id	sid	eid	entity	type
ajlm-760	1	1	anthony m. smith centre	PERSON
ajlm-760	1	2	national institute for	ORG
ajlm-760	1	3	national health laboratory service	ORG
ajlm-760	1	4	johannesburg	GPE
ajlm-760	1	5	south africa	GPE
ajlm-760	1	6	university of the witwatersrand	ORG
ajlm-760	1	7	johannesburg	GPE
ajlm-760	1	8	south africa	GPE
ajlm-760	1	9	smith am	ORG
ajlm-760	2	1	africa	LOC
ajlm-760	3	1	afr j	PERSON
ajlm-760	3	2	2019;8(1	CARDINAL
ajlm-760	3	3	a760	ORG
ajlm-760	4	1	https://doi.org/10.4102/ajlm.v8i1.760 review article review of molecular	ORG
ajlm-760	4	2	africa	LOC
ajlm-760	4	3	anthony m. smith	PERSON
ajlm-760	4	4	23 jan. 2018	DATE
ajlm-760	4	5	25	CARDINAL
ajlm-760	4	6	sept. 2018	DATE
ajlm-760	4	7	14 mar.	DATE
ajlm-760	5	1	2019	DATE
ajlm-760	6	1	2019	DATE
ajlm-760	10	1	africa	LOC
ajlm-760	12	1	africa	LOC
ajlm-760	13	1	english	LANGUAGE
ajlm-760	13	2	africa	LOC
ajlm-760	13	3	africa	LOC
ajlm-760	13	4	africa	LOC
ajlm-760	13	5	africa	LOC
ajlm-760	13	6	africa	LOC
ajlm-760	13	7	africa	LOC
ajlm-760	13	8	africa	LOC
ajlm-760	13	9	africa	LOC
ajlm-760	13	10	africa	LOC
ajlm-760	16	1	the year 1991	DATE
ajlm-760	16	2	one	CARDINAL
ajlm-760	16	3	first	ORDINAL
ajlm-760	16	4	africa	LOC
ajlm-760	21	1	african	NORP
ajlm-760	22	1	africa	LOC
ajlm-760	24	1	disease.4	NORP
ajlm-760	24	2	the mid-1990s	DATE
ajlm-760	25	1	africa	LOC
ajlm-760	25	2	1	CARDINAL
ajlm-760	25	3	1	CARDINAL
ajlm-760	25	4	mlva	ORG
ajlm-760	25	5	mlst	PERSON
ajlm-760	26	1	mlva	ORG
ajlm-760	26	2	mlst	PERSON
ajlm-760	27	1	1	CARDINAL
ajlm-760	27	2	africa	LOC
ajlm-760	28	1	1	CARDINAL
ajlm-760	28	2	africa	LOC
ajlm-760	29	1	analysis.15 wgs	PERSON
ajlm-760	31	1	africa	LOC
ajlm-760	33	1	africa	LOC
ajlm-760	33	2	african	NORP
ajlm-760	34	1	english	LANGUAGE
ajlm-760	34	2	africa	LOC
ajlm-760	34	3	africa	LOC
ajlm-760	34	4	africa	LOC
ajlm-760	34	5	africa	LOC
ajlm-760	34	6	africa	LOC
ajlm-760	34	7	africa	LOC
ajlm-760	34	8	africa	LOC
ajlm-760	34	9	africa	LOC
ajlm-760	34	10	africa	LOC
ajlm-760	37	1	africa	LOC
ajlm-760	38	1	one	CARDINAL
ajlm-760	38	2	first	ORDINAL
ajlm-760	38	3	africa	LOC
ajlm-760	38	4	1991	DATE
ajlm-760	38	5	african	NORP
ajlm-760	38	6	united states	GPE
ajlm-760	38	7	us	GPE
ajlm-760	38	8	kenya	GPE
ajlm-760	38	9	64	CARDINAL
ajlm-760	38	10	eight	CARDINAL
ajlm-760	38	11	africa	LOC
ajlm-760	39	1	africa	LOC
ajlm-760	40	1	first	ORDINAL
ajlm-760	40	2	kenya	GPE
ajlm-760	40	3	malawi	GPE
ajlm-760	40	4	2009	DATE
ajlm-760	40	5	kenya	GPE
ajlm-760	40	6	ceftriaxone	GPE
ajlm-760	40	7	blactx-m-15	GPE
ajlm-760	40	8	malawi	GPE
ajlm-760	40	9	nigeria	GPE
ajlm-760	40	10	democratic republic	GPE
ajlm-760	40	11	congo	GPE
ajlm-760	40	12	coworkers22	ORG
ajlm-760	40	13	mlst, pfge	ORG
ajlm-760	40	14	nigeria	GPE
ajlm-760	40	15	democratic republic	GPE
ajlm-760	40	16	congo	GPE
ajlm-760	40	17	cata1	WORK_OF_ART
ajlm-760	40	18	sul1	ORG
ajlm-760	40	19	dfra1	ORG
ajlm-760	41	1	keddy	PERSON
ajlm-760	41	2	coworkers23	PERSON
ajlm-760	41	3	south africa	GPE
ajlm-760	41	4	south africa	GPE
ajlm-760	42	1	africa	LOC
ajlm-760	43	1	coworkers25	PERSON
ajlm-760	43	2	675	CARDINAL
ajlm-760	43	3	45	CARDINAL
ajlm-760	43	4	28	CARDINAL
ajlm-760	43	5	african	NORP
ajlm-760	43	6	one	CARDINAL
ajlm-760	43	7	two	CARDINAL
ajlm-760	43	8	african	NORP
ajlm-760	43	9	africa	LOC
ajlm-760	44	1	african	NORP
ajlm-760	45	1	african	NORP
ajlm-760	45	2	africa	LOC
ajlm-760	45	3	african	NORP
ajlm-760	46	1	south africa	GPE
ajlm-760	47	1	coworkers28	ORG
