Final Nepas Journal no.28-2.indd ���� Original Article Distribution of Serotypes and Antimicrobial Resistance of Streptococcus Pneumoniae in a Children’s Hospital in Nepal Sherchand JB1, Joshi AR2, Gauchan P3, Amatya J4 ����� ��� �� ��� ��������� ��� ���� ��� ��� �� � �� ���������� ��� �� �!���"!�#�$% ��� &�!�� �� '��# � (������� )�"��� ��% *+��!�� (�, ����! ���� ���!��# �!���"!�#�$%�� &�##�$� �� ��!���� ��� ������#�$%� ��#!-� !� .�/�! � 0�/����� ���� ���!��# �!���"!�#�$%� (������� 1��!���2 ��!"�/ �� ��! ���! % 3�� ! / � �� ���!�!��� '��# � (������� )�"��� ��%� ����� -�� �� &#!�!��# �!���"!�#�$%� ������,$/�,� �� �-���/� 4���#� ��%� ! +-� %�� ���� ���!��# �!���"!�#�$%�� +��!� �� ��������� !� �!���"!�#�$%2 &�##�$� �� ��!���� ��� ������#�$%� ��#!-� !� 4���# Address for Correspondence: ���� � � ��������� 5�-�!#2 ! ���6���# ��� ��$ �� Abstract Introduction: Streptococcus pneumoniae !� #�7 �/-"�� !� � ��� �� ���-�# ��������%�$��# ��� �������%�$��# �#��� �� -��% ���# �% ������� ��� �#�� ��!#����� 7�!�� $�����##% ��-�!�� ���-#��� /�#��� ��� �8�� "% !��# !���� !��� �/�� �� ��--�� ��#�� !��#/��9� � � 3� �!� �! /� !��� ���/-�����/� !� ��������% �� ��$�� "/ -�% "� ��!-��% �� ��$�� !� !--/����-���-!��� ����#� ��� ��!�# ��#��!9� !�� �� ��������%�: � �� � !--��!� �#% �� �� "!� � 7! ��/ �� �#��-�� �� �!����� Objectives: ��� � /�% 7�� ����/� �� � �� ��-!�� �� ��� �#���� �� ��������%�$��# ��#��!9� !�� 7! � S pneumoniae� � �� ��-!�� ��!� �� !"!� !� �/���� !"!#! % �� ��� ��� � �� ��-!�� �!� �!"/ !�� �� �!������ ���� %��� Methods: '���! �# "���� ������� ! � � /�% 7�� ����/� �� ���- ;�"�/��% *<<= � ��� �-"�� *<<= +## �� ����!-��� 7��� !���/#� �� !� � => ����� "#��� �$�� ��� !��/"� �� !� � ? �<> &1 * � -������� � .= @& ��� *� ��/�� S pneumoniae 7�� !��� !�!�� "% ��#��% -�����#�$%� 0��-A� � �!�� �� ���!� �/���� !"!#! % �� ��� "!#� ��#/"!#! % �� +� !"!� !� �/���� !"!#! % �� 7�� ������-�� "% -��!�!�� �!�"%���/�� �!�� �!��/�!�� -� ��� ��� in vitro �/���� !"!#! % �� �� 1:��!##!� ���!� �� !��#� �� � ���!�!##!� 7�� �� ��-!��� "% �� 5� �� ���� %��� 7��� �� ��-!��� "% "�� ��!�# ����$$#/ !�� !�� /�!�$ �� ���/-� �� �! �� � ��� ���/- 3�� ! / � ���-��8� 7! � �* ���#�� �� !���� Results: 3� �� � /�%� .� B> �� �� ��!#���� 7��� ��/�� � "� ��������%�$��# ����!��� �� S pneumoniae �-��$ 7�!