NUM
ijassa-310	311	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	311	5	23(21	23(21	NUM
ijassa-310	311	6	):	):	PUNCT
ijassa-310	311	7	2903	2903	NUM
ijassa-310	311	8	-	-	SYM
ijassa-310	311	9	2909	2909	NUM
ijassa-310	311	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	312	1	[	[	X
ijassa-310	312	2	19	19	NUM
ijassa-310	312	3	]	]	X
ijassa-310	312	4	shudong	shudong	PROPN
ijassa-310	312	5	wang	wang	PROPN
ijassa-310	312	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	312	7	yan	yan	PROPN
ijassa-310	312	8	chen	chen	PROPN
ijassa-310	312	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	312	10	qingyun	qingyun	PROPN
ijassa-310	312	11	wang	wang	PROPN
ijassa-310	312	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	312	13	eryan	eryan	PROPN
ijassa-310	312	14	li	li	PROPN
ijassa-310	312	15	,	,	PUNCT
ijassa-310	312	16	yansen	yansen	PROPN
ijassa-310	312	17	su	su	PROPN
ijassa-310	312	18	,	,	PUNCT
ijassa-310	312	19	dazhi	dazhi	PROPN
ijassa-310	312	20	meng	meng	PROPN
ijassa-310	312	21	.	.	PUNCT
ijassa-310	313	1	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	313	2	for	for	ADP
ijassa-310	313	3	gene	gene	NOUN
ijassa-310	313	4	networks	network	NOUN
ijassa-310	313	5	based	base	VERB
ijassa-310	313	6	on	on	ADP
ijassa-310	313	7	logical	logical	ADJ
ijassa-310	313	8	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	313	9	.	.	PUNCT
ijassa-310	314	1	journal	journal	PROPN
ijassa-310	314	2	of	of	ADP
ijassa-310	314	3	systems	system	NOUN
ijassa-310	314	4	science	science	NOUN
ijassa-310	314	5	and	and	CCONJ
ijassa-310	314	6	complexity	complexity	NOUN
ijassa-310	314	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	314	8	2010	2010	NUM
ijassa-310	314	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	314	10	23(5	23(5	NUM
ijassa-310	314	11	):	):	PUNCT
ijassa-310	314	12	999	999	NUM
ijassa-310	314	13	-	-	SYM
ijassa-310	314	14	1011	1011	NUM
ijassa-310	314	15	.	.	PUNCT
ijassa-310	315	1	[	[	X
ijassa-310	315	2	20	20	NUM
ijassa-310	315	3	]	]	PUNCT
ijassa-310	315	4	qingyun	qingyun	PROPN
ijassa-310	315	5	wang	wang	PROPN
ijassa-310	315	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	315	7	hui	hui	PROPN
ijassa-310	315	8	yi	yi	PROPN
ijassa-310	315	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	315	10	laifu	laifu	VERB
ijassa-310	315	11	liu	liu	PROPN
ijassa-310	315	12	,	,	PUNCT
ijassa-310	315	13	dazhi	dazhi	PROPN
ijassa-310	315	14	meng	meng	PROPN
ijassa-310	315	15	.	.	PUNCT
ijassa-310	316	1	progress	progress	NOUN
ijassa-310	316	2	in	in	ADP
ijassa-310	316	3	gene	gene	NOUN
ijassa-310	316	4	logic	logic	NOUN
ijassa-310	316	5	networks	network	NOUN
ijassa-310	316	6	.	.	PUNCT
ijassa-310	317	1	progress	progress	NOUN
ijassa-310	317	2	in	in	ADP
ijassa-310	317	3	biochemistry	biochemistry	NOUN
ijassa-310	317	4	and	and	CCONJ
ijassa-310	317	5	biophysics	biophysic	NOUN
ijassa-310	317	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	317	7	2008	2008	NUM
ijassa-310	317	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	317	9	35(11	35(11	NUM
ijassa-310	317	10	):	):	PUNCT
ijassa-310	317	11	1239	1239	NUM
ijassa-310	317	12	-	-	SYM
ijassa-310	317	13	1246	1246	NUM
ijassa-310	317	14	.	.	PUNCT
ijassa-310	318	1	[	[	X
ijassa-310	318	2	21	21	NUM
ijassa-310	318	3	]	]	X
ijassa-310	318	4	lǚsheng	lǚsheng	X
ijassa-310	318	5	si	si	PROPN
ijassa-310	318	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	318	7	xu	xu	PROPN
ijassa-310	318	8	li	li	PROPN
ijassa-310	318	9	.	.	PUNCT
ijassa-310	319	1	oncogene	oncogene	NOUN
ijassa-310	319	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	319	3	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	319	4	suppressor	suppressor	NOUN
ijassa-310	319	5	gene	gene	NOUN
ijassa-310	319	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	319	7	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	319	8	-	-	PUNCT
ijassa-310	319	9	related	relate	VERB
ijassa-310	319	10	gene	gene	NOUN
ijassa-310	319	11	.	.	PUNCT
ijassa-310	320	1	shanxi	shanxi	PROPN
ijassa-310	320	2	technology	technology	PROPN
ijassa-310	320	3	and	and	CCONJ
ijassa-310	320	4	science	science	NOUN
ijassa-310	320	5	press	press	NOUN