ajlm-760	47	2	tanzania	GPE
ajlm-760	48	1	mlva	ORG
ajlm-760	48	2	south africa	GPE
ajlm-760	48	3	mlva	ORG
ajlm-760	48	4	2013–2015	CARDINAL
ajlm-760	48	5	mlva	ORG
ajlm-760	48	6	south africa	GPE
ajlm-760	48	7	coworkers30	PERSON
ajlm-760	49	1	smith	PERSON
ajlm-760	49	2	coworkers31	ORG
ajlm-760	49	3	mlva	ORG
ajlm-760	49	4	st34	PRODUCT
ajlm-760	49	5	ceftriaxone	GPE
ajlm-760	50	1	2004	DATE
ajlm-760	50	2	coworkers32	ORG
ajlm-760	50	3	one	CARDINAL
ajlm-760	50	4	first	ORDINAL
ajlm-760	50	5	africa	LOC
ajlm-760	51	1	102	CARDINAL
ajlm-760	51	2	kenyan	NORP
ajlm-760	51	3	two	CARDINAL
ajlm-760	51	4	82%	PERCENT
ajlm-760	53	1	south africa	GPE
ajlm-760	53	2	australia	GPE
ajlm-760	54	1	keddy	PERSON
ajlm-760	54	2	coworkers33	PERSON
ajlm-760	54	3	south african	NORP
ajlm-760	54	4	bangladesh	GPE
ajlm-760	54	5	indian	NORP
ajlm-760	54	6	bangladesh	GPE
ajlm-760	56	1	asia	LOC
ajlm-760	56	2	africa	LOC
ajlm-760	56	3	african	NORP
ajlm-760	56	4	malawi	GPE
ajlm-760	56	5	uganda35,36	ORG
ajlm-760	56	6	uganda	GPE
ajlm-760	56	7	walters	PERSON
ajlm-760	56	8	coworkers36	ORG
ajlm-760	56	9	two	CARDINAL
ajlm-760	56	10	kasese	NORP
ajlm-760	58	1	south africa	GPE
ajlm-760	58	2	keddy and coworkers37	ORG
ajlm-760	58	3	south africa	GPE
ajlm-760	58	4	2005	DATE
ajlm-760	59	1	2005	DATE
ajlm-760	59	2	1993	DATE
ajlm-760	61	1	tau	PERSON
ajlm-760	61	2	coworkers38	ORG
ajlm-760	61	3	africa	LOC
ajlm-760	62	1	african	NORP
ajlm-760	63	1	africa	LOC
ajlm-760	63	2	wong	PERSON
ajlm-760	63	3	1832	DATE
ajlm-760	63	4	63	CARDINAL
ajlm-760	63	5	one	CARDINAL
ajlm-760	63	6	asia	LOC
ajlm-760	63	7	africa	LOC
ajlm-760	63	8	the past 30 years	DATE
ajlm-760	64	1	asia	LOC
ajlm-760	64	2	africa	LOC
ajlm-760	65	1	africa	LOC
ajlm-760	66	1	africa	LOC
ajlm-760	66	2	kenya	GPE
ajlm-760	66	3	tanzania	GPE
ajlm-760	66	4	malawi	GPE
ajlm-760	66	5	south africa.5,38,39,40	LOC
ajlm-760	66	6	hendriksen	ORG
ajlm-760	66	7	coworkers41	ORG
ajlm-760	66	8	zambia	GPE
ajlm-760	68	1	nigeria	GPE
ajlm-760	68	2	blatem1	PERSON
ajlm-760	68	3	cata1	FAC
ajlm-760	68	4	dfra1	ORG
ajlm-760	68	5	sul1	ORG
ajlm-760	69	1	africa	LOC
ajlm-760	69	2	first	ORDINAL
ajlm-760	69	3	1996	DATE
ajlm-760	69	4	first	ORDINAL
ajlm-760	69	5	africa	LOC
ajlm-760	70	1	1994–1995	CARDINAL
ajlm-760	70	2	1987	DATE
ajlm-760	70	3	1994–1995	CARDINAL
ajlm-760	71	1	senegal	GPE
ajlm-760	71	2	1994–1995	CARDINAL
ajlm-760	71	3	senegal	GPE
ajlm-760	71	4	2001	DATE
ajlm-760	71	5	coworkers46	ORG
ajlm-760	71	6	mozambican migrant	ORG
ajlm-760	71	7	1998	DATE
ajlm-760	71	8	south african	NORP
ajlm-760	71	9	mozambique	GPE
ajlm-760	72	1	1	CARDINAL
ajlm-760	72	2	sxt	PRODUCT
ajlm-760	73	1	mozambican	NORP
ajlm-760	73	2	1998	DATE
ajlm-760	73	3	mozambique/south africa cholera	EVENT
ajlm-760	73	4	sxt	PRODUCT
ajlm-760	73	5	two	CARDINAL
ajlm-760	73	6	africa	LOC
ajlm-760	75	1	sxt	FAC
ajlm-760	76	1	sxt	PRODUCT
ajlm-760	76	2	2006	DATE
ajlm-760	76	3	kenya	GPE
ajlm-760	76	4	1998 and 1999	DATE
ajlm-760	78	1	2008–2009	CARDINAL
ajlm-760	78	2	ghana	GPE
ajlm-760	78	3	cameroon	GPE
ajlm-760	78	4	ethiopia	GPE
ajlm-760	78	5	somalia	GPE
ajlm-760	78	6	country.50,53,54,55	ORG
ajlm-760	78	7	2007	DATE
ajlm-760	79	1	2007	DATE
ajlm-760	79	2	keddy	PERSON
ajlm-760	79	3	coworkers56	GPE
ajlm-760	79	4	south african	NORP
ajlm-760	79	5	2001–2002	CARDINAL
ajlm-760	79	6	1980–1987	CARDINAL
ajlm-760	79	7	1980–1987	CARDINAL
ajlm-760	79	8	2001–2002	CARDINAL
ajlm-760	80	1	2008	DATE
ajlm-760	80	2	coworkers57	PERSON