�� �< C> 7��� -�#� ��� �D *> 7��� ��-�#� &���� �:!-� ��<<>�� &�#���-����!��# ��<<>� ��� 5�% ���-%�!� �DC �>� 7��� -�� ����� ! � �� !"!� !� �$�!�� S pneumoniae ��� �� #��� ����� ! � 7�� &� �!-�:�9�#� �B<>� �� �> 7��� ��/�� � "� ���!� �� � 1:��!##!� 1� ������-!�$ 5� �� �� 1:��!##!� ���!� �� � ��!�� �$�!�� ���!�!##!�� �## 7��� ��/�� � "� �/���� !"#� � ���!�!##!� ��� !��#� �� � ��!�� 7��� ��/�� � "�#��$ � �B �!������ ���� %��� 7������ C> 7��� 4��� %���"#� Conclusions: &���!�$� �� � !� �!-!#�� "� � !� -�#� ��� ��-�#� ���!�!##!� ���!� ���� ��� �� ��!��� !� S pneumo�!�� !��#� �� ���- ��������%�: 7�!�� !� ��/�!�$ ���"#�- 7��#� 7!�� Key words: &�!#����� 4�������%�$��# �7�"� S pneumoniae� ���� %��� 5� �� Introduction (���!�� ��% ��� !���� !�� !� �� -�,�� ���# � ���"#�- !� �� �#��!�$ ��/� �!�� 3���� !�� �� �� ����!�� ��% ��� !� �� -�� ���E/�� ��� !-��� �� ��/�� �� ���� ��- !##���� !� �� ���/#� !�� 3 !� ���E/�� #% �� � �� !���� !�� � ���/� �� �� "!� �� ��� �� �� �� �� � ��# !##���� "����� ��� �� +# ��/$�� -�,��! % �� ���� ����!�� ��% ��� !���� !��� ��� !��# !� ��!$!�� ��������% "�� ��!�# !���� !�� !� �#�� ��--��� ��� !�/#��#% !� -�#��/�!���� ��� ��% %�/�$ (��!��� "�� ��!� �� /���� ����!�� ��% ��� �/�� �� S pneumoniae� H infl uenzae� S pyogenes ��� �� -�� ��--�� ��/�� ! � �$�� � �� ����!�� ��% ��� !���� !��� S pneumoniae !� ��!�� % !� �# �� !� !���� !�� �� /���� ��� #�7�� ����!�� ��% ��� ��-� !-��� �� ����!�� ��% ��� !���� !��� �� ��� ��/��� "% S pneumo�!�� ��� �!�/�! !�� � ! !� -��!�� "�����! !�� ���/-��!� � �* +����:!-� �#% * B -!##!�� ��!#���� /���� � %���� �� �$� �!� ���/�##% �� ���/-��!� �����-!��� #% !� J. Nepal Paediatr. Soc. Vol 28, No. 2 ��B� �� �� �#��!�$ 7��#�� �����:!-� �#% ��� ��#� �� ���� ��� �� ��� � �!"/ �"#� � S pneumoniae �! ��� ��#�#% �� !� ���,/�� !�� 7! � � !��# ����!�� ��% !���� !��� -�#�/ �! !�� �� '3F !���� !��. ����#� /�/�##% ����% ���/-�����! 7! ��/ �%-� �-�� "/ /���� ��� �!� �!��/-� ������ �!� ����!�$� ��� �#�� ��� �!"/ � � ����!�� ��% �� � �� �%� �-!� �!����� 3���� !�� /�/�##% ���/�� !� � ������ �#����% ��#��!9�� 7! � S pneumoniae, 7��� �� "�� ��!� !� ��� !� � �� �� !�� A� "��% �� ���# ��� ��� �� � ����!����"#� !-��� �� ���/-������# ����!�$� ��� ! � �� ���� � ��� "�� ��!� S pneumoniae ����!�� !� �� ����� ����%�: �� ��!#���� ��� �� �� !���� !�� ��/�!�$ � ��!�� �/���� #% �!��/#� !�$ !