ijassa-310	320	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	320	7	xi‟an	xi‟an	PROPN
ijassa-310	320	8	,	,	PUNCT
ijassa-310	320	9	2002.12	2002.12	NUM
ijassa-310	320	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	321	1	[	[	X
ijassa-310	321	2	22	22	NUM
ijassa-310	321	3	]	]	X
ijassa-310	321	4	milo	milo	PROPN
ijassa-310	321	5	r	r	PROPN
ijassa-310	321	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	321	7	shen	shen	PROPN
ijassa-310	321	8	orr	orr	PROPN
ijassa-310	321	9	s	s	PROPN
ijassa-310	321	10	s	s	PROPN
ijassa-310	321	11	,	,	PUNCT
ijassa-310	321	12	itzkovitz	itzkovitz	PROPN
ijassa-310	321	13	s	s	PART
ijassa-310	321	14	,	,	PUNCT
ijassa-310	321	15	et	et	PROPN
ijassa-310	321	16	al	al	PROPN
ijassa-310	321	17	..	..	PROPN
ijassa-310	321	18	network	network	NOUN
ijassa-310	321	19	motifs	motif	NOUN
ijassa-310	321	20	:	:	PUNCT
ijassa-310	321	21	simple	simple	ADJ
ijassa-310	321	22	building	building	NOUN
ijassa-310	321	23	blocks	block	NOUN
ijassa-310	321	24	of	of	ADP
ijassa-310	321	25	complex	complex	ADJ
ijassa-310	321	26	network	network	NOUN
ijassa-310	321	27	.	.	PUNCT
ijassa-310	322	1	science	science	NOUN
ijassa-310	322	2	,	,	PUNCT
ijassa-310	322	3	2002	2002	NUM
ijassa-310	322	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	322	5	298	298	NUM
ijassa-310	322	6	:	:	PUNCT
ijassa-310	322	7	824	824	NUM
ijassa-310	322	8	-	-	SYM
ijassa-310	322	9	827	827	NUM
ijassa-310	322	10	.	.	PUNCT
ijassa-310	323	1	[	[	X
ijassa-310	323	2	23	23	NUM
ijassa-310	323	3	]	]	PUNCT
ijassa-310	323	4	barábasi	barábasi	NOUN
ijassa-310	323	5	a	a	DET
ijassa-310	323	6	l	l	NOUN
ijassa-310	323	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	323	8	oltvai	oltvai	ADV
ijassa-310	323	9	z	z	PROPN
ijassa-310	323	10	n.	n.	PROPN
ijassa-310	323	11	network	network	NOUN
ijassa-310	323	12	biology	biology	NOUN
ijassa-310	323	13	:	:	PUNCT
ijassa-310	323	14	understanding	understand	VERB
ijassa-310	323	15	the	the	DET
ijassa-310	323	16	cell‟s	cell‟s	ADJ
ijassa-310	323	17	functional	functional	ADJ
ijassa-310	323	18	organization	organization	NOUN
ijassa-310	323	19	.	.	PUNCT
ijassa-310	324	1	nature	nature	NOUN
ijassa-310	324	2	reviews	review	NOUN
ijassa-310	324	3	-	-	PUNCT
ijassa-310	324	4	genetics	genetic	NOUN
ijassa-310	324	5	,	,	PUNCT
ijassa-310	324	6	2004	2004	NUM
ijassa-310	324	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	324	8	5	5	NUM
ijassa-310	324	9	:	:	SYM
ijassa-310	324	10	101	101	NUM
ijassa-310	324	11	-	-	SYM
ijassa-310	324	12	114	114	NUM
ijassa-310	324	13	.	.	PUNCT
ijassa-310	325	1	[	[	X
ijassa-310	325	2	24	24	NUM
ijassa-310	325	3	]	]	PUNCT
ijassa-310	325	4	fuchu	fuchu	PROPN
ijassa-310	325	5	he	he	PRON
ijassa-310	325	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	325	7	pengyuan	pengyuan	PROPN
ijassa-310	325	8	yang	yang	PROPN
ijassa-310	325	9	,	,	PUNCT
ijassa-310	325	10	yunping	yunping	PROPN
ijassa-310	325	11	zhu	zhu	PROPN
ijassa-310	325	12	.	.	PUNCT
ijassa-310	326	1	systems	system	NOUN
ijassa-310	326	2	biology	biology	NOUN
ijassa-310	326	3	in	in	ADP
ijassa-310	326	4	practice	practice	NOUN
ijassa-310	326	5	:	:	PUNCT
ijassa-310	326	6	concepts	concept	NOUN
ijassa-310	326	7	,	,	PUNCT
ijassa-310	326	8	implementation	implementation	NOUN
ijassa-310	326	9	and	and	CCONJ
ijassa-310	326	10	application	application	NOUN
ijassa-310	326	11	.	.	PUNCT
ijassa-310	327	1	fudan	fudan	NOUN
ijassa-310	327	2	unversity	unversity	PROPN
ijassa-310	327	3	press	press	NOUN
ijassa-310	327	4	,	,	PUNCT
ijassa-310	327	5	shanghai	shanghai	PROPN
ijassa-310	327	6	,	,	PUNCT
ijassa-310	327	7	2007.12	2007.12	NUM
ijassa-310	327	8	.	.	PUNCT
ijassa-310	328	1	200	200	NUM
ijassa-310	328	2	xu	xu	NUM
ijassa-310	328	3	:	:	PUNCT
ijassa-310	328	4	analysis	analysis	NOUN
ijassa-310	328	5	for	for	ADP
ijassa-310	328	6	gene	gene	NOUN
ijassa-310	328	7	networks	network	NOUN
ijassa-310	328	8	of	of	ADP
ijassa-310	328	9	colon	colon	NOUN
ijassa-310	328	10	cancer	cancer	NOUN
ijassa-310	328	11	based	base	VERB
ijassa-310	328	12	on	on	ADP
ijassa-310	328	13	logical	logical	ADJ
ijassa-310	328	14	relationships	relationship	NOUN
ijassa-310	328	15	http://www.cqvip.com/qk/94860x/200811/28883778.html	http://www.cqvip.com/qk/94860x/200811/28883778.html	PROPN