ajlm-760	80	3	first	ORDINAL
ajlm-760	80	4	namibia	GPE
ajlm-760	80	5	2006–2007	DATE
ajlm-760	81	1	2011	DATE
ajlm-760	81	2	ismail	PERSON
ajlm-760	81	3	coworkers48	ORG
ajlm-760	81	4	south africa	GPE
ajlm-760	81	5	july 2008	DATE
ajlm-760	82	1	sxt	PRODUCT
ajlm-760	83	1	later in 2008	DATE
ajlm-760	83	2	zimbabwe	GPE
ajlm-760	83	3	south africa	GPE
ajlm-760	83	4	south africa	GPE
ajlm-760	83	5	the period november 2008 to april 2009	DATE
ajlm-760	84	1	sxt	PRODUCT
ajlm-760	84	2	october 2010	DATE
ajlm-760	84	3	o1.59,60	DATE
ajlm-760	84	4	haiti	GPE
ajlm-760	84	5	the period october 2010 to february 2011	DATE
ajlm-760	85	1	cameroon	GPE
ajlm-760	85	2	south africa	GPE
ajlm-760	85	3	india	GPE
ajlm-760	85	4	nepal	GPE
ajlm-760	85	5	pakistan	GPE
ajlm-760	85	6	afghanistan	GPE
ajlm-760	86	1	haiti	GPE
ajlm-760	86	2	india	GPE
ajlm-760	86	3	cameroon.62	ORG
ajlm-760	87	1	2011	DATE
ajlm-760	87	2	thompson	ORG
ajlm-760	87	3	coworkers63	ORG
ajlm-760	87	4	ghana	GPE
ajlm-760	87	5	two	CARDINAL
ajlm-760	87	6	ghana	GPE
ajlm-760	88	1	2011	DATE
ajlm-760	88	2	seventh	ORDINAL
ajlm-760	88	3	africa	LOC
ajlm-760	88	4	african	NORP
ajlm-760	89	1	2013	DATE
ajlm-760	89	2	kenyan	NORP
ajlm-760	89	3	three	CARDINAL
ajlm-760	89	4	seventh	ORDINAL
ajlm-760	89	5	seventh	ORDINAL
ajlm-760	91	1	tanzania	GPE
ajlm-760	91	2	three	CARDINAL
ajlm-760	91	3	seventh	ORDINAL
ajlm-760	91	4	cameroon	GPE
ajlm-760	91	5	african	NORP
ajlm-760	91	6	kenya	GPE
ajlm-760	91	7	tanzania	GPE
ajlm-760	91	8	zambia	GPE
ajlm-760	91	9	zimbabwe	GPE
ajlm-760	91	10	mozambique	GPE
ajlm-760	91	11	the lake chad basin.67	LOC
ajlm-760	91	12	africa	LOC
ajlm-760	91	13	mlva	ORG
ajlm-760	91	14	mlst	PERSON
ajlm-760	91	15	africa	LOC
ajlm-760	98	1	chad basin region	GPE
ajlm-760	98	2	moore	PERSON
ajlm-760	98	3	coworkers72	ORG
ajlm-760	98	4	western africa	GPE
ajlm-760	98	5	togo	NORP
ajlm-760	98	6	african	NORP
ajlm-760	98	7	congo	GPE
ajlm-760	98	8	zambia	GPE
ajlm-760	99	1	smith	PERSON
ajlm-760	99	2	coworkers71	ORG
ajlm-760	99	3	mozambican	NORP
ajlm-760	99	4	western africa	GPE
ajlm-760	99	5	togo	NORP
ajlm-760	99	6	côte d’ivoire	ORG
ajlm-760	99	7	central africa	GPE
ajlm-760	99	8	democratic republic of	ORG
ajlm-760	99	9	congo	GPE
ajlm-760	100	1	first	ORDINAL
ajlm-760	100	2	africa	LOC
ajlm-760	100	3	first	ORDINAL
ajlm-760	100	4	the years 1996	DATE
ajlm-760	100	5	1997.6,74	CARDINAL
ajlm-760	100	6	1996	DATE
ajlm-760	100	7	coworkers6	PERSON
ajlm-760	100	8	mdr s. dysenteriae serotype	PERSON
ajlm-760	100	9	1	CARDINAL
ajlm-760	100	10	kenya	GPE
ajlm-760	100	11	all 22	CARDINAL
ajlm-760	101	1	1997	DATE
ajlm-760	101	2	mdr s. dysenteriae serotype	PERSON
ajlm-760	101	3	1	CARDINAL
ajlm-760	101	4	south africa	GPE
ajlm-760	103	1	later in 1996	DATE
ajlm-760	103	2	mdr s. dysenteriae serotype	PERSON
ajlm-760	103	3	1	CARDINAL
ajlm-760	103	4	two	CARDINAL
ajlm-760	103	5	african republic	GPE
ajlm-760	103	6	2009	DATE
ajlm-760	103	7	coworkers76	ORG
ajlm-760	103	8	29	CARDINAL
ajlm-760	103	9	mdr shigella boydii	ORG
ajlm-760	103	10	2	CARDINAL
ajlm-760	103	11	south africa	GPE
ajlm-760	105	1	africa	LOC
ajlm-760	106	1	connor	PERSON
ajlm-760	106	2	coworkers77	PERSON
ajlm-760	106	3	351	CARDINAL
ajlm-760	106	4	africa	LOC
ajlm-760	106	5	s. flexneri	PERSON
ajlm-760	106	6	seven	CARDINAL
ajlm-760	107	1	several decades	DATE
ajlm-760	108	1	s. flexneri	PERSON
ajlm-760	108	2	africa	LOC
ajlm-760	109	1	331	CARDINAL
ajlm-760	109	2	africa	LOC
ajlm-760	109	3	s. dysenteriae serotype	ORG