� �� ��--/�! % �� � /�!�� �� �� ��� �#���� �� �!������ �� ��$��� ��� ��!� ���!�� ���� �� ���� ��� ��� !�� /���/# !��!�� !��� ��� -��� �� !���# ������/ !� ��� ��� �� ! � � �� �$!�� ��� ����� ����%�$��# ����!�$� �� S pneumoniae !� %�/�$ ��!#���� ��� "��� ��#� �� � �� �� �#��-�� �� �!����� ��� �� ������ �� �� �� ��$�� ��� ! ��� "��� ��/�� � "�#��$ � � #!-! �� �/-"�� �� ���� %��� �� ��� �#�� ��-� �� �� -�� ��--�� ��/�� �� !� ��! � ���!� �!� �!������B &���!���!�$ ���� ��� �� �� �/���� � /�% 7�� ����!�� �/ Methods + � �# �� �CC ��!#���� �� �$� "� 7��� * -�� �� ��� � %���� � ���!�$ �/ �� !�� ����� -�� �� ��� ! &�!#����A� '���! �# 7��� !��#/��� !� �� � /�% �� �� �8!�$ ������ ���- $/���!�� �� � ��!#� ��� �#�� ���- �� ��!#� 7���� �� ����!"#� 4�������%�$��# �7�" ����!-��� 7��� ��##�� �� /�!�$ ����!� ��##% ���!$��� ���!� �!� �!9�� �7�" �� �!� � �:!"#� �#/-!�/- ���� !���� 7! � ������ ��#%�� �� �&���� �!�$��� !�� &������ &� ��+� ��� ������� �� � '��# � (������� )�"��� ��%� 3�� ! / � �� ���!�!��� ��!"�/ �� ��! ���! % �����!�$ '���! �# !� �8!- -!#8 �%� ��� $#/���� $#%���!� ���00� 3� �� #�"��� ��%� �� ����!-��� 7��� �� �:�� ��� !���/#� �� �� "#��� �$�� �/��#�-�� �� 7! � => ����� "#��� ��� !��/"� �� � .= @& ��� *� ��/�� !� � ? �<> &1 * � -������� S pneumoniae 7�� !��� !� �� "% ��#��% -�����#�$%� 0��-A� � �!�� �� ���!� �/���� !"!#! % �� ��� "!#� ��#/"!#! % �� +� !"!� !� �/���� !"!#! % �� 7�� ������-�� "% -��!� �� �!�"%���/�� �!�� �!��/�!�� -� ��� �� �/�##���'!� �� +$�� �/��#�-�� �� 7! � => ����� "#��� ��� !� ����� �� ������!�$ � 4� !���# &�--! �� ��� &#!�!��# )�"��� ��% � ������� �4&&)�� ����--���� !�� 5� �� �� 1:��!##!� ���!� �� � ��!�� �� ���/-�����! 7�� ������-�� �$�!�� ���!�!##!� "% /�!�$ 5� �� � �!� �� ���!�!##!� �+� �!��!�8 4�� � +-��!��� 3��� ��� !� ����� �� ������!�$ � 4&&)� ���� %�!�$ �� �� !��#� �� ���/-�����! 7�� ���� "% ���$$#/ !�� !�� -� ��� /�!�$ ���/-� �� 8! 7! � �* ���#�� �� !���� 3 7�� "���� �� ����/#�� ���� !�� �/� � !� ���� !�� "� 7��� ���/-������# ����/#�� ��#%�������!�� ��� ! � ��-�#�$�/� �� !"��% Results 1� �CC ����!-��� !� �� !$� �� ��� S pneumoniae� B� �.� B>� ���7�� �� $��7 � �� S pneumoniae 1/ �� �� B� !��#� ��� .. ��< C>� 7��� -�#� ��� .* ��D *>� 7��� ��-�#� �;!$/�� �� 0����� 7!�� �!� �!"/ !�� �� ��� ������%�$��# ����!�$� �� S pneumoniae 7�� � � !� !��##% �� �!$�!