ajlm-760	109	4	1	CARDINAL
ajlm-760	109	5	s. dysenteriae serotype	ORG
ajlm-760	109	6	1	CARDINAL
ajlm-760	109	7	four	CARDINAL
ajlm-760	110	1	last few decades	DATE
ajlm-760	110	2	africa	LOC
ajlm-760	110	3	indian	NORP
ajlm-760	110	4	africa	LOC
ajlm-760	110	5	1990	DATE
ajlm-760	110	6	africa	LOC
ajlm-760	110	7	africa	LOC
ajlm-760	110	8	e. coli enteric pathogens	ORG
ajlm-760	111	1	six	CARDINAL
ajlm-760	111	2	e. coli	PERSON
ajlm-760	111	3	e. coli	PERSON
ajlm-760	111	4	e. coli	PERSON
ajlm-760	112	1	2003	DATE
ajlm-760	112	2	coworkers79	PERSON
ajlm-760	112	3	nigeria	GPE
ajlm-760	114	1	2012	DATE
ajlm-760	114	2	tau	PERSON
ajlm-760	114	3	e. coli o104	ORG
ajlm-760	115	1	south africa	GPE
ajlm-760	115	2	the years 2004–2011	DATE
ajlm-760	116	1	2011	DATE
ajlm-760	116	2	germany	GPE
ajlm-760	117	1	south african	NORP
ajlm-760	117	2	two	CARDINAL
ajlm-760	119	1	five	CARDINAL
ajlm-760	119	2	e. coli o104	ORG
ajlm-760	120	1	south african	NORP
ajlm-760	120	2	germany	GPE
ajlm-760	122	1	methodologies.14,82,83,84	ORG
ajlm-760	127	1	pathogens;85,86,87,88,89	ORG
ajlm-760	130	1	africa	LOC
ajlm-760	131	1	mlva	GPE
ajlm-760	131	2	mlst.90,91,92,93	GPE
ajlm-760	131	3	the next year	DATE
ajlm-760	135	1	van belkum	PERSON
ajlm-760	136	1	clin	PERSON
ajlm-760	137	1	2007;13	ORG
ajlm-760	137	2	3):1–46	CARDINAL
ajlm-760	138	1	https://doi.org/10.1111/j.1469-0691.2007.01786.x	NORP
ajlm-760	138	2	sabat aj	PERSON
ajlm-760	138	3	budimir	ORG
ajlm-760	140	1	2013;18(4):20380	CARDINAL
ajlm-760	141	1	ng lk	PERSON
ajlm-760	145	1	keddy kh	PERSON
ajlm-760	145	2	ismail h	PERSON
ajlm-760	146	1	two	CARDINAL
ajlm-760	146	2	south africa	GPE
ajlm-760	146	3	australia	GPE
ajlm-760	148	1	2011;60:1405–1407	CARDINAL
ajlm-760	149	1	https://doi.org/10.1099/jmm.0.030700-0 wong vk	ORG
ajlm-760	149	2	baker s	PERSON
ajlm-760	150	1	nat genet	PERSON
ajlm-760	151	1	2015;47(6):632–639	CARDINAL
ajlm-760	152	1	muthotho n	PERSON
ajlm-760	152	2	kimari j	PERSON
ajlm-760	152	3	hart ca	LAW
ajlm-760	153	1	1	CARDINAL
ajlm-760	154	1	hyg	ORG
ajlm-760	154	2	1996;90(6):712–714	CARDINAL
ajlm-760	155	1	foley sl	PERSON
ajlm-760	155	2	lynne am	PERSON
ajlm-760	155	3	nayak r.	PERSON
ajlm-760	155	4	gram	CARDINAL
ajlm-760	157	1	2009;9(4):430–440	CARDINAL
ajlm-760	157	2	karama m	PERSON
ajlm-760	160	1	2010;57(7–8):447–462	CARDINAL
ajlm-760	162	1	ghosh jb	PERSON
ajlm-760	162	2	sen gupta s	PERSON
ajlm-760	163	1	africa	LOC
ajlm-760	165	1	goering rv	PERSON
ajlm-760	165	2	kock r	ORG
ajlm-760	165	3	werner g	PERSON
ajlm-760	167	1	2013;18(4):20383	CARDINAL
ajlm-760	168	1	islam t	PERSON
ajlm-760	168	2	colwell rr	PERSON
ajlm-760	168	3	alam m.	PERSON
ajlm-760	171	1	turner	ORG
ajlm-760	171	2	riley mf	PERSON
ajlm-760	171	3	petri wa, jr.	ORG
ajlm-760	171	4	hewlett el.	GPE
ajlm-760	173	1	clin microbiol	ORG
ajlm-760	173	2	2015;28(3):541–563	CARDINAL
ajlm-760	174	1	https://doi.org/10.1128/cmr.00075-13 leekitcharoenphon p	ORG
ajlm-760	174	2	nielsen	PERSON
ajlm-760	174	3	kaas rs	PERSON
ajlm-760	175	1	plos one	PERSON
ajlm-760	176	1	2014;9(2):e87991	CARDINAL
ajlm-760	177	1	https://doi.org/10.1371/journal.pone.0087991 jackson br	PERSON
ajlm-760	178	1	clin infect dis	ORG
ajlm-760	179	1	2016;63(3):380–386	CARDINAL
ajlm-760	179	2	van walle	PERSON
ajlm-760	182	1	2017;22	CARDINAL
ajlm-760	182	2	30544	CARDINAL
ajlm-760	183	1	kiehlbauch ja	PERSON
ajlm-760	186	1	1991;12(1):77–89	CARDINAL
ajlm-760	187	1	kimari j	PERSON
ajlm-760	188	1	enterica	DATE
ajlm-760	190	1	1999;48(11):1037–1042	CARDINAL
ajlm-760	191	1	gordon ma	PERSON
ajlm-760	191	2	graham sm	PERSON
ajlm-760	191	3	walsh al	PERSON
ajlm-760	192	1	s. enterica	ORG
ajlm-760	192	2	malawi	GPE
ajlm-760	193	1	clin	GPE
ajlm-760	194	1	2008;46(7):963–969	CARDINAL
ajlm-760	195	1	heyderman rs	PERSON
ajlm-760	195	2	malawi	GPE
ajlm-760	195	3	south africa	GPE
ajlm-760	199	1	kingsley ra	PERSON
ajlm-760	199	2	epidemic multiple drug	ORG
ajlm-760	199	3	africa	LOC
ajlm-760	202	1	enterica	DATE
ajlm-760	202	2	313	CARDINAL
ajlm-760	202	3	kenyan	NORP
ajlm-760	202	4	inchi2	ORG
ajlm-760	203	1	antimicrob	PERSON
ajlm-760	205	1	https://doi.org/10.1128/aac.00078-15 leekitcharoenphon p	ORG
ajlm-760	206	1	nigeria	GPE
ajlm-760	206	2	the democratic republic of congo	GPE
ajlm-760	208	1	2013;7(10):696–706	DATE
ajlm-760	208	2	https://doi.org/10.3855/jidc.3328 keddy kh	PERSON
ajlm-760	209	1	south african	NORP
ajlm-760	209	2	2003–2013	CARDINAL
ajlm-760	210	1	clin infect dis	ORG
ajlm-760	211	1	2015;61	CARDINAL
ajlm-760	212	1	kingsley ra	PERSON
ajlm-760	212	2	quail ma	PERSON
ajlm-760	213	1	clin infect dis	ORG
ajlm-760	214	1	2012;54(7):955–963	CARDINAL
ajlm-760	215	1	keddy kh	PERSON
ajlm-760	216	1	nat genet	PERSON
ajlm-760	217	1	2016;48(10):1211–1217	CARDINAL
ajlm-760	218	1	niehaus aj	PERSON
ajlm-760	218	2	apalata t	PERSON
ajlm-760	218	3	coovadia ym	PERSON
ajlm-760	218	4	smith	PERSON
ajlm-760	218	5	moodley	PERSON
ajlm-760	218	6	kwazulu	GPE
ajlm-760	218	7	south africa	GPE
ajlm-760	220	1	https://doi.org/10.1089/fpd.2010.0749 akinyemi ko	PERSON
ajlm-760	220	2	philipp w	PERSON
ajlm-760	220	3	beyer w	PERSON
ajlm-760	220	4	bohm r. application	PERSON
ajlm-760	220	5	lagos	GPE
ajlm-760	220	6	nigeria	GPE
ajlm-760	222	1	2010;4(12):828–833	CARDINAL
ajlm-760	223	1	blomberg	GPE
ajlm-760	223	2	kruger c	ORG
ajlm-760	223	3	jureen	PERSON
ajlm-760	223	4	tanzania	GPE
ajlm-760	224	1	bmc infect dis	ORG
ajlm-760	224	2	2004;4:35	CARDINAL
ajlm-760	225	1	smith	PERSON
ajlm-760	225	2	keddy kh	PERSON
ajlm-760	225	3	south africa	GPE
ajlm-760	225	4	2013–2015	CARDINAL
ajlm-760	226	1	bmc infect dis	ORG
ajlm-760	227	1	2017;17(1):661	CARDINAL
ajlm-760	228	1	https://doi.org/10.1186/s12879-017-2751-8 wadula j	PERSON
ajlm-760	228	2	von gottberg	PERSON
ajlm-760	230	1	https://doi.org/10.1097/01.inf.0000233543.78070.a2 smith am	PERSON
ajlm-760	230	2	mthanti ma	PERSON
ajlm-760	231	1	south africa	GPE
ajlm-760	231	2	2012	DATE
ajlm-760	232	1	j clin microbiol	PERSON
ajlm-760	233	1	2014;52(2):627–631	CARDINAL
ajlm-760	234	1	https://doi.org/10.1128/jcm.02422-13 kariuki s	PERSON
ajlm-760	234	2	revathi g	PERSON
ajlm-760	234	3	kenya	GPE
ajlm-760	235	1	j clin microbiol	PERSON
ajlm-760	236	1	2004;42(4):1477–1482	TIME
ajlm-760	237	1	keddy kh	PERSON
ajlm-760	237	2	smith	PERSON
ajlm-760	237	3	ismail h	PERSON
ajlm-760	237	4	oliver s.	PERSON
ajlm-760	237	5	south africa	GPE
ajlm-760	239	1	2010;16(5):879–880	CARDINAL
ajlm-760	240	1	malawi	GPE
ajlm-760	241	1	clin infect dis	ORG
ajlm-760	242	1	2012;54(8):1100–1106	CARDINAL
ajlm-760	243	1	neil kp	PERSON
ajlm-760	243	2	sodha sv, lukwago l	PERSON
ajlm-760	244	1	kasese district	GPE
ajlm-760	244	2	uganda	GPE
ajlm-760	244	3	2008–2009	CARDINAL
ajlm-760	245	1	clin infect dis	ORG
ajlm-760	246	1	https://doi.org/10.1093/cid/cis025 walters ms	PERSON
ajlm-760	246	2	routh j	PERSON
ajlm-760	246	3	kasese	NORP
ajlm-760	246	4	uganda	GPE
ajlm-760	246	5	2009–2011	CARDINAL