� ��� ��� < <�� Fig. 12 ���7!�$ ��!#���� ����##�� ��� $����� 7!�� �!� �!"/ !�� �� S pneumoniae �-��$ ��- 0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 number percentage number 188 65 33 32 percentage 34.6 50.8 49.2 total subjects enrolled total positive male positive female positive ��=� 100.0 100.0 60.0 98.5 78.5 84.6 0.0 20.0 40.0 60.0 80.0 100.0 Cephotaxime Chloromphenicol Cotrimoxazole Erythromycin Tetracycline Oxacillin P er ce nt ag e Antibiotics Fig. 22 ���7!�$ �� !"!� !� �/���� !"!#! % �� ��� �� ��������%�$��# ���/-������# !��#� �� &���� �:!-�� &�#���-����!��# ��� 5�% ���-%�!� 7��� ��/�� � "� -�� ����� ! � ��/$� �$�!�� �� !��#� �� &� �!-�:�9�#� 7�� �� #��� ����� ! � ��/$ �� �> �� �� !��#� �� 7��� ��/�� � "� 1:��!##!� ���!� �� �;!$/�� *� 1� ������-!�$ 5� �� �� 1:��!##!� ���!� �� � ��!�� �$�!�� ���!�!##!�� �!�!-/- 3��!"! ��% &����� �� !�� ��3&� �� ���!�!##!� 7�� ��/�� � #!� "�#�7 * G$H-# !�� �!�� !�$ ���� !��#� �� � "� �/���� !"#� � ���!�!##!� ��� !��#� �� � ��!�� �� S pneumo�!�� 7��� ��/�� � "�#��$ � �B �!������ ���� %��� 7������ C> �� �� !��#� �� 7��� 4����%���"#� ���� %��� �D� B� �� ��� C 7��� �� -�� ��--�� ���"#� �� Table 1: ���7!�$ �!� �!"/ !�� �� �!������ ���� %��� �� �� !��#� �� S pneumoniae. Serotypes Number Percentage 19 �* �C> 6 �* �C> 15 B D> 14 � C> 23 � B> 11 � B> 20 . �> 7 . �> 3 . �> 12 * .> 18 � *> 17 � *> 10 � *> 9 � *> 8 � *> 5 � *> Non-Typeable � C> Total B� �<<> Discussion 1/ �� �CC ��������%�$��# �7�" ����!-�� ���������� B� �.� B>� �� ��- ���7�� $��7 � �� S pneumoniae. +# ��/$� � ��-���!��� �� ���/-������# ����!�$� �� �� "� 7��� � /�!�� !� �!�� �/# �/� � ��!�"#� -� ����#�$!��# ��� ���� �� ���/-������# ����!�$� �� � 7�� � #! #� "! #�7�� !� �!� � /�% 7��� ��-����� � �� � /�% ����!�� �/ "% ������ !� 7�!��� ��������%�$��# ��#��!9� !�� 7! � ���/-�����! 7�� ��/�� !� �<> �� �� �����= +-��$ B� ���! ! � �/",�� �� �< C> 7��� -�#� ����!��� ��� �D *> 7��� ��-�#� ����!��� !��!�� !�$ �"����� �� �����#� !�� "� 7��� $����� ��� ��������%�$��# ��#��!9� !�� 7! � ���/-�����! ��� ���/# ��� "� �����#� �� � �� � ��!�$� �� ��##� et al !� 7�!�� �D> 7��� ��-�#� ��� ��> 7��� -�#� ����!���C +## �� !��#� �� ���/-�����! 7��� ��/�� � "� �/���� !"#� � &���� �:!-� ��� &�#���-����!��# 5�% ���-%�!� 7�� �#�� ����� ! � ��/$ �� ���!�� �!��� ��#% � �> 7��� ��/�� � "� ���!� �� � ! �� ���%�#!�� ��/#� �#�� "� /��� ��� �����% �!��� ��#% D *> 7��� ���!� �� � ! &� �!-!�:�9�#� ���7�� #�7�� �/���� !"!#! % � !��#� �� ���/-�����! 7! � �<> !��#� �� ���!� �� � ! 3� � �!-!#�� � /�%� &� �!-�:�9�#� 7�� �� #��� ����� ! � ��/$ �$�!�� S pneumoniaeC. 3� ���! !�� � �!�� 7� � /�!�� !� ��8!� �� ��� ��/�� &� �!-�:�9�#� � "� !������ ! � !� ��� �!�� �� �� !�� � �� ���/-��!�� ��� ��!#���� /���� �$� �� � %��� 7��� �����!�##% �/���� !"#� � ��� -�� ��!#/�� &� �!-�:�9�#� 7�� ����--����� "% I ' 1 ��� ��� -�� �� !���� !��� ��/��� "% S pneumoniae �/� � ! � #����� �!�� ����� �� #�7�� ��� ��� ���% � �!#�"!#! % '�7� ��� -�,��! % �� S pneumoniae !� ��/ � +�!� ��� ��7 &� �!-�:�9�#� ���!� �� ��!�!�$ �� E/�� !�� �� 7�� ��� I ' 1 ���/#� ��!� ���- &� �!-�:�9�#� � -��� �:����! � ��/$ ��� ��� -�� D ����� ��� �� ���# ����!"#� -�����!�-� �� �� �#��-�� �� ���!� ���� !� ���/-�����! �/�� �� �/� � �!�$#� ��!� -/ � !��� �������-� !�� �/� �8� ��� ����-���-�# �:����$� �� ���� �4+ ���- �#���#% ��#� �� � ��!�� �� ����!���� ���,/$� ! � ���������� � ������� ��� $��� !� !�������� !�� �� �-�## ��$-�� � �� �4+ �/�!�$ "�� ��!�# �/�!�� � �� �� � ��< ��C� 1:��!##!�� ��/$� ! !� �� /��� !� �����%� 7�� /��� ��� ����!� !�$ �� ���!� ���� �� S pneumoniae �$�!�� ���!�!##!� �/� � ! � �!$��� ���!� ���� � ��$���� !�� �/�!�$ #��$ ��- � ���$� ��� �� �> �� �� !��#� �� 7��� ��/�� � "� 1:��!##!� ���!� �� 1:��!##!� ���!� ���� 7�� �!$� !� �� � /�% 7��� ��-����� � � �> !� � /�% ���� "% ��##� et al8 1� ������-!�$ 5� �� �� 1:��!##!� ���!� �� � ��!�� �$�!�� ���!�!##!�� �3& �� 7� 1:��!##!� ���!� �� ���/� -������# !��#� �� 7�� ��/�� � "� -����� �#% �/����� !"#� ��� �� �� ��-�!�!�$ �!$� 7�� ��/�� � "� �/�� ��� !"#� � ���!�!##!� ��/�� ���� �� �� !��#� �� 7��� ��/�� � "� ���!�!##!� ���!� �� 5� �� �� 1:��!##!� ��� �!� �� � ��!�� �� S pneumoniae 7�� ������-�� �$�!�� ���!�!##!� �!��� �!�� �� !�$ �� 1:��!##!� ���!� ���� ��� S pneumoniae !� �� �/�� �!�� � �!� !�$/!�� "� 7��� ��-�#� � ��� ��� !�# ���!� ���� �$�!�� ���!�!##!� ���!�!##!� ���!� ���� �-��$ ���/-������# !��#� �� !� +�!� ��� �#�� �-��$�� ��� !� $���/�##% !������!�$ ��� �/# !�$ ��� -�� ��!#/��D 3����-� !�� �� �� ��$!���# �!� �!"/ !�� �� ���/� -������# ���� %�� !� ����� !�# ��� �� �� �#��-�� ��� /�� �� �������!� � ���/-������# ���!�� !� �� �#��!�$ ��/� �!���� �� ��-!�!