ajlm-760	247	1	plos	PERSON
ajlm-760	249	1	https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0002726 keddy kh	PERSON
ajlm-760	249	2	ismail h	PERSON
ajlm-760	250	1	south africa	GPE
ajlm-760	250	2	2005	DATE
ajlm-760	250	3	1993	DATE
ajlm-760	253	1	tau np	PERSON
ajlm-760	253	2	smith am	PERSON
ajlm-760	253	3	wain jr	PERSON
ajlm-760	253	4	africa	LOC
ajlm-760	255	1	2017;66(7):937–945	CARDINAL
ajlm-760	255	2	revathi g	PERSON
ajlm-760	256	1	kenya	GPE
ajlm-760	256	2	southeast asia	LOC
ajlm-760	257	1	j clin microbiol	PERSON
ajlm-760	258	1	2010;48(6):2171–2176	CARDINAL
ajlm-760	259	1	gaskell k	PERSON
ajlm-760	259	2	wong	PERSON
ajlm-760	259	3	blantyre	GPE
ajlm-760	259	4	malawi	GPE
ajlm-760	260	1	plos	PERSON
ajlm-760	260	2	trop dis	PERSON
ajlm-760	262	1	https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0003748 hendriksen	PERSON
ajlm-760	262	2	leekitcharoenphon p	ORG
ajlm-760	262	3	lukjancenko	PERSON
ajlm-760	262	4	o	DATE
ajlm-760	263	1	zambia	GPE
ajlm-760	263	2	between 2010 and 2012	DATE
ajlm-760	264	1	j clin microbiol	PERSON
ajlm-760	265	1	2015;53(1):262–272	CARDINAL
ajlm-760	266	1	https://doi.org/10.1128/jcm.02026-14 wong vk	PERSON
ajlm-760	266	2	holt ke	PERSON
ajlm-760	267	1	west africa	GPE
ajlm-760	268	1	plos	ORG
ajlm-760	268	2	trop dis	PERSON
ajlm-760	269	1	2016;10(9):e0004781	CARDINAL
ajlm-760	269	2	mortensen hf	PERSON
ajlm-760	269	3	molbak k	PERSON
ajlm-760	269	4	dias f	PERSON
ajlm-760	269	5	echeverria p. molecular	PERSON
ajlm-760	270	1	j clin microbiol	PERSON
ajlm-760	272	1	colombo mm	PERSON
ajlm-760	272	2	mastrandrea s	ORG
ajlm-760	272	3	leite f	PERSON
ajlm-760	273	1	eric pcr	PERSON
ajlm-760	275	1	1997;19(1):33–45	CARDINAL
ajlm-760	276	1	boye cs	PERSON
ajlm-760	277	1	senegal	GPE
ajlm-760	278	1	j trop med	PERSON
ajlm-760	278	2	hyg	ORG
ajlm-760	279	1	1998;58(2):163–167	CARDINAL
ajlm-760	281	1	keddy k.	PERSON
ajlm-760	281	2	mozambique	GPE
ajlm-760	281	3	south africa	GPE
ajlm-760	281	4	1998	DATE
ajlm-760	281	5	sxt	PRODUCT
ajlm-760	281	6	aada2	ORG
ajlm-760	281	7	1	CARDINAL
ajlm-760	282	1	j antimicrob	PERSON
ajlm-760	283	1	2001;48(6):827–838	CARDINAL
ajlm-760	284	1	mastrandrea s	ORG
ajlm-760	284	2	cappuccinelli p	PERSON
ajlm-760	285	1	eric	PERSON
ajlm-760	285	2	mozambique	GPE
ajlm-760	288	1	ismail	PERSON
ajlm-760	288	2	smith am	ORG
ajlm-760	288	3	keddy kh	PERSON
ajlm-760	289	1	mpumalanga	GPE
ajlm-760	289	2	south africa	GPE
ajlm-760	289	3	2008	DATE
ajlm-760	290	1	j clin microbiol	PERSON
ajlm-760	292	1	https://doi.org/10.1128/jcm.00293-11 pugliese n	PERSON
ajlm-760	292	2	scrascia m	ORG
ajlm-760	292	3	materu sf	GPE
ajlm-760	292	4	pazzani c. sxt	PERSON
ajlm-760	292	5	eastern africa	GPE
ajlm-760	293	1	j antimicrob	PERSON
ajlm-760	294	1	2009;63(3):438–442	CARDINAL
ajlm-760	295	1	opintan ja	PERSON
ajlm-760	295	2	newman mj	PERSON
ajlm-760	296	1	accra	GPE
ajlm-760	296	2	ghana	GPE
ajlm-760	296	3	2	CARDINAL
ajlm-760	296	4	sxt	FAC
ajlm-760	297	1	j antimicrob	PERSON
ajlm-760	298	1	2008;62(5):929–933	DATE
ajlm-760	299	1	https://doi.org/10.1093/jac/dkn334 kiiru jn	PERSON
ajlm-760	299	2	saidi sm	PERSON
ajlm-760	299	3	bm	ORG
ajlm-760	299	4	wamae nc	PERSON
ajlm-760	299	5	butaye p	ORG
ajlm-760	300	1	kenya	GPE
ajlm-760	301	1	1994–2007	CARDINAL
ajlm-760	302	1	bmc microbiol	ORG
ajlm-760	303	1	2009;9:275	DATE
ajlm-760	304	1	https://doi.org/10.1186/1471-2180-9-275	GPE
ajlm-760	304	2	scrascia m	PERSON
ajlm-760	304	3	mohamud ka	PERSON
ajlm-760	304	4	kenya	GPE
ajlm-760	304	5	the late 1990s	DATE
ajlm-760	305	1	j clin microbiol	PERSON
ajlm-760	306	1	2006;44(9):3401–3404	ORDINAL
ajlm-760	307	1	2004	DATE
ajlm-760	307	2	2005	DATE
ajlm-760	307	3	cameroon	GPE
ajlm-760	310	1	https://doi.org/10.1089/fpd.2008.0127 scrascia	PERSON
ajlm-760	310	2	somalia	GPE
ajlm-760	312	1	2009;299(3):203–207	LANGUAGE
ajlm-760	314	1	cholera	GPE
ajlm-760	314	2	ethiopia	GPE
ajlm-760	314	3	the 1990s	DATE
ajlm-760	316	1	2009;299(5):367–372	PERSON
ajlm-760	316	2	https://doi.org/10.1016/j.ijmm.2008.10.004 keddy kh	PERSON
ajlm-760	316	3	nadan s	PERSON
ajlm-760	316	4	two	CARDINAL
ajlm-760	316	5	2001 2002	DATE
ajlm-760	316	6	1980 1987	DATE
ajlm-760	316	7	south africa	GPE
ajlm-760	319	1	https://doi.org/10.1099/jmm.0.47230-0 smith am	PERSON
ajlm-760	319	2	keddy kh	PERSON
ajlm-760	319	3	de wee l.	PERSON
ajlm-760	319	4	namibia	GPE
ajlm-760	319	5	december 2006 to february 2007	DATE
ajlm-760	322	1	https://doi.org/10.1017/s0950268807009685 ismail h	PERSON
ajlm-760	322	2	smith am	ORG
ajlm-760	322	3	tau np	PERSON
ajlm-760	322	4	keddy kh	PERSON
ajlm-760	323	1	south africa	GPE
ajlm-760	323	2	2008-2009	DATE
ajlm-760	325	1	1):39–45	CARDINAL
ajlm-760	326	1	d.	NORP
ajlm-760	326	2	haiti	GPE
ajlm-760	328	1	chin cs	PERSON
ajlm-760	328	2	sorenson j	PERSON
ajlm-760	328	3	harris jb	PERSON
ajlm-760	329	1	haitian	NORP
ajlm-760	331	1	2011;364(1):33–42	CARDINAL
ajlm-760	331	2	https://doi.org/10.1056/nejmoa1012928 talkington	PERSON
ajlm-760	331	3	haiti	GPE
ajlm-760	331	4	2010–2011	CARDINAL
ajlm-760	335	1	haiti	GPE
ajlm-760	335	2	asia	LOC
ajlm-760	335	3	africa	LOC
ajlm-760	337	1	2011;17(11):2113–2121	CARDINAL
ajlm-760	339	1	thompson cc	PERSON
ajlm-760	339	2	marin ma	PERSON
ajlm-760	339	3	fonseca el	PERSON
ajlm-760	339	4	seventh	ORDINAL
ajlm-760	339	5	ghana	GPE
ajlm-760	342	1	kim dw	PERSON
ajlm-760	342	2	thomson	GPE
ajlm-760	342	3	seventh	ORDINAL
ajlm-760	344	1	https://doi.org/10.1038/nature10392 kiiru j	PERSON
ajlm-760	344	2	mohamed aa	PERSON
ajlm-760	345	1	kenya	GPE
ajlm-760	346	1	plos	PERSON
ajlm-760	346	2	one	CARDINAL
ajlm-760	347	1	2013;8(9):e74829	DATE
ajlm-760	348	1	https://doi.org/10.1371/journal.pone.0074829 kachwamba y	PERSON
ajlm-760	348	2	mohammed aa	PERSON
ajlm-760	349	1	between 2011 and	DATE
ajlm-760	349	2	2015	DATE
ajlm-760	349	3	tanzania	GPE
ajlm-760	350	1	bmc infect dis	ORG
ajlm-760	351	1	2017;17(1):157	TIME
ajlm-760	352	1	kaas rs	PERSON
ajlm-760	352	2	ngandjio a	PERSON
ajlm-760	353	1	chad basin	GPE
ajlm-760	353	2	cameroon	GPE
ajlm-760	353	3	2010	DATE
ajlm-760	354	1	plos one.	PERSON
ajlm-760	355	1	2016;11(5):e0155691	DATE
ajlm-760	356	1	marin ma	PERSON
ajlm-760	356	2	thompson cc	PERSON
ajlm-760	356	3	nigeria	GPE
ajlm-760	357	1	plos	PERSON
ajlm-760	358	1	2013;7(2):e2049	PERSON
ajlm-760	359	1	https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0002049 mercy n	PERSON
ajlm-760	359	2	mohamed aa	PERSON
ajlm-760	359	3	kenya	GPE
ajlm-760	359	4	between 2007 and 2010	DATE
ajlm-760	360	1	pan afr med j. 2014;19:8	PERSON
ajlm-760	361	1	mahmud zh	PERSON
ajlm-760	361	2	islam s	PERSON
ajlm-760	361	3	zaman ru	PERSON
ajlm-760	362	1	leone cholera outbreak	PRODUCT
ajlm-760	362	2	2012	DATE
ajlm-760	363	1	hyg	ORG
ajlm-760	363	2	2014;108(11):715–720	CARDINAL
ajlm-760	364	1	mengel ma	PERSON
ajlm-760	364	2	five	CARDINAL
ajlm-760	364	3	african	NORP
ajlm-760	365	1	plos one.	ORG
ajlm-760	366	1	2015;10(11):e0142989	CARDINAL
ajlm-760	367	1	moore s	ORG
ajlm-760	367	2	miwanda	ORG
ajlm-760	367	3	sadji ay	ORG
ajlm-760	367	4	african	NORP
ajlm-760	367	5	337	CARDINAL
ajlm-760	368	1	plos	PERSON
ajlm-760	369	1	2015;9(6):e0003817	CARDINAL
ajlm-760	370	1	herrera-leon s	PERSON
ajlm-760	370	2	gil h	ORG
ajlm-760	371	1	ghana	GPE
ajlm-760	371	2	2014	DATE
ajlm-760	372	1	plos	PERSON
ajlm-760	372	2	trop dis	PERSON
ajlm-760	374	1	karas ja	PERSON
ajlm-760	374	2	1	CARDINAL
ajlm-760	376	1	1997;37(3):199–205	CARDINAL
ajlm-760	376	2	demartin m	PERSON
ajlm-760	376	3	1	CARDINAL
ajlm-760	376	4	central african	NORP
ajlm-760	376	5	2003–2004	CARDINAL
ajlm-760	377	1	2006;100(12):1151–1158	CARDINAL
ajlm-760	378	1	smith	PERSON
ajlm-760	378	2	keddy kh	PERSON
ajlm-760	378	3	ismail h	PERSON
ajlm-760	378	4	de jong gm	PERSON
ajlm-760	378	5	hoyland g. analysis	PERSON
ajlm-760	378	6	mpumalanga	GPE
ajlm-760	378	7	south africa	GPE
ajlm-760	378	8	november to december 2007	DATE
ajlm-760	380	1	2009;3(1):65–70	CARDINAL
ajlm-760	382	1	barker cr	PERSON
ajlm-760	382	2	baker ks	PERSON
ajlm-760	385	1	2015;4	CARDINAL
ajlm-760	387	1	njamkepo e	PERSON
ajlm-760	387	2	tran	PERSON
ajlm-760	387	3	1	CARDINAL
ajlm-760	388	1	nat	ORG
ajlm-760	389	1	2016;1:16027	PERSON
ajlm-760	390	1	nigeria	GPE
ajlm-760	391	1	j clin microbiol	PERSON
ajlm-760	392	1	2003;41(10):4525–4530	TIME
ajlm-760	393	1	np	ORG
ajlm-760	393	2	smith am	ORG
ajlm-760	393	3	keddy kh	PERSON
ajlm-760	393	4	south africa	GPE
ajlm-760	393	5	2004–2011	CARDINAL
ajlm-760	396	1	zhang w	PERSON
ajlm-760	396	2	germany	GPE
ajlm-760	396	3	2011	DATE
ajlm-760	397	1	lancet	ORG
ajlm-760	398	1	2011;11(9):671–676	CARDINAL
ajlm-760	398	2	https://doi.org/10.1016/s1473-3099(11)70165-7	CARDINAL
ajlm-760	398	3	byrne l	PERSON
ajlm-760	398	4	ashton pm	PERSON
ajlm-760	400	1	clin infect dis	ORG
ajlm-760	401	1	2015;61(3):305–312	CARDINAL
ajlm-760	402	1	allard mw	PERSON
ajlm-760	407	1	moura	PERSON
ajlm-760	407	2	leclercq	PERSON
ajlm-760	408	1	france	GPE
ajlm-760	411	1	zankari	NORP
ajlm-760	411	2	kaas rs	PERSON
ajlm-760	413	1	j antimicrob	PERSON
ajlm-760	415	1	mcdermott pf	PERSON
ajlm-760	415	2	tyson gh	PERSON
ajlm-760	415	3	kabera	PERSON
ajlm-760	417	1	antimicrob	PERSON
ajlm-760	418	1	2016;60(9):5515–5520	CARDINAL
ajlm-760	419	1	https://doi.org/10.1128/aac.01030-16 zhao s	PERSON
ajlm-760	419	2	tyson gh	PERSON
ajlm-760	419	3	chen y	PERSON
ajlm-760	421	1	environ microbiol	ORG
ajlm-760	422	1	2016;82(2):459–466	CARDINAL
ajlm-760	422	2	eyre dw	PERSON
ajlm-760	423	1	j antimicrob	PERSON
ajlm-760	424	1	2013;68(10):2234–2244	CARDINAL
ajlm-760	425	1	bradley p	PERSON
ajlm-760	426	1	j clin microbiol	PERSON
ajlm-760	427	1	2018;56(9):e01815–17	PERSON
ajlm-760	428	1	koser cu	PERSON
ajlm-760	428	2	ellington mj	PERSON
ajlm-760	428	3	cartwright ej	PERSON
ajlm-760	429	1	plos pathog	PERSON
ajlm-760	430	1	2012;8(8):e1002824	CARDINAL
ajlm-760	431	1	williams	PERSON
ajlm-760	433	1	j clin microbiol	PERSON
ajlm-760	434	1	2013;51(4):1272–1277	CARDINAL
ajlm-760	435	1	greub g.	PERSON
ajlm-760	436	1	clin microbiol	ORG
ajlm-760	437	1	2013;19(9):803–813	CARDINAL
ajlm-760	438	1	allard mw	PERSON
ajlm-760	440	1	j clin microbiol	PERSON
ajlm-760	441	1	2016;54(8):1946–1948	CARDINAL
ajlm-760	442	1	https://doi.org/10.1128/jcm.01082-16	GPE
ajlm-760	442	2	oakeson kf	PERSON
ajlm-760	442	3	wagner jm	PERSON
ajlm-760	442	4	atkinson-dunn r. bioinformatic	ORG
ajlm-760	444	1	2017;23(9):1441–1445	CARDINAL