�$ �� ���� %�� �� S pneumoniae !� !-��� �� �� �� ���!�� ����/� !�� !� "���� �� �� -�� ��--�� ���� %��� ��� !��#� �� S pneumoniae 7��� ��/�� � "�#��$ � �B �!������ ���� %��� 7�!�� ��� ���7� !� �"#� � ���� %�� � !� ��$����� �� �� -�� !� ��! � � ��!� ���� %��� �� .� �� B� ��� �D ��� *. ��� ����!����� ��-�������! � %��� !� !� ��! � ���/-�� �����# !���� !��� 5:��� ���� %�� �� �## ���� %��� ���� �!����� ��-�������! � %�� !� ���/-������# !���� !��� 7��� ����/� ���� !� �� � /�% ���� %��� �D� B� ��� *.� D� ��� C� =� �=� *< ��� ** ��� ��!�� % !� �# �� !� ����� ����%�$��# ��#��!9� !�� !� ��!#�����* Conclusion ����� 7�� ��/�� � "� �� �����#� !�� "� 7��� ��� ������%�$��# ����!�$� �� S pneumoniae ��� $����� �� ��!#���� &� �!-�:�9�#� 7�� ��/�� � "� �� #��� ��� ��� ! � ��/$ ��� ��� -�� �3& �� 1:��!##!� ���!� �� � ��!�� �$�!�� ���!�!##!� #!�� !� �/���� !"#� ��� -����� � �#% �/���� !"#� ��$!�� !��!�� !�$ �"����� �� ���!�!##!� ���!� ���� +� ! ���/-������# ��#%�������!�� ���!�� �*.� �#�� � �� ��� �## �� !��#� �� ���� %��� �� ���/� -�����! ��� �!����#%�������!�� �&��,/$� �� ���!�� �/�������� ��������%�$��# ����!�$� �� S pneumoniae ��/�� ���,/$� � ���!�� !--/�!9� !�� ��##�7�� "% ��#%�������!�� ���!�� "��� !�$ -!$� ��� !�� � ��/�� �� !�� ��� #!�� #��$ ��� �� !�� �$�!�� ���/-������# �!����� Acknowledgement I� ��� ���8�/# � �� &��!� &�#��� +��!� �� ���������� ����� '��8!�� �#��-"��$ �����# �� �/"#!� '��# � ��� 443�� ��-!#% ��� ��!� $�����/� �/���� � �� � /�% I� 7�/#� �#�� #!8� � ��8��7#��$� � ���� �� '��# � (������� )�"��� ��%� 3�� ! / � �� ���!�!��� ��!"�/ �� ��! ���! % �����!�$ '���! �# ��� ��� ! &�!#����A� '���! �# ��� ��!� ������� !�� ���/$��/ �� � /�% References � ��7��! �� (�� ��� ���� 0� �� ��� �� �� !-!���"!�# ������!� !�� ��� ! � ��� ���#%�!� !� ����!�� ��% ��� !���� !�� KU J Sci, Engi and Tec *<<� ��� � ����2 ��� * 0����7��� �� �#��8 (&�� ��/ ����� �; ���!��# �!���"!�#�$%� �B � ��! !�� &�/���!## )! !�$� ��� �/"#!�� !��� 5�$#��� *<<.2 �=���CC . 1A"�!�� �)� 4��%��8 '� ��� I'1 ���/-������# ���!�� �!�# ����!�$� 7��8!�$ $��/� (���� ���- � I'1 7��8!�$ $��/�2 � ������ -� ��� ��� �� �� !�$ /���� ����!�� ��% ����!�$� �� � ��� �����/� ���/-��!�� Pediatr Infect Dis J *<<. ;�"� **�*�2 ���� � ��!,�#�!��� � ��� !��� !� �� !�� �� � ��� �����/� ���/-��!��. 4� !���# �/"#!� '��# � 3�� ! / � �/"#!�� !��� ;!�#